Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471330
- Subject:
- XM_005266813.5
- Aligned Length:
- 1875
- Identities:
- 1179
- Gaps:
- 687
Alignment
Query 1 ATGCCGTCTGAACGCTGCCTCAGTATTCAAGAAATGCTGACAGGCCAGAGGCTCTGCCACTCCGAATCTCACAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TGACAGTGTCCTGGCAGCGCTGAATCAGCAGAGGAGTGATGGCATCCTCTGCGACATCACCCTGATTGCTGAGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AACAGAAATTCCATGCTCACAAGGCAGTCCTAGCAGCATGCAGTGACTATTTCCGGGCAATGTTCAGTCTTTGT 222
|||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------------------------------------------------ATGTTCAGTCTTTGT 15
Query 223 ATGGTGGAAAGTGGAGCTGATGAGGTTAATTTGCACGGTGTGACCAGCCTTGGCTTAAAGCAGGCTCTGGAGTT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16 ATGGTGGAAAGTGGAGCTGATGAGGTTAATTTGCACGGTGTGACCAGCCTTGGCTTAAAGCAGGCTCTGGAGTT 89
Query 297 TGCATACACAGGACAGATTTTGCTGGAGCCAGGTGTGATCCAGGATGTGCTAGCAGCGGGCAGTCACCTACAGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 90 TGCATACACAGGACAGATTTTGCTGGAGCCAGGTGTGATCCAGGATGTGCTAGCAGCGGGCAGTCACCTACAGC 163
Query 371 TGTTGGAGCTTCTCAATTTATGCTCCCACTATCTCATCCAGGAATTAAATAGCTTTAATTACTTGGATCTGTAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 164 TGTTGGAGCTTCTCAATTTATGCTCCCACTATCTCATCCAGGAATTAAATAGCTTTAATTACTTGGATCTGTAC 237
Query 445 AGACTTGCTGACCTCTTTAACCTCACTTTGTTGGAGAAGGCAGTGATCGATTTCTTAGTGAAACATCTCTCTGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 238 AGACTTGCTGACCTCTTTAACCTCACTTTGTTGGAGAAGGCAGTGATCGATTTCTTAGTGAAACATCTCTCTGA 311
Query 519 ACTCCTGAAGAGCCGCCCAGAAGAAGTTCTAACGCTTCCCTATTGCCTGCTTCAGGAGGTGCTGAAGAGCGACC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 312 ACTCCTGAAGAGCCGCCCAGAAGAAGTTCTAACGCTTCCCTATTGCCTGCTTCAGGAGGTGCTGAAGAGCGACC 385
Query 593 GCCTGACCTCCCTGAGTGAAGAGCAGATCTGGCAGCTAGCTGTGAGGTGGTTGGAACACAACTGCCACTACCAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 386 GCCTGACCTCCCTGAGTGAAGAGCAGATCTGGCAGCTAGCTGTGAGGTGGTTGGAACACAACTGCCACTACCAG 459
Query 667 TACATGGACGAGCTCCTGCAATACATCCGCTTTGGCCTAATGGATGTGGATACTCTCCATACAGTTGCCCTGTC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 460 TACATGGACGAGCTCCTGCAATACATCCGCTTTGGCCTAATGGATGTGGATACTCTCCATACAGTTGCCCTGTC 533
Query 741 CCACCCCCTTGTCCAAGCAAGTGAGACTGCAACAGCCCTTGTCAACGAGGCCCTGGAATACCACCAGAGCATCT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 534 CCACCCCCTTGTCCAAGCAAGTGAGACTGCAACAGCCCTTGTCAACGAGGCCCTGGAATACCACCAGAGCATCT 607
Query 815 ATGCACAGCCTGTCTGGCAGACTCGCAGGACCAAACCACGATTCCAGTCAGACACTCTGTATATCATTGGTGGG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 608 ATGCACAGCCTGTCTGGCAGACTCGCAGGACCAAACCACGATTCCAGTCAGACACTCTGTATATCATTGGTGGG 681
Query 889 AAAAAGCGCGAGGTCTGCAAGGTCAAGGAACTTCGGTACTTCAATCCTGTTGATCAGGAGAATGCTCTCATAGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 682 AAAAAGCGCGAGGTCTGCAAGGTCAAGGAACTTCGGTACTTCAATCCTGTTGATCAGGAGAATGCTCTCATAGC 755
Query 963 TGCCATTGCCAACTGGAGTGAGCTGGCTCCCATGCCTGTGGGAAGGAGCCACCATTGTGTGGCAGTCATGGGGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 756 TGCCATTGCCAACTGGAGTGAGCTGGCTCCCATGCCTGTGGGAAGGAGCCACCATTGTGTGGCAGTCATGGGGG 829
Query 1037 ACTTCCTGTTTGTGGCAGGAGGGGAAGTTGAGCATGCCAGTGGCCGGACGTGTGCTGTGAGGACTGCCTGTCGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 830 ACTTCCTGTTTGTGGCAGGAGGGGAAGTTGAGCATGCCAGTGGCCGGACGTGTGCTGTGAGGACTGCCTGTCGC 903
Query 1111 TATGACCCCCGCAGTAATTCCTGGGCAGAGATAGCACCCATGAAAAACTGCCGGGAGCATTTTGTGCTGGGTGC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 904 TATGACCCCCGCAGTAATTCCTGGGCAGAGATAGCACCCATGAAAAACTGCCGGGAGCATTTTGTGCTGGGTGC 977
Query 1185 CATGGAGGAATACCTCTATGCAGTTGGGGGCAGAAATGAACTGCGCCAGGTTCTGCCTACAGTTGAGCGATATT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 978 CATGGAGGAATACCTCTATGCAGTTGGGGGCAGAAATGAACTGCGCCAGGTTCTGCCTACAGTTGAGCGATATT 1051
Query 1259 GCCCCAAGAAGAACAAATGGACTTTTGTTCAGTCCTTTGACAGATCCCTTTCATGCCATGCTGGATATGTGGCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1052 GCCCCAAGAAGAACAAATGGACTTTTGTTCAGTCCTTTGACAGATCCCTTTCATGCCATGCTGGATATGTGGCT 1125
Query 1333 GATGGTCTTCTTTGGATATCAGGTAG---AAC--ATAC--CTCATGTTGGATTTATCAAAACACACTTTCATTG 1399
||||||||||||||||||||||||.| ||| |||| |.|| .|||||.||||..| |.||.|
Sbjct 1126 GATGGTCTTCTTTGGATATCAGGTGGAGTAACTAATACGGCACA--------ATATCAGAACAGGC--TAATGG 1189
Query 1400 TGGTATATATT--------------------------------------------------------------- 1410
|| |||.
Sbjct 1190 TG-----TATGAACCTAACCAGAATAAGTGGATAAGCCGTAGCCCCATGCTGCAGAGAAGGGTCTACCATTCCA 1258
Query 1411 -------------------------------------------------------------------------- 1410
Sbjct 1259 TGGCTGCTGTACAAAGGAAGCTTTATGTTCTTGGAGGCAATGACCTAGACTACAATAATGACCGGATCCTTGTG 1332
Query 1411 -------------------------------------------------------------------------- 1410
Sbjct 1333 CGCCATATAGATTCTTACAACATAGACACTGACCAGTGGACACGTTGTAATTTCAACCTGCTGACTGGCCAAAA 1406
Query 1411 -------------------------------------------------------------------------- 1410
Sbjct 1407 TGAATCTGGAGTTGCTGTCCATAATGGGAGAATATATTTAGTTGGTGGATATTCAATTTGGACAAATGAGCCTC 1480
Query 1411 -------------------------------------------------------------------------- 1410
Sbjct 1481 TGGCTTGTATCCAGGTACTGGATGTAAGCAGAGAAGGCAAAGAAGAAGTATTCTATGGGCCTACACTCCCTTTT 1554
Query 1411 -------------------------------------------------------------------------- 1410
Sbjct 1555 GCTTCCAATGGAATAGCAGCATGCTTCCTTCCAGCTCCATATTTTACATGCCCTAACCTTCAAACTCTTCAAGT 1628
Query 1411 ------------------------- 1410
Sbjct 1629 GCCTCATCACAGGATTGGCACCATC 1653
