Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471554
- Subject:
- XM_017321475.1
- Aligned Length:
- 2152
- Identities:
- 1617
- Gaps:
- 338
Alignment
Query 1 ---------------------------------------ATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGA 35
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTTACTGACCCTGATTTACCTCAGGAGTTTGAAAGGATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGA 74
Query 36 AGCAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAAAGTGGAAGAAGAGGAGAGTGACGGGCTCCCAGCCT 109
..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||
Sbjct 75 GACAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAAAGTGGAAGAGGAGGAGAGTGAGAGGCTCCCAGCCT 148
Query 110 TTCACCTTCCCTTGCATGTGAGTTTTCCCAACAAGCCTCACTCTGAGGAATTTCAGCCAGTTTCTCTGCTGACG 183
|||||||||||||.|||
Sbjct 149 TTCACCTTCCCTTACAT--------------------------------------------------------- 165
Query 184 CAAGAGACTTGTGGCCATAGGACTCCCACTTCTCAGCACAATACAATGGAAGTTGATGGCAATAAAGTTATGTC 257
|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 166 ------------------------------------------------GAAGTCGATGGCAATAAAGTTATGTC 191
Query 258 TTCATTTGCCCCACACAACTCATCTACCTCACCTCAGAAGGCAGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCT 331
||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 192 TTCATTAGCTCCATACAACTCATCTACCTCACCTCAGAAGGCGGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCG 265
Query 332 TGTCTAGTACAGCCCTGGGAACTCCTGAACGGCGCAAGGGCAGTTTAGCTGATGTTGTTGACACCTTGAAGCAG 405
||||.||..||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||.||||||||
Sbjct 266 TGTCGAGCGCAGCCCTGGGGACTCCCGAGCGGCGCAAGGGCAGCTTAGCGGATGTGGTGGACACCCTGAAGCAG 339
Query 406 AGGAAAATGGAAGAGCTCATCAAAAACGAGCCGGAAGAAACCCCCAGTATTGAAAAACTACTCTCAAAGGACTG 479
|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 340 AGGAAGATGGAAGAGCTGATCAAGAATGAGCCAGAAGACACTCCCAGTATTGAAAAGCTACTCTCCAAGGACTG 413
Query 480 GAAAGACAAGCTTCTTGCAATGGGATCGGGGAACTTTGGCGAAATAAAAGGGACTCCCGAGAGCTTAGCTGAGA 553
||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||||
Sbjct 414 GAAAGACAAGCTCCTGGCAATGGGATCAGGGAACTTTGGAGAAATAAAAGGGACTCCTGAGAGCCTCGCTGAGA 487
Query 554 AAGAAAGGCAACTCATGGGTATGATCAACCAGCTGACCAGCCTCCGAGAGCAGCTGTTGGCTGCCCACGATGAG 627
|.||..||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||..|||||||||||||||||
Sbjct 488 AGGAGCGGCAGCTCATGGGTATGATCAATCAGCTGACCAGTCTACGGGAGCAACTCCTGGCTGCCCACGATGAG 561
Query 628 CAGAAGAAACTAGCTGCCTCTCAGATTGAGAAACAGCGTCAGCAAATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAAGAACA 701
||||||||..|.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 562 CAGAAGAAGTTGGCTGCATCTCAGATAGAGAAACAGCGTCAGCAGATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAGGAGCA 635
Query 702 AATTGCAAGACAGCAGCAGCAGCTTCTACAGCAACAACACAAAATCAATTTGCTCCAGCAACAGATC---CAGG 772
.||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||| ||||
Sbjct 636 GATCGCGAGGCAACAGCAGCAGCTTCTGCAGCAACAACACAAAATCAACTTGCTTCAGCAACAGATCCAGCAGG 709
Query 773 TTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTAATGATTCCCGTATTCCCTCCTGATCAACGGACACTGGCTGCAGCTGCCCAG 846
||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 710 TTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTGATGATTCCCGTGTTCCCTCCTGACCAGCGGACCCTCGCAGCAGCTGCCCAG 783
Query 847 CAAGGATTCCTCCTCCCTCCAGGCTTCAGCTATAAGGCTGGATGTAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCC 920
||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 784 CAAGGATTCCTCCTTCCTCCTGGTTTCAGCTACAAGGCTGGGTGCAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCC 857
Query 921 AACTACCATGGCAGCTGCTGCCGCAGCAACACCAGGCTTAGGCCCACTCCAACTGCAGCAGTTATATGCTGCCC 994
|||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.| |.|..|| ||||
Sbjct 858 AACCACTATGGCAGCTGCTGCTGCAGCAACACCAGGCTTAGGCCCACTCCAGCTGCAGGA-TGAAGTG--GCCC 928
Query 995 AGCTAGCTG---CAATGCAGGTATCTCCAGGA--------GGGAA-------GC-------------------- 1030
|||.| ||| |.|| |||.||...|||.|| ||.|| ||
Sbjct 929 AGCCA-CTGAACCTAT-CAGCTAAGCCCAAGACCTCTGATGGCAAATCACCTGCATCACCCACCTCTCCTCACA 1000
Query 1031 TGCCAG------GCATA-----------------CCCCAA------------GGCAACCT----TGGTGCTGCT 1065
|||||| |.||| ||.||| ||||.|.| |.||.||.||
Sbjct 1001 TGCCAGCTCTGAGAATAAACAGTGGGGCTGGCCCCCTCAAAGCCTCTGTCCCGGCAGCATTAGCTAGTCCTTCT 1074
Query 1066 G--------------------TAT----------------CTCCTACCA--GCATTC----------------- 1084
| ||| ||...|||| |||.||
Sbjct 1075 GCAAGAGTTAGCACAATAGGCTATTTAAATGACCACGATGCTGTCACCAAGGCAATCCAAGAAGCTCGCCAGAT 1148
Query 1085 ---------ACACAGACAAGAGCA-CA----------------------------AACAG-------CCCACCA 1113
||.|||.|.|||||| || ||||| |.||.||
Sbjct 1149 GAAAGAGCAACTCAGGCGAGAGCAGCAAGCGTTGGACGGGAAGGTGGCCGTGGTGAACAGCATAGGTCTCAGCA 1222
Query 1114 CC-------CAAAAGCAAGGAAAAAACAACACTGGAGAGTCTGACTCAGCAACTGGCAGTTAAACAGAATGAAG 1180
.| ||.|| |||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||
Sbjct 1223 ACTGCCGGACAGAA--AAGGAAAAAACAACACTGGAGAGCCTGACTCAGCAGTTGGCAGTTAAACAGAATGAAG 1294
Query 1181 AAGGAAAATTTAGCCATGCAATGATGGATTTCAATCTGAGTGGAGATTCTGATGGAAGTGCTGGAGTCTCAGAG 1254
||||.|||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1295 AAGGGAAATTTAGCCATGGAATGATGGATTTCAATATGAGTGGAGATTCTGACGGAAGCGCTGGAGTCTCAGAG 1368
Query 1255 TCAAGAATTTATAGGGAATCCCGAGGGCGTGGTAGCAATGAACCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCAT 1328
|||||||||||.|||||||||.|.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1369 TCAAGAATTTACAGGGAATCCAGGGGACGTGGTAGCAACGAGCCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCAT 1442
Query 1329 GGTGTGGGCTAAAGATGAACGGAGAAAGATCCTTCAAGCCTTTCCTGACATGCACAACTCCAACATCAGCAAGA 1402
|||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1443 GGTGTGGGCGAAAGATGAACGGAGGAAAATCCTTCAGGCCTTTCCCGACATGCACAATTCCAACATCAGCAAGA 1516
Query 1403 TATTGGGATCTCGCTGGAAAGCTATGACAAACCTAGAGAAACAGCCATATTATGAGGAGCAAGCCCGTCTCAGC 1476
||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1517 TACTGGGATCTCGCTGGAAAGCTATGACCAACCTAGAGAAACAGCCATACTATGAGGAGCAGGCCCGCCTCAGC 1590
Query 1477 AAGCAGCACCTGGAGAAGTACCCTGACTATAAGTACAAGCCCAGGCCAAAGCGCACCTGCCTGGTGGATGGCAA 1550
||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1591 AAACAGCACCTGGAGAAGTACCCGGACTACAAGTACAAGCCTAGGCCAAAGCGCACCTGTCTGGTGGACGGCAA 1664
Query 1551 AAAGCTGCGCATTGGTGAATACAAGGCAATCATGCGCAACAGGCGGCAGGAAATGCGGCAGTACTTCAATGTTG 1624
.||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||.||.|||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1665 GAAACTGCGTATCGGGGAGTACAAGGCCATCATGCGGAACCGGAGGCAGGAAATGCGACAGTACTTCAACGTTG 1738
Query 1625 GGCAACAAGCACAGATCCCCATTGCCACTGCTGGTGTTGTGTACCCTGGAGCCATCGCCATGGCTGGGATGCCC 1698
||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||..|.||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1739 GGCAACAAGCACAGATCCCCATCGCGACGGCCGGAGTTGTATACCCCAGCGCCATCGCCATGGCAGGAATGCCG 1812
Query 1699 TCCCCTCACCTGCCCTCGGAGCACTCAAGCGTGTCTAGCAGCCCAGAGCCTGGGATGCCTGTTATCCAGAGCAC 1772
|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1813 TCCCCTCACCTGCCCTCCGAGCACTCGAGCGTGTCCAGCAGCCCGGAGCCCGGGATGCCCGTGATCCAGAGCAC 1886
Query 1773 TTACGGTGTGAAAGGAGAGGAGCCACATATCAAAGAAGAGATACAGGCCGAGGACATCAATGGAGAAATTTATG 1846
||||||.|..||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1887 TTACGGCGCCAAGGGAGAGGAGCCCCACATCAAGGAAGAGATCCAGGCTGAGGACATCAACGGAGAGATTTACG 1960
Query 1847 ATGAGTACGACGAGGAAGAGGATGATCCAGATGTAGATTATGGGAGTGACAGTGAAAACCATATTGCAGGACAA 1920
|.||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1961 AGGAGTACGATGAGGAGGAGGAGGACCCGGATGTGGATTATGGGAGTGACAGCGAAAACCACATTGCGGGACAA 2034
Query 1921 GCCAAC 1926
||||||
Sbjct 2035 GCCAAC 2040