Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471271
• Subject: XM_005258285.1
• Aligned Length: 735
• Identities: 597
• Gaps: 138

Alignment

Query   1  ATGGCCGAGGACCTCTCTGCGGCCACGTCCTACACCGAAGATGATTTCTACTGCCCCGTCTGTCAGGAGGTGCT  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  CAAAACGCCCGTGCGGACCACGGCCTGTCAGCACGTTTTCTGTAGAAAATGTTTCCTGACTGCAATGAGGGAAA  148
                                                                           ||||||||||
Sbjct   1  ----------------------------------------------------------------ATGAGGGAAA  10

Query 149  GCGGAGCACATTGTCCCCTATGTCGTGGAAATGTGACTAGAAGAGAGAGAGCATGTCCTGAACGGGCCTTAGAC  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  11  GCGGAGCACATTGTCCCCTATGTCGTGGAAATGTGACTAGAAGAGAGAGAGCATGTCCTGAACGGGCCTTAGAC  84

Query 223  CTTGAAAATATAATGAGGAAGTTTTCTGGTAGCTGCAGATGCTGTGCAAAACAGATTAAATTCTATCGCATGAG  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  85  CTTGAAAATATAATGAGGAAGTTTTCTGGTAGCTGCAGATGCTGTGCAAAACAGATTAAATTCTATCGCATGAG  158

Query 297  ACATCATTACAAATCTTGTAAGAAGTATCAGGATGAATATGGTGTTTCTTCTATCATTCCAAACTTTCAGATCT  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 159  ACATCATTACAAATCTTGTAAGAAGTATCAGGATGAATATGGTGTTTCTTCTATCATTCCAAACTTTCAGATCT  232

Query 371  CTCAAGATTCAGTAGGGAACAGCAATAGGAGTGAAACATCCACATCTGATAACACAGAAACTTACCAAGAGAAT  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 233  CTCAAGATTCAGTAGGGAACAGCAATAGGAGTGAAACATCCACATCTGATAACACAGAAACTTACCAAGAGAAT  306

Query 445  ACAAGTTCTTCTGGTCATCCTACTTTTAAGTGTCCCCTGTGTCAAGAATCAAATTTTACCAGACAGCGTTTACT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 307  ACAAGTTCTTCTGGTCATCCTACTTTTAAGTGTCCCCTGTGTCAAGAATCAAATTTTACCAGACAGCGTTTACT  380

Query 519  GGATCACTGTAACAGTAATCACCTATTTCAGATAGTTCCTGTGACATGTCCTATTTGTGTGTCTCTTCCTTGGG  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 381  GGATCACTGTAACAGTAATCACCTATTTCAGATAGTTCCTGTGACATGTCCTATTTGTGTGTCTCTTCCTTGGG  454

Query 593  GAGATCCTAGCCAGATTACCAGAAATTTCGTTAGTCATCTAAATCAGAGACATCAATTTGATTATGGAGAATTT  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 455  GAGATCCTAGCCAGATTACCAGAAATTTCGTTAGTCATCTAAATCAGAGACATCAATTTGATTATGGAGAATTT  528

Query 667  GTGAATCTTCAGCTAGATGAAGAAACCCAATACCAAACTGCTGTTGAAGAATCTTTTCAAGTAAACATC  735
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 529  GTGAATCTTCAGCTAGATGAAGAAACCCAATACCAAACTGCTGTTGAAGAATCTTTTCAAGTAAACATC  597