Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471594
• Subject: XM_011545034.2
• Aligned Length: 1347
• Identities: 1251
• Gaps: 93

Alignment

Query    1  -------------------------------------ATG---GGCG---ACAAA-------------------  12
                                                 |||   ||||   |||.|                   
Sbjct    1  ATGGAAGGAGACTTGCAGCGGGAGAGGCTGAGGTTACATGCCAGGCGCATACAGACGTTGGCCTTTCATCCCCC  74

Query   13  ---------GGGA----------------------CCCGAGTGTTCAAGAAGGCCAGTCCAAATGGAAAGCTCA  55
                     .|||                      ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCAACACCCTGGAGCAGGCTGTGTTGCCCTATTATCCAGAGTGTTCAAGAAGGCCAGTCCAAATGGAAAGCTCA  148

Query   56  CCGTCTACCTGGGAAAGCGGGACTTTGTGGACCACATCGACCTCGTGGACCCTGTGGATGGTGTGGTCCTGGTG  129
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCGTCTACCTGGGAAAGCGGGACTTTGTGGACCACATCGACCTCGTGGACCCTGTGGATGGTGTGGTCCTGGTG  222

Query  130  GATCCTGAGTATCTCAAAGAGCGGAGAGTCTATGTGACGCTGACCTGCGCCTTCCGCTATGGCCGGGAGGACCT  203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATCCTGAGTATCTCAAAGAGCGGAGAGTCTATGTGACGCTGACCTGCGCCTTCCGCTATGGCCGGGAGGACCT  296

Query  204  GGATGTCCTGGGCCTGACCTTTCGCAAGGACCTGTTTGTGGCCAACGTACAGTCGTTCCCACCGGCCCCCGAGG  277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGATGTCCTGGGCCTGACCTTTCGCAAGGACCTGTTTGTGGCCAACGTACAGTCGTTCCCACCGGCCCCCGAGG  370

Query  278  ACAAGAAGCCCCTGACGCGGCTGCAGGAACGCCTCATCAAGAAGCTGGGCGAGCACGCTTACCCTTTCACCTTT  351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAAGAAGCCCCTGACGCGGCTGCAGGAACGCCTCATCAAGAAGCTGGGCGAGCACGCTTACCCTTTCACCTTT  444

Query  352  GAGATCCCTCCAAACCTTCCATGTTCTGTGACACTGCAGCCGGGGCCCGAAGACACGGGGAAGGCTTGCGGTGT  425
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGATCCCTCCAAACCTTCCATGTTCTGTGACACTGCAGCCGGGGCCCGAAGACACGGGGAAGGCTTGCGGTGT  518

Query  426  GGACTATGAAGTCAAAGCCTTCTGCGCGGAGAATTTGGAGGAGAAGATCCACAAGCGGAATTCTGTGCGTCTGG  499
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGACTATGAAGTCAAAGCCTTCTGCGCGGAGAATTTGGAGGAGAAGATCCACAAGCGGAATTCTGTGCGTCTGG  592

Query  500  TCATCCGGAAGGTTCAGTATGCCCCAGAGAGGCCTGGCCCCCAGCCCACAGCCGAGACCACCAGGCAGTTCCTC  573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCATCCGGAAGGTTCAGTATGCCCCAGAGAGGCCTGGCCCCCAGCCCACAGCCGAGACCACCAGGCAGTTCCTC  666

Query  574  ATGTCGGACAAGCCCTTGCACCTAGAAGCCTCTCTGGATAAGGAGATCTATTACCATGGAGAACCCATCAGCGT  647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATGTCGGACAAGCCCTTGCACCTAGAAGCCTCTCTGGATAAGGAGATCTATTACCATGGAGAACCCATCAGCGT  740

Query  648  CAACGTCCACGTCACCAACAACACCAACAAGACGGTGAAGAAGATCAAGATCTCAGTGCGCCAGTATGCAGACA  721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAACGTCCACGTCACCAACAACACCAACAAGACGGTGAAGAAGATCAAGATCTCAGTGCGCCAGTATGCAGACA  814

Query  722  TCTGCCTTTTCAACACAGCTCAGTACAAGTGCCCTGTTGCCATGGAAGAGGCTGATGACACTGTGGCACCCAGC  795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTGCCTTTTCAACACAGCTCAGTACAAGTGCCCTGTTGCCATGGAAGAGGCTGATGACACTGTGGCACCCAGC  888

Query  796  TCGACGTTCTGCAAGGTCTACACACTGACCCCCTTCCTAGCCAATAACCGAGAGAAGCGGGGCCTCGCCTTGGA  869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCGACGTTCTGCAAGGTCTACACACTGACCCCCTTCCTAGCCAATAACCGAGAGAAGCGGGGCCTCGCCTTGGA  962

Query  870  CGGGAAGCTCAAGCACGAAGACACGAACTTGGCCTCTAGCACCCTGTTGAGGGAAGGTGCCAACCGTGAGATCC  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGGGAAGCTCAAGCACGAAGACACGAACTTGGCCTCTAGCACCCTGTTGAGGGAAGGTGCCAACCGTGAGATCC  1036

Query  944  TGGGGATCATTGTTTCCTACAAAGTGAAAGTGAAGCTGGTGGTGTCTCGGGGCGGCCTGTTGGGAGATCTTGCA  1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGGGATCATTGTTTCCTACAAAGTGAAAGTGAAGCTGGTGGTGTCTCGGGGCGGCCTGTTGGGAGATCTTGCA  1110

Query 1018  TCCAGCGACGTGGCCGTGGAACTGCCCTTCACCCTAATGCACCCCAAGCCCAAAGAGGAACCCCCGCATCGGGA  1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCCAGCGACGTGGCCGTGGAACTGCCCTTCACCCTAATGCACCCCAAGCCCAAAGAGGAACCCCCGCATCGGGA  1184

Query 1092  AGTTCCAGAGAACGAGACGCCAGTAGATACCAATCTCATAGAACTTGACACAAATGATGACGACATTGTATTTG  1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGTTCCAGAGAACGAGACGCCAGTAGATACCAATCTCATAGAACTTGACACAAATGATGACGACATTGTATTTG  1258

Query 1166  AGGACTTTGCTCGCCAGAGACTGAAAGGCATGAAGGATGACAAGGAGGAAGAGGAGGATGGTACCGGCTCTCCA  1239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGACTTTGCTCGCCAGAGACTGAAAGGCATGAAGGATGACAAGGAGGAAGAGGAGGATGGTACCGGCTCTCCA  1332

Query 1240  CAGCTCAACAACAGA  1254
            |||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGCTCAACAACAGA  1347