Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471639
• Subject: NM_178041.2
• Aligned Length: 1293
• Identities: 1194
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGTCTGTCAATGTCAAGCGCAGCGTGTCAGACCAGTTCTATCGCTACAAGATGCCCCGTCTGATTGCCAAGGT  74
            |||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||
Sbjct    1  ATGTCTGTCAACGTCAACCGCAGCGTGTCAGACCAGTTCTATCGCTACAAGATGCCCCGTTTGATTGCTAAGGT  74

Query   75  TGAGGGCAAAGGCAATGGAATCAAGACAGTTATAGTCAACATGGTTGACGTTGCAAAGGCGCTTAATCGGCCTC  148
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGAGGGCAAAGGAAATGGAATCAAGACAGTTATAGTCAACATGGTTGACGTTGCAAAGGCGCTTAATCGGCCTC  148

Query  149  CAACGTATCCCACCAAATATTTTGGTTGTGAGCTGGGAGCACAGACCCAGTTTGATGTTAAGAATGACCGTTAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAACGTATCCCACCAAATATTTTGGTTGTGAGCTGGGAGCACAGACCCAGTTTGATGTTAAGAATGACCGTTAC  222

Query  223  ATTGTCAATGGATCTCATGAGGCGAATAAGCTGCAAGACATGTTGGATGGATTCATTAAAAAATTTGTTCTCTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTGTCAATGGATCTCATGAGGCGAATAAGCTGCAAGACATGTTGGATGGATTCATTAAAAAATTTGTTCTCTG  296

Query  297  TCCTGAATGTGAGAATCCTGAAACAGATTTGCATGTCAATCCAAAGAAGCAAACAATAGGTAATTCTTGTAAAG  370
            ||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCTGAGTGTGAGAATCCTGAAACAGATCTGCATGTCAATCCAAAGAAGCAAACAATAGGTAATTCTTGTAAAG  370

Query  371  CCTGTGGCTATCGAGGCATGCTTGACACACATCATAAACTCTGCACATTCATTCTCAAAAACCCACCTGAGAAT  444
            |||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCTGTGGGTACCGAGGCATGCTTGACACACATCATAAACTCTGTACATTCATTCTCAAAAACCCACCTGAGAAT  444

Query  445  AGTGACAGTGGTACAGGAAAGAAAGAAAAAGAAAAGAAAAACAGAAAGGGCAAAGACAAGGAAAATGGCTCCGT  518
            |||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  445  AGTGACATTGGTACAGGAAAGAAAGAAAAGGAAAAGAAAAATAGAAAGGGCAAGGACAAGGAAAATGGCTCTGT  518

Query  519  ATCCAGCAGTGAGACACCACCACCACCACCACCACCAAATGAAATTAATCCTCCTCCACATACAATGGAAGAAG  592
            |||.|.||||||||   ||||||||||.|||||||||||||||||||   .||||||||||.|..|||||||||
Sbjct  519  ATCTACCAGTGAGA---CACCACCACCTCCACCACCAAATGAAATTA---GTCCTCCACATGCTGTGGAAGAAG  586

Query  593  AGGAGGATGATGACTGGGGAGAAGATACAACTGAGGAAGCTCAAAGGCGTCGAATGGATGAAATCAGTGACCAT  666
            ||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||
Sbjct  587  AGGAAGATGATGATTGGGGGGAGGATACAACTGAGGAAGCTCAAAGGCGCAGAATGGATGAAATCAGTGACCAT  660

Query  667  GCAAAAGTTCTGACACTCAGTGATGATTTGGAAAGAACAATTGAGGAGAGGGTCAATATCCTCTTTGATTTTGT  740
            |||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||..|.||.|||.|.||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct  661  GCAAAAGGTCTGACACTTAGTGATGATTTGGAAAGAACTGTAGAAGAGCGTGTTAACATCCTGTTTGATTTTGT  734

Query  741  TAAGAAAAAGAAAGAAGAGGGTGTTATTGATTCATCTGACAAAGAAATCGTTGCTGAAGCAGAAAGACTGGATG  814
            |||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  735  TAAGAAAAAGAAAGAAGAGGGCATTATTGATTCATCTGATAAAGAAATTGTGGCTGAGGCAGAAAGACTGGATG  808

Query  815  TAAAAGCCATGGGCCCTCTTGTTCTAACTGAAGTTCTTTTTAATGAGAAGATTAGAGAACAGATTAAGAAATAC  888
            |||||||||||||.|||||||||.|.||.||||||||.|||.||||||||||.|||||.||.||.|||||||||
Sbjct  809  TAAAAGCCATGGGTCCTCTTGTTTTGACAGAAGTTCTCTTTGATGAGAAGATAAGAGAGCAAATCAAGAAATAC  882

Query  889  AGGCGCCATTTCCTACGATTTTGTCACAACAACAAAAAAGCCCAACGGTACCTTCTTCATGGTTTGGAGTGTGT  962
            |||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  883  AGGCGCCATTTTCTAAGATTTTGTCATAACAACAAAAAGGCTCAGCGGTACCTTCTTCATGGTTTGGAATGTGT  956

Query  963  GGTAGCAATGCATCAAGCTCAGCTTATCTCCAAGATTCCACATATCTTGAAGGAGATGTACGATGCAGACCTTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct  957  GGTAGCAATGCATCAAGCTCAGCTGATCTCCAAGATCCCACACATCCTGAAGGAGATGTATGATGCCGACCTGT  1030

Query 1037  TAGAAGAAGAGGTCATCATCAGCTGGTCGGAAAAGGCCTCTAAGAAATATGTCTCCAAAGAACTTGCCAAAGAG  1110
            ||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1031  TAGAGGAGGAGGTCATTATCAGCTGGTCAGAAAAGGCCTCTAAGAAATATGTCTCAAAAGAACTTGCCAAAGAG  1104

Query 1111  ATTCGTGTCAAAGCAGAACCATTTATAAAATGGTTGAAGGAGGCAGAGGAAGAATCTTCTGGTGGCGAAGAAGA  1184
            |||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1105  ATTCGTGTCAAAGCAGAGCCATTTATTAAATGGTTGAAGGAAGCAGAGGAAGAATCTTCTGGTGGTGAGGAAGA  1178

Query 1185  AGATGAAGATGAGAACATTGAGGTGGTGTATTCGAAGGCTGCCAGTGTACCGAAAGTTGAGACTGTAAAGTCAG  1258
            |||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||..|||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1179  AGATGAAGACGAAAATATTGAGGTCGTATATTCGAAAACTGCCAGTGTACCAAAAGTTGAAACTGTGAAGTCTG  1252

Query 1259  ACAACAAGGATGACGACATCGATATTGATGCCATT  1293
            |||||||||||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 1253  ACAACAAGGATGATGACATTGATATTGACGCCATT  1287