Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471365
- Subject:
- XM_011248927.2
- Aligned Length:
- 1509
- Identities:
- 1309
- Gaps:
- 60
Alignment
Query 1 ------------------------------------------------------------ATGCAGGTGATTGT 14
.|.|||||||||||
Sbjct 1 ATGTGCGCAGTGTTTAAGGACCAGGCCTTTCTTCCCAGGGTGTGTCTCCTGCCCATTCTGCTTCAGGTGATTGT 74
Query 15 GATGTCAGCTACGATGGATGTGGACCTGTTCTCTCAGTATTTCAATGGCGCCCCCGTCCTCTACCTAGAGGGTC 88
||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||.|.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 75 GATGTCAGCTACCATGGATGTCGACCTGTTTTCTCAGTACTTCAATAGAGCCCCTGTCCTTTACCTTGAGGGTC 148
Query 89 GGCAGCATCCGATCCAGGTGTTTTACACCAAACAGCCTCAGAATGATTACCTGCACGCCGCGCTTGTCTCCGTC 162
||||||||||.||||||.|.||.||.|||||||||||||||.|.|||||||||||.||.||.||||||||.|||
Sbjct 149 GGCAGCATCCAATCCAGATCTTCTATACCAAACAGCCTCAGCAGGATTACCTGCATGCAGCCCTTGTCTCAGTC 222
Query 163 TTCCAGATCCACCAGGAAGCCCCTTCTTCACAGGACATCCTGGTGTTCCTCACTGGGCAGGAGGAGATCGAAGC 236
||||||||||||||||||||.|||.||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 223 TTCCAGATCCACCAGGAAGCTCCTGCTTCTCAAGACATCCTGGTGTTCCTCACTGGTCAGGAGGAGATCGAAGC 296
Query 237 CATGAGCAAGACGTGCCGAGACATTGCAAAGCACCTCCCAGACGGCTGCCCTGCGATGCTGGTCCTTCCTCTGT 310
.|||||||||||.|||.|||||||.||||.||||||||||||.|||||||||.|.|||||.|||||||||||||
Sbjct 297 AATGAGCAAGACCTGCAGAGACATCGCAAGGCACCTCCCAGATGGCTGCCCTTCAATGCTCGTCCTTCCTCTGT 370
Query 311 ACGCCTCCCTGCCCTATGCACAGCAGCTCCGAGTCTTCCAAGGGGCCCCAAAGGGCTATCGCAAAGTGATCATT 384
|||||||||||||||||.|.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACGCCTCCCTGCCCTATTCGCAGCAGCTTCGAGTCTTTCAAGGGGCCCCAAAGGGCTATCGCAAAGTGATCATT 444
Query 385 TCAACCAACATCGCTGAAACCTCCATAACCATTACAGGAATAAAATATGTAGTTGACACGGGCATGGTTAAAGC 458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCAACCAACATCGCTGAAACCTCCATAACCATTACAGGAATAAAATATGTAGTTGACACGGGCATGGTTAAAGC 518
Query 459 AAAGAAGTATAACCCTGACAGTGGTCTTGAGGTGTTAGCAGTGCAGCGGGTATCGAAGACGCAGGCTTGGCAGC 532
|||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||.|||.|.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 519 AAAGAAGTATAACCCTGACAGTGGTCTTGAGGTACTAGCTGTACAGAGAGTATCAAAGACCCAGGCCTGGCAGC 592
Query 533 GCACAGGGAGGGCTGGCAGAGAGGACAGTGGCATCTGCTACCGGCTCTACACGGAGGACGAGTTTGAGAAGTTT 606
|||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 593 GCACAGGCAGGGCTGGGCGAGAGGACAGTGGCATCTGCTACCGACTCTACACTGAGGACGAGTTTGAGAAGTTC 666
Query 607 GATAAGATGACCGTGCCAGAGATCCAGAGGTGTAACCTGGCCAGTGTGATGCTTCAGCTTCTAGCAATGAAAGT 680
||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 667 GAGAAGATGACGGTGCCAGAGATCCAGAGGTGTAACCTGGCCAGTGTAATACTTCAGCTCCTAGCAATGAAAGT 740
