Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471554
- Subject:
- NM_001113559.2
- Aligned Length:
- 2152
- Identities:
- 1715
- Gaps:
- 233
Alignment
Query 1 ---------------------------------------ATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGA 35
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTTACTGACCCTGATTTACCTCAGGAGTTTGAAAGGATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGA 74
Query 36 AGCAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAAAGTGGAAGAAGAGGAGAGTGACGGGCTCCCAGCCT 109
..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||
Sbjct 75 GACAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAAAGTGGAAGAGGAGGAGAGTGAGAGGCTCCCAGCCT 148
Query 110 TTCACCTTCCCTTGCATGTGAGTTTTCCCAACAAGCCTCACTCTGAGGAATTTCAGCCAGTTTCTCTGCTGACG 183
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTCACCTTCCCTTACATGTGAGTTTTCCCAACAAGCCTCACTCTGAGGAATTTCAGCCAGTTTCTCTGCTGACG 222
Query 184 CAAGAGACTTGTGGCCATAGGACTCCCACTTCTCAGCACAATACAATGGAAGTTGATGGCAATAAAGTTATGTC 257
||||||||||||||.|.||||||.||||||...||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAAGAGACTTGTGGTCCTAGGACCCCCACTGTGCAGCACAACACAATGGAAGTCGATGGCAATAAAGTTATGTC 296
Query 258 TTCATTTGCCCCACACAACTCATCTACCTCACCTCAGAAGGCAGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCT 331
||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 297 TTCATTAGCTCCATACAACTCATCTACCTCACCTCAGAAGGCGGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCG 370
Query 332 TGTCTAGTACAGCCCTGGGAACTCCTGAACGGCGCAAGGGCAGTTTAGCTGATGTTGTTGACACCTTGAAGCAG 405
||||.||..||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||.||||||||
Sbjct 371 TGTCGAGCGCAGCCCTGGGGACTCCCGAGCGGCGCAAGGGCAGCTTAGCGGATGTGGTGGACACCCTGAAGCAG 444
Query 406 AGGAAAATGGAAGAGCTCATCAAAAACGAGCCGGAAGAAACCCCCAGTATTGAAAAACTACTCTCAAAGGACTG 479
|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 445 AGGAAGATGGAAGAGCTGATCAAGAATGAGCCAGAAGACACTCCCAGTATTGAAAAGCTACTCTCCAAGGACTG 518
Query 480 GAAAGACAAGCTTCTTGCAATGGGATCGGGGAACTTTGGCGAAATAAAAGGGACTCCCGAGAGCTTAGCTGAGA 553
||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||||
Sbjct 519 GAAAGACAAGCTCCTGGCAATGGGATCAGGGAACTTTGGAGAAATAAAAGGGACTCCTGAGAGCCTCGCTGAGA 592
Query 554 AAGAAAGGCAACTCATGGGTATGATCAACCAGCTGACCAGCCTCCGAGAGCAGCTGTTGGCTGCCCACGATGAG 627
|.||..||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||..|||||||||||||||||
Sbjct 593 AGGAGCGGCAGCTCATGGGTATGATCAATCAGCTGACCAGTCTACGGGAGCAACTCCTGGCTGCCCACGATGAG 666
Query 628 CAGAAGAAACTAGCTGCCTCTCAGATTGAGAAACAGCGTCAGCAAATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAAGAACA 701
||||||||..|.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 667 CAGAAGAAGTTGGCTGCATCTCAGATAGAGAAACAGCGTCAGCAGATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAGGAGCA 740
Query 702 AATTGCAAGACAGCAGCAGCAGCTTCTACAGCAACAACACAAAATCAATTTGCTCCAGCAACAGATC---CAGG 772
.||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||| ||||
Sbjct 741 GATCGCGAGGCAACAGCAGCAGCTTCTGCAGCAACAACACAAAATCAACTTGCTTCAGCAACAGATCCAGCAGG 814
Query 773 TTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTAATGATTCCCGTATTCCCTCCTGATCAACGGACACTGGCTGCAGCTGCCCAG 846
||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 815 TTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTGATGATTCCCGTGTTCCCTCCTGACCAGCGGACCCTCGCAGCAGCTGCCCAG 888
Query 847 CAAGGATTCCTCCTCCCTCCAGGCTTCAGCTATAAGGCTGGATGTAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCC 920
||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CAAGGATTCCTCCTTCCTCCTGGTTTCAGCTACAAGGCTGGGTGCAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCC 962
Query 921 AACTACCATGGCAGCTGCTGCCGCAGCAACACCAGGCTTAGGCCCACTCCAACTGCAGCAGTTATATGCTGCCC 994
|||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.| |.|..|| ||||
Sbjct 963 AACCACTATGGCAGCTGCTGCTGCAGCAACACCAGGCTTAGGCCCACTCCAGCTGCAGGA-TGAAGTG--GCCC 1033
Query 995 AGCTAGCTG---CAATGCAGGTATCTCCAGGA--------GGGAA-------GC-------------------- 1030
|||.| ||| |.|| |||.||...|||.|| ||.|| ||
Sbjct 1034 AGCCA-CTGAACCTAT-CAGCTAAGCCCAAGACCTCTGATGGCAAATCACCTGCATCACCCACCTCTCCTCACA 1105
Query 1031 TGCCAG------GCATA-----------------CCCCAA------------GGCAACCT----TGGTGCTGCT 1065
|||||| |.||| ||.||| ||||.|.| |.||.||.||
Sbjct 1106 TGCCAGCTCTGAGAATAAACAGTGGGGCTGGCCCCCTCAAAGCCTCTGTCCCGGCAGCATTAGCTAGTCCTTCT 1179
Query 1066 G--------------------TAT----------------CTCCTACCA--GCATTC----------------- 1084
| ||| ||...|||| |||.||
Sbjct 1180 GCAAGAGTTAGCACAATAGGCTATTTAAATGACCACGATGCTGTCACCAAGGCAATCCAAGAAGCTCGCCAGAT 1253
Query 1085 ---------ACACAGACAAGAGCA-CA----------------------------AACAG-------CCCACCA 1113
||.|||.|.|||||| || ||||| |.||.||
Sbjct 1254 GAAAGAGCAACTCAGGCGAGAGCAGCAAGCGTTGGACGGGAAGGTGGCCGTGGTGAACAGCATAGGTCTCAGCA 1327
Query 1114 CC-------CAAAAGCAAGGAAAAAACAACACTGGAGAGTCTGACTCAGCAACTGGCAGTTAAACAGAATGAAG 1180
.| ||.|| |||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||
Sbjct 1328 ACTGCCGGACAGAA--AAGGAAAAAACAACACTGGAGAGCCTGACTCAGCAGTTGGCAGTTAAACAGAATGAAG 1399
Query 1181 AAGGAAAATTTAGCCATGCAATGATGGATTTCAATCTGAGTGGAGATTCTGATGGAAGTGCTGGAGTCTCAGAG 1254
||||.|||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1400 AAGGGAAATTTAGCCATGGAATGATGGATTTCAATATGAGTGGAGATTCTGACGGAAGCGCTGGAGTCTCAGAG 1473
Query 1255 TCAAGAATTTATAGGGAATCCCGAGGGCGTGGTAGCAATGAACCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCAT 1328
|||||||||||.|||||||||.|.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1474 TCAAGAATTTACAGGGAATCCAGGGGACGTGGTAGCAACGAGCCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCAT 1547
Query 1329 GGTGTGGGCTAAAGATGAACGGAGAAAGATCCTTCAAGCCTTTCCTGACATGCACAACTCCAACATCAGCAAGA 1402
|||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1548 GGTGTGGGCGAAAGATGAACGGAGGAAAATCCTTCAGGCCTTTCCCGACATGCACAATTCCAACATCAGCAAGA 1621
Query 1403 TATTGGGATCTCGCTGGAAAGCTATGACAAACCTAGAGAAACAGCCATATTATGAGGAGCAAGCCCGTCTCAGC 1476
||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1622 TACTGGGATCTCGCTGGAAAGCTATGACCAACCTAGAGAAACAGCCATACTATGAGGAGCAGGCCCGCCTCAGC 1695
Query 1477 AAGCAGCACCTGGAGAAGTACCCTGACTATAAGTACAAGCCCAGGCCAAAGCGCACCTGCCTGGTGGATGGCAA 1550
||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1696 AAACAGCACCTGGAGAAGTACCCGGACTACAAGTACAAGCCTAGGCCAAAGCGCACCTGTCTGGTGGACGGCAA 1769
Query 1551 AAAGCTGCGCATTGGTGAATACAAGGCAATCATGCGCAACAGGCGGCAGGAAATGCGGCAGTACTTCAATGTTG 1624
.||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||.||.|||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1770 GAAACTGCGTATCGGGGAGTACAAGGCCATCATGCGGAACCGGAGGCAGGAAATGCGACAGTACTTCAACGTTG 1843
Query 1625 GGCAACAAGCACAGATCCCCATTGCCACTGCTGGTGTTGTGTACCCTGGAGCCATCGCCATGGCTGGGATGCCC 1698
||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||..|.||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1844 GGCAACAAGCACAGATCCCCATCGCGACGGCCGGAGTTGTATACCCCAGCGCCATCGCCATGGCAGGAATGCCG 1917
Query 1699 TCCCCTCACCTGCCCTCGGAGCACTCAAGCGTGTCTAGCAGCCCAGAGCCTGGGATGCCTGTTATCCAGAGCAC 1772
|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1918 TCCCCTCACCTGCCCTCCGAGCACTCGAGCGTGTCCAGCAGCCCGGAGCCCGGGATGCCCGTGATCCAGAGCAC 1991
Query 1773 TTACGGTGTGAAAGGAGAGGAGCCACATATCAAAGAAGAGATACAGGCCGAGGACATCAATGGAGAAATTTATG 1846
||||||.|..||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1992 TTACGGCGCCAAGGGAGAGGAGCCCCACATCAAGGAAGAGATCCAGGCTGAGGACATCAACGGAGAGATTTACG 2065
Query 1847 ATGAGTACGACGAGGAAGAGGATGATCCAGATGTAGATTATGGGAGTGACAGTGAAAACCATATTGCAGGACAA 1920
|.||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 2066 AGGAGTACGATGAGGAGGAGGAGGACCCGGATGTGGATTATGGGAGTGACAGCGAAAACCACATTGCGGGACAA 2139
Query 1921 GCCAAC 1926
||||||
Sbjct 2140 GCCAAC 2145