Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471554
- Subject:
- XM_017321476.1
- Aligned Length:
- 2110
- Identities:
- 1617
- Gaps:
- 296
Alignment
Query 1 ATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGAAGCAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCTTCCAAGCGACCAGCCTCTCCGTATGGGGAGACAGATGGAGAGGTAGCCATGGTGACAAGCAGACAGAA 74
Query 75 AGTGGAAGAAGAGGAGAGTGACGGGCTCCCAGCCTTTCACCTTCCCTTGCATGTGAGTTTTCCCAACAAGCCTC 148
|||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 75 AGTGGAAGAGGAGGAGAGTGAGAGGCTCCCAGCCTTTCACCTTCCCTTACAT---------------------- 126
Query 149 ACTCTGAGGAATTTCAGCCAGTTTCTCTGCTGACGCAAGAGACTTGTGGCCATAGGACTCCCACTTCTCAGCAC 222
Sbjct 127 -------------------------------------------------------------------------- 126
Query 223 AATACAATGGAAGTTGATGGCAATAAAGTTATGTCTTCATTTGCCCCACACAACTCATCTACCTCACCTCAGAA 296
|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 127 ---------GAAGTCGATGGCAATAAAGTTATGTCTTCATTAGCTCCATACAACTCATCTACCTCACCTCAGAA 191
Query 297 GGCAGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCTTGTCTAGTACAGCCCTGGGAACTCCTGAACGGCGCAAGG 370
|||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||..||||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 192 GGCGGAAGAAGGTGGGCGACAGAGTGGCGAGTCCGTGTCGAGCGCAGCCCTGGGGACTCCCGAGCGGCGCAAGG 265
Query 371 GCAGTTTAGCTGATGTTGTTGACACCTTGAAGCAGAGGAAAATGGAAGAGCTCATCAAAAACGAGCCGGAAGAA 444
||||.|||||.|||||.||.||||||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.
Sbjct 266 GCAGCTTAGCGGATGTGGTGGACACCCTGAAGCAGAGGAAGATGGAAGAGCTGATCAAGAATGAGCCAGAAGAC 339
Query 445 ACCCCCAGTATTGAAAAACTACTCTCAAAGGACTGGAAAGACAAGCTTCTTGCAATGGGATCGGGGAACTTTGG 518
||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 340 ACTCCCAGTATTGAAAAGCTACTCTCCAAGGACTGGAAAGACAAGCTCCTGGCAATGGGATCAGGGAACTTTGG 413
Query 519 CGAAATAAAAGGGACTCCCGAGAGCTTAGCTGAGAAAGAAAGGCAACTCATGGGTATGATCAACCAGCTGACCA 592
.|||||||||||||||||.||||||.|.||||||||.||..||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 414 AGAAATAAAAGGGACTCCTGAGAGCCTCGCTGAGAAGGAGCGGCAGCTCATGGGTATGATCAATCAGCTGACCA 487
Query 593 GCCTCCGAGAGCAGCTGTTGGCTGCCCACGATGAGCAGAAGAAACTAGCTGCCTCTCAGATTGAGAAACAGCGT 666
|.||.||.|||||.||..|||||||||||||||||||||||||..|.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 488 GTCTACGGGAGCAACTCCTGGCTGCCCACGATGAGCAGAAGAAGTTGGCTGCATCTCAGATAGAGAAACAGCGT 561
Query 667 CAGCAAATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAAGAACAAATTGCAAGACAGCAGCAGCAGCTTCTACAGCAACAACA 740
|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 562 CAGCAGATGGAGCTGGCCAAGCAGCAACAGGAGCAGATCGCGAGGCAACAGCAGCAGCTTCTGCAGCAACAACA 635
Query 741 CAAAATCAATTTGCTCCAGCAACAGATCCAGGTTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTAATGATTCCCGTATTCCCTC 814
|||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 636 CAAAATCAACTTGCTTCAGCAACAGATCCAGGTTCAAGGTCAGCTGCCGCCATTGATGATTCCCGTGTTCCCTC 709
Query 815 CTGATCAACGGACACTGGCTGCAGCTGCCCAGCAAGGATTCCTCCTCCCTCCAGGCTTCAGCTATAAGGCTGGA 888
||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.
Sbjct 710 CTGACCAGCGGACCCTCGCAGCAGCTGCCCAGCAAGGATTCCTCCTTCCTCCTGGTTTCAGCTACAAGGCTGGG 783
Query 889 TGTAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCCAACTACCATGGCAGCTGCTGCCGCAGCAACACCAGGCTTAGG 962
||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 784 TGCAGTGACCCTTACCCTGTTCAGCTGATCCCAACCACTATGGCAGCTGCTGCTGCAGCAACACCAGGCTTAGG 857
Query 963 CCCACTCCAACTGCAGCAGTTATATGCTGCCCAGCTAGCTG---CAATGCAGGTATCTCCAGGA--------GG 1025
|||||||||.||||||.| |.|..|| |||||||.| ||| |.|| |||.||...|||.|| ||
Sbjct 858 CCCACTCCAGCTGCAGGA-TGAAGTG--GCCCAGCCA-CTGAACCTAT-CAGCTAAGCCCAAGACCTCTGATGG 926
Query 1026 GAA-------GC--------------------TGCCAG------GCATA-----------------CCCCAA-- 1047
.|| || |||||| |.||| ||.|||
Sbjct 927 CAAATCACCTGCATCACCCACCTCTCCTCACATGCCAGCTCTGAGAATAAACAGTGGGGCTGGCCCCCTCAAAG 1000
Query 1048 ----------GGCAACCT----TGGTGCTGCTG--------------------TAT----------------CT 1071
||||.|.| |.||.||.||| ||| ||
Sbjct 1001 CCTCTGTCCCGGCAGCATTAGCTAGTCCTTCTGCAAGAGTTAGCACAATAGGCTATTTAAATGACCACGATGCT 1074
Query 1072 CCTACCA--GCATTC--------------------------ACACAGACAAGAGCA-CA--------------- 1101
...|||| |||.|| ||.|||.|.|||||| ||
Sbjct 1075 GTCACCAAGGCAATCCAAGAAGCTCGCCAGATGAAAGAGCAACTCAGGCGAGAGCAGCAAGCGTTGGACGGGAA 1148
Query 1102 -------------AACAG-------CCCACCACC-------CAAAAGCAAGGAAAAAACAACACTGGAGAGTCT 1148
||||| |.||.||.| ||.|| |||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1149 GGTGGCCGTGGTGAACAGCATAGGTCTCAGCAACTGCCGGACAGAA--AAGGAAAAAACAACACTGGAGAGCCT 1220
Query 1149 GACTCAGCAACTGGCAGTTAAACAGAATGAAGAAGGAAAATTTAGCCATGCAATGATGGATTTCAATCTGAGTG 1222
|||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1221 GACTCAGCAGTTGGCAGTTAAACAGAATGAAGAAGGGAAATTTAGCCATGGAATGATGGATTTCAATATGAGTG 1294
Query 1223 GAGATTCTGATGGAAGTGCTGGAGTCTCAGAGTCAAGAATTTATAGGGAATCCCGAGGGCGTGGTAGCAATGAA 1296
||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.||.|||||||||||.||.
Sbjct 1295 GAGATTCTGACGGAAGCGCTGGAGTCTCAGAGTCAAGAATTTACAGGGAATCCAGGGGACGTGGTAGCAACGAG 1368
Query 1297 CCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATGGTGTGGGCTAAAGATGAACGGAGAAAGATCCTTCAAGCCTT 1370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 1369 CCCCACATAAAGCGTCCAATGAATGCCTTCATGGTGTGGGCGAAAGATGAACGGAGGAAAATCCTTCAGGCCTT 1442
Query 1371 TCCTGACATGCACAACTCCAACATCAGCAAGATATTGGGATCTCGCTGGAAAGCTATGACAAACCTAGAGAAAC 1444
|||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1443 TCCCGACATGCACAATTCCAACATCAGCAAGATACTGGGATCTCGCTGGAAAGCTATGACCAACCTAGAGAAAC 1516
Query 1445 AGCCATATTATGAGGAGCAAGCCCGTCTCAGCAAGCAGCACCTGGAGAAGTACCCTGACTATAAGTACAAGCCC 1518
|||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 1517 AGCCATACTATGAGGAGCAGGCCCGCCTCAGCAAACAGCACCTGGAGAAGTACCCGGACTACAAGTACAAGCCT 1590
Query 1519 AGGCCAAAGCGCACCTGCCTGGTGGATGGCAAAAAGCTGCGCATTGGTGAATACAAGGCAATCATGCGCAACAG 1592
|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||.|
Sbjct 1591 AGGCCAAAGCGCACCTGTCTGGTGGACGGCAAGAAACTGCGTATCGGGGAGTACAAGGCCATCATGCGGAACCG 1664
Query 1593 GCGGCAGGAAATGCGGCAGTACTTCAATGTTGGGCAACAAGCACAGATCCCCATTGCCACTGCTGGTGTTGTGT 1666
|.|||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|
Sbjct 1665 GAGGCAGGAAATGCGACAGTACTTCAACGTTGGGCAACAAGCACAGATCCCCATCGCGACGGCCGGAGTTGTAT 1738
Query 1667 ACCCTGGAGCCATCGCCATGGCTGGGATGCCCTCCCCTCACCTGCCCTCGGAGCACTCAAGCGTGTCTAGCAGC 1740
||||..|.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1739 ACCCCAGCGCCATCGCCATGGCAGGAATGCCGTCCCCTCACCTGCCCTCCGAGCACTCGAGCGTGTCCAGCAGC 1812
Query 1741 CCAGAGCCTGGGATGCCTGTTATCCAGAGCACTTACGGTGTGAAAGGAGAGGAGCCACATATCAAAGAAGAGAT 1814
||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|..||.|||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1813 CCGGAGCCCGGGATGCCCGTGATCCAGAGCACTTACGGCGCCAAGGGAGAGGAGCCCCACATCAAGGAAGAGAT 1886
Query 1815 ACAGGCCGAGGACATCAATGGAGAAATTTATGATGAGTACGACGAGGAAGAGGATGATCCAGATGTAGATTATG 1888
.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||||
Sbjct 1887 CCAGGCTGAGGACATCAACGGAGAGATTTACGAGGAGTACGATGAGGAGGAGGAGGACCCGGATGTGGATTATG 1960
Query 1889 GGAGTGACAGTGAAAACCATATTGCAGGACAAGCCAAC 1926
||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1961 GGAGTGACAGCGAAAACCACATTGCGGGACAAGCCAAC 1998