Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471554
- Subject:
- XM_006506935.3
- Aligned Length:
- 2373
- Identities:
- 1645
- Gaps:
- 552
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCAGATACCTGCTCTCCTCCACGCCTGGTTTCTGGAGTTTGAAGCTACAGAAACTTTGCCTGGGTTGCCAGG 74
Query 1 -------------------------------------------------ATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTC 25
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACATTCAGAGCACTTTGTGGAAAGCAAGCTAGCACTGAGCCGGACAGAGATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTC 148
Query 26 CGTATGGGGAAGCAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAAAGTGGAAGAAGAGGAGAGTGACGGG 99
||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||
Sbjct 149 CGTATGGGGAGACAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAAAGTGGAAGAGGAGGAGAGTGAGAGG 222
Query 100 CTCCCAGCCTTTCACCTTCCCTTGCATGTGAGTTTTCCCAACAAGCCTCACTCTGAGGAATTTCAGCCAGTTTC 173
|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 223 CTCCCAGCCTTTCACCTTCCCTTACAT----------------------------------------------- 249
Query 174 TCTGCTGACGCAAGAGACTTGTGGCCATAGGACTCCCACTTCTCAGCACAATACAATGGAAGTTGATGGCAATA 247
|||||.||||||||||
Sbjct 250 ----------------------------------------------------------GAAGTCGATGGCAATA 265
Query 248 AAGTTATGTCTTCATTTGCCCCACACAACTCATCTACCTCACCTCAGAAGGCAGAAGAAGGTGGGCGACAGAGT 321
||||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 266 AAGTTATGTCTTCATTAGCTCCATACAACTCATCTACCTCACCTCAGAAGGCGGAAGAAGGTGGGCGACAGAGT 339
Query 322 GGCGAGTCCTTGTCTAGTACAGCCCTGGGAACTCCTGAACGGCGCAAGGGCAGTTTAGCTGATGTTGTTGACAC 395
|||||||||.||||.||..||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct 340 GGCGAGTCCGTGTCGAGCGCAGCCCTGGGGACTCCCGAGCGGCGCAAGGGCAGCTTAGCGGATGTGGTGGACAC 413
Query 396 CTTGAAGCAGAGGAAAATGGAAGAGCTCATCAAAAACGAGCCGGAAGAAACCCCCAGTATTGAAAAACTACTCT 469
|.|||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 414 CCTGAAGCAGAGGAAGATGGAAGAGCTGATCAAGAATGAGCCAGAAGACACTCCCAGTATTGAAAAGCTACTCT 487
Query 470 CAAAGGACTGGAAAGACAAGCTTCTTGCAATGGGATCGGGGAACTTTGGCGAAATAAAAGGGACTCCCGAGAGC 543
|.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 488 CCAAGGACTGGAAAGACAAGCTCCTGGCAATGGGATCAGGGAACTTTGGAGAAATAAAAGGGACTCCTGAGAGC 561
Query 544 TTAGCTGAGAAAGAAAGGCAACTCATGGGTATGATCAACCAGCTGACCAGCCTCCGAGAGCAGCTGTTGGCTGC 617
.|.||||||||.||..||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||..|||||||
Sbjct 562 CTCGCTGAGAAGGAGCGGCAGCTCATGGGTATGATCAATCAGCTGACCAGTCTACGGGAGCAACTCCTGGCTGC 635
Query 618 CCACGATGAGCAGAAGAAACTAGCTGCCTCTCAGATTGAGAAACAGCGTCAGCAAATGGAGCTGGCCAAGCAGC 691
||||||||||||||||||..|.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 636 CCACGATGAGCAGAAGAAGTTGGCTGCATCTCAGATAGAGAAACAGCGTCAGCAGATGGAGCTGGCCAAGCAGC 709
Query 692 AACAAGAACAAATTGCAAGACAGCAGCAGCAGCTTCTACAGCAACAACACAAAATCAATTTGCTCCAGCAACAG 765
||||.||.||.||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 710 AACAGGAGCAGATCGCGAGGCAACAGCAGCAGCTTCTGCAGCAACAACACAAAATCAACTTGCTTCAGCAACAG 783
Query 766 ATCCAGGTTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTAATGATTCCCGTATTCCCTCCTGATCAACGGACACTGGCTGCAGC 839
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.|||||
Sbjct 784 ATCCAGGTTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTGATGATTCCCGTGTTCCCTCCTGACCAGCGGACCCTCGCAGCAGC 857
Query 840 TGCCCAGCAAGGATTCCTCCTCCCTCCAGGCTTCAGCTATAAGGCTGGATGTAGTGACCCTTACCCTGTTCAGC 913
|||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 858 TGCCCAGCAAGGATTCCTCCTTCCTCCTGGTTTCAGCTACAAGGCTGGGTGCAGTGACCCTTACCCTGTTCAGC 931
Query 914 TGATCCCAACTACCATGGCAGCTGCTGCCGCAGCAACACCAGGCTTAGGCCCACTCCAACTGCAGCAGTTATAT 987
||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 932 TGATCCCAACCACTATGGCAGCTGCTGCTGCAGCAACACCAGGCTTAGGCCCACTCCAGCTGCAGCAGTTCTAT 1005
Query 988 GCTGCCCAGCTAGCTGCAATGCAGGTATCTCCAGGAGGGAAGCTGCCAGGCATACCCCAAGGCAACCTTGGTGC 1061
