Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471340
• Subject: NM_007838.2
• Aligned Length: 1369
• Identities: 1167
• Gaps: 47

Alignment

Query    1  ATGGGGTACTTCCGGTGTGCAGGTGCTGGGTCCTTCGGCAGGAGGAGGAAGATGGAGCCCAGCACCGCGGCCCG  74
                                                         |.|||||||||.|||.||..|||.|.|||
Sbjct    1  ---------------------------------------------ATGAAGATGGATCCCCGCCTCGCCGTCCG  29

Query   75  GGCTTGGGCCCTCTTTTGGTTGCTGCTGCCCTTGCTTGGC-GCGGTTTGCGCCAGCGGACCCCGCACCTTAGTG  147
            .||.|||.||||||...||.||||||||.||.||||.||| || ||.|||||||||||.|||||||||.|.|||
Sbjct   30  CGCCTGGCCCCTCTGCGGGCTGCTGCTGGCCGTGCTCGGCTGC-GTCTGCGCCAGCGGCCCCCGCACCCTCGTG  102

Query  148  CTGCTGGACAACCTCAACGTGCGGGAGACTCATTCGCTTTTCTTCCGGAGCCTGAAGGACCGGGGCTTTGAGCT  221
            ||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  103  CTGCTGGACAACCTGAACGTGCGGGACACGCACTCGCTGTTCTTCCGCAGCCTGAAGGACCGGGGCTTTGAGCT  176

Query  222  CACATTCAAGACCGCTGATGACCCCAGCCTGTCTCTCATAAAGTATGGGGAATTCCTCTATGACAATCTCATCA  295
            |||.|||||||||||.||||||||||||.||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct  177  CACCTTCAAGACCGCAGATGACCCCAGCTTGTCCCTCATTAAGTACGGGGAGTTCCTCTATGACAACCTTATCA  250

Query  296  TTTTCTCCCCTTCGGTAGAAGATTTTGGAGGCAACATCAACGTGGAGACCATCAGTGCCTTTATTGACGGTGGA  369
            |.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct  251  TCTTTTCCCCGTCGGTGGAAGATTTTGGAGGCAACATCAACGTGGAGACCATCAGTGCCTTCATTGATGGTGGC  324

Query  370  GGCAGTGTGCTGGTAGCTGCCAGCTCCGACATTGGTGACCCTCTTCGAGAGCTGGGCAGTGAGTGCGGGATTGA  443
            |||||.||..||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  325  GGCAGCGTTTTGGTGGCTGCCAGCTCTGATATTGGTGACCCTCTTCGGGAGCTGGGCAGTGAGTGTGGGATTGA  398

Query  444  GTTTGACGAGGAGAAAACGGCTGTCATTGACCATCACAACTATGACATCTCAGACCTTGGCCAGCATACGCTCA  517
            .|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||..|.||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct  399  ATTTGATGAAGAGAAAACAGCTGTCATCGACCACCACAACTATGATGTTTCTGACCTTGGCCAGCACACACTCA  472

Query  518  TCGTGGCTGACACTGAGAACCTGCTGAAGGCCCCAACCATCGTTGGGAAATCATCTCTAAATCCCATCCTCTTT  591
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.
Sbjct  473  TTGTGGCTGACACTGAGAACCTGCTGAAGGCCCCGACCATTGTTGGCAAGTCATCTCTGAACCCCATTCTCTTC  546

Query  592  CGAGGTGTTGGGATGGTGGCCGATCCTGATAACCCTTTGGTGCTGGACATCCTGACGGGCTCTTCCACCTCTTA  665
            |||||.|||||.||||||||.||.||.||.||.||.|||||..||||||||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct  547  CGAGGAGTTGGAATGGTGGCAGACCCGGACAATCCCTTGGTTTTGGACATCCTAACAGGCTCTTCAACCTCTTA  620

