Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471554
- Subject:
- XM_011241580.2
- Aligned Length:
- 2289
- Identities:
- 1645
- Gaps:
- 468
Alignment
Query 1 ---------------------------------------ATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGA 35
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTTACTGACCCTGATTTACCTCAGGAGTTTGAAAGGATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGA 74
Query 36 AGCAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAAAGTGGAAGAAGAGGAGAGTGACGGGCTCCCAGCCT 109
..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||
Sbjct 75 GACAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAAAGTGGAAGAGGAGGAGAGTGAGAGGCTCCCAGCCT 148
Query 110 TTCACCTTCCCTTGCATGTGAGTTTTCCCAACAAGCCTCACTCTGAGGAATTTCAGCCAGTTTCTCTGCTGACG 183
|||||||||||||.|||
Sbjct 149 TTCACCTTCCCTTACAT--------------------------------------------------------- 165
Query 184 CAAGAGACTTGTGGCCATAGGACTCCCACTTCTCAGCACAATACAATGGAAGTTGATGGCAATAAAGTTATGTC 257
|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 166 ------------------------------------------------GAAGTCGATGGCAATAAAGTTATGTC 191
Query 258 TTCATTTGCCCCACACAACTCATCTACCTCACCTCAGAAGGCAGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCT 331
||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 192 TTCATTAGCTCCATACAACTCATCTACCTCACCTCAGAAGGCGGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCG 265
Query 332 TGTCTAGTACAGCCCTGGGAACTCCTGAACGGCGCAAGGGCAGTTTAGCTGATGTTGTTGACACCTTGAAGCAG 405
||||.||..||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||.||||||||
Sbjct 266 TGTCGAGCGCAGCCCTGGGGACTCCCGAGCGGCGCAAGGGCAGCTTAGCGGATGTGGTGGACACCCTGAAGCAG 339
Query 406 AGGAAAATGGAAGAGCTCATCAAAAACGAGCCGGAAGAAACCCCCAGTATTGAAAAACTACTCTCAAAGGACTG 479
|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 340 AGGAAGATGGAAGAGCTGATCAAGAATGAGCCAGAAGACACTCCCAGTATTGAAAAGCTACTCTCCAAGGACTG 413
Query 480 GAAAGACAAGCTTCTTGCAATGGGATCGGGGAACTTTGGCGAAATAAAAGGGACTCCCGAGAGCTTAGCTGAGA 553
||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||||
Sbjct 414 GAAAGACAAGCTCCTGGCAATGGGATCAGGGAACTTTGGAGAAATAAAAGGGACTCCTGAGAGCCTCGCTGAGA 487
Query 554 AAGAAAGGCAACTCATGGGTATGATCAACCAGCTGACCAGCCTCCGAGAGCAGCTGTTGGCTGCCCACGATGAG 627
|.||..||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||..|||||||||||||||||
Sbjct 488 AGGAGCGGCAGCTCATGGGTATGATCAATCAGCTGACCAGTCTACGGGAGCAACTCCTGGCTGCCCACGATGAG 561
Query 628 CAGAAGAAACTAGCTGCCTCTCAGATTGAGAAACAGCGTCAGCAAATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAAGAACA 701
||||||||..|.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 562 CAGAAGAAGTTGGCTGCATCTCAGATAGAGAAACAGCGTCAGCAGATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAGGAGCA 635
Query 702 AATTGCAAGACAGCAGCAGCAGCTTCTACAGCAACAACACAAAATCAATTTGCTCCAGCAACAGATCCAGGTTC 775
.||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 636 GATCGCGAGGCAACAGCAGCAGCTTCTGCAGCAACAACACAAAATCAACTTGCTTCAGCAACAGATCCAGGTTC 709
Query 776 AAGGTCAGCTGCCGCCATTAATGATTCCCGTATTCCCTCCTGATCAACGGACACTGGCTGCAGCTGCCCAGCAA 849
|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 710 AAGGTCAGCTGCCGCCATTGATGATTCCCGTGTTCCCTCCTGACCAGCGGACCCTCGCAGCAGCTGCCCAGCAA 783
Query 850 GGATTCCTCCTCCCTCCAGGCTTCAGCTATAAGGCTGGATGTAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCCAAC 923
|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 784 GGATTCCTCCTTCCTCCTGGTTTCAGCTACAAGGCTGGGTGCAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCCAAC 857
Query 924 TACCATGGCAGCTGCTGCCGCAGCAACACCAGGCTTAGGCCCACTCCAACTGCAGCAGTTATATGCTGCCCAGC 997
.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 858 CACTATGGCAGCTGCTGCTGCAGCAACACCAGGCTTAGGCCCACTCCAGCTGCAGCAGTTCTATGCTGCCCAGC 931
Query 998 TAGCTGCAATGCAGGTATCTCCAGGAGGGAAGCTGCCAGGCATACCCCAAGGCAACCTTGGTGCTGCTGTATCT 1071
||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|.||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 932 TAGCCGCAATGCAGGTTTCTCCAGGAGGGAAGCTCCTAGGCCTACCCCAAGGCAACCTTGGTGCTGCCGTGTCT 1005
Query 1072 CCTACCAGCATTCACACAGACAAGAGCACAAACAGCCCACCACCCAAAAGC----------------------- 1122
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1006 CCTACCAGCATTCACACAGACAAGAGCACAAACAGTCCACCACCCAAAAGCAAGGATGAAGTGGCCCAGCCACT 1079
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1080 GAACCTATCAGCTAAGCCCAAGACCTCTGATGGCAAATCACCTGCATCACCCACCTCTCCTCACATGCCAGCTC 1153
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1154 TGAGAATAAACAGTGGGGCTGGCCCCCTCAAAGCCTCTGTCCCGGCAGCATTAGCTAGTCCTTCTGCAAGAGTT 1227
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1228 AGCACAATAGGCTATTTAAATGACCACGATGCTGTCACCAAGGCAATCCAAGAAGCTCGCCAGATGAAAGAGCA 1301
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1302 ACTCAGGCGAGAGCAGCAAGCGTTGGACGGGAAGGTGGCCGTGGTGAACAGCATAGGTCTCAGCAACTGCCGGA 1375
Query 1123 -----AAGGAAAAAACAACACTGGAGAGTCTGACTCAGCAACTGGCAGTTAAACAGAATGAAGAAGGAAAATTT 1191
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1376 CAGAAAAGGAAAAAACAACACTGGAGAGCCTGACTCAGCAGTTGGCAGTTAAACAGAATGAAGAAGGGAAATTT 1449
Query 1192 AGCCATGCAATGATGGATTTCAATCTGAGTGGAGATTCTGATGGAAGTGCTGGAGTCTCAGAGTCAAGAATTTA 1265
|||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1450 AGCCATGGAATGATGGATTTCAATATGAGTGGAGATTCTGACGGAAGCGCTGGAGTCTCAGAGTCAAGAATTTA 1523
Query 1266 TAGGGAATCCCGAGGGCGTGGTAGCAATGAACCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATGGTGTGGGCTA 1339
.|||||||||.|.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1524 CAGGGAATCCAGGGGACGTGGTAGCAACGAGCCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATGGTGTGGGCGA 1597
Query 1340 AAGATGAACGGAGAAAGATCCTTCAAGCCTTTCCTGACATGCACAACTCCAACATCAGCAAGATATTGGGATCT 1413
|||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1598 AAGATGAACGGAGGAAAATCCTTCAGGCCTTTCCCGACATGCACAATTCCAACATCAGCAAGATACTGGGATCT 1671
Query 1414 CGCTGGAAAGCTATGACAAACCTAGAGAAACAGCCATATTATGAGGAGCAAGCCCGTCTCAGCAAGCAGCACCT 1487
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1672 CGCTGGAAAGCTATGACCAACCTAGAGAAACAGCCATACTATGAGGAGCAGGCCCGCCTCAGCAAACAGCACCT 1745
Query 1488 GGAGAAGTACCCTGACTATAAGTACAAGCCCAGGCCAAAGCGCACCTGCCTGGTGGATGGCAAAAAGCTGCGCA 1561
||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.|
Sbjct 1746 GGAGAAGTACCCGGACTACAAGTACAAGCCTAGGCCAAAGCGCACCTGTCTGGTGGACGGCAAGAAACTGCGTA 1819
Query 1562 TTGGTGAATACAAGGCAATCATGCGCAACAGGCGGCAGGAAATGCGGCAGTACTTCAATGTTGGGCAACAAGCA 1635
|.||.||.||||||||.||||||||.|||.||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1820 TCGGGGAGTACAAGGCCATCATGCGGAACCGGAGGCAGGAAATGCGACAGTACTTCAACGTTGGGCAACAAGCA 1893
Query 1636 CAGATCCCCATTGCCACTGCTGGTGTTGTGTACCCTGGAGCCATCGCCATGGCTGGGATGCCCTCCCCTCACCT 1709
|||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||..|.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1894 CAGATCCCCATCGCGACGGCCGGAGTTGTATACCCCAGCGCCATCGCCATGGCAGGAATGCCGTCCCCTCACCT 1967
Query 1710 GCCCTCGGAGCACTCAAGCGTGTCTAGCAGCCCAGAGCCTGGGATGCCTGTTATCCAGAGCACTTACGGTGTGA 1783
||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|..|
Sbjct 1968 GCCCTCCGAGCACTCGAGCGTGTCCAGCAGCCCGGAGCCCGGGATGCCCGTGATCCAGAGCACTTACGGCGCCA 2041
Query 1784 AAGGAGAGGAGCCACATATCAAAGAAGAGATACAGGCCGAGGACATCAATGGAGAAATTTATGATGAGTACGAC 1857
|.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.
Sbjct 2042 AGGGAGAGGAGCCCCACATCAAGGAAGAGATCCAGGCTGAGGACATCAACGGAGAGATTTACGAGGAGTACGAT 2115
Query 1858 GAGGAAGAGGATGATCCAGATGTAGATTATGGGAGTGACAGTGAAAACCATATTGCAGGACAAGCCAAC 1926
|||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2116 GAGGAGGAGGAGGACCCGGATGTGGATTATGGGAGTGACAGCGAAAACCACATTGCGGGACAAGCCAAC 2184