Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471342
- Subject:
- NM_010941.3
- Aligned Length:
- 1122
- Identities:
- 923
- Gaps:
- 39
Alignment
Query 1 ATGGAACCAGCAGT---TAGCGAGCCAATGAGAGACCAAGTCGCACGGACTCATTTGACAGAGGACACTCCCAA 71
|||||||.|||.|| |.|.||..|||.|.|||.|||.|||.||.|.||.|||||||||.|.||||.|.||||
Sbjct 1 ATGGAACAAGCTGTTCATGGTGAATCAAAGCGAGGCCAGGTCACAGGAACACATTTGACAAATGACATTTCCAA 74
Query 72 AGTGAATGCTGACATAGAAAAGGTTAACCAGAATCAGGCCAAGAGATGCACAGTGATCGGGGGCTCTGGATTCC 145
| ||.||||..|||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 75 A------------------------------------GCTAAGAAGTGCACAGTGATTGGAGGCTCTGGGTTCC 112
Query 146 TGGGGCAGCACATGGTGGAGCAGTTGCTGGCAAGAGGATATGCTGTCAATGTATTTGATATCCAGCAAGGGTTT 219
||||||||||||||||||||||||||||||...||||.|||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 113 TGGGGCAGCACATGGTGGAGCAGTTGCTGGAGCGAGGCTATACTGTCAATGTATTTGATATCCACCAAGGCTTT 186
Query 220 GATAATCCCCAGGTGCGGTTCTTTCTGGGTGACCTCTGCAGCCGACAGGATCTGTACCCAGCTCTGAAAGGTGT 293
|||||.||||.|||||.|||||||.|.||.|||||.||||.||.||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 187 GATAACCCCCGGGTGCAGTTCTTTATAGGCGACCTGTGCAACCAACAGGACCTGTACCCAGCTCTCAAAGGTGT 260
Query 294 AAACACAGTTTTCCACTGTGCGTCACCCCCACCATCCAGTAACAACAAGGAGCTCTTTTATAGAGTGAATTACA 367
||.|||||||||||||||.|||||.||.||.||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 261 AAGCACAGTTTTCCACTGCGCGTCCCCTCCGCCGTACAGTAACAACAAGGAGCTCTTTTATAGAGTGAATTTCA 334
Query 368 TTGGCACCAAGAATGTCATTGAAACTTGCAAAGAGGCTGGGGTTCAGAAACTCATTTTAACCAGCAGTGCCAGT 441
||||||||||||.||||||||||||.||||.||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 335 TTGGCACCAAGACTGTCATTGAAACCTGCAGAGAGGCCGGAGTTCAGAAACTCATTTTAACCAGCAGTGCCAGT 408
Query 442 GTCATCTTTGAGGGCGTCGATATCAAGAATGGAACTGAAGACCTTCCCTATGCCATGAAACCCATTGACTACTA 515
||..||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 409 GTTGTCTTTGAGGGTGTTGACATAAAAAATGGAACTGAAGACCTCCCTTACGCCATGAAGCCTATTGACTATTA 482
Query 516 CACAGAGACTAAGATCTTACAGGAGAGGGCAGTTCTGGGCGCCAACGATCCTGAGAAGAATTTCTTAACCACAG 589
|||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||..||||||||.|||.||||||||||.||||||.|||
Sbjct 483 CACAGAGACCAAGATCTTGCAGGAGAGAGCAGTACTGGATGCCAACGACCCTAAGAAGAATTTTTTAACCGCAG 556
Query 590 CCATCCGCCCTCATGGCATTTTCGGCCCAAGGGACCCGCAGTTGGTACCCATCCTCATCGAGGCAGCCAGGAAC 663
||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.
Sbjct 557 CCATTCGTCCTCATGGCATTTTCGGCCCAAGGGACCCCCAGTTGGTCCCAATCCTAATTGATGCAGCTAGAAAG 630
Query 664 GGCAAGATGAAGTTCGTGATTGGAAATGGGAAGAACTTGGTGGACTTCACCTTTGTGGAGAACGTGGTCCATGG 737
|||||.|||||||||.||||||||||||||.|.|||.||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 631 GGCAAAATGAAGTTCATGATTGGAAATGGGGAAAACCTGGTGGACTTCACCTTCGTGGAGAATGTGGTTCATGG 704
Query 738 ACACATCCTGGCGGCAGAGCAGCTCTCCCGAGACTCGACACTGGGTGGGAAGGCATTTCACATCACCAATGATG 811
|||||||.|.||.||.|||||.|||||||.|||..|..|.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 705 ACACATCTTAGCCGCTGAGCACCTCTCCCAAGATGCAGCTCTAGGTGGAAAGGCATTTCACATCACCAACGATG 778
Query 812 AGCCCATCCCTTTCTGGACATTCCTGTCTCGCATCCTGACAGGCCTCAATTATGAGGCCCCCAAGTACCACATC 885
|.||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 779 AACCAATCCCTTTCTGGACGTTCCTGTCCCGCATTCTGACAGGCCTCAATTATGAGGCCCCTAAGTACCACATC 852
Query 886 CCCTACTGGGTGGCCTACTACCTGGCCCTCCTGCTATCCCTGCTGGTGATGGTGATCAGTCCTGTCATCCAGCT 959
|||||||||.|||||||.|||||.||..||||||||||.||.||||||||||||.||||.|||.|||||||..|
Sbjct 853 CCCTACTGGATGGCCTATTACCTTGCTTTCCTGCTATCTCTACTGGTGATGGTGGTCAGCCCTCTCATCCAAAT 926
Query 960 GCAGCCCACCTTCACACCCATGCGGGTCGCACTGGCTGGCACATTCCACTACTACAGCTGCGAGAGAGCCAAAA 1033
.|||||.|||||.|||||.||.||.||.|||.|||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|.||||||||
Sbjct 927 CCAGCCAACCTTTACACCAATTCGAGTGGCATTGGCTGGAACATTCCACTATTACAGTTGTGAAAAAGCCAAAA 1000
Query 1034 AGGCCATGGGCTACCAGCCACTAGTGACCATGGATGATGCTATGGAGAGGACCGTGCAGAGCTTTCGCCACCTG 1107
||..|.|.||.||||.||||||.||.|||||||||||.|||.||||.|||||.||||||||.||.|.|||||||
Sbjct 1001 AGCTCTTTGGGTACCGGCCACTGGTCACCATGGATGAAGCTGTGGAAAGGACTGTGCAGAGTTTCCACCACCTG 1074
Query 1108 CGGAGGGTCAAG 1119
||||.||.||||
Sbjct 1075 CGGAAGGACAAG 1086