Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000471433
Subject:
NM_001206650.2
Aligned Length:
1277
Identities:
835
Gaps:
391

Alignment

Query    1  ATGGGACCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACTCAGCACATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||          
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCATATAACCTGGAAAGGGCTCCTGCTCACAG----------  64

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTAATAATTGAAGCCAAGCCACCCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
                                                                                      
Sbjct   65  --------------------------------------------------------------------------  64

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGACGGAC  222
                                                                                      
Sbjct   65  --------------------------------------------------------------------------  64

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTACACGGTCAAATTATATATGGGCCTGCCTACAGTGGACGAGAAAC  296
                                                                                      
Sbjct   65  --------------------------------------------------------------------------  64

Query  297  AGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACACAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACATCA  370
                                                                                      
Sbjct   65  --------------------------------------------------------------------------  64

Query  371  TAAAGCGAGGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGATATTTCACTGTCACCTTATACTCGGAGACTCCCAAGCCC  444
                                                                     .||||||||||||.|||
Sbjct   65  ---------------------------------------------------------TGGAGACTCCCAAACCC  81

Query  445  TCCATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGTCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGACTCC  518
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||||.||.||||||||||...||||.||||||||||||||||||
Sbjct   82  TCCATCTCCAGCAGCAATTTCAACCCCAGGGAGGCCACGGAGGCTGTGATTTTAACCTGTGATCCTGAGACTCC  155

Query  519  GGATGCAAGCTACCTGTGGTTGCTGAATGGTCAGAACCTCCCTATGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAACCA  592
            .|||||||||||||||||||.|.||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||..||||||
Sbjct  156  AGATGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGCAGCTGTCTGAAACCA  229

Query  593  ACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCAGTG  666
            |||||||||||||.|||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  230  ACAGGACCCTCTACCTATTTGGTGTCACAAACTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCAGTG  303

Query  667  AGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCATGCCTTACATCACCATCAACAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||.||
Sbjct  304  AGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAATAA  377

Query  741  CTTAAACCCCAGGGAGAAGAAGGATGTGTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTCGGAACTACACCTACATTT  814
            ||||||||||||||||||.||||||||.|.|.|||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||
Sbjct  378  CTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTCAACCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACATTT  451

Query  815  GGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCGAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCATTCTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  452  GGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACGCATTGAAAACAGGATCCTCATTCTA  525

Query  889  CCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAGTAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  526  CCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAGTGA  599

Query  963  CCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTTCAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  600  CCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCATTCAG  673

Query 1037  GAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTTGCGGACTCTAACCCACCGGCAGAGTATTCTTGGACAATTAATGGGAAG  1110
            ||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  674  GACAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGGGAAG  747

Query 1111  TTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTCTGT  1184
            |||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  748  TTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTTTCTATCCCCCAGATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTCTGT  821

Query 1185  TCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGATAGTCAAAGTCTCTGGTCCCTGCCA-TGGA---  1254
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||.|||||.||||||||         | ||||   
Sbjct  822  TCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCGTGACAGTCAGAGTCTCTG---------ACTGGACAT  886

Query 1255  -AACCAGACAGAGTCTCAT  1272
             |.||              
Sbjct  887  TACCC--------------  891