Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471330
- Subject:
- NM_001163020.2
- Aligned Length:
- 1875
- Identities:
- 1280
- Gaps:
- 480
Alignment
Query 1 ATGCCGTCTGAACGCTGCCTCAGTATTCAAGAAATGCTGACAGGCCAGAGGCTCTGCCACTCCGAATCTCACAA 74
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||.|||||||
Sbjct 1 ATGCCGTCTGAACACTGCCTCAGTATTCAAGAAATGCTGACGGGCCAGAGGCTGTGCCACTCGGAAACTCACAA 74
Query 75 TGACAGTGTCCTGGCAGCGCTGAATCAGCAGAGGAGTGATGGCATCCTCTGCGACATCACCCTGATTGCTGAGG 148
|||||..||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||.|.||||||||.||.||||
Sbjct 75 TGACACGGTCCTGGCGGCGCTGAATCAGCAAAGAAGTGATGGCATTCTCTGCGACGTGACCCTGATCGCCGAGG 148
Query 149 AACAGAAATTCCATGCTCACAAGGCAGTCCTAGCAGCATGCAGTGACTATTTCCGGGCAATGTTCAGTCTTTGT 222
|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AACAGAAATTCCACGCTCACAAGGCGGTCCTAGCAGCCTGCAGTGACTACTTCCGGGCAATGTTCAGTCTTTGT 222
Query 223 ATGGTGGAAAGTGGAGCTGATGAGGTTAATTTGCACGGTGTGACCAGCCTTGGCTTAAAGCAGGCTCTGGAGTT 296
|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|..||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATGGTGGAAAGTGGAGCCGATGAAGTAAATTTACGTGGTGTGACCAGCCTGGGCTTAAAGCAGGCTCTGGAGTT 296
Query 297 TGCATACACAGGACAGATTTTGCTGGAGCCAGGTGTGATCCAGGATGTGCTAGCAGCGGGCAGTCACCTACAGC 370
.|||||.|||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||
Sbjct 297 CGCATATACAGGACAGATTTTGTTGGAGCCAGGAGTGATCCAGGATGTGTTAGCAGCTGGCAGTCACCTACAGC 370
Query 371 TGTTGGAGCTTCTCAATTTATGCTCCCACTATCTCATCCAGGAATTAAATAGCTTTAATTACTTGGATCTGTAC 444
|||||||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGTTGGAACTTCTCAATCTGTGCTCCCACTATCTCATCCAGGAACTAAATAGCTTTAATTACTTGGATCTGTAC 444
Query 445 AGACTTGCTGACCTCTTTAACCTCACTTTGTTGGAGAAGGCAGTGATCGATTTCTTAGTGAAACATCTCTCTGA 518
||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||.||||||||.||
Sbjct 445 AGACTTGCTGACCTCTTTCACCTCACTTTGTTGGAGAAGGCAGTGATTGACTTCCTAGTGAAGCATCTCTCGGA 518
Query 519 ACTCCTGAAGAGCCGCCCAGAAGAAGTTCTAACGCTTCCCTATTGCCTGCTTCAGGAGGTGCTGAAGAGCGACC 592
.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 519 GCTCCTGAAGAGCCGCCCAGAGGATGTCCTCACGCTGCCCTACTGCCTGCTTCAGGAGGTGCTGAAGAGTGACC 592
Query 593 GCCTGACCTCCCTGAGTGAAGAGCAGATCTGGCAGCTAGCTGTGAGGTGGTTGGAACACAACTGCCACTACCAG 666
|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 593 GCCTGACGTCCCTGAGTGAGGAGCAGATCTGGCAGCTAGCTGTGAGGTGGCTGGAACACAATTGCCATTACCAG 666
Query 667 TACATGGACGAGCTCCTGCAATACATCCGCTTTGGCCTAATGGATGTGGATACTCTCCATACAGTTGCCCTGTC 740
.|..||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct 667 CATCTGGACGAGCTCCTGCAGTACATCCGCTTTGGCCTAATGGATGTGGATACACTCCACACGGTTGCCCTATC 740
Query 741 CCACCCCCTTGTCCAAGCAAGTGAGACTGCAACAGCCCTTGTCAACGAGGCCCTGGAATACCACCAGAGCATCT 814
|||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 741 CCACCCCCTGGTGCAGGCAAGTGAGACGGCAACTGCCCTTGTCAACGAGGCCCTGGAATACCACCAAAGCATCT 814
Query 815 ATGCACAGCCTGTCTGGCAGACTCGCAGGACCAAACCACGATTCCAGTCAGACACTCTGTATATCATTGGTGGG 888
