Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471433
• Subject: XM_017026997.2
• Aligned Length: 1294
• Identities: 1179
• Gaps: 38

Alignment

Query    1  ATGGGACCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACTCAGCACATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGGTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTAATAATTGAAGCCAAGCCACCCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
            ||||||||||||.|.||||||.|||||||||||.|..|||||||||.||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAATCCGCCCACAACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGACGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||..||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATTTGGTACAAAGGGCAAATGACATAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTACACGGTCA---AATTATATATGGGCCTGCCTACAGTGGACGAGA  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||   ||||||||||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAAGAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA  296

Query  294  AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACACAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA  367
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACGCAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA  370

Query  368  TCATAAAGCGAGGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGATATTTCACTGTCACCTTATACTCGGAGACTCCCAAG  441
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||||||||.||..|||||||||||||
Sbjct  371  TCATAAAGCGACGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGACATTTCACCTTCACCTTACACCTGGAGACTCCCAAG  444

Query  442  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGTCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGAC  515
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||..|||||.|||||||||||.|||
Sbjct  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGATCTTAACCTGTGATCCTGCGAC  518

Query  516  TCCGGATGCAAGCTACCTGTGGTTGCTGAATGGTCAGAACCTCCCTATGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA  589
            |||.|..||||||||||.|||||.|.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCAGCCGCAAGCTACCAGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA  592

Query  590  CCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  663
            |||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAACAGGACCCTCTTTATATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666

Query  664  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCATGCCTTACATCACCATCAA  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||.|||.||||||||.|||||
Sbjct  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCAAAGCTGTCCAAGCCCTACATCACAATCAA  740

Query  738  CAACTTAAACCCCAGGGAGAAGAAGGATGTGTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTCGGAACTACACCTACA  811
            |||||||||||||||.|||||.||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||..||||||||||||||
Sbjct  741  CAACTTAAACCCCAGAGAGAATAAGGATGTCTTAACCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTAAGAACTACACCTACA  814

Query  812  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCGAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCATT  885
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCTGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888

Query  886  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  959
            |||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTACCCAATGTCACGAGAAATGAAACAGGACCTTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  962

Query  960  TAACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1033
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036

Query 1034  CAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTTGCGGACTCTAACCCACCGGCAGAGTATTCTTGGACAATTAATGGG  1107
            ||||||||||||||.|||||||||||||.||.||.||||||||||.||||.|.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCCGAGTCTAACCCACGGGCACAATATTCTTGGACAATTAATGGG  1110

Query 1108  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATAACTACAAAGCATAGTGGGCTCTATGCTTGCTC  1184

Query 1182  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGATAGTCAAAGTCTCTGGTCCCTGCCA--TGG  1253
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||||       |  |||
Sbjct 1185  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATCACAGTCAAAGTCTCTGGT-------AAGTGG  1251

Query 1254  AAACCAGACAGAGTCTCAT-----------------  1272
            |..||||         |||                 
Sbjct 1252  ATCCCAG---------CATCCTTGGCAATAGGGATT  1278