Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471330
- Subject:
- NM_001033531.4
- Aligned Length:
- 1875
- Identities:
- 1188
- Gaps:
- 579
Alignment
Query 1 ATGCCGTCTGAACGCTGCCTCAGTATTCAAGAAATGCTGACAGGCCAGAGGCTCTGCCACTCCGAATCTCACAA 74
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||.|||||||
Sbjct 1 ATGCCGTCTGAACACTGCCTCAGTATTCAAGAAATGCTGACGGGCCAGAGGCTGTGCCACTCGGAAACTCACAA 74
Query 75 TGACAGTGTCCTGGCAGCGCTGAATCAGCAGAGGAGTGATGGCATCCTCTGCGACATCACCCTGATTGCTGAGG 148
|||||..||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||.|.||||||||.||.||||
Sbjct 75 TGACACGGTCCTGGCGGCGCTGAATCAGCAAAGAAGTGATGGCATTCTCTGCGACGTGACCCTGATCGCCGAGG 148
Query 149 AACAGAAATTCCATGCTCACAAGGCAGTCCTAGCAGCATGCAGTGACTATTTCCGGGCAATGTTCAGTCTTTGT 222
|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AACAGAAATTCCACGCTCACAAGGCGGTCCTAGCAGCCTGCAGTGACTACTTCCGGGCAATGTTCAGTCTTTGT 222
Query 223 ATGGTGGAAAGTGGAGCTGATGAGGTTAATTTGCACGGTGTGACCAGCCTTGGCTTAAAGCAGGCTCTGGAGTT 296
|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|..||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATGGTGGAAAGTGGAGCCGATGAAGTAAATTTACGTGGTGTGACCAGCCTGGGCTTAAAGCAGGCTCTGGAGTT 296
Query 297 TGCATACACAGGACAGATTTTGCTGGAGCCAGGTGTGATCCAGGATGTGCTAGCAGCGGGCAGTCACCTACAGC 370
.|||||.||||||
Sbjct 297 CGCATATACAGGA------------------------------------------------------------- 309
Query 371 TGTTGGAGCTTCTCAATTTATGCTCCCACTATCTCATCCAGGAATTAAATAGCTTTAATTACTTGGATCTGTAC 444
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 310 --------------------------------------CAGGAACTAAATAGCTTTAATTACTTGGATCTGTAC 345
Query 445 AGACTTGCTGACCTCTTTAACCTCACTTTGTTGGAGAAGGCAGTGATCGATTTCTTAGTGAAACATCTCTCTGA 518
||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||.||||||||.||
Sbjct 346 AGACTTGCTGACCTCTTTCACCTCACTTTGTTGGAGAAGGCAGTGATTGACTTCCTAGTGAAGCATCTCTCGGA 419
Query 519 ACTCCTGAAGAGCCGCCCAGAAGAAGTTCTAACGCTTCCCTATTGCCTGCTTCAGGAGGTGCTGAAGAGCGACC 592
.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 420 GCTCCTGAAGAGCCGCCCAGAGGATGTCCTCACGCTGCCCTACTGCCTGCTTCAGGAGGTGCTGAAGAGTGACC 493
Query 593 GCCTGACCTCCCTGAGTGAAGAGCAGATCTGGCAGCTAGCTGTGAGGTGGTTGGAACACAACTGCCACTACCAG 666
|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 494 GCCTGACGTCCCTGAGTGAGGAGCAGATCTGGCAGCTAGCTGTGAGGTGGCTGGAACACAATTGCCATTACCAG 567
Query 667 TACATGGACGAGCTCCTGCAATACATCCGCTTTGGCCTAATGGATGTGGATACTCTCCATACAGTTGCCCTGTC 740
.|..||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct 568 CATCTGGACGAGCTCCTGCAGTACATCCGCTTTGGCCTAATGGATGTGGATACACTCCACACGGTTGCCCTATC 641
Query 741 CCACCCCCTTGTCCAAGCAAGTGAGACTGCAACAGCCCTTGTCAACGAGGCCCTGGAATACCACCAGAGCATCT 814
|||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 642 CCACCCCCTGGTGCAGGCAAGTGAGACGGCAACTGCCCTTGTCAACGAGGCCCTGGAATACCACCAAAGCATCT 715
Query 815 ATGCACAGCCTGTCTGGCAGACTCGCAGGACCAAACCACGATTCCAGTCAGACACTCTGTATATCATTGGTGGG 888
