Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471554
- Subject:
- XM_006506933.3
- Aligned Length:
- 2292
- Identities:
- 1743
- Gaps:
- 366
Alignment
Query 1 ---------------------------------------ATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGA 35
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTTACTGACCCTGATTTACCTCAGGAGTTTGAAAGGATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGA 74
Query 36 AGCAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAAAGTGGAAGAAGAGGAGAGTGACGGGCTCCCAGCCT 109
..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||
Sbjct 75 GACAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAAAGTGGAAGAGGAGGAGAGTGAGAGGCTCCCAGCCT 148
Query 110 TTCACCTTCCCTTGCATGTGAGTTTTCCCAACAAGCCTCACTCTGAGGAATTTCAGCCAGTTTCTCTGCTGACG 183
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTCACCTTCCCTTACATGTGAGTTTTCCCAACAAGCCTCACTCTGAGGAATTTCAGCCAGTTTCTCTGCTGACG 222
Query 184 CAAGAGACTTGTGGCCATAGGACTCCCACTTCTCAGCACAATACAATGGAAGTTGATGGCAATAAAGTTATGTC 257
||||||||||||||.|.||||||.||||||...||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAAGAGACTTGTGGTCCTAGGACCCCCACTGTGCAGCACAACACAATGGAAGTCGATGGCAATAAAGTTATGTC 296
Query 258 TTCATTTGCCCCACACAACTCATCTACCTCACCTCAGAAGGCAGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCT 331
||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 297 TTCATTAGCTCCATACAACTCATCTACCTCACCTCAGAAGGCGGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCG 370
Query 332 TGTCTAGTACAGCCCTGGGAACTCCTGAACGGCGCAAGGGCAGTTTAGCTGATGTTGTTGACACCTTGAAGCAG 405
||||.||..||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||.||||||||
Sbjct 371 TGTCGAGCGCAGCCCTGGGGACTCCCGAGCGGCGCAAGGGCAGCTTAGCGGATGTGGTGGACACCCTGAAGCAG 444
Query 406 AGGAAAATGGAAGAGCTCATCAAAAACGAGCCGGAAGAAACCCCCAGTATTGAAAAACTACTCTCAAAGGACTG 479
|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 445 AGGAAGATGGAAGAGCTGATCAAGAATGAGCCAGAAGACACTCCCAGTATTGAAAAGCTACTCTCCAAGGACTG 518
Query 480 GAAAGACAAGCTTCTTGCAATGGGATCGGGGAACTTTGGCGAAATAAAAGGGACTCCCGAGAGCTTAGCTGAGA 553
||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||||
Sbjct 519 GAAAGACAAGCTCCTGGCAATGGGATCAGGGAACTTTGGAGAAATAAAAGGGACTCCTGAGAGCCTCGCTGAGA 592
Query 554 AAGAAAGGCAACTCATGGGTATGATCAACCAGCTGACCAGCCTCCGAGAGCAGCTGTTGGCTGCCCACGATGAG 627
|.||..||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||..|||||||||||||||||
Sbjct 593 AGGAGCGGCAGCTCATGGGTATGATCAATCAGCTGACCAGTCTACGGGAGCAACTCCTGGCTGCCCACGATGAG 666
Query 628 CAGAAGAAACTAGCTGCCTCTCAGATTGAGAAACAGCGTCAGCAAATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAAGAACA 701
||||||||..|.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 667 CAGAAGAAGTTGGCTGCATCTCAGATAGAGAAACAGCGTCAGCAGATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAGGAGCA 740
Query 702 AATTGCAAGACAGCAGCAGCAGCTTCTACAGCAACAACACAAAATCAATTTGCTCCAGCAACAGATC---CAGG 772
.||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||| ||||
Sbjct 741 GATCGCGAGGCAACAGCAGCAGCTTCTGCAGCAACAACACAAAATCAACTTGCTTCAGCAACAGATCCAGCAGG 814
Query 773 TTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTAATGATTCCCGTATTCCCTCCTGATCAACGGACACTGGCTGCAGCTGCCCAG 846
||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 815 TTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTGATGATTCCCGTGTTCCCTCCTGACCAGCGGACCCTCGCAGCAGCTGCCCAG 888
Query 847 CAAGGATTCCTCCTCCCTCCAGGCTTCAGCTATAAGGCTGGATGTAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCC 920
||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CAAGGATTCCTCCTTCCTCCTGGTTTCAGCTACAAGGCTGGGTGCAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCC 962
Query 921 AACTACCATGGCAGCTGCTGCCGCAGCAACACCAGGCTTAGGCCCACTCCAACTGCAGCAGTTATATGCTGCCC 994
|||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 963 AACCACTATGGCAGCTGCTGCTGCAGCAACACCAGGCTTAGGCCCACTCCAGCTGCAGCAGTTCTATGCTGCCC 1036
Query 995 AGCTAGCTGCAATGCAGGTATCTCCAGGAGGGAAGCTGCCAGGCATACCCCAAGGCAACCTTGGTGCTGCTGTA 1068
|||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|.||||.|||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1037 AGCTAGCCGCAATGCAGGTTTCTCCAGGAGGGAAGCTCCTAGGCCTACCCCAAGGCAACCTTGGTGCTGCCGTG 1110
Query 1069 TCTCCTACCAGCATTCACACAGACAAGAGCACAAACAGCCCACCACCCAAAAGC-------------------- 1122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1111 TCTCCTACCAGCATTCACACAGACAAGAGCACAAACAGTCCACCACCCAAAAGCAAGGATGAAGTGGCCCAGCC 1184
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1185 ACTGAACCTATCAGCTAAGCCCAAGACCTCTGATGGCAAATCACCTGCATCACCCACCTCTCCTCACATGCCAG 1258
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1259 CTCTGAGAATAAACAGTGGGGCTGGCCCCCTCAAAGCCTCTGTCCCGGCAGCATTAGCTAGTCCTTCTGCAAGA 1332
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1333 GTTAGCACAATAGGCTATTTAAATGACCACGATGCTGTCACCAAGGCAATCCAAGAAGCTCGCCAGATGAAAGA 1406
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1407 GCAACTCAGGCGAGAGCAGCAAGCGTTGGACGGGAAGGTGGCCGTGGTGAACAGCATAGGTCTCAGCAACTGCC 1480
Query 1123 --------AAGGAAAAAACAACACTGGAGAGTCTGACTCAGCAACTGGCAGTTAAACAGAATGAAGAAGGAAAA 1188
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1481 GGACAGAAAAGGAAAAAACAACACTGGAGAGCCTGACTCAGCAGTTGGCAGTTAAACAGAATGAAGAAGGGAAA 1554
Query 1189 TTTAGCCATGCAATGATGGATTTCAATCTGAGTGGAGATTCTGATGGAAGTGCTGGAGTCTCAGAGTCAAGAAT 1262
||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TTTAGCCATGGAATGATGGATTTCAATATGAGTGGAGATTCTGACGGAAGCGCTGGAGTCTCAGAGTCAAGAAT 1628
Query 1263 TTATAGGGAATCCCGAGGGCGTGGTAGCAATGAACCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATGGTGTGGG 1336
|||.|||||||||.|.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TTACAGGGAATCCAGGGGACGTGGTAGCAACGAGCCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATGGTGTGGG 1702
Query 1337 CTAAAGATGAACGGAGAAAGATCCTTCAAGCCTTTCCTGACATGCACAACTCCAACATCAGCAAGATATTGGGA 1410
|.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1703 CGAAAGATGAACGGAGGAAAATCCTTCAGGCCTTTCCCGACATGCACAATTCCAACATCAGCAAGATACTGGGA 1776
Query 1411 TCTCGCTGGAAAGCTATGACAAACCTAGAGAAACAGCCATATTATGAGGAGCAAGCCCGTCTCAGCAAGCAGCA 1484
||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 1777 TCTCGCTGGAAAGCTATGACCAACCTAGAGAAACAGCCATACTATGAGGAGCAGGCCCGCCTCAGCAAACAGCA 1850
Query 1485 CCTGGAGAAGTACCCTGACTATAAGTACAAGCCCAGGCCAAAGCGCACCTGCCTGGTGGATGGCAAAAAGCTGC 1558
|||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 1851 CCTGGAGAAGTACCCGGACTACAAGTACAAGCCTAGGCCAAAGCGCACCTGTCTGGTGGACGGCAAGAAACTGC 1924
Query 1559 GCATTGGTGAATACAAGGCAATCATGCGCAACAGGCGGCAGGAAATGCGGCAGTACTTCAATGTTGGGCAACAA 1632
|.||.||.||.||||||||.||||||||.|||.||.|||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1925 GTATCGGGGAGTACAAGGCCATCATGCGGAACCGGAGGCAGGAAATGCGACAGTACTTCAACGTTGGGCAACAA 1998
Query 1633 GCACAGATCCCCATTGCCACTGCTGGTGTTGTGTACCCTGGAGCCATCGCCATGGCTGGGATGCCCTCCCCTCA 1706
||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||..|.||||||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1999 GCACAGATCCCCATCGCGACGGCCGGAGTTGTATACCCCAGCGCCATCGCCATGGCAGGAATGCCGTCCCCTCA 2072
Query 1707 CCTGCCCTCGGAGCACTCAAGCGTGTCTAGCAGCCCAGAGCCTGGGATGCCTGTTATCCAGAGCACTTACGGTG 1780
|||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 2073 CCTGCCCTCCGAGCACTCGAGCGTGTCCAGCAGCCCGGAGCCCGGGATGCCCGTGATCCAGAGCACTTACGGCG 2146
Query 1781 TGAAAGGAGAGGAGCCACATATCAAAGAAGAGATACAGGCCGAGGACATCAATGGAGAAATTTATGATGAGTAC 1854
..||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||
Sbjct 2147 CCAAGGGAGAGGAGCCCCACATCAAGGAAGAGATCCAGGCTGAGGACATCAACGGAGAGATTTACGAGGAGTAC 2220
Query 1855 GACGAGGAAGAGGATGATCCAGATGTAGATTATGGGAGTGACAGTGAAAACCATATTGCAGGACAAGCCAAC 1926
||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2221 GATGAGGAGGAGGAGGACCCGGATGTGGATTATGGGAGTGACAGCGAAAACCACATTGCGGGACAAGCCAAC 2292