Query 681 CCCAAATGTGCTCACCTTTGACTTCATGTCGAAGCCATCTCCAGATCACATTCAGGCGGCCATTGCCCAACTGG 754
||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.||||
Sbjct 741 CCCAAATGTGCTCACCTTTGACTTCATGTCCAAACCTTCTCCAGATCACATTGAGGCGGCCATTGCCCAGCTGG 814
Query 755 ACCTGTTAGGTGCTCTTGAACATAAGGATGACCAGCTTACCCTGACTCCAATGGGAAGAAAGATGGCAGCATTT 828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 815 ACCTGTTAGGTGCTCTTGAACATAAGGATGACCAGCTTACCCTGACTCCAATTGGAAGAAAGATGGCAGCATTC 888
Query 829 CCTTTAGAACCCAAATTTGCCAAAACCATCCTCATGTCCCCCAAATTCCACTGTACAGAGGAGATCCTGACCAT 902
||||||||.||||.||||||||||||.||||||.|||||.||||||||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 889 CCTTTAGAGCCCAGATTTGCCAAAACTATCCTCCTGTCCTCCAAATTCCACTGTACCGAAGAGATTCTGACCAT 962
Query 903 TGTCTCCCTGCTGTCTGTGGACAGCGTCCTCCACAACCCTCCTTCCCGGCGAGAGGAAGTGCAAGGGGTCCGCA 976
.|||||||||||.|||||||||||.|||||..|||||||||||.|||||.||||.||.|||||..|.|||||.|
Sbjct 963 AGTCTCCCTGCTATCTGTGGACAGTGTCCTTTACAACCCTCCTGCCCGGAGAGATGAGGTGCAGAGTGTCCGGA 1036
Query 977 AGAAGTTCATATCCAGCGAGGGGGATCACATGACCCTGCTCAATATCTATCGGACCTTCAAAAACCTAGGCGGA 1050
||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||.
Sbjct 1037 AGAAATTCATATCCAGTGAGGGGGATCACATCACCCTGCTCAATATCTATCGGACCTTCAAAAACATCGGTGGG 1110
Query 1051 AATAAGGATTGGTGCAAAGAGAATTTTGTCAACAGCAAGAATATGACGCTGGTAGCAGAAGTCAGAGCACAGCT 1124
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111 AATAAGGACTGGTGCAAAGAGAATTTTGTCAACAGCAAGAATATGCTGCTAGTAGCTGAAGTCAGAGCACAGCT 1184
Query 1125 GAGGGACATCTGCTTAAAGATGTCAATGCCAATCGCATCATCCCGAGGAGACGTGGAGAGTGTCCGCCGCTGCC 1198
|||.||.|||||||||||||||||||||||||||...|||||.|||||.|||.||||||||||||||||.|||.
Sbjct 1185 GAGAGAAATCTGCTTAAAGATGTCAATGCCAATCATGTCATCTCGAGGGGACATGGAGAGTGTCCGCCGTTGCA 1258
Query 1199 TGGCTCACAGCCTCTTCATGAGCACCGCCGAGCTTCAGCCAGATGGCACCTATGCCACCACGGACACCCACCAG 1272
||||||||||||||||.||||..||.||.||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1259 TGGCTCACAGCCTCTTTATGAATACTGCTGAACTCCAGACAGATGGCACCTATGCCACCACGGACACACATCAG 1332
Query 1273 CCAGTGGCCATCCACCCGTCGTCTGTCCTCTTCCACTGCAAGCCGGCCTGCGTCGTGTACACTGAGCTGCTCTA 1346
|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||...||||||||
Sbjct 1333 CCAGTGGCCATCCACCCATCATCTGTCCTCTTCCACTGCAAGCCTGCCTGCGTGGTCTACACTTCACTGCTCTA 1406
Query 1347 CACCAACAAGTGCTACATGCGGGACCTCTGCGTCATAGATGCACAGTGGCTGTACGAGGCTGCCCCTGAGTACT 1420
|||||||||.|||||||||||.||||||||.||..|.|||||..|||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1407 CACCAACAAATGCTACATGCGTGACCTCTGTGTGGTGGATGCCGAGTGGCTCTACGAGGCTGCCCCTGACTACT 1480
Query 1421 TTAGGAGGAAGCTGAGAACCGCCAGAAAC 1449
|.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1481 TCAGGAGGAAGCTGAGAACGGCCAGAAAC 1509