Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471554
- Subject:
- XM_006506939.3
- Aligned Length:
- 2292
- Identities:
- 1645
- Gaps:
- 471
Alignment
Query 1 ---------------------------------------ATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGA 35
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTTACTGACCCTGATTTACCTCAGGAGTTTGAAAGGATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGA 74
Query 36 AGCAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAAAGTGGAAGAAGAGGAGAGTGACGGGCTCCCAGCCT 109
..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||
Sbjct 75 GACAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAAAGTGGAAGAGGAGGAGAGTGAGAGGCTCCCAGCCT 148
Query 110 TTCACCTTCCCTTGCATGTGAGTTTTCCCAACAAGCCTCACTCTGAGGAATTTCAGCCAGTTTCTCTGCTGACG 183
|||||||||||||.|||
Sbjct 149 TTCACCTTCCCTTACAT--------------------------------------------------------- 165
Query 184 CAAGAGACTTGTGGCCATAGGACTCCCACTTCTCAGCACAATACAATGGAAGTTGATGGCAATAAAGTTATGTC 257
|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 166 ------------------------------------------------GAAGTCGATGGCAATAAAGTTATGTC 191
Query 258 TTCATTTGCCCCACACAACTCATCTACCTCACCTCAGAAGGCAGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCT 331
||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 192 TTCATTAGCTCCATACAACTCATCTACCTCACCTCAGAAGGCGGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCG 265
Query 332 TGTCTAGTACAGCCCTGGGAACTCCTGAACGGCGCAAGGGCAGTTTAGCTGATGTTGTTGACACCTTGAAGCAG 405
||||.||..||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||.||||||||
Sbjct 266 TGTCGAGCGCAGCCCTGGGGACTCCCGAGCGGCGCAAGGGCAGCTTAGCGGATGTGGTGGACACCCTGAAGCAG 339
Query 406 AGGAAAATGGAAGAGCTCATCAAAAACGAGCCGGAAGAAACCCCCAGTATTGAAAAACTACTCTCAAAGGACTG 479
|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 340 AGGAAGATGGAAGAGCTGATCAAGAATGAGCCAGAAGACACTCCCAGTATTGAAAAGCTACTCTCCAAGGACTG 413
Query 480 GAAAGACAAGCTTCTTGCAATGGGATCGGGGAACTTTGGCGAAATAAAAGGGACTCCCGAGAGCTTAGCTGAGA 553
||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||||
Sbjct 414 GAAAGACAAGCTCCTGGCAATGGGATCAGGGAACTTTGGAGAAATAAAAGGGACTCCTGAGAGCCTCGCTGAGA 487
Query 554 AAGAAAGGCAACTCATGGGTATGATCAACCAGCTGACCAGCCTCCGAGAGCAGCTGTTGGCTGCCCACGATGAG 627
|.||..||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||..|||||||||||||||||
Sbjct 488 AGGAGCGGCAGCTCATGGGTATGATCAATCAGCTGACCAGTCTACGGGAGCAACTCCTGGCTGCCCACGATGAG 561
Query 628 CAGAAGAAACTAGCTGCCTCTCAGATTGAGAAACAGCGTCAGCAAATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAAGAACA 701
||||||||..|.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 562 CAGAAGAAGTTGGCTGCATCTCAGATAGAGAAACAGCGTCAGCAGATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAGGAGCA 635
Query 702 AATTGCAAGACAGCAGCAGCAGCTTCTACAGCAACAACACAAAATCAATTTGCTCCAGCAACAGATC---CAGG 772
.||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||| ||||
Sbjct 636 GATCGCGAGGCAACAGCAGCAGCTTCTGCAGCAACAACACAAAATCAACTTGCTTCAGCAACAGATCCAGCAGG 709
Query 773 TTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTAATGATTCCCGTATTCCCTCCTGATCAACGGACACTGGCTGCAGCTGCCCAG 846
||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 710 TTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTGATGATTCCCGTGTTCCCTCCTGACCAGCGGACCCTCGCAGCAGCTGCCCAG 783
Query 847 CAAGGATTCCTCCTCCCTCCAGGCTTCAGCTATAAGGCTGGATGTAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCC 920
||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 784 CAAGGATTCCTCCTTCCTCCTGGTTTCAGCTACAAGGCTGGGTGCAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCC 857
Query 921 AACTACCATGGCAGCTGCTGCCGCAGCAACACCAGGCTTAGGCCCACTCCAACTGCAGCAGTTATATGCTGCCC 994
|||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 858 AACCACTATGGCAGCTGCTGCTGCAGCAACACCAGGCTTAGGCCCACTCCAGCTGCAGCAGTTCTATGCTGCCC 931
Query 995 AGCTAGCTGCAATGCAGGTATCTCCAGGAGGGAAGCTGCCAGGCATACCCCAAGGCAACCTTGGTGCTGCTGTA 1068
|||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|.||||.|||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 932 AGCTAGCCGCAATGCAGGTTTCTCCAGGAGGGAAGCTCCTAGGCCTACCCCAAGGCAACCTTGGTGCTGCCGTG 1005
Query 1069 TCTCCTACCAGCATTCACACAGACAAGAGCACAAACAGCCCACCACCCAAAAGC-------------------- 1122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1006 TCTCCTACCAGCATTCACACAGACAAGAGCACAAACAGTCCACCACCCAAAAGCAAGGATGAAGTGGCCCAGCC 1079
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1080 ACTGAACCTATCAGCTAAGCCCAAGACCTCTGATGGCAAATCACCTGCATCACCCACCTCTCCTCACATGCCAG 1153
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1154 CTCTGAGAATAAACAGTGGGGCTGGCCCCCTCAAAGCCTCTGTCCCGGCAGCATTAGCTAGTCCTTCTGCAAGA 1227
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1228 GTTAGCACAATAGGCTATTTAAATGACCACGATGCTGTCACCAAGGCAATCCAAGAAGCTCGCCAGATGAAAGA 1301
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1302 GCAACTCAGGCGAGAGCAGCAAGCGTTGGACGGGAAGGTGGCCGTGGTGAACAGCATAGGTCTCAGCAACTGCC 1375
Query 1123 --------AAGGAAAAAACAACACTGGAGAGTCTGACTCAGCAACTGGCAGTTAAACAGAATGAAGAAGGAAAA 1188
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1376 GGACAGAAAAGGAAAAAACAACACTGGAGAGCCTGACTCAGCAGTTGGCAGTTAAACAGAATGAAGAAGGGAAA 1449
Query 1189 TTTAGCCATGCAATGATGGATTTCAATCTGAGTGGAGATTCTGATGGAAGTGCTGGAGTCTCAGAGTCAAGAAT 1262
||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1450 TTTAGCCATGGAATGATGGATTTCAATATGAGTGGAGATTCTGACGGAAGCGCTGGAGTCTCAGAGTCAAGAAT 1523
Query 1263 TTATAGGGAATCCCGAGGGCGTGGTAGCAATGAACCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATGGTGTGGG 1336
|||.|||||||||.|.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1524 TTACAGGGAATCCAGGGGACGTGGTAGCAACGAGCCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATGGTGTGGG 1597
Query 1337 CTAAAGATGAACGGAGAAAGATCCTTCAAGCCTTTCCTGACATGCACAACTCCAACATCAGCAAGATATTGGGA 1410
|.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1598 CGAAAGATGAACGGAGGAAAATCCTTCAGGCCTTTCCCGACATGCACAATTCCAACATCAGCAAGATACTGGGA 1671
Query 1411 TCTCGCTGGAAAGCTATGACAAACCTAGAGAAACAGCCATATTATGAGGAGCAAGCCCGTCTCAGCAAGCAGCA 1484
||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 1672 TCTCGCTGGAAAGCTATGACCAACCTAGAGAAACAGCCATACTATGAGGAGCAGGCCCGCCTCAGCAAACAGCA 1745
Query 1485 CCTGGAGAAGTACCCTGACTATAAGTACAAGCCCAGGCCAAAGCGCACCTGCCTGGTGGATGGCAAAAAGCTGC 1558
|||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 1746 CCTGGAGAAGTACCCGGACTACAAGTACAAGCCTAGGCCAAAGCGCACCTGTCTGGTGGACGGCAAGAAACTGC 1819
Query 1559 GCATTGGTGAATACAAGGCAATCATGCGCAACAGGCGGCAGGAAATGCGGCAGTACTTCAATGTTGGGCAACAA 1632
|.||.||.||.||||||||.||||||||.|||.||.|||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1820 GTATCGGGGAGTACAAGGCCATCATGCGGAACCGGAGGCAGGAAATGCGACAGTACTTCAACGTTGGGCAACAA 1893
Query 1633 GCACAGATCCCCATTGCCACTGCTGGTGTTGTGTACCCTGGAGCCATCGCCATGGCTGGGATGCCCTCCCCTCA 1706
||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||..|.||||||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1894 GCACAGATCCCCATCGCGACGGCCGGAGTTGTATACCCCAGCGCCATCGCCATGGCAGGAATGCCGTCCCCTCA 1967
Query 1707 CCTGCCCTCGGAGCACTCAAGCGTGTCTAGCAGCCCAGAGCCTGGGATGCCTGTTATCCAGAGCACTTACGGTG 1780
|||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1968 CCTGCCCTCCGAGCACTCGAGCGTGTCCAGCAGCCCGGAGCCCGGGATGCCCGTGATCCAGAGCACTTACGGCG 2041
Query 1781 TGAAAGGAGAGGAGCCACATATCAAAGAAGAGATACAGGCCGAGGACATCAATGGAGAAATTTATGATGAGTAC 1854
..||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||
Sbjct 2042 CCAAGGGAGAGGAGCCCCACATCAAGGAAGAGATCCAGGCTGAGGACATCAACGGAGAGATTTACGAGGAGTAC 2115
Query 1855 GACGAGGAAGAGGATGATCCAGATGTAGATTATGGGAGTGACAGTGAAAACCATATTGCAGGACAAGCCAAC 1926
||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2116 GATGAGGAGGAGGAGGACCCGGATGTGGATTATGGGAGTGACAGCGAAAACCACATTGCGGGACAAGCCAAC 2187