Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471350
• Subject: NM_001113564.1
• Aligned Length: 1206
• Identities: 1080
• Gaps: 48

Alignment

Query    1  ATGCCTGGGCACTTACAGGAAGGCTTCGGCTGCGTGGTCACCAACCGATTCGACCAGTTATTTGACGACGAATC  74
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTGGGCACCTACAGGAAGGCTTCGGCTGCGTGGTCACCAACCGATTCGACCAGCTATTTGACGACGAATC  74

Query   75  GGACCCCTTCGAGGTGCTGAAGGCAGCAGAGAACAAGAAAAAAGAAGCCGGCGGGGGCGGCGTTGGGGGCCCTG  148
            ||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  GGACCCTTTCGAGGTACTGAAGGCAGCAGAGAACAAGAAAAAAGAAGCCGGCGGGGGCGGCGTTGGGGGCCCCG  148

Query  149  GGGCCAAGAGCGCAGCTCAGGCCGCGGCCCAGACCAACTCCAACGCGGCAGGCAAACAGCTGCGCAAGGAGTCC  222
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||.||.||||||
Sbjct  149  GGGCCAAGAGCGCGGCTCAGGCCGCGGCCCAGACCAACTCCAACGCGGCGGGCAAACAGTTGCGTAAAGAGTCC  222

Query  223  CAGAAAGACCGCAAGAACCCGCTGCCCCCCAGCGTTGGCGTGGTTGACAAGAAAGAGGAGACGCAGCCGCCCGT  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..|||||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  223  CAGAAAGACCGCAAGAACCCGCTGCCCCCCAGCGTCGGCGTGGCCGACAAAAAGGAGGAGACGCAGCCGCCGGT  296

Query  297  GGCGCTTAAGAAAGAAGGAATAAGACGAGTTGGAAGAAGACCTGATCAACAACTTCAGGGTGAAGGGAAAATAA  370
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||.|||
Sbjct  297  GGCGCTTAAGAAAGAAGGAATAAGGCGAGTTGGAAGAAGACCCGATCAACAACTACAGGGTGATGGGAAACTAA  370

Query  371  TTGATAGAAGACCAGAAAGGCGACCACCTCGTGAACGAAGATTCGAAAAGCCACTTGAAGAAAAGGGTGAAGGA  444
            |||||||.|||.||||||||||||||||.||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  371  TTGATAGGAGAGCAGAAAGGCGACCACCCCGTGAAAGAAGATTTGAAAAGCCACTTGAAGAAAAAGGTGAAGGA  444

Query  445  GGCGAATTTTCAGTTGATAGACCGATTATTGACCGACCTATTCGAGGTCGTGGTGGTCTTGGAAGAGGTCGAGG  518
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  GGTGAATTTTCAGTTGATAGACCGATTATCGAACGGCCTATCCGAGGCCGAGGTGGTCTTGGAAGGGGTCGAGG  518

Query  519  GGGCCGTGGACGTGGAATGGGCCGAGGAGATGGATTTGATTCTCGTGGCAAACGTGAATTTGATAGGCATAGTG  592
            .||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGCCGTGGACGTGGAATGGGCCGAGGCGATGGATTTGATTCTCGTGGCAAGCGTGAATTTGATAGGCATAGTG  592

Query  593  GAAGTGATAGATCTGGCCTGAAGCACGAGGACAAACGTGGAGGTAGCGGATCTCACAACTGGGGAACTGTCAAA  666
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAAGTGATAGATCTGGCCTGAAGCATGAGGACAAACGCGGAGGTAGCGGCTCTCACAACTGGGGAACTGTCAAA  666

Query  667  GACGAATTAAC---------------------------------------------TGACTTGGATCAATCAAA  695
            ||.||||||||                                             |||.||||||||||||||
Sbjct  667  GATGAATTAACAGAGTCACCCAAATACATTCAGAAACAAATATCTTATAATTGCAGTGATTTGGATCAATCAAA  740

Query  696  TGTGACTGAGGAAACACCTGAAGGTGAAGAACATCATCCAGTGGCAGACACTGAAAATAAGGAGAATGAAGTTG  769
            |||||||||||||||||||||||||||||   |.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  741  TGTGACTGAGGAAACACCTGAAGGTGAAG---AGCACCCTGTGGCAGATACTGAAAATAAGGAGAACGAAGTTG  811

Query  770  AAGAGGTAAAAGAGGAGGGTCCAAAAGAGATGACTTTGGATGAGTGGAAGGCTATTCAAAATAAGGACCGGGCA  843
            |||||||.||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  812  AAGAGGTTAAGGAAGAGGGTCCAAAAGAGATGACTCTGGATGAGTGGAAAGCTATTCAAAATAAAGACCGAGCA  885

Query  844  AAAGTAGAATTTAATATCCGAAAACCAAATGAAGGTGCTGATGGGCAGTGGAAGAAGGGATTTGTTCTTCATAA  917
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  886  AAAGTAGAATTTAATATCCGAAAACCAAATGAAGGCGCCGATGGACAATGGAAAAAGGGATTTGTTCTGCATAA  959

Query  918  ATCAAAGAGTGAAGAGGCTCATGCTGAAGATTCGGTTATGGACCATCATTTCCGGAAGCCAGCAAATGATATAA  991
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  ATCAAAAAGTGAAGAGGCTCATGCTGAAGATTCAGTTATGGACCATCATTTCCGGAAGCCAGCAAATGATATAA  1033

Query  992  CGTCTCAGCTGGAGATCAATTTTGGAGACCTTGGCCGCCCAGGACGTGGCGGCAGGGGAGGACGAGGTGGACGT  1065
            |.|||||.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 1034  CATCTCAACTGGAGATCAATTTTGGAGACTTAGGCCGCCCAGGACGTGGTGGCAGAGGAGGACGTGGTGGGCGT  1107

Query 1066  GGGCGTGGTGGGCGCCCAAACCGTGGCAGCAGGACCGACAAGTCAAGTGCTTCTGCTCCTGATGTGGATGACCC  1139
            |||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1108  GGGCGTGGTGGACGTCCAAACCGTGGCAGCAGGACTGATAAGTCAAGTGCTTCTGCTCCTGATGTAGATGACCC  1181

Query 1140  AGAGGCATTCCCAGCTCTGGCT  1161
            ||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1182  AGAGGCCTTCCCAGCTCTGGCC  1203