||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|.||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006 GCTGCCCAGCTAGCCGCAATGCAGGTTTCTCCAGGAGGGAAGCTCCTAGGCCTACCCCAAGGCAACCTTGGTGC 1079
Query 1062 TGCTGTATCTCCTACCAGCATTCACACAGACAAGAGCACAAACAGCCCACCACCCAAAAGC------------- 1122
|||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1080 TGCCGTGTCTCCTACCAGCATTCACACAGACAAGAGCACAAACAGTCCACCACCCAAAAGCAAGGATGAAGTGG 1153
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1154 CCCAGCCACTGAACCTATCAGCTAAGCCCAAGACCTCTGATGGCAAATCACCTGCATCACCCACCTCTCCTCAC 1227
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1228 ATGCCAGCTCTGAGAATAAACAGTGGGGCTGGCCCCCTCAAAGCCTCTGTCCCGGCAGCATTAGCTAGTCCTTC 1301
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1302 TGCAAGAGTTAGCACAATAGGCTATTTAAATGACCACGATGCTGTCACCAAGGCAATCCAAGAAGCTCGCCAGA 1375
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1376 TGAAAGAGCAACTCAGGCGAGAGCAGCAAGCGTTGGACGGGAAGGTGGCCGTGGTGAACAGCATAGGTCTCAGC 1449
Query 1123 ---------------AAGGAAAAAACAACACTGGAGAGTCTGACTCAGCAACTGGCAGTTAAACAGAATGAAGA 1181
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||
Sbjct 1450 AACTGCCGGACAGAAAAGGAAAAAACAACACTGGAGAGCCTGACTCAGCAGTTGGCAGTTAAACAGAATGAAGA 1523
Query 1182 AGGAAAATTTAGCCATGCAATGATGGATTTCAATCTGAGTGGAGATTCTGATGGAAGTGCTGGAGTCTCAGAGT 1255
|||.|||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1524 AGGGAAATTTAGCCATGGAATGATGGATTTCAATATGAGTGGAGATTCTGACGGAAGCGCTGGAGTCTCAGAGT 1597
Query 1256 CAAGAATTTATAGGGAATCCCGAGGGCGTGGTAGCAATGAACCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATG 1329
||||||||||.|||||||||.|.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1598 CAAGAATTTACAGGGAATCCAGGGGACGTGGTAGCAACGAGCCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATG 1671
Query 1330 GTGTGGGCTAAAGATGAACGGAGAAAGATCCTTCAAGCCTTTCCTGACATGCACAACTCCAACATCAGCAAGAT 1403
||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1672 GTGTGGGCGAAAGATGAACGGAGGAAAATCCTTCAGGCCTTTCCCGACATGCACAATTCCAACATCAGCAAGAT 1745
Query 1404 ATTGGGATCTCGCTGGAAAGCTATGACAAACCTAGAGAAACAGCCATATTATGAGGAGCAAGCCCGTCTCAGCA 1477
|.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1746 ACTGGGATCTCGCTGGAAAGCTATGACCAACCTAGAGAAACAGCCATACTATGAGGAGCAGGCCCGCCTCAGCA 1819
Query 1478 AGCAGCACCTGGAGAAGTACCCTGACTATAAGTACAAGCCCAGGCCAAAGCGCACCTGCCTGGTGGATGGCAAA 1551
|.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1820 AACAGCACCTGGAGAAGTACCCGGACTACAAGTACAAGCCTAGGCCAAAGCGCACCTGTCTGGTGGACGGCAAG 1893
Query 1552 AAGCTGCGCATTGGTGAATACAAGGCAATCATGCGCAACAGGCGGCAGGAAATGCGGCAGTACTTCAATGTTGG 1625
||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||.||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1894 AAACTGCGTATCGGGGAGTACAAGGCCATCATGCGGAACCGGAGGCAGGAAATGCGACAGTACTTCAACGTTGG 1967
Query 1626 GCAACAAGCACAGATCCCCATTGCCACTGCTGGTGTTGTGTACCCTGGAGCCATCGCCATGGCTGGGATGCCCT 1699
|||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||..|.||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 1968 GCAACAAGCACAGATCCCCATCGCGACGGCCGGAGTTGTATACCCCAGCGCCATCGCCATGGCAGGAATGCCGT 2041
Query 1700 CCCCTCACCTGCCCTCGGAGCACTCAAGCGTGTCTAGCAGCCCAGAGCCTGGGATGCCTGTTATCCAGAGCACT 1773
||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 2042 CCCCTCACCTGCCCTCCGAGCACTCGAGCGTGTCCAGCAGCCCGGAGCCCGGGATGCCCGTGATCCAGAGCACT 2115
Query 1774 TACGGTGTGAAAGGAGAGGAGCCACATATCAAAGAAGAGATACAGGCCGAGGACATCAATGGAGAAATTTATGA 1847
|||||.|..||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 2116 TACGGCGCCAAGGGAGAGGAGCCCCACATCAAGGAAGAGATCCAGGCTGAGGACATCAACGGAGAGATTTACGA 2189
Query 1848 TGAGTACGACGAGGAAGAGGATGATCCAGATGTAGATTATGGGAGTGACAGTGAAAACCATATTGCAGGACAAG 1921
.||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 2190 GGAGTACGATGAGGAGGAGGAGGACCCGGATGTGGATTATGGGAGTGACAGCGAAAACCACATTGCGGGACAAG 2263
Query 1922 CCAAC 1926
|||||
Sbjct 2264 CCAAC 2268