Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471672
- Subject:
- NM_001206955.1
- Aligned Length:
- 3078
- Identities:
- 2087
- Gaps:
- 987
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGGTTGCCATGGGAACTGCTGGTACTGCAATCATTCATTTTGTGCCTTGCAGATGATTCCACACTGCATGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCCGATTTTTATTCAAGAACCAAGTCCTGTAATGTTCCCTTTGGATTCTGAGGAGAAAAAAGTGAAGCTCAATT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GTGAAGTTAAAGGAAATCCAAAACCTCATATCAGGTGGAAGTTAAATGGAACAGATGTTGACACTGGTATGGAT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TTCCGCTACAGTGTTGTTGAAGGGAGCTTGTTGATCAATAACCCCAATAAAACCCAAGATGCTGGAACGTACCA 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 GTGCACAGCGACAAACTCGTTTGGAACAATTGTTAGCAGAGAAGCAAAGCTTCAGTTTGCTTATCTTGACAACT 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 TTAAAACAAGAACAAGAAGCACTGTGTCTGTCCGTCGAGGTCAAGGAATGGTGCTACTGTGTGGCCCGCCACCC 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 CATTCTGGAGAGCTGAGTTATGCCTGGATCTTCAATGAATACCCTTCCTATCAGGATAATCGCCGCTTTGTTTC 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 TCAAGAGACTGGGAATCTGTATATTGCCAAAGTAGAAAAATCAGATGTTGGGAATTATACCTGTGTGGTTACCA 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 ATACCGTGACAAACCACAAGGTCCTGGGGCCACCTACACCACTAATATTGAGAAATGATGGAGTGATGGGTGAA 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 TATGAGCCCAAAATAGAAGTGCAGTTCCCAGAAACAGTTCCGACTGCAAAAGGAGCAACGGTGAAGCTGGAATG 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 CTTTGCTTTAGGAAATCCAGTACCAACTATTATCTGGCGAAGAGCTGATGGAAAGCCAATAGCAAGGAