Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471554
• Subject: NM_011444.3
• Aligned Length: 2289
• Identities: 1743
• Gaps: 363

Alignment

Query    1  ---------------------------------------ATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGA  35
                                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTTACTGACCCTGATTTACCTCAGGAGTTTGAAAGGATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGA  74

Query   36  AGCAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAAAGTGGAAGAAGAGGAGAGTGACGGGCTCCCAGCCT  109
            ..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||
Sbjct   75  GACAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAAAGTGGAAGAGGAGGAGAGTGAGAGGCTCCCAGCCT  148

Query  110  TTCACCTTCCCTTGCATGTGAGTTTTCCCAACAAGCCTCACTCTGAGGAATTTCAGCCAGTTTCTCTGCTGACG  183
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTCACCTTCCCTTACATGTGAGTTTTCCCAACAAGCCTCACTCTGAGGAATTTCAGCCAGTTTCTCTGCTGACG  222

Query  184  CAAGAGACTTGTGGCCATAGGACTCCCACTTCTCAGCACAATACAATGGAAGTTGATGGCAATAAAGTTATGTC  257
            ||||||||||||||.|.||||||.||||||...||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAAGAGACTTGTGGTCCTAGGACCCCCACTGTGCAGCACAACACAATGGAAGTCGATGGCAATAAAGTTATGTC  296

Query  258  TTCATTTGCCCCACACAACTCATCTACCTCACCTCAGAAGGCAGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCT  331
            ||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  297  TTCATTAGCTCCATACAACTCATCTACCTCACCTCAGAAGGCGGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCG  370

Query  332  TGTCTAGTACAGCCCTGGGAACTCCTGAACGGCGCAAGGGCAGTTTAGCTGATGTTGTTGACACCTTGAAGCAG  405
            ||||.||..||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||.||||||||
Sbjct  371  TGTCGAGCGCAGCCCTGGGGACTCCCGAGCGGCGCAAGGGCAGCTTAGCGGATGTGGTGGACACCCTGAAGCAG  444

Query  406  AGGAAAATGGAAGAGCTCATCAAAAACGAGCCGGAAGAAACCCCCAGTATTGAAAAACTACTCTCAAAGGACTG  479
            |||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  445  AGGAAGATGGAAGAGCTGATCAAGAATGAGCCAGAAGACACTCCCAGTATTGAAAAGCTACTCTCCAAGGACTG  518

Query  480  GAAAGACAAGCTTCTTGCAATGGGATCGGGGAACTTTGGCGAAATAAAAGGGACTCCCGAGAGCTTAGCTGAGA  553
            ||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||||
Sbjct  519  GAAAGACAAGCTCCTGGCAATGGGATCAGGGAACTTTGGAGAAATAAAAGGGACTCCTGAGAGCCTCGCTGAGA  592

Query  554  AAGAAAGGCAACTCATGGGTATGATCAACCAGCTGACCAGCCTCCGAGAGCAGCTGTTGGCTGCCCACGATGAG  627
            |.||..||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||..|||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGAGCGGCAGCTCATGGGTATGATCAATCAGCTGACCAGTCTACGGGAGCAACTCCTGGCTGCCCACGATGAG  666

Query  628  CAGAAGAAACTAGCTGCCTCTCAGATTGAGAAACAGCGTCAGCAAATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAAGAACA  701
            ||||||||..|.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  667  CAGAAGAAGTTGGCTGCATCTCAGATAGAGAAACAGCGTCAGCAGATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAGGAGCA  740

Query  702  AATTGCAAGACAGCAGCAGCAGCTTCTACAGCAACAACACAAAATCAATTTGCTCCAGCAACAGATCCAGGTTC  775
            .||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  741  GATCGCGAGGCAACAGCAGCAGCTTCTGCAGCAACAACACAAAATCAACTTGCTTCAGCAACAGATCCAGGTTC  814

Query  776  AAGGTCAGCTGCCGCCATTAATGATTCCCGTATTCCCTCCTGATCAACGGACACTGGCTGCAGCTGCCCAGCAA  849
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct  815  AAGGTCAGCTGCCGCCATTGATGATTCCCGTGTTCCCTCCTGACCAGCGGACCCTCGCAGCAGCTGCCCAGCAA  888

Query  850  GGATTCCTCCTCCCTCCAGGCTTCAGCTATAAGGCTGGATGTAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCCAAC  923
            |||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGATTCCTCCTTCCTCCTGGTTTCAGCTACAAGGCTGGGTGCAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCCAAC  962

Query  924  TACCATGGCAGCTGCTGCCGCAGCAACACCAGGCTTAGGCCCACTCCAACTGCAGCAGTTATATGCTGCCCAGC  997
            .||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  963  CACTATGGCAGCTGCTGCTGCAGCAACACCAGGCTTAGGCCCACTCCAGCTGCAGCAGTTCTATGCTGCCCAGC  1036

Query  998  TAGCTGCAATGCAGGTATCTCCAGGAGGGAAGCTGCCAGGCATACCCCAAGGCAACCTTGGTGCTGCTGTATCT  1071
            ||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|.||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1037  TAGCCGCAATGCAGGTTTCTCCAGGAGGGAAGCTCCTAGGCCTACCCCAAGGCAACCTTGGTGCTGCCGTGTCT  1110

Query 1072  CCTACCAGCATTCACACAGACAAGAGCACAAACAGCCCACCACCCAAAAGC-----------------------  1122
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||                       
Sbjct 1111  CCTACCAGCATTCACACAGACAAGAGCACAAACAGTCCACCACCCAAAAGCAAGGATGAAGTGGCCCAGCCACT  1184

Query 1123  --------------------------------------------------------------------------  1122
                                                                                      
Sbjct 1185  GAACCTATCAGCTAAGCCCAAGACCTCTGATGGCAAATCACCTGCATCACCCACCTCTCCTCACATGCCAGCTC  1258

Query 1123  --------------------------------------------------------------------------  1122
                                                                                      
Sbjct 1259  TGAGAATAAACAGTGGGGCTGGCCCCCTCAAAGCCTCTGTCCCGGCAGCATTAGCTAGTCCTTCTGCAAGAGTT  1332

Query 1123  --------------------------------------------------------------------------  1122
                                                                                      
Sbjct 1333  AGCACAATAGGCTATTTAAATGACCACGATGCTGTCACCAAGGCAATCCAAGAAGCTCGCCAGATGAAAGAGCA  1406

Query 1123  --------------------------------------------------------------------------  1122
                                                                                      
Sbjct 1407  ACTCAGGCGAGAGCAGCAAGCGTTGGACGGGAAGGTGGCCGTGGTGAACAGCATAGGTCTCAGCAACTGCCGGA  1480

Query 1123  -----AAGGAAAAAACAACACTGGAGAGTCTGACTCAGCAACTGGCAGTTAAACAGAATGAAGAAGGAAAATTT  1191
                 |||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1481  CAGAAAAGGAAAAAACAACACTGGAGAGCCTGACTCAGCAGTTGGCAGTTAAACAGAATGAAGAAGGGAAATTT  1554

Query 1192  AGCCATGCAATGATGGATTTCAATCTGAGTGGAGATTCTGATGGAAGTGCTGGAGTCTCAGAGTCAAGAATTTA  1265
            |||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGCCATGGAATGATGGATTTCAATATGAGTGGAGATTCTGACGGAAGCGCTGGAGTCTCAGAGTCAAGAATTTA  1628

Query 1266  TAGGGAATCCCGAGGGCGTGGTAGCAATGAACCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATGGTGTGGGCTA  1339
            .|||||||||.|.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1629  CAGGGAATCCAGGGGACGTGGTAGCAACGAGCCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATGGTGTGGGCGA  1702

Query 1340  AAGATGAACGGAGAAAGATCCTTCAAGCCTTTCCTGACATGCACAACTCCAACATCAGCAAGATATTGGGATCT  1413
            |||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1703  AAGATGAACGGAGGAAAATCCTTCAGGCCTTTCCCGACATGCACAATTCCAACATCAGCAAGATACTGGGATCT  1776

Query 1414  CGCTGGAAAGCTATGACAAACCTAGAGAAACAGCCATATTATGAGGAGCAAGCCCGTCTCAGCAAGCAGCACCT  1487
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1777  CGCTGGAAAGCTATGACCAACCTAGAGAAACAGCCATACTATGAGGAGCAGGCCCGCCTCAGCAAACAGCACCT  1850

Query 1488  GGAGAAGTACCCTGACTATAAGTACAAGCCCAGGCCAAAGCGCACCTGCCTGGTGGATGGCAAAAAGCTGCGCA  1561
            ||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.|
Sbjct 1851  GGAGAAGTACCCGGACTACAAGTACAAGCCTAGGCCAAAGCGCACCTGTCTGGTGGACGGCAAGAAACTGCGTA  1924

Query 1562  TTGGTGAATACAAGGCAATCATGCGCAACAGGCGGCAGGAAATGCGGCAGTACTTCAATGTTGGGCAACAAGCA  1635
            |.||.||.||||||||.||||||||.|||.||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1925  TCGGGGAGTACAAGGCCATCATGCGGAACCGGAGGCAGGAAATGCGACAGTACTTCAACGTTGGGCAACAAGCA  1998

Query 1636  CAGATCCCCATTGCCACTGCTGGTGTTGTGTACCCTGGAGCCATCGCCATGGCTGGGATGCCCTCCCCTCACCT  1709
            |||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||..|.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1999  CAGATCCCCATCGCGACGGCCGGAGTTGTATACCCCAGCGCCATCGCCATGGCAGGAATGCCGTCCCCTCACCT  2072

Query 1710  GCCCTCGGAGCACTCAAGCGTGTCTAGCAGCCCAGAGCCTGGGATGCCTGTTATCCAGAGCACTTACGGTGTGA  1783
            ||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|..|
Sbjct 2073  GCCCTCCGAGCACTCGAGCGTGTCCAGCAGCCCGGAGCCCGGGATGCCCGTGATCCAGAGCACTTACGGCGCCA  2146

Query 1784  AAGGAGAGGAGCCACATATCAAAGAAGAGATACAGGCCGAGGACATCAATGGAGAAATTTATGATGAGTACGAC  1857
            |.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.
Sbjct 2147  AGGGAGAGGAGCCCCACATCAAGGAAGAGATCCAGGCTGAGGACATCAACGGAGAGATTTACGAGGAGTACGAT  2220

Query 1858  GAGGAAGAGGATGATCCAGATGTAGATTATGGGAGTGACAGTGAAAACCATATTGCAGGACAAGCCAAC  1926
            |||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2221  GAGGAGGAGGAGGACCCGGATGTGGATTATGGGAGTGACAGCGAAAACCACATTGCGGGACAAGCCAAC  2289