|||||||||||||.||||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 716 ATGCACAGCCTGTGTGGCAGACCCGCCGGACAAAACCGCGATTCCAGTCCGATACTCTCTATATTATTGGTGGG 789
Query 889 AAAAAGCGCGAGGTCTGCAAGGTCAAGGAACTTCGGTACTTCAATCCTGTTGATCAGGAGAATGCTCTCATAGC 962
||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 790 AAGAAGCGTGAGGTCTGCAAAGTCAAGGAACTTCGTTACTTCAATCCTGTGGACCAGGAGAATGCCCTCATAGC 863
Query 963 TGCCATTGCCAACTGGAGTGAGCTGGCTCCCATGCCTGTGGGAAGGAGCCACCATTGTGTGGCAGTCATGGGGG 1036
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 864 CGCCATTGCCAACTGGAGTGAGCTGGCTCCCATGCCGGTGGGAAGGAGCCATCACTGTGTGGCAGTCATGGGGG 937
Query 1037 ACTTCCTGTTTGTGGCAGGAGGGGAAGTTGAGCATGCCAGTGGCCGGACGTGTGCTGTGAGGACTGCCTGTCGC 1110
|||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 938 ACTTCCTGTTTGTAGCAGGAGGAGAAGTGGAACATGCCAGTGGCCGGACATGTGCCGTGAGGACAGCCTGTCGC 1011
Query 1111 TATGACCCCCGCAGTAATTCCTGGGCAGAGATAGCACCCATGAAAAACTGCCGGGAGCATTTTGTGCTGGGTGC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1012 TATGACCCCCGCAGTAATTCCTGGGCAGAGATAGCACCCATGAAAAACTGCCGGGAACATTTTGTGCTGGGTGC 1085
Query 1185 CATGGAGGAATACCTCTATGCAGTTGGGGGCAGAAATGAACTGCGCCAGGTTCTGCCTACAGTTGAGCGATATT 1258
||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 1086 CATGGATGAATACCTCTATGCAGTAGGGGGCAGAAATGAACTGTGCCAAGTTCTACCTACAGTTGAACGATACT 1159
Query 1259 GCCCCAAGAAGAACAAATGGACTTTTGTTCAGTCCTTTGACAGATCCCTTTCATGCCATGCTGGATATGTGGCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1160 GCCCCAAGAAGAACAAATGGACTTTTGTGCAGTCCTTTGACAGATCCCTCTCGTGTCACGCTGGATATGTGGCT 1233
Query 1333 GATGGTCTTCTTTGGATATCAGGTAG-------AACATACCTCA-TGTTGGATTTATCAAAACACACTTTCATT 1398
||||||||||||||||||||||||.| ||| |||.|| .| |||||.||||.|| |
Sbjct 1234 GATGGTCTTCTTTGGATATCAGGTGGGGTGACAAAC--ACCGCACAG-------TATCAGAACAGAC------T 1292
Query 1399 G-TGGTATAT------------ATT------------------------------------------------- 1410
| |||||||| |.|
Sbjct 1293 GATGGTATATGAACCTAACCAGAATAAGTGGATAAGTCGCAGCCCCATGCTACAGAGAAGAGTCTACCACTCCA 1366
Query 1411 -------------------------------------------------------------------------- 1410
Sbjct 1367 TGGCTGCTGTCCAAAGGAAGCTTTATGTGCTTGGAGGCAATGACCTGGATTACAATAATGACCGGATTCTCGTG 1440
Query 1411 -------------------------------------------------------------------------- 1410
Sbjct 1441 CGTCATATAGATTCTTACAACATTGACACTGATCAGTGGACGCGCTGTAATTTCAACTTGTTGACTGGCCAGAA 1514
Query 1411 -------------------------------------------------------------------------- 1410
Sbjct 1515 TGAATCTGGAGTCGCTGTCCATAATGGGAGAATATATTTAGTTGGTGGATATTCAATTTGGACAAATGAGCCTC 1588
Query 1411 -------------------------------------------------------------------------- 1410
Sbjct 1589 TGGCTTGTATCCAGGTATTGGATGTGAGCAGAGAAGGCAAAGAGGAAGTGTTCTACGGACCTACACTGCCCTTT 1662
Query 1411 -------------------------------------------------------------------------- 1410
Sbjct 1663 GCTTCCAACGGCATAGCGGCGTGCTTCCTTCCGGCTCCGTATTTCACATGCCCCAACCTGCAGACTCTGCAAGT 1736
Query 1411 ------------------------- 1410
Sbjct 1737 GCCTCACCACAGGATCGGCACTGTC 1761
