Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000471221
Subject:
XM_017005206.2
Aligned Length:
1170
Identities:
870
Gaps:
300

Alignment

Query    1  ATGCCAAGTGAGTACACCTATGTGAAACTGAGAAGTGATTGCTCGAGGCCTTCCCTGCAATGGTACACCCGAGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TCAAAGCAAGATGAGAAGGCCCAGCTTGTTATTAAAAGACATCCTCAAATGTACATTGCTTGTGTTTGGAGTGT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGATCCTTTATATCCTCAAGTTAAATTATACTACTGAAGAATGTGACATGAAAAAAATGCATTATGTGGACCCT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GACCGTGTAAAGAGAGCTCAGAAATATGCTCAGCAAGTCTTGCAGAAGGAATGTCGTCCCAAGTTTGCCAAGAC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  ATCAATGGCGCTGTTATTTGAGCACAGGTATAGCGTGGACTTACTCCCTTTTGTGCAGAAGGCCCCCAAAGACA  370
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----ATGGCGCTGTTATTTGAGCACAGGTATAGCGTGGACTTACTCCCTTTTGTGCAGAAGGCCCCCAAAGACA  70

Query  371  GTGAAGCTGAGTCCAAGTACGATCCTCCTTTTGGGTTCCGGAAGTTCTCCAGTAAAGTCCAGACCCTCTTGGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   71  GTGAAGCTGAGTCCAAGTACGATCCTCCTTTTGGGTTCCGGAAGTTCTCCAGTAAAGTCCAGACCCTCTTGGAA  144

Query  445  CTCTTGCCAGAGCACGACCTCCCTGAACACTTGAAAGCCAAGACCTGTCGGCGCTGTGTGGTTATTGGAAGCGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  145  CTCTTGCCAGAGCACGACCTCCCTGAACACTTGAAAGCCAAGACCTGTCGGCGCTGTGTGGTTATTGGAAGCGG  218

Query  519  AGGAATACTGCACGGATTAGAACTGGGCCACACCCTGAACCAGTTCGATGTTGTGATAAGGTTAAACAGTGCAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  219  AGGAATACTGCACGGATTAGAACTGGGCCACACCCTGAACCAGTTCGATGTTGTGATAAGGTTAAACAGTGCAC  292

Query  593  CAGTTGAGGGATATTCAGAACATGTTGGAAATAAAACTACTATAAGGATGACTTATCCAGAGGGCGCACCACTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  293  CAGTTGAGGGATATTCAGAACATGTTGGAAATAAAACTACTATAAGGATGACTTATCCAGAGGGCGCACCACTG  366

Query  667  TCTGACCTTGAATATTATTCCAATGACTTATTTGTTGCTGTTTTATTTAAGAGTGTTGATTTCAACTGGCTTCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  367  TCTGACCTTGAATATTATTCCAATGACTTATTTGTTGCTGTTTTATTTAAGAGTGTTGATTTCAACTGGCTTCA  440

Query  741  AGCAATGGTAAAAAAGGAAACCCTGCCATTCTGGGTACGACTCTTCTTTTGGAAGCAGGTGGCAGAAAAAATCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  441  AGCAATGGTAAAAAAGGAAACCCTGCCATTCTGGGTACGACTCTTCTTTTGGAAGCAGGTGGCAGAAAAAATCC  514

Query  815  CACTGCAGCCAAAACATTTCAGGATTTTGAATCCAGTTATCATCAAAGAGACTGCCTTTGACATCCTTCAGTAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  515  CACTGCAGCCAAAACATTTCAGGATTTTGAATCCAGTTATCATCAAAGAGACTGCCTTTGACATCCTTCAGTAC  588

Query  889  TCAGAGCCTCAGTCAAGGTTCTGGGGCCGAGATAAGAACGTCCCCACAATCGGTGTCATTGCCGTTGTCTTAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  589  TCAGAGCCTCAGTCAAGGTTCTGGGGCCGAGATAAGAACGTCCCCACAATCGGTGTCATTGCCGTTGTCTTAGC  662

Query  963  CACACATCTGTGCGATGAAGTCAGTTTGGCGGGTTTTGGATATGACCTCAATCAACCCAGAACACCTTTGCACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  663  CACACATCTGTGCGATGAAGTCAGTTTGGCGGGTTTTGGATATGACCTCAATCAACCCAGAACACCTTTGCACT  736

Query 1037  ACTTCGACAGTCAATGCATGGCTGCTATGAACTTTCAGACCATGCATAATGTGACAACGGAAACCAAGTTCCTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  737  ACTTCGACAGTCAATGCATGGCTGCTATGAACTTTCAGACCATGCATAATGTGACAACGGAAACCAAGTTCCTC  810

Query 1111  TTAAAGCTGGTCAAAGAGGGAGTGGTGAAAGATCTCAGTGGAGGCATTGATCGTGAATTT  1170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  811  TTAAAGCTGGTCAAAGAGGGAGTGGTGAAAGATCTCAGTGGAGGCATTGATCGTGAATTT  870