Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471410
• Subject: NM_001039371.2
• Aligned Length: 1641
• Identities: 1404
• Gaps: 45

Alignment

Query    1  ------------------------------------ATGGGCATCTACCAGATGTACTTGTGCTTCCTGCTGGC  38
                                                ||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGTGGAGGAGGCGTTCCAGGCGGTGGGCGAGATGGGCCTCTATCAGATGTACTTGTGCTTCCTGCTGGC  74

Query   39  CGTGCTGCTGCAGCTCTACGTGGCCACGGAGGCCATCCTCATTGCACTGGTTGGGGCCACGCCATCCTACCACT  112
            .||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||.||||.||.||.|||.|.|||||||
Sbjct   75  TGTGCTGCTGCAGCTTTATGTGGCCACAGAAGCCATCCTCATTGCACTGATTGGAGCTACACCAGCATACCACT  148

Query  113  GGGACCTGGCAGAGCTCCTGCCAAATCAGAGCCACGGTAACCAGTCAGCTGGTGAAGACCAGGCCTTTGGGGAC  186
            |||||.||||.||.||||||||.||.|||||||||.|.||||||.|....||..|||.|||||||||.||||||
Sbjct  149  GGGACATGGCCGATCTCCTGCCCAACCAGAGCCACAGCAACCAGACTTTGGGCAAAGGCCAGGCCTTCGGGGAC  222

Query  187  TGGCTCCTGACAGCCAACGGCAGTGAGATCCATAAGCACGTGCATTTCAGCAGCAGCTTCACCTCCATCGCCTC  260
            |||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.||.|||||
Sbjct  223  TGGCTGCTGACCGCCAATGGCAGTGAGATCCATAAGCACGTGCATTTCAGCAACAGTTTCACCTCTATTGCCTC  296

Query  261  GGAGTGGTTTTTAATTGCCAACAGATCCTACAAAGTCAGTGCAGCAAGCTCTTTTTTCTTCAGTGGTGTATTTG  334
            .|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||.||.|||||.|.|||||||||||||||.||||
Sbjct  297  TGAGTGGTTTTTAATTGCCAACCGATCTTACAAAGTCAGCGCGGCCAGCTCCTCTTTCTTCAGTGGTGTGTTTG  370

Query  335  TTGGAGTTATCTCTTTTGGTCAGCTTTCAGATCGCTTCGGAAGGAAAAAAGTCTATCTCACAGGTTTTGCTCTT  408
            ||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTGGTGTTATCTCCTTTGGTCAGCTTTCAGATCGATTTGGAAGGAGAAAAGTCTATCTCACAGGTTTTGCTCTT  444

Query  409  GACATCTTATTTGCAATTGCAAATGGATTTTCCCCCTCATATGAGTTCTTTGCAGTAACTCGCTTCCTGGTGGG  482
            ||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  445  GACATCTTATTTGCTGTCGCAAATGGATTTTCCCCCTCATATGAATTCTTTGCAGTAACTCGCTTCTTGGTGGG  518

Query  483  CATGATGAATGGAGGGATGTCGCTGGTGGCCTTTGTCTTGCTTAATGAGTGTGTGGGCACCGCCTACTGGGCAC  556
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATGATGAATGGAGGGATGTCCCTGGTGGCCTTTGTCTTGCTAAATGAGTGCGTGGGCACCGCCTACTGGGCAC  592

Query  557  TTGCAGGATCGATTGGCGGCCTCTTCTTTGCAGTTGGCATTGCCCAATATGCCCTGTTAGGATACTTCATCCGC  630
            ||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct  593  TTGCAGGATCGATTGGTGGTCTCTTCTTCGCTGTTGGCATCGCGCAGTATGCCCTATTAGGGTACTTCATCCGC  666

Query  631  TCCTGGAGGACCCTAGCCATTCTGGTTAACCTGCAGGGAACGGTGGTCTTTCTCTTATCTTTATTCATTCCTGA  704
            |||||||||||||||||..|||||||.|||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCTGGAGGACCCTAGCTGTTCTGGTCAACCTTCAGGGAACATTGGTCTTTCTCTTATCTTTATTCATTCCTGA  740

Query  705  ATCACCTCGTTGGTTATACTCCCAGGGTCGACTGAGTGAGGCTGAAGAGGCGCTGTACCTCATTGCCAAGAGGA  778
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||.|||||||||||||||
Sbjct  741  ATCACCTCGTTGGTTATACTCCCAGGGTCGGCTGAGTGAGGCGGAAGAGGCTCTGTACTTCATTGCCAAGAGGA  814

Query  779  ACCGCAAACTCAAGTGCACGTTCTCACTAACACACCCAGCCAACAGGAGCTGCAGGGAGACTGGAAGTTTCCTG  852
            |||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||..||||||||.||||||
Sbjct  815  ACCGCAAGCTCAAGTGTACATTCTCACTAACACACCCGGCCAACAGGAGCTACAGGGCAACTGGAAGCTTCCTG  888

Query  853  GATCTCTTTCGTTACCGGGTCCTGTTAGGACACACTTTGATCCTGATGTTCATCTGGTTTGTGTGCAGCTTGGT  926
            |||||.||.|||||||||.||||..|||||||.||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GATCTTTTCCGTTACCGGATCCTCCTAGGACATACCCTGATCCTGATGTTCATCTGGTTTGTGTGCAGCTTGGT  962

Query  927  GTATTATGGCCTAACTCTGAGTGCGGGTGATCTAGGTGGAAGTATTTATGCCAACCTGGCCCTGTCTGGCCTCA  1000
            |||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  963  GTACTACGGCCTCACCCTGAGTGCAGGTGACCTAGGGGGCAGCATTTATGCCAACCTGGCTCTATCTGGCCTCA  1036

Query 1001  TAGAGATTCAATCTTACCCTCTCTGTATCTACTTGATTAACCAAAAATGGTTTGGTCGGAAGCGAACATTATCA  1074
            |||||||||.|||.|||||||||||.||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||.|||.||.||
Sbjct 1037  TAGAGATTCCATCCTACCCTCTCTGCATCTACCTGATTAACCAAAGATGGTTTGGTCGGAAGCGGACACTAGCA  1110

Query 1075  GCATTTCTGTGCCTAGGAGGACTGGCTTGTCTTATTGTAATGTTTCTTCCAGAAAAGAAAGACACAGGTGTGTT  1148
            ||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111  GCGTTTCTGTGCCTTGGAGGACTGGCCTGTCTTATTGTGATGTTTCTTCCGGAAAAGAAAGACACAGGCGTGTT  1184

Query 1149  TGCAGTGGTGAACAGCCATTCCTTGTCCTTGCTGGGGAAGCTGACCATCAGTGCTGCCTTTAACATTGTTTATA  1222
            |||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1185  TGCAGTGGTCAACAGCCATTCCTTGTCCCTGCTGGGGAAGCTGACCATCAGTGCTGCCTTTAACATTGTTTACA  1258

Query 1223  TCTACACCTCTGAGCTTTACCCTACAGTCATCAGGAATGTTGGGCTTGGAACTTGTTCCATGTTCTCCCGAGTT  1296
            ||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||.|||.|.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1259  TCTACACCTCTGAGCTGTACCCCACTGTCATCAGAAACGTTGGCCTGGGAGCGTGCTCCATGTTCTCCCGAGTC  1332

Query 1297  GGTGGGATTATTGCTCCCTTCATCCCCTCACTGAAATATGTGCAATGGTCTTTACCATTCATTGTCTTCGGAGC  1370
            ||||||||.|||||.||||||.|||||||.|||||..|.||.||.||||||.|.||.|||||.||.||.|||||
Sbjct 1333  GGTGGGATCATTGCCCCCTTCGTCCCCTCCCTGAAGGAAGTACAGTGGTCTCTGCCCTTCATCGTGTTTGGAGC  1406

Query 1371  CACGGGTCTGACCTCCGGCCTCCTGAGTTTGTTATTGCCGGAGACCCTTAACAGTCCGCTGCTAGAAACATTCT  1444
            |||.||.||||||||.|||||||||||..||.|||||||.|||||.||.|||||.||..||||.||.|||||.|
Sbjct 1407  CACAGGCCTGACCTCAGGCCTCCTGAGCCTGCTATTGCCAGAGACTCTGAACAGCCCTTTGCTGGAGACATTTT  1480

Query 1445  CCGACCTTCAGGTGTATTCGTATCGCAGGCTGGGAGAAGAAGCATTATCTTTACAGGCTTTGGACCCCCAACAG  1518
            |.||.|||||..||||.||.|||.|.|||.|.|||||.|||||..|||||.|||||.|.|||||.||.|.||||
Sbjct 1481  CTGATCTTCAAATGTACTCATATAGGAGGTTAGGAGAGGAAGCGCTATCTCTACAGACCTTGGATCCTCCACAG  1554

Query 1519  TGTGTGGACAAGGAGAGCTCTTTAGGGAGTGAGAGTGAGGAAGAGGAAGAATTTTATGATGCAGATGAAGAGAC  1592
            ....|||||||||..|||         ||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1555  CCCCTGGACAAGGTCAGC---------AGTGAGAGTGAGGAGGAGGAAGAGTTCTATGATGCAGATGAGGAGAC  1619

Query 1593  TCAGATGATCAAG  1605
            .||||||||||||
Sbjct 1620  CCAGATGATCAAG  1632