Query  666  CTCCTTCTTCCCGGACAAGCCTATCACCCAGTATCCACATGCGGTGGGGAAGAACACCCTCCTCATTGCTGGGC  739
            ||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||.||||||.||.||.|||||.||||
Sbjct  621  CTCCTTCTTCCCAGATAAACCAATCACCCAGTACCCCCATGCGGTGGGGAGGAACACTCTGCTGATTGCCGGGC  694

Query  740  TCCAGGCCAGGAACAATGCCCGCGTCATCTTCAGCGGCTCCCTCGACTTCTTCAGCGACTCCTTCTTCAACTCA  813
            ||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||..|||||||||||||.
Sbjct  695  TCCAGGCCAGGAACAACGCCCGGGTCATCTTCAGTGGCTCTCTGGATTTCTTCAGCGATGCCTTCTTCAACTCG  768

Query  814  GCAGTGCAGAAGGCGGCGCCCGGCTCCCAGAGGTATTCCCAGACAGGCAACTATGAACTAGCTGTGGCCCTCTC  887
            ||||||||||||||..|.|||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  769  GCAGTGCAGAAGGCCACACCCGGTGCGCAGAGGTATTCTCAGACAGGCAACTATGAACTAGCTGTGGCCCTCTC  842

Query  888  CCGCTGGGTGTTCAAGGAGGAGGGTGTCCTCCGTGTGGGGCCTGTGTCCCATCATCGGGTGGGTGAGACAGCCC  961
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||..||.|
Sbjct  843  ACGCTGGGTGTTCAAGGAGGAGGGTGTCCTTCGAGTAGGGCCTGTGTCCCATCACCGGGTGGGCGAGATGGCTC  916

Query  962  CACCCAATGCCTACACTGTCACTGACCTAGTGGAGTATAGCATCGTGATCCAGCAGCTCTCAAATGGCAAATGG  1035
            ||||||||||||||||||||||.|||.|.|||||||||||||||.|.||..|.||||||||.||||||||.|||
Sbjct  917  CACCCAATGCCTACACTGTCACCGACTTGGTGGAGTATAGCATCATCATAGAACAGCTCTCCAATGGCAAGTGG  990

Query 1036  GTCCCCTTTGATGGCGATGACATTCAGCTGGAGTTTGTCCGCATTGATCCTTTTGTGAGGACCTTCCTGAAGAA  1109
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||.
Sbjct  991  GTCCCCTTTGATGGTGATGACATTCAGCTGGAGTTCGTGCGCATCGACCCCTTCGTGAGGACCTTCCTGAAGAG  1064

Query 1110  GAAAGGTGGCAAATACAGTGTTCAGTTCAAGTTGCCCGACGTGTATGGTGTATTCCAGTTTAAAGTGGATTACA  1183
            ||||||||||||.||||||||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1065  GAAAGGTGGCAAGTACAGTGTCCAGTTCAAGCTGCCTGACGTGTATGGTGTATTCCAGTTTAAAGTGGATTACA  1138

Query 1184  ACCGGCTAGGCTACACACACCTGTACTCTTCCACTCAGGTATCCGTGCGGCCACTCCAGCACACGCAGTATGAG  1257
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139  ACCGGCTAGGCTACACCCACCTGTACTCTTCCACCCAGGTGTCAGTGAGGCCACTCCAGCACACGCAGTATGAG  1212

Query 1258  CGCTTCATCCCCTCGGCCTACCCCTACTACGCCAGCGCCTTCTCCATGATGCTGGGGCTCTTCATCTTCAGCAT  1331
            ||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||...||||||||||||||||||||
Sbjct 1213  CGCTTCATCCCCTCGGCCTATCCCTACTATGCCAGTGCCTTCTCCATGATGGCCGGGCTCTTCATCTTCAGCAT  1286

Query 1332  CGTCTTCTTGCACATGAAGGAGAAGGAGAAGTCCGAC  1368
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1287  CGTCTTCTTGCACATGAAGGAGAAGGAGAAGTCTGAC  1323