|||||||||||||.||||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 815 ATGCACAGCCTGTGTGGCAGACCCGCCGGACAAAACCGCGATTCCAGTCCGATACTCTCTATATTATTGGTGGG 888
Query 889 AAAAAGCGCGAGGTCTGCAAGGTCAAGGAACTTCGGTACTTCAATCCTGTTGATCAGGAGAATGCTCTCATAGC 962
||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 889 AAGAAGCGTGAGGTCTGCAAAGTCAAGGAACTTCGTTACTTCAATCCTGTGGACCAGGAGAATGCCCTCATAGC 962
Query 963 TGCCATTGCCAACTGGAGTGAGCTGGCTCCCATGCCTGTGGGAAGGAGCCACCATTGTGTGGCAGTCATGGGGG 1036
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 963 CGCCATTGCCAACTGGAGTGAGCTGGCTCCCATGCCGGTGGGAAGGAGCCATCACTGTGTGGCAGTCATGGGGG 1036
Query 1037 ACTTCCTGTTTGTGGCAGGAGGGGAAGTTGAGCATGCCAGTGGCCGGACGTGTGCTGTGAGGACTGCCTGTCGC 1110
|||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1037 ACTTCCTGTTTGTAGCAGGAGGAGAAGTGGAACATGCCAGTGGCCGGACATGTGCCGTGAGGACAGCCTGTCGC 1110
Query 1111 TATGACCCCCGCAGTAATTCCTGGGCAGAGATAGCACCCATGAAAAACTGCCGGGAGCATTTTGTGCTGGGTGC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111 TATGACCCCCGCAGTAATTCCTGGGCAGAGATAGCACCCATGAAAAACTGCCGGGAACATTTTGTGCTGGGTGC 1184
Query 1185 CATGGAGGAATACCTCTATGCAGTTGGGGGCAGAAATGAACTGCGCCAGGTTCTGCCTACAGTTGAGCGATATT 1258
||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 1185 CATGGATGAATACCTCTATGCAGTAGGGGGCAGAAATGAACTGTGCCAAGTTCTACCTACAGTTGAACGATACT 1258
Query 1259 GCCCCAAGAAGAACAAATGGACTTTTGTTCAGTCCTTTGACAGATCCCTTTCATGCCATGCTGGATATGTGGCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1259 GCCCCAAGAAGAACAAATGGACTTTTGTGCAGTCCTTTGACAGATCCCTCTCGTGTCACGCTGGATATGTGGCT 1332
Query 1333 GATGGTCTTCTTTGGATATCAGGTAG-------AACATACCTCA-TGTTGGATTTATCAAAACACACTTTCATT 1398
||||||||||||||||||||||||.| ||| |||.|| .| |||||.||||.|| |
Sbjct 1333 GATGGTCTTCTTTGGATATCAGGTGGGGTGACAAAC--ACCGCACAG-------TATCAGAACAGAC------T 1391
Query 1399 G-TGGTATAT------------ATT------------------------------------------------- 1410
| |||||||| |.|
Sbjct 1392 GATGGTATATGAACCTAACCAGAATAAGTGGATAAGTCGCAGCCCCATGCTACAGAGAAGAGTCTACCACTCCA 1465
Query 1411 -------------------------------------------------------------------------- 1410
Sbjct 1466 TGGCTGCTGTCCAAAGGAAGCTTTATGTGCTTGGAGGCAATGACCTGGATTACAATAATGACCGGATTCTCGTG 1539
Query 1411 -------------------------------------------------------------------------- 1410
Sbjct 1540 CGTCATATAGATTCTTACAACATTGACACTGATCAGTGGACGCGCTGTAATTTCAACTTGTTGACTGGCCAGAA 1613
Query 1411 -------------------------------------------------------------------------- 1410
Sbjct 1614 TGAATCTGGAGTCGCTGTCCATAATGGGAGAATATATTTAGTTGGTGGATATTCAATTTGGACAAATGAGCCTC 1687
Query 1411 -------------------------------------------------------------------------- 1410
Sbjct 1688 TGGCTTGTATCCAGGTATTGGATGTGAGCAGAGAAGGCAAAGAGGAAGTGTTCTACGGACCTACACTGCCCTTT 1761
Query 1411 -------------------------------------------------------------------------- 1410
Sbjct 1762 GCTTCCAACGGCATAGCGGCGTGCTTCCTTCCGGCTCCGTATTTCACATGCCCCAACCTGCAGACTCTGCAAGT 1835
Query 1411 ------------------------- 1410
Sbjct 1836 GCCTCACCACAGGATCGGCACTGTC 1860