Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471554
- Subject:
- XM_006506932.3
- Aligned Length:
- 2373
- Identities:
- 1743
- Gaps:
- 447
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCAGATACCTGCTCTCCTCCACGCCTGGTTTCTGGAGTTTGAAGCTACAGAAACTTTGCCTGGGTTGCCAGG 74
Query 1 -------------------------------------------------ATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTC 25
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACATTCAGAGCACTTTGTGGAAAGCAAGCTAGCACTGAGCCGGACAGAGATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTC 148
Query 26 CGTATGGGGAAGCAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAAAGTGGAAGAAGAGGAGAGTGACGGG 99
||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||
Sbjct 149 CGTATGGGGAGACAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAAAGTGGAAGAGGAGGAGAGTGAGAGG 222
Query 100 CTCCCAGCCTTTCACCTTCCCTTGCATGTGAGTTTTCCCAACAAGCCTCACTCTGAGGAATTTCAGCCAGTTTC 173
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTCCCAGCCTTTCACCTTCCCTTACATGTGAGTTTTCCCAACAAGCCTCACTCTGAGGAATTTCAGCCAGTTTC 296
Query 174 TCTGCTGACGCAAGAGACTTGTGGCCATAGGACTCCCACTTCTCAGCACAATACAATGGAAGTTGATGGCAATA 247
||||||||||||||||||||||||.|.||||||.||||||...||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 297 TCTGCTGACGCAAGAGACTTGTGGTCCTAGGACCCCCACTGTGCAGCACAACACAATGGAAGTCGATGGCAATA 370
Query 248 AAGTTATGTCTTCATTTGCCCCACACAACTCATCTACCTCACCTCAGAAGGCAGAAGAAGGTGGGCGACAGAGT 321
||||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGTTATGTCTTCATTAGCTCCATACAACTCATCTACCTCACCTCAGAAGGCGGAAGAAGGTGGGCGACAGAGT 444
Query 322 GGCGAGTCCTTGTCTAGTACAGCCCTGGGAACTCCTGAACGGCGCAAGGGCAGTTTAGCTGATGTTGTTGACAC 395
|||||||||.||||.||..||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct 445 GGCGAGTCCGTGTCGAGCGCAGCCCTGGGGACTCCCGAGCGGCGCAAGGGCAGCTTAGCGGATGTGGTGGACAC 518
Query 396 CTTGAAGCAGAGGAAAATGGAAGAGCTCATCAAAAACGAGCCGGAAGAAACCCCCAGTATTGAAAAACTACTCT 469
|.|||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 519 CCTGAAGCAGAGGAAGATGGAAGAGCTGATCAAGAATGAGCCAGAAGACACTCCCAGTATTGAAAAGCTACTCT 592
Query 470 CAAAGGACTGGAAAGACAAGCTTCTTGCAATGGGATCGGGGAACTTTGGCGAAATAAAAGGGACTCCCGAGAGC 543
|.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 593 CCAAGGACTGGAAAGACAAGCTCCTGGCAATGGGATCAGGGAACTTTGGAGAAATAAAAGGGACTCCTGAGAGC 666
Query 544 TTAGCTGAGAAAGAAAGGCAACTCATGGGTATGATCAACCAGCTGACCAGCCTCCGAGAGCAGCTGTTGGCTGC 617
.|.||||||||.||..||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||..|||||||
Sbjct 667 CTCGCTGAGAAGGAGCGGCAGCTCATGGGTATGATCAATCAGCTGACCAGTCTACGGGAGCAACTCCTGGCTGC 740
Query 618 CCACGATGAGCAGAAGAAACTAGCTGCCTCTCAGATTGAGAAACAGCGTCAGCAAATGGAGCTGGCCAAGCAGC 691
||||||||||||||||||..|.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCACGATGAGCAGAAGAAGTTGGCTGCATCTCAGATAGAGAAACAGCGTCAGCAGATGGAGCTGGCCAAGCAGC 814
Query 692 AACAAGAACAAATTGCAAGACAGCAGCAGCAGCTTCTACAGCAACAACACAAAATCAATTTGCTCCAGCAACAG 765
||||.||.||.||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 815 AACAGGAGCAGATCGCGAGGCAACAGCAGCAGCTTCTGCAGCAACAACACAAAATCAACTTGCTTCAGCAACAG 888
Query 766 ATCCAGGTTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTAATGATTCCCGTATTCCCTCCTGATCAACGGACACTGGCTGCAGC 839
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.|||||
Sbjct 889 ATCCAGGTTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTGATGATTCCCGTGTTCCCTCCTGACCAGCGGACCCTCGCAGCAGC 962
Query 840 TGCCCAGCAAGGATTCCTCCTCCCTCCAGGCTTCAGCTATAAGGCTGGATGTAGTGACCCTTACCCTGTTCAGC 913
|||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGCCCAGCAAGGATTCCTCCTTCCTCCTGGTTTCAGCTACAAGGCTGGGTGCAGTGACCCTTACCCTGTTCAGC 1036
Query 914 TGATCCCAACTACCATGGCAGCTGCTGCCGCAGCAACACCAGGCTTAGGCCCACTCCAACTGCAGCAGTTATAT 987
||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1037 TGATCCCAACCACTATGGCAGCTGCTGCTGCAGCAACACCAGGCTTAGGCCCACTCCAGCTGCAGCAGTTCTAT 1110
Query 988 GCTGCCCAGCTAGCTGCAATGCAGGTATCTCCAGGAGGGAAGCTGCCAGGCATACCCCAAGGCAACCTTGGTGC 1061
||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|.||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCTGCCCAGCTAGCCGCAATGCAGGTTTCTCCAGGAGGGAAGCTCCTAGGCCTACCCCAAGGCAACCTTGGTGC 1184
Query 1062 TGCTGTATCTCCTACCAGCATTCACACAGACAAGAGCACAAACAGCCCACCACCCAAAAGC------------- 1122
|||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1185 TGCCGTGTCTCCTACCAGCATTCACACAGACAAGAGCACAAACAGTCCACCACCCAAAAGCAAGGATGAAGTGG 1258
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1259 CCCAGCCACTGAACCTATCAGCTAAGCCCAAGACCTCTGATGGCAAATCACCTGCATCACCCACCTCTCCTCAC 1332
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1333 ATGCCAGCTCTGAGAATAAACAGTGGGGCTGGCCCCCTCAAAGCCTCTGTCCCGGCAGCATTAGCTAGTCCTTC 1406
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1407 TGCAAGAGTTAGCACAATAGGCTATTTAAATGACCACGATGCTGTCACCAAGGCAATCCAAGAAGCTCGCCAGA 1480
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1481 TGAAAGAGCAACTCAGGCGAGAGCAGCAAGCGTTGGACGGGAAGGTGGCCGTGGTGAACAGCATAGGTCTCAGC 1554
Query 1123 ---------------AAGGAAAAAACAACACTGGAGAGTCTGACTCAGCAACTGGCAGTTAAACAGAATGAAGA 1181
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AACTGCCGGACAGAAAAGGAAAAAACAACACTGGAGAGCCTGACTCAGCAGTTGGCAGTTAAACAGAATGAAGA 1628
Query 1182 AGGAAAATTTAGCCATGCAATGATGGATTTCAATCTGAGTGGAGATTCTGATGGAAGTGCTGGAGTCTCAGAGT 1255
|||.|||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGGGAAATTTAGCCATGGAATGATGGATTTCAATATGAGTGGAGATTCTGACGGAAGCGCTGGAGTCTCAGAGT 1702
Query 1256 CAAGAATTTATAGGGAATCCCGAGGGCGTGGTAGCAATGAACCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATG 1329
||||||||||.|||||||||.|.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CAAGAATTTACAGGGAATCCAGGGGACGTGGTAGCAACGAGCCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATG 1776
Query 1330 GTGTGGGCTAAAGATGAACGGAGAAAGATCCTTCAAGCCTTTCCTGACATGCACAACTCCAACATCAGCAAGAT 1403
||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1777 GTGTGGGCGAAAGATGAACGGAGGAAAATCCTTCAGGCCTTTCCCGACATGCACAATTCCAACATCAGCAAGAT 1850
Query 1404 ATTGGGATCTCGCTGGAAAGCTATGACAAACCTAGAGAAACAGCCATATTATGAGGAGCAAGCCCGTCTCAGCA 1477
|.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1851 ACTGGGATCTCGCTGGAAAGCTATGACCAACCTAGAGAAACAGCCATACTATGAGGAGCAGGCCCGCCTCAGCA 1924
Query 1478 AGCAGCACCTGGAGAAGTACCCTGACTATAAGTACAAGCCCAGGCCAAAGCGCACCTGCCTGGTGGATGGCAAA 1551
|.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1925 AACAGCACCTGGAGAAGTACCCGGACTACAAGTACAAGCCTAGGCCAAAGCGCACCTGTCTGGTGGACGGCAAG 1998
Query 1552 AAGCTGCGCATTGGTGAATACAAGGCAATCATGCGCAACAGGCGGCAGGAAATGCGGCAGTACTTCAATGTTGG 1625
||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||.||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1999 AAACTGCGTATCGGGGAGTACAAGGCCATCATGCGGAACCGGAGGCAGGAAATGCGACAGTACTTCAACGTTGG 2072
Query 1626 GCAACAAGCACAGATCCCCATTGCCACTGCTGGTGTTGTGTACCCTGGAGCCATCGCCATGGCTGGGATGCCCT 1699
|||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||..|.||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 2073 GCAACAAGCACAGATCCCCATCGCGACGGCCGGAGTTGTATACCCCAGCGCCATCGCCATGGCAGGAATGCCGT 2146
Query 1700 CCCCTCACCTGCCCTCGGAGCACTCAAGCGTGTCTAGCAGCCCAGAGCCTGGGATGCCTGTTATCCAGAGCACT 1773
||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 2147 CCCCTCACCTGCCCTCCGAGCACTCGAGCGTGTCCAGCAGCCCGGAGCCCGGGATGCCCGTGATCCAGAGCACT 2220
Query 1774 TACGGTGTGAAAGGAGAGGAGCCACATATCAAAGAAGAGATACAGGCCGAGGACATCAATGGAGAAATTTATGA 1847
|||||.|..||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 2221 TACGGCGCCAAGGGAGAGGAGCCCCACATCAAGGAAGAGATCCAGGCTGAGGACATCAACGGAGAGATTTACGA 2294
Query 1848 TGAGTACGACGAGGAAGAGGATGATCCAGATGTAGATTATGGGAGTGACAGTGAAAACCATATTGCAGGACAAG 1921
.||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 2295 GGAGTACGATGAGGAGGAGGAGGACCCGGATGTGGATTATGGGAGTGACAGCGAAAACCACATTGCGGGACAAG 2368
Query 1922 CCAAC 1926
|||||
Sbjct 2369 CCAAC 2373