Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471567
• Subject: XM_011532310.2
• Aligned Length: 1049
• Identities: 915
• Gaps: 118

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGATTCCGATGTTCACTGTAACATTGGAAGACTCTGGAACTCTGTGGAAAAGTCTTCACAGCTCCTCTGAATC  74

Query    1  ----ATGACCACCCTGCCCCCACTGCCCATGACACGCCCGAAGCTTACAGCCTTAGCCAGACAGAAGCTGCCTT  70
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGAAATGACCACCCTGCCCCCACTGCCCATGACACGCCCGAAGCTTACAGCCTTAGCCAGACAGAAGCTGCCTT  148

Query   71  GCTCCTCCAGAAAAATTCCAAGGTCTCAATTGATCAAAGAAAAAGATGACATAGATCATTATCTAGAGGTAAAT  144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTCCTCCAGAAAAATTCCAAGGTCTCAATTGATCAAAGAAAAAGATGACATAGATCATTATCTAGAGGTAAAT  222

Query  145  TTCAAAGGATTATCAAAAGAGGAAGTTGCTGCTTATAGGAACTCCTACAAGAAGAATATCTGTGTGGACATGCT  218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCAAAGGATTATCAAAAGAGGAAGTTGCTGCTTATAGGAACTCCTACAAGAAGAATATCTGTGTGGACATGCT  296

Query  219  GCGAGATGGTTATCATAAGTCCTTCACCGAGCTCTTCGCTCTGATGGAGCGGTGGGATGCCCTGAGGGAGGCTG  292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCGAGATGGTTATCATAAGTCCTTCACCGAGCTCTTCGCTCTGATGGAGCGGTGGGATGCCCTGAGGGAGGCTG  370

Query  293  CGAGAGTCAGGTCCCTCTTCTGGCTGCAGAAGCCCCTGGAGGAGCAGCCTGATAAACTGGATTACCTGTACCAT  366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGAGAGTCAGGTCCCTCTTCTGGCTGCAGAAGCCCCTGGAGGAGCAGCCTGATAAACTGGATTACCTGTACCAT  444

Query  367  TACCTGACCAGGGCTGAGGACGCTGAGAGGAAAGAATCCTTCGAAGATGTATATAATAACTTGTATGCTCTGGC  440
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TACCTGACCAGGGCTGAGGACGCTGAGAGGAAAGAATCCTTCGAAGATGTACATAATAACTTGTATGCTCTGGC  518

Query  441  CTGTTACTTCAATAATTCTGAAGACAAGTGGGTAAGGAACCACTTCTATGAACGATGTTTTAAGATTGCTCAGC  514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTGTTACTTCAATAATTCTGAAGACAAGTGGGTAAGGAACCACTTCTATGAACGATGTTTTAAGATTGCTCAGC  592

Query  515  TGATCAAAATTGACTGTGGGAAGAAAGAAGCCGAGGCACACATGCATATGGGTCTTCTCTACGAGGAAGATGGT  588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGATCAAAATTGACTGTGGGAAGAAAGAAGCCGAGGCACACATGCATATGGGTCTTCTCTACGAGGAAGATGGT  666

Query  589  CAGCTTCTGGAAGCTGCTGAGCATTATGAAGCATTCCATCAATTGACACAGGGGCGGATATGGAAGGATGAGAC  662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGCTTCTGGAAGCTGCTGAGCATTATGAAGCATTCCATCAATTGACACAGGGGCGGATATGGAAGGATGAGAC  740

Query  663  AGGCCGCTCTCTCAACTTGTTGGCCTGTGAGAGTCTCCTGAGGACTTACAGATTACTCTCAGACAAAATGCTAG  736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGCCGCTCTCTCAACTTGTTGGCCTGTGAGAGTCTCCTGAGGACTTACAGATTACTCTCAGACAAAATGCTAG  814

Query  737  AAAATAAAGAATACAAACAGGCCATCAAAATTCTAATAAAAGCTTCTGAAATAGCCAAAGAAGGAAGTGACAAA  810
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAAATAAAGAATACAAACAGGCCATCAAAATTCTAATAAAAGCTTCTGAAATAGCCAAAGAAGGAAGTGACAAA  888

Query  811  AAGATGGAAGCGGAAACCTCTTACTACTTGGGCTTAGCACACTTAGCTGCTGAGGAATATGAAACAGCATTAAC  884
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGATGGAAGCGGAAGCCTCTTACTACTTGGGCTTAGCACACTTAGCTGCTGAGGAATATGAAACAGCATTAAC  962

Query  885  AGTCCTTGACACT--TACTGTAAATCTCCACAGACCTGGATGATGATC------------TCAGTCTGGGGAGA  944
            |||.||    |||  |||       ||||..||..||..|..||..||            |||          |
Sbjct  963  AGTACT----ACTAGTAC-------CTCCCAAGGGCTCTACAATAGTCATTCAACAATATTCA----------A  1015

Query  945  GGCTATGAAGCCA  957
            ||.||..|     
Sbjct 1016  GGTTAACA-----  1023