Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471554
- Subject:
- XM_011241577.1
- Aligned Length:
- 2253
- Identities:
- 1743
- Gaps:
- 327
Alignment
Query 1 ATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGAAGCAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGAGACAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAA 74
Query 75 AGTGGAAGAAGAGGAGAGTGACGGGCTCCCAGCCTTTCACCTTCCCTTGCATGTGAGTTTTCCCAACAAGCCTC 148
|||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGTGGAAGAGGAGGAGAGTGAGAGGCTCCCAGCCTTTCACCTTCCCTTACATGTGAGTTTTCCCAACAAGCCTC 148
Query 149 ACTCTGAGGAATTTCAGCCAGTTTCTCTGCTGACGCAAGAGACTTGTGGCCATAGGACTCCCACTTCTCAGCAC 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||.||||||...||||||
Sbjct 149 ACTCTGAGGAATTTCAGCCAGTTTCTCTGCTGACGCAAGAGACTTGTGGTCCTAGGACCCCCACTGTGCAGCAC 222
Query 223 AATACAATGGAAGTTGATGGCAATAAAGTTATGTCTTCATTTGCCCCACACAACTCATCTACCTCACCTCAGAA 296
||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AACACAATGGAAGTCGATGGCAATAAAGTTATGTCTTCATTAGCTCCATACAACTCATCTACCTCACCTCAGAA 296
Query 297 GGCAGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCTTGTCTAGTACAGCCCTGGGAACTCCTGAACGGCGCAAGG 370
|||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||..||||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 297 GGCGGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCGTGTCGAGCGCAGCCCTGGGGACTCCCGAGCGGCGCAAGG 370
Query 371 GCAGTTTAGCTGATGTTGTTGACACCTTGAAGCAGAGGAAAATGGAAGAGCTCATCAAAAACGAGCCGGAAGAA 444
||||.|||||.|||||.||.||||||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.
Sbjct 371 GCAGCTTAGCGGATGTGGTGGACACCCTGAAGCAGAGGAAGATGGAAGAGCTGATCAAGAATGAGCCAGAAGAC 444
Query 445 ACCCCCAGTATTGAAAAACTACTCTCAAAGGACTGGAAAGACAAGCTTCTTGCAATGGGATCGGGGAACTTTGG 518
||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 445 ACTCCCAGTATTGAAAAGCTACTCTCCAAGGACTGGAAAGACAAGCTCCTGGCAATGGGATCAGGGAACTTTGG 518
Query 519 CGAAATAAAAGGGACTCCCGAGAGCTTAGCTGAGAAAGAAAGGCAACTCATGGGTATGATCAACCAGCTGACCA 592
.|||||||||||||||||.||||||.|.||||||||.||..||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 519 AGAAATAAAAGGGACTCCTGAGAGCCTCGCTGAGAAGGAGCGGCAGCTCATGGGTATGATCAATCAGCTGACCA 592
Query 593 GCCTCCGAGAGCAGCTGTTGGCTGCCCACGATGAGCAGAAGAAACTAGCTGCCTCTCAGATTGAGAAACAGCGT 666
|.||.||.|||||.||..|||||||||||||||||||||||||..|.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 593 GTCTACGGGAGCAACTCCTGGCTGCCCACGATGAGCAGAAGAAGTTGGCTGCATCTCAGATAGAGAAACAGCGT 666
Query 667 CAGCAAATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAAGAACAAATTGCAAGACAGCAGCAGCAGCTTCTACAGCAACAACA 740
|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 667 CAGCAGATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAGGAGCAGATCGCGAGGCAACAGCAGCAGCTTCTGCAGCAACAACA 740
Query 741 CAAAATCAATTTGCTCCAGCAACAGATC---CAGGTTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTAATGATTCCCGTATTCC 811
|||||||||.|||||.|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 741 CAAAATCAACTTGCTTCAGCAACAGATCCAGCAGGTTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTGATGATTCCCGTGTTCC 814
Query 812 CTCCTGATCAACGGACACTGGCTGCAGCTGCCCAGCAAGGATTCCTCCTCCCTCCAGGCTTCAGCTATAAGGCT 885
|||||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||
Sbjct 815 CTCCTGACCAGCGGACCCTCGCAGCAGCTGCCCAGCAAGGATTCCTCCTTCCTCCTGGTTTCAGCTACAAGGCT 888
Query 886 GGATGTAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCCAACTACCATGGCAGCTGCTGCCGCAGCAACACCAGGCTT 959
||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 889 GGGTGCAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCCAACCACTATGGCAGCTGCTGCTGCAGCAACACCAGGCTT 962
Query 960 AGGCCCACTCCAACTGCAGCAGTTATATGCTGCCCAGCTAGCTGCAATGCAGGTATCTCCAGGAGGGAAGCTGC 1033
||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 963 AGGCCCACTCCAGCTGCAGCAGTTCTATGCTGCCCAGCTAGCCGCAATGCAGGTTTCTCCAGGAGGGAAGCTCC 1036
Query 1034 CAGGCATACCCCAAGGCAACCTTGGTGCTGCTGTATCTCCTACCAGCATTCACACAGACAAGAGCACAAACAGC 1107
.||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037 TAGGCCTACCCCAAGGCAACCTTGGTGCTGCCGTGTCTCCTACCAGCATTCACACAGACAAGAGCACAAACAGT 1110
Query 1108 CCACCACCCAAAAGC----------------------------------------------------------- 1122
|||||||||||||||
Sbjct 1111 CCACCACCCAAAAGCAAGGATGAAGTGGCCCAGCCACTGAACCTATCAGCTAAGCCCAAGACCTCTGATGGCAA 1184
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1185 ATCACCTGCATCACCCACCTCTCCTCACATGCCAGCTCTGAGAATAAACAGTGGGGCTGGCCCCCTCAAAGCCT 1258
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1259 CTGTCCCGGCAGCATTAGCTAGTCCTTCTGCAAGAGTTAGCACAATAGGCTATTTAAATGACCACGATGCTGTC 1332
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1333 ACCAAGGCAATCCAAGAAGCTCGCCAGATGAAAGAGCAACTCAGGCGAGAGCAGCAAGCGTTGGACGGGAAGGT 1406
Query 1123 -------------------------------------------AAGGAAAAAACAACACTGGAGAGTCTGACTC 1153
|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1407 GGCCGTGGTGAACAGCATAGGTCTCAGCAACTGCCGGACAGAAAAGGAAAAAACAACACTGGAGAGCCTGACTC 1480
Query 1154 AGCAACTGGCAGTTAAACAGAATGAAGAAGGAAAATTTAGCCATGCAATGATGGATTTCAATCTGAGTGGAGAT 1227
||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1481 AGCAGTTGGCAGTTAAACAGAATGAAGAAGGGAAATTTAGCCATGGAATGATGGATTTCAATATGAGTGGAGAT 1554
Query 1228 TCTGATGGAAGTGCTGGAGTCTCAGAGTCAAGAATTTATAGGGAATCCCGAGGGCGTGGTAGCAATGAACCCCA 1301
|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 1555 TCTGACGGAAGCGCTGGAGTCTCAGAGTCAAGAATTTACAGGGAATCCAGGGGACGTGGTAGCAACGAGCCCCA 1628
Query 1302 CATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATGGTGTGGGCTAAAGATGAACGGAGAAAGATCCTTCAAGCCTTTCCTG 1375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 1629 CATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATGGTGTGGGCGAAAGATGAACGGAGGAAAATCCTTCAGGCCTTTCCCG 1702
Query 1376 ACATGCACAACTCCAACATCAGCAAGATATTGGGATCTCGCTGGAAAGCTATGACAAACCTAGAGAAACAGCCA 1449
||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ACATGCACAATTCCAACATCAGCAAGATACTGGGATCTCGCTGGAAAGCTATGACCAACCTAGAGAAACAGCCA 1776
Query 1450 TATTATGAGGAGCAAGCCCGTCTCAGCAAGCAGCACCTGGAGAAGTACCCTGACTATAAGTACAAGCCCAGGCC 1523
||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1777 TACTATGAGGAGCAGGCCCGCCTCAGCAAACAGCACCTGGAGAAGTACCCGGACTACAAGTACAAGCCTAGGCC 1850
Query 1524 AAAGCGCACCTGCCTGGTGGATGGCAAAAAGCTGCGCATTGGTGAATACAAGGCAATCATGCGCAACAGGCGGC 1597
||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||.||.|||
Sbjct 1851 AAAGCGCACCTGTCTGGTGGACGGCAAGAAACTGCGTATCGGGGAGTACAAGGCCATCATGCGGAACCGGAGGC 1924
Query 1598 AGGAAATGCGGCAGTACTTCAATGTTGGGCAACAAGCACAGATCCCCATTGCCACTGCTGGTGTTGTGTACCCT 1671
||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.
Sbjct 1925 AGGAAATGCGACAGTACTTCAACGTTGGGCAACAAGCACAGATCCCCATCGCGACGGCCGGAGTTGTATACCCC 1998
Query 1672 GGAGCCATCGCCATGGCTGGGATGCCCTCCCCTCACCTGCCCTCGGAGCACTCAAGCGTGTCTAGCAGCCCAGA 1745
.|.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 1999 AGCGCCATCGCCATGGCAGGAATGCCGTCCCCTCACCTGCCCTCCGAGCACTCGAGCGTGTCCAGCAGCCCGGA 2072
Query 1746 GCCTGGGATGCCTGTTATCCAGAGCACTTACGGTGTGAAAGGAGAGGAGCCACATATCAAAGAAGAGATACAGG 1819
|||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|..||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 2073 GCCCGGGATGCCCGTGATCCAGAGCACTTACGGCGCCAAGGGAGAGGAGCCCCACATCAAGGAAGAGATCCAGG 2146
Query 1820 CCGAGGACATCAATGGAGAAATTTATGATGAGTACGACGAGGAAGAGGATGATCCAGATGTAGATTATGGGAGT 1893
|.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2147 CTGAGGACATCAACGGAGAGATTTACGAGGAGTACGATGAGGAGGAGGAGGACCCGGATGTGGATTATGGGAGT 2220
Query 1894 GACAGTGAAAACCATATTGCAGGACAAGCCAAC 1926
|||||.||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2221 GACAGCGAAAACCACATTGCGGGACAAGCCAAC 2253