Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471554
- Subject:
- XM_011241582.1
- Aligned Length:
- 2110
- Identities:
- 1715
- Gaps:
- 191
Alignment
Query 1 ATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGAAGCAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGAGACAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAA 74
Query 75 AGTGGAAGAAGAGGAGAGTGACGGGCTCCCAGCCTTTCACCTTCCCTTGCATGTGAGTTTTCCCAACAAGCCTC 148
|||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGTGGAAGAGGAGGAGAGTGAGAGGCTCCCAGCCTTTCACCTTCCCTTACATGTGAGTTTTCCCAACAAGCCTC 148
Query 149 ACTCTGAGGAATTTCAGCCAGTTTCTCTGCTGACGCAAGAGACTTGTGGCCATAGGACTCCCACTTCTCAGCAC 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||.||||||...||||||
Sbjct 149 ACTCTGAGGAATTTCAGCCAGTTTCTCTGCTGACGCAAGAGACTTGTGGTCCTAGGACCCCCACTGTGCAGCAC 222
Query 223 AATACAATGGAAGTTGATGGCAATAAAGTTATGTCTTCATTTGCCCCACACAACTCATCTACCTCACCTCAGAA 296
||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AACACAATGGAAGTCGATGGCAATAAAGTTATGTCTTCATTAGCTCCATACAACTCATCTACCTCACCTCAGAA 296
Query 297 GGCAGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCTTGTCTAGTACAGCCCTGGGAACTCCTGAACGGCGCAAGG 370
|||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||..||||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 297 GGCGGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCGTGTCGAGCGCAGCCCTGGGGACTCCCGAGCGGCGCAAGG 370
Query 371 GCAGTTTAGCTGATGTTGTTGACACCTTGAAGCAGAGGAAAATGGAAGAGCTCATCAAAAACGAGCCGGAAGAA 444
||||.|||||.|||||.||.||||||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.
Sbjct 371 GCAGCTTAGCGGATGTGGTGGACACCCTGAAGCAGAGGAAGATGGAAGAGCTGATCAAGAATGAGCCAGAAGAC 444
Query 445 ACCCCCAGTATTGAAAAACTACTCTCAAAGGACTGGAAAGACAAGCTTCTTGCAATGGGATCGGGGAACTTTGG 518
||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 445 ACTCCCAGTATTGAAAAGCTACTCTCCAAGGACTGGAAAGACAAGCTCCTGGCAATGGGATCAGGGAACTTTGG 518
Query 519 CGAAATAAAAGGGACTCCCGAGAGCTTAGCTGAGAAAGAAAGGCAACTCATGGGTATGATCAACCAGCTGACCA 592
.|||||||||||||||||.||||||.|.||||||||.||..||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 519 AGAAATAAAAGGGACTCCTGAGAGCCTCGCTGAGAAGGAGCGGCAGCTCATGGGTATGATCAATCAGCTGACCA 592
Query 593 GCCTCCGAGAGCAGCTGTTGGCTGCCCACGATGAGCAGAAGAAACTAGCTGCCTCTCAGATTGAGAAACAGCGT 666
|.||.||.|||||.||..|||||||||||||||||||||||||..|.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 593 GTCTACGGGAGCAACTCCTGGCTGCCCACGATGAGCAGAAGAAGTTGGCTGCATCTCAGATAGAGAAACAGCGT 666
Query 667 CAGCAAATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAAGAACAAATTGCAAGACAGCAGCAGCAGCTTCTACAGCAACAACA 740
|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 667 CAGCAGATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAGGAGCAGATCGCGAGGCAACAGCAGCAGCTTCTGCAGCAACAACA 740
Query 741 CAAAATCAATTTGCTCCAGCAACAGATCCAGGTTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTAATGATTCCCGTATTCCCTC 814
|||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 741 CAAAATCAACTTGCTTCAGCAACAGATCCAGGTTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTGATGATTCCCGTGTTCCCTC 814
Query 815 CTGATCAACGGACACTGGCTGCAGCTGCCCAGCAAGGATTCCTCCTCCCTCCAGGCTTCAGCTATAAGGCTGGA 888
||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.
Sbjct 815 CTGACCAGCGGACCCTCGCAGCAGCTGCCCAGCAAGGATTCCTCCTTCCTCCTGGTTTCAGCTACAAGGCTGGG 888
Query 889 TGTAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCCAACTACCATGGCAGCTGCTGCCGCAGCAACACCAGGCTTAGG 962
||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGCAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCCAACCACTATGGCAGCTGCTGCTGCAGCAACACCAGGCTTAGG 962
Query 963 CCCACTCCAACTGCAGCAGTTATATGCTGCCCAGCTAGCTG---CAATGCAGGTATCTCCAGGA--------GG 1025
|||||||||.||||||.| |.|..|| |||||||.| ||| |.|| |||.||...|||.|| ||
Sbjct 963 CCCACTCCAGCTGCAGGA-TGAAGTG--GCCCAGCCA-CTGAACCTAT-CAGCTAAGCCCAAGACCTCTGATGG 1031
Query 1026 GAA-------GC--------------------TGCCAG------GCATA-----------------CCCCAA-- 1047
.|| || |||||| |.||| ||.|||
Sbjct 1032 CAAATCACCTGCATCACCCACCTCTCCTCACATGCCAGCTCTGAGAATAAACAGTGGGGCTGGCCCCCTCAAAG 1105
Query 1048 ----------GGCAACCT----TGGTGCTGCTG--------------------TAT----------------CT 1071
||||.|.| |.||.||.||| ||| ||
Sbjct 1106 CCTCTGTCCCGGCAGCATTAGCTAGTCCTTCTGCAAGAGTTAGCACAATAGGCTATTTAAATGACCACGATGCT 1179
Query 1072 CCTACCA--GCATTC--------------------------ACACAGACAAGAGCA-CA--------------- 1101
...|||| |||.|| ||.|||.|.|||||| ||
Sbjct 1180 GTCACCAAGGCAATCCAAGAAGCTCGCCAGATGAAAGAGCAACTCAGGCGAGAGCAGCAAGCGTTGGACGGGAA 1253
Query 1102 -------------AACAG-------CCCACCACC-------CAAAAGCAAGGAAAAAACAACACTGGAGAGTCT 1148
||||| |.||.||.| ||.|| |||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1254 GGTGGCCGTGGTGAACAGCATAGGTCTCAGCAACTGCCGGACAGAA--AAGGAAAAAACAACACTGGAGAGCCT 1325
Query 1149 GACTCAGCAACTGGCAGTTAAACAGAATGAAGAAGGAAAATTTAGCCATGCAATGATGGATTTCAATCTGAGTG 1222
|||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1326 GACTCAGCAGTTGGCAGTTAAACAGAATGAAGAAGGGAAATTTAGCCATGGAATGATGGATTTCAATATGAGTG 1399
Query 1223 GAGATTCTGATGGAAGTGCTGGAGTCTCAGAGTCAAGAATTTATAGGGAATCCCGAGGGCGTGGTAGCAATGAA 1296
||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.||.|||||||||||.||.
Sbjct 1400 GAGATTCTGACGGAAGCGCTGGAGTCTCAGAGTCAAGAATTTACAGGGAATCCAGGGGACGTGGTAGCAACGAG 1473
Query 1297 CCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATGGTGTGGGCTAAAGATGAACGGAGAAAGATCCTTCAAGCCTT 1370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 1474 CCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATGGTGTGGGCGAAAGATGAACGGAGGAAAATCCTTCAGGCCTT 1547
Query 1371 TCCTGACATGCACAACTCCAACATCAGCAAGATATTGGGATCTCGCTGGAAAGCTATGACAAACCTAGAGAAAC 1444
|||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1548 TCCCGACATGCACAATTCCAACATCAGCAAGATACTGGGATCTCGCTGGAAAGCTATGACCAACCTAGAGAAAC 1621
Query 1445 AGCCATATTATGAGGAGCAAGCCCGTCTCAGCAAGCAGCACCTGGAGAAGTACCCTGACTATAAGTACAAGCCC 1518
|||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 1622 AGCCATACTATGAGGAGCAGGCCCGCCTCAGCAAACAGCACCTGGAGAAGTACCCGGACTACAAGTACAAGCCT 1695
Query 1519 AGGCCAAAGCGCACCTGCCTGGTGGATGGCAAAAAGCTGCGCATTGGTGAATACAAGGCAATCATGCGCAACAG 1592
|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||.|
Sbjct 1696 AGGCCAAAGCGCACCTGTCTGGTGGACGGCAAGAAACTGCGTATCGGGGAGTACAAGGCCATCATGCGGAACCG 1769
Query 1593 GCGGCAGGAAATGCGGCAGTACTTCAATGTTGGGCAACAAGCACAGATCCCCATTGCCACTGCTGGTGTTGTGT 1666
|.|||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|
Sbjct 1770 GAGGCAGGAAATGCGACAGTACTTCAACGTTGGGCAACAAGCACAGATCCCCATCGCGACGGCCGGAGTTGTAT 1843
Query 1667 ACCCTGGAGCCATCGCCATGGCTGGGATGCCCTCCCCTCACCTGCCCTCGGAGCACTCAAGCGTGTCTAGCAGC 1740
||||..|.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1844 ACCCCAGCGCCATCGCCATGGCAGGAATGCCGTCCCCTCACCTGCCCTCCGAGCACTCGAGCGTGTCCAGCAGC 1917
Query 1741 CCAGAGCCTGGGATGCCTGTTATCCAGAGCACTTACGGTGTGAAAGGAGAGGAGCCACATATCAAAGAAGAGAT 1814
||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|..||.|||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1918 CCGGAGCCCGGGATGCCCGTGATCCAGAGCACTTACGGCGCCAAGGGAGAGGAGCCCCACATCAAGGAAGAGAT 1991
Query 1815 ACAGGCCGAGGACATCAATGGAGAAATTTATGATGAGTACGACGAGGAAGAGGATGATCCAGATGTAGATTATG 1888
.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||||
Sbjct 1992 CCAGGCTGAGGACATCAACGGAGAGATTTACGAGGAGTACGATGAGGAGGAGGAGGACCCGGATGTGGATTATG 2065
Query 1889 GGAGTGACAGTGAAAACCATATTGCAGGACAAGCCAAC 1926
||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2066 GGAGTGACAGCGAAAACCACATTGCGGGACAAGCCAAC 2103