Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471457
• Subject: NR_029431.1
• Aligned Length: 2007
• Identities: 1314
• Gaps: 693

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  AAGCCCTAGAGAGGCTACCACCGGTACACCCCGCCTTCCCACCCACGGGTAAAGTGGCGCCGCCTACGCACCGG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CACAGCCCCTGGGCTCCCGCCCCGGCGCGGAGACCACCGTGGACATCCGGGGGCGGGAGGCCGCTCTGGCCCCA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AGCGGAGCCTCTCTCTGGTAGACGAGCCCGAGGGAGCCCTTCTGGGCGCGGCGCCGCGGAGCTGCTCTATGCTC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CAACCGGAAGTGCTCTTCACCGCCGGCCTCCCACCCAGCTCTCTGGTCCCGGCGGTAAGATGGCGGCTGCCGCG  296

Query    1  ----------------------------------------------------------------ATGTGTCCTA  10
                                                                            ||||||||||
Sbjct  297  GAGTGCGATGTGGTAATGGCGGCGACCGAGCCGGAGCTGCTCGACGACCAAGAGGCGAAGAGATATGTGTCCTA  370

Query   11  AAAATGCTAGCTATTATGGTAATCGAGCAGCCACCTTGATGATGCTTGGAAGGTTCCGGGAAGCTCTTGGAGAT  84
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAAATGCTAGCTATTATGGTAATCGAGCAGCCACCTTGATGATGCTTGGAAGGTTCCGGGAAGCTCTTGGAGAT  444

Query   85  GCACAACAGTCAGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACATCTACGAGAGGGCAAGTGCCACCTCTCTCT  158
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCACAACAGTCAGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACATCTACGAGAGGGCAAGTGCCACCTCTCTCT  518

Query  159  GGGGAATGCCATGGCAGCATGTCGCAGCTTCCAGAGAGCCCTAGAACTGGATCATAAAAATGCTCAGGCACAAC  232
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGGGAATGCCATGGCAGCATGTCGCAGCTTCCAGAGAGCCCTAGAACTGGATCATAAAAATGCTCAGGCACAAC  592

Query  233  AAGAGTTCAAGAATGCTAATGCAGTCATGGAATATGAGAAAATAGCAGAAACAGATTTTGAGAAGCGAGATTTT  306
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGAGTTCAAGAATGCTAATGCAGTCATGGAATATGAGAAAATAGCAGAAACAGATTTTGAGAAGCGAGATTTT  666

Query  307  CGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCCTGCCTGCCATCGCTTCAAAATCCTCAAGGC  380
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCCTGCCTGCCATCGCTTCAAAATCCTCAAGGC  740

Query  381  AGAATGTTTAGCAATGCTGGGTCGTTATCCAGAAGCACAGTCTGTGGCTAGTGACATTCTACGAATGGATTCCA  454
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGAATGTTTAGCAATGCTGGGTCGTTATCCAGAAGCACAGTCTGTGGCTAGTGACATTCTACGAATGGATTCCA  814

Query  455  CCAATGCAGATGCTCTGTATGTACGAGGTCTTTGCCTTTATTACGAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTTCAGTTT  528
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCAATGCAGATGCTCTGTATGTACGAGGTCTTTGCCTTTATTACGAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTTCAGTTT  888

Query  529  TTCGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCCTGCATTGCCTGCAGAAATGCCAAAGCACTCAA  602
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTCGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCCTGCATTGCCTGCAGAAATGCCAAAGCACTCAA  962

Query  603  AGCAAAGAAAGAAGATGGGAATAAAGCATTTAAGGAAGGAAATTACAAACTAGCATATGAACTGTACACAGAAG  676
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGCAAAGAAAGAAGATGGGAATAAAGCATTTAAGGAAGGAAATTACAAACTAGCATATGAACTGTACACAGAAG  1036

Query  677  CCCTGGGGATAGACCCCAACAATATAAAAACAAATGCTAAACTCTACTGTAATCGGGGTACGGTTAATTCCAAG  750
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCCTGGGGATAGACCCCAACAATATAAAAACAAATGCTAAACTCTACTGTAATCGGGGTACGGTTAATTCCAAG  1110

Query  751  CTTAGGAAACTAGATGATGCAATAGAAGACTGCACAAATGCAGTGAAGCTTGATGACACTTACATAAAAGCCTA  824
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTTAGGAAACTAGATGATGCAATAGAAGACTGCACAAATGCAGTGAAGCTTGATGACACTTACATAAAAGCCTA  1184

Query  825  CTTGAGAAGAGCTCAGTGTTACATGGACACAGAACAGTATGAAGAAGCAGTACGAGACTATGAAAAAGTATACC  898
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTTGAGAAGAGCTCAGTGTTACATGGACACAGAACAGTATGAAGAAGCAGTACGAGACTATGAAAAAGTATACC  1258

Query  899  AGACAGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTAAAAAATGCGCAGCTGGAACTGAAGAAGAGTAAGAGGAAA  972
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGACAGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTAAAAAATGCGCAGCTGGAACTGAAGAAGAGTAAGAGGAAA  1332

Query  973  GATTACTACAAGATTCTAGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGACGAGATCAAGAAAGCTTATCGGAAACGGGC  1046
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GATTACTACAAGATTCTAGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGACGAGATCAAGAAAGCTTATCGGAAACGGGC  1406

Query 1047  CTTGATGCACCATCCAGATCGGCATAGTGGAGCCAGTGCTGAGGTTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTCAAGG  1120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTTGATGCACCATCCAGATCGGCATAGTGGAGCCAGTGCTGAGGTTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTCAAGG  1480

Query 1121  AAGTTGGAGAGGCCTTTACTATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAGACTCGCTATGACAGTGGACAGGACCTAGAT  1194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AAGTTGGAGAGGCCTTTACTATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAGACTCGCTATGACAGTGGACAGGACCTAGAT  1554

Query 1195  GAGGAGGGCATGAATATGGGTGATTTTGATCCAAACAATATCTTCAAGGCATTCTTTGGCGGTCCTGGCGGCTT  1268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAGGAGGGCATGAATATGGGTGATTTTGATCCAAACAATATCTTCAAGGCATTCTTTGGCGGTCCTGGCGGCTT  1628

Query 1269  CAGCTTTGAAGCATCTGGTCCAGGGAATTTCTTTTTTCAATTTGGC----------------------------  1314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                            
Sbjct 1629  CAGCTTTGAAGCATCTGGTCCAGGGAATTTCTTTTTTCAATTTGGCTAATGAAGGGCAACCACCCAGAACCCAG  1702

Query 1315  --------------------------------------------------------------------------  1314
                                                                                      
Sbjct 1703  AAAATGCAGATTCACTCAGTTTAATCTTGAATGTGGAAACAGTTCACCTCCTCCCTTCATCACGTCTCCGTGTG  1776

Query 1315  --------------------------------------------------------------------------  1314
                                                                                      
Sbjct 1777  CTTAGAGCAGTTTCGTTTTCTCAGTTGGATGCCCTGTGTCTCTGTGAGTGGGGTGGAGCAAAGGGAACCAATGC  1850

Query 1315  --------------------------------------------------------------------------  1314
                                                                                      
Sbjct 1851  CGAAGACCGAGGGCAGGGGAGGGAGGCGGGGGTGGACAGGGAGGCAGCTTGTGAATTTTTGTTTTACTGTTTAA  1924

Query 1315  --------------------------------------------------------------------------  1314
                                                                                      
Sbjct 1925  CTTTATTAAAAAAGAAAAAAAAAAGAGAATAAAATGTTTTGACCCTTCCTGGCCCTTTGCTCTGGAAAAAAAAA  1998

Query 1315  ---------  1314
                     
Sbjct 1999  AAAAAAAAA  2007