Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471330
- Subject:
- NM_001323263.1
- Aligned Length:
- 1878
- Identities:
- 1190
- Gaps:
- 678
Alignment
Query 1 ATGCCGTCTGAACGCTGCCTCAGTATTCAAGAAATGCTGACAGGCCAGAGGCTCTGCCACTCCGAATCTCACAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TGACAGTGTCCTGGCAGCGCTGAATCAGCAGAGGAGTGATGGCATCCTCTGCGACATCACCCTGATTGCTGAGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AACAGAAATTCCATGCTCACAAGGCAGTCCTAGCAGCATGCAGT---GACTATTTCCGGGCAATGTTCAGTCTT 219
||| .|| || ||||||||||||||||
Sbjct 1 -------------------------------------ATG-GGTATAGA---------GGCAATGTTCAGTCTT 27
Query 220 TGTATGGTGGAAAGTGGAGCTGATGAGGTTAATTTGCACGGTGTGACCAGCCTTGGCTTAAAGCAGGCTCTGGA 293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 28 TGTATGGTGGAAAGTGGAGCTGATGAGGTTAATTTGCACGGTGTGACCAGCCTTGGCTTAAAGCAGGCTCTGGA 101
Query 294 GTTTGCATACACAGGACAGATTTTGCTGGAGCCAGGTGTGATCCAGGATGTGCTAGCAGCGGGCAGTCACCTAC 367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102 GTTTGCATACACAGGACAGATTTTGCTGGAGCCAGGTGTGATCCAGGATGTGCTAGCAGCGGGCAGTCACCTAC 175
Query 368 AGCTGTTGGAGCTTCTCAATTTATGCTCCCACTATCTCATCCAGGAATTAAATAGCTTTAATTACTTGGATCTG 441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 176 AGCTGTTGGAGCTTCTCAATTTATGCTCCCACTATCTCATCCAGGAATTAAATAGCTTTAATTACTTGGATCTG 249
Query 442 TACAGACTTGCTGACCTCTTTAACCTCACTTTGTTGGAGAAGGCAGTGATCGATTTCTTAGTGAAACATCTCTC 515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 250 TACAGACTTGCTGACCTCTTTAACCTCACTTTGTTGGAGAAGGCAGTGATCGATTTCTTAGTGAAACATCTCTC 323
Query 516 TGAACTCCTGAAGAGCCGCCCAGAAGAAGTTCTAACGCTTCCCTATTGCCTGCTTCAGGAGGTGCTGAAGAGCG 589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 324 TGAACTCCTGAAGAGCCGCCCAGAAGAAGTTCTAACGCTTCCCTATTGCCTGCTTCAGGAGGTGCTGAAGAGCG 397
Query 590 ACCGCCTGACCTCCCTGAGTGAAGAGCAGATCTGGCAGCTAGCTGTGAGGTGGTTGGAACACAACTGCCACTAC 663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 398 ACCGCCTGACCTCCCTGAGTGAAGAGCAGATCTGGCAGCTAGCTGTGAGGTGGTTGGAACACAACTGCCACTAC 471
Query 664 CAGTACATGGACGAGCTCCTGCAATACATCCGCTTTGGCCTAATGGATGTGGATACTCTCCATACAGTTGCCCT 737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 472 CAGTACATGGACGAGCTCCTGCAATACATCCGCTTTGGCCTAATGGATGTGGATACTCTCCATACAGTTGCCCT 545
Query 738 GTCCCACCCCCTTGTCCAAGCAAGTGAGACTGCAACAGCCCTTGTCAACGAGGCCCTGGAATACCACCAGAGCA 811
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 546 GTCCCACCCCCTTGTCCAAGCAAGTGAGACTGCAACAGCCCTTGTCAACGAGGCCCTGGAATACCACCAGAGCA 619
Query 812 TCTATGCACAGCCTGTCTGGCAGACTCGCAGGACCAAACCACGATTCCAGTCAGACACTCTGTATATCATTGGT 885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 620 TCTATGCACAGCCTGTCTGGCAGACTCGCAGGACCAAACCACGATTCCAGTCAGACACTCTGTATATCATTGGT 693
Query 886 GGGAAAAAGCGCGAGGTCTGCAAGGTCAAGGAACTTCGGTACTTCAATCCTGTTGATCAGGAGAATGCTCTCAT 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 694 GGGAAAAAGCGCGAGGTCTGCAAGGTCAAGGAACTTCGGTACTTCAATCCTGTTGATCAGGAGAATGCTCTCAT 767
Query 960 AGCTGCCATTGCCAACTGGAGTGAGCTGGCTCCCATGCCTGTGGGAAGGAGCCACCATTGTGTGGCAGTCATGG 1033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 768 AGCTGCCATTGCCAACTGGAGTGAGCTGGCTCCCATGCCTGTGGGAAGGAGCCACCATTGTGTGGCAGTCATGG 841
Query 1034 GGGACTTCCTGTTTGTGGCAGGAGGGGAAGTTGAGCATGCCAGTGGCCGGACGTGTGCTGTGAGGACTGCCTGT 1107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 842 GGGACTTCCTGTTTGTGGCAGGAGGGGAAGTTGAGCATGCCAGTGGCCGGACGTGTGCTGTGAGGACTGCCTGT 915
Query 1108 CGCTATGACCCCCGCAGTAATTCCTGGGCAGAGATAGCACCCATGAAAAACTGCCGGGAGCATTTTGTGCTGGG 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 916 CGCTATGACCCCCGCAGTAATTCCTGGGCAGAGATAGCACCCATGAAAAACTGCCGGGAGCATTTTGTGCTGGG 989
Query 1182 TGCCATGGAGGAATACCTCTATGCAGTTGGGGGCAGAAATGAACTGCGCCAGGTTCTGCCTACAGTTGAGCGAT 1255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 990 TGCCATGGAGGAATACCTCTATGCAGTTGGGGGCAGAAATGAACTGCGCCAGGTTCTGCCTACAGTTGAGCGAT 1063
Query 1256 ATTGCCCCAAGAAGAACAAATGGACTTTTGTTCAGTCCTTTGACAGATCCCTTTCATGCCATGCTGGATATGTG 1329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1064 ATTGCCCCAAGAAGAACAAATGGACTTTTGTTCAGTCCTTTGACAGATCCCTTTCATGCCATGCTGGATATGTG 1137
Query 1330 GCTGATGGTCTTCTTTGGATATCAGGTAG---AAC--ATAC--CTCATGTTGGATTTATCAAAACACACTTTCA 1396
|||||||||||||||||||||||||||.| ||| |||| |.|| .|||||.||||..| |.|
Sbjct 1138 GCTGATGGTCTTCTTTGGATATCAGGTGGAGTAACTAATACGGCACA--------ATATCAGAACAGGC--TAA 1201
Query 1397 TTGTGGTATATATT------------------------------------------------------------ 1410
|.||| |||.
Sbjct 1202 TGGTG-----TATGAACCTAACCAGAATAAGTGGATAAGCCGTAGCCCCATGCTGCAGAGAAGGGTCTACCATT 1270
Query 1411 -------------------------------------------------------------------------- 1410
Sbjct 1271 CCATGGCTGCTGTACAAAGGAAGCTTTATGTTCTTGGAGGCAATGACCTAGACTACAATAATGACCGGATCCTT 1344
Query 1411 -------------------------------------------------------------------------- 1410
Sbjct 1345 GTGCGCCATATAGATTCTTACAACATAGACACTGACCAGTGGACACGTTGTAATTTCAACCTGCTGACTGGCCA 1418
Query 1411 -------------------------------------------------------------------------- 1410
Sbjct 1419 AAATGAATCTGGAGTTGCTGTCCATAATGGGAGAATATATTTAGTTGGTGGATATTCAATTTGGACAAATGAGC 1492
Query 1411 -------------------------------------------------------------------------- 1410
Sbjct 1493 CTCTGGCTTGTATCCAGGTACTGGATGTAAGCAGAGAAGGCAAAGAAGAAGTATTCTATGGGCCTACACTCCCT 1566
Query 1411 -------------------------------------------------------------------------- 1410
Sbjct 1567 TTTGCTTCCAATGGAATAGCAGCATGCTTCCTTCCAGCTCCATATTTTACATGCCCTAACCTTCAAACTCTTCA 1640
Query 1411 ---------------------------- 1410
Sbjct 1641 AGTGCCTCATCACAGGATTGGCACCATC 1668
