Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471206
- Subject:
- XR_001743517.2
- Aligned Length:
- 1795
- Identities:
- 1234
- Gaps:
- 560
Alignment
Query 1 ---------------------------------------ATGGCGTGCGGCTTTCGCCGCGCTATTGCTTGCCA 35
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GGAACTGGCGGACTGCGGCGCACTTCCGTAGAGGTGGACATGGCGTGCGGCTTTCGCCGCGCTATTGCTTGCCA 74
Query 36 GCTTTCCAGAGTGTTGAATCTTCCACCAGAAAACTTGATCACATCAATATCTGCAGTTCCAATTTCCCAAAAAG 109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCTTTCCAGAGTGTTGAATCTTCCACCAGAAAACTTGATCACATCAATATCTGCAGTTCCAATTTCCCAAAAAG 148
Query 110 AAGAAGTAGCTGATTTTCAGCTTTCTGTGGATTCTTTATTGGAAAAAGACAATGACCATTCAAGACCAGATATT 183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAGAAGTAGCTGATTTTCAGCTTTCTGTGGATTCTTTATTGGAAAAAGACAATGACCATTCAAGACCAGATATT 222
Query 184 CAAGTTCAAGCCAAGAGACTAGCAGAGAAGCTAAGATGTGATACAGTGGTGAGTGAAATCAGTACTGGTCAAAG 257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAAGTTCAAGCCAAGAGACTAGCAGAGAAGCTAAGATGTGATACAGTGGTGAGTGAAATCAGTACTGGTCAAAG 296
Query 258 GACTGTAAATTTCAAAATAAACAGAGAGCTCTTAACAAAGACAGTGCTACAACAAGTAATTGAAGATGGCTCAA 331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GACTGTAAATTTCAAAATAAACAGAGAGCTCTTAACAAAGACAGTGCTACAACAAGTAATTGAAGATGGCTCAA 370
Query 332 AATATGGATTAAAAAGTGAACTTTTCTCTGGACTTCCCCAGAAGAAGATTGTGGTTGAATTCAGTTCACCTAAT 405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AATATGGATTAAAAAGTGAACTTTTCTCTGGACTTCCCCAGAAGAAGATTGTGGTTGAATTCAGTTCACCTAAT 444
Query 406 GTTGCCAAAAAATTTCATGTTGGACATTTGCGTTCTACCATCATAGGAAATTTTATAGCAAATCTCAAAGAAGC 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTTGCCAAAAAATTTCATGTTGGACATTTGCGTTCTACCATCATAGGAAATTTTATAGCAAATCTCAAAGAAGC 518
Query 480 TTTAGGACATCAAGTAATAAGAATAAATTACCTTGGCGATTGGGGCATGCAGTTTGGTCTTCTGGGAACTGGCT 553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TTTAGGACATCAAGTAATAAGAATAAATTACCTTGGCGATTGGGGCATGCAGTTTGGTCTTCTGGGAACTGGCT 592
Query 554 TCCAGCTGTTTGGCTATGAGGAAAAACTGCAGTCCAATCCTCTACAGCATCTCTTTGAAGTTTATGTACAAGTT 627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCCAGCTGTTTGGCTATGAGGAAAAACTGCAGTCCAATCCTCTACAGCATCTCTTTGAAGTTTATGTACAAGTT 666
Query 628 AATAAAGAAGCAGCAGATGATAAAAGTGTAGCAAAAGCAGCACAGGAGTTCTTCCAACGATTGGAACTGGGCGA 701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AATAAAGAAGCAGCAGATGATAAAAGTGTAGCAAAAGCAGCACAGGAGTTCTTCCAACGATTGGAACTGGGCGA 740
Query 702 TGTGCAAGCACTTTCACTGTGGCAAAAATTTCGGGACTTGAGCATTGAAGAGTACATTCGGGTTTACAAGCGTC 775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGTGCAAGCACTTTCACTGTGGCAAAAATTTCGGGACTTGAGCATTGAAGAGTACATTCGGGTTTACAAGCGTC 814
Query 776 TGGGAGTATATTTTGATGAATATTCAGGAGAATCATTTTATCGTGAAAAATCTCAAGAGGTCTTAAAGTTGCTG 849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGGAGTATATTTTGATGAATATTCAGGAGAATCATTTTATCGTGAAAAATCTCAAGAGGTCTTAAAGTTGCTG 888
Query 850 GAGAGTAAAGGACTCCTACTGAGAACAAT----------------------AAAAGGAACGGCTGTAGTAGATC 901
||||||||||||||||||||||.|||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAGAGTAAAGGACTCCTACTGAAAACAATAGTTACCTTTTCGAATTTCTAGAAAAGGAACGGCTGTAGTAGATC 962
Query 902 TCTCTGGGAATGGCGACCCCTCCTCAATTTGTACTGTAATGCGAAGTGATGGGACTTCTCTCTATGCAACCAGA 975
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TCTCTGGGAATGGCGACCCCTCCTCAATTTGTACTGTAATGCGAAGTGATGGGACTTCTCTCTATGCAACCAGA 1036
Query 976 GATCTTGCAGCTGCTATAGATCGAATGGACAAGTATAATTTTGATACAATGATATATGTGACAGATAAAGGACA 1049
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GATCTTGCAGCTGCTATAGATCGAATGGACAAGTATAATTTTGATACAATGATATATGTGACAGATAAAGGACA 1110
Query 1050 AAAAAAGCATTTTCAGCAAGTATTCCAAATGCTGAAGATCATGGGATATGACTGGGCAGAAAGGTGCCAGCACG 1123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAAAAAGCATTTTCAGCAAGTATTCCAAATGCTGAAGATCATGGGATATGACTGGGCAGAAAGGTGCCAGCACG 1184
Query 1124 TGCCCTTTGGAGTAGTACAGGGAATGAAGACTCGAAGAGGAGATGTCACTTTCCTGGAAGATGTTTTAAATGAG 1197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGCCCTTTGGAGTAGTACAGGGAATGAAGACTCGAAGAGGAGATGTCACTTTCCTGGAAGATGTTTTAAATGAG 1258
Query 1198 ATTCAATTAAGGATGCTACAGAACATGGCTTCAATTAAGACAACTAAAGAACTCAAGAACCCACAAGAGACTGC 1271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ATTCAATTAAGGATGCTACAGAACATGGCTTCAATTAA------------------------------------ 1296
Query 1272 AGAGAGGGTCGGGCTCGCAGCACTCATTATTCAGGACTTCAAAGGTTTACTCTTATCTGACTACAAGTTCAGCT 1345
Sbjct 1297 -------------------------------------------------------------------------- 1296
Query 1346 GGGATCGTGTTTTCCAGAGTCGCGGGGACACAGGAGTCTTCCTACAGTACACACACGCCCGCCTCCACAGTTTG 1419
Sbjct 1297 -------------------------------------------------------------------------- 1296
Query 1420 GAAGAGACTTTTGGATGTGGGTACCTGAATGACTTCAACACTGCTTGTTTACAAGAGCCACAGTCTGTTTCAAT 1493
Sbjct 1297 -------------------------------------------------------------------------- 1296
Query 1494 TCTTCAGCATCTTCTCAGGTTCGACGAGGTGCTTTATAAATCATCTCAGGACTTTCAACCCAGGCATATCGTCA 1567
Sbjct 1297 -------------------------------------------------------------------------- 1296
Query 1568 GTTACCTTCTAACTTTAAGTCATCTTGCAGCTGTGGCACACAAAACACTACAAATAAAAGATAGTCCTCCTGAA 1641
Sbjct 1297 -------------------------------------------------------------------------- 1296
Query 1642 GTGGCTGGGGCCAGACTTCATCTTTTCAAAGCTGTCCGTTCTGTCCTAGCCAATGGAATGAAACTTCTTGGAAT 1715
Sbjct 1297 -------------------------------------------------------------------------- 1296
Query 1716 AACACCTGTATGTAGGATG 1734
Sbjct 1297 ------------------- 1296