Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471457
- Subject:
- NM_003315.4
- Aligned Length:
- 1482
- Identities:
- 1314
- Gaps:
- 168
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGGCTGCCGCGGAGTGCGATGTGGTAATGGCGGCGACCGAGCCGGAGCTGCTCGACGACCAAGAGGCGAA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GAGGGAAGCAGAGACTTTCAAGGAACAAGGAAATGCATACTATGCCAAGAAAGATTACAATGAAGCTTATAATT 148
Query 1 --------------------ATGTGTCCTAAAAATGCTAGCTATTATGGTAATCGAGCAGCCACCTTGATGATG 54
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATTATACAAAAGCCATAGATATGTGTCCTAAAAATGCTAGCTATTATGGTAATCGAGCAGCCACCTTGATGATG 222
Query 55 CTTGGAAGGTTCCGGGAAGCTCTTGGAGATGCACAACAGTCAGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACA 128
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTTGGAAGGTTCCGGGAAGCTCTTGGAGATGCACAACAGTCAGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACA 296
Query 129 TCTACGAGAGGGCAAGTGCCACCTCTCTCTGGGGAATGCCATGGCAGCATGTCGCAGCTTCCAGAGAGCCCTAG 202
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCTACGAGAGGGCAAGTGCCACCTCTCTCTGGGGAATGCCATGGCAGCATGTCGCAGCTTCCAGAGAGCCCTAG 370
Query 203 AACTGGATCATAAAAATGCTCAGGCACAACAAGAGTTCAAGAATGCTAATGCAGTCATGGAATATGAGAAAATA 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AACTGGATCATAAAAATGCTCAGGCACAACAAGAGTTCAAGAATGCTAATGCAGTCATGGAATATGAGAAAATA 444
Query 277 GCAGAAACAGATTTTGAGAAGCGAGATTTTCGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCC 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCAGAAACAGATTTTGAGAAGCGAGATTTTCGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCC 518
Query 351 TGCCTGCCATCGCTTCAAAATCCTCAAGGCAGAATGTTTAGCAATGCTGGGTCGTTATCCAGAAGCACAGTCTG 424
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGCCTGCCATCGCTTCAAAATCCTCAAGGCAGAATGTTTAGCAATGCTGGGTCGTTATCCAGAAGCACAGTCTG 592
Query 425 TGGCTAGTGACATTCTACGAATGGATTCCACCAATGCAGATGCTCTGTATGTACGAGGTCTTTGCCTTTATTAC 498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGCTAGTGACATTCTACGAATGGATTCCACCAATGCAGATGCTCTGTATGTACGAGGTCTTTGCCTTTATTAC 666
Query 499 GAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTTCAGTTTTTCGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCCTG 572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTTCAGTTTTTCGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCCTG 740
Query 573 CATTGCCTGCAGAAATGCCAAAGCACTCAAAGCAAAGAAAGAAGATGGGAATAAAGCATTTAAGGAAGGAAATT 646
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CATTGCCTGCAGAAATGCCAAAGCACTCAAAGCAAAGAAAGAAGATGGGAATAAAGCATTTAAGGAAGGAAATT 814
Query 647 ACAAACTAGCATATGAACTGTACACAGAAGCCCTGGGGATAGACCCCAACAATATAAAAACAAATGCTAAACTC 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACAAACTAGCATATGAACTGTACACAGAAGCCCTGGGGATAGACCCCAACAATATAAAAACAAATGCTAAACTC 888
Query 721 TACTGTAATCGGGGTACGGTTAATTCCAAGCTTAGGAAACTAGATGATGCAATAGAAGACTGCACAAATGCAGT 794
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TACTGTAATCGGGGTACGGTTAATTCCAAGCTTAGGAAACTAGATGATGCAATAGAAGACTGCACAAATGCAGT 962
Query 795 GAAGCTTGATGACACTTACATAAAAGCCTACTTGAGAAGAGCTCAGTGTTACATGGACACAGAACAGTATGAAG 868
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GAAGCTTGATGACACTTACATAAAAGCCTACTTGAGAAGAGCTCAGTGTTACATGGACACAGAACAGTATGAAG 1036
Query 869 AAGCAGTACGAGACTATGAAAAAGTATACCAGACAGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTAAAAAATGCG 942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AAGCAGTACGAGACTATGAAAAAGTATACCAGACAGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTAAAAAATGCG 1110
Query 943 CAGCTGGAACTGAAGAAGAGTAAGAGGAAAGATTACTACAAGATTCTAGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGA 1016
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CAGCTGGAACTGAAGAAGAGTAAGAGGAAAGATTACTACAAGATTCTAGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGA 1184
Query 1017 CGAGATCAAGAAAGCTTATCGGAAACGGGCCTTGATGCACCATCCAGATCGGCATAGTGGAGCCAGTGCTGAGG 1090
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CGAGATCAAGAAAGCTTATCGGAAACGGGCCTTGATGCACCATCCAGATCGGCATAGTGGAGCCAGTGCTGAGG 1258
Query 1091 TTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTCAAGGAAGTTGGAGAGGCCTTTACTATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAG 1164
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTCAAGGAAGTTGGAGAGGCCTTTACTATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAG 1332
Query 1165 ACTCGCTATGACAGTGGACAGGACCTAGATGAGGAGGGCATGAATATGGGTGATTTTGATCCAAACAATATCTT 1238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACTCGCTATGACAGTGGACAGGACCTAGATGAGGAGGGCATGAATATGGGTGATTTTGATCCAAACAATATCTT 1406
Query 1239 CAAGGCATTCTTTGGCGGTCCTGGCGGCTTCAGCTTTGAAGCATCTGGTCCAGGGAATTTCTTTTTTCAATTTG 1312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CAAGGCATTCTTTGGCGGTCCTGGCGGCTTCAGCTTTGAAGCATCTGGTCCAGGGAATTTCTTTTTTCAATTTG 1480
Query 1313 GC 1314
||
Sbjct 1481 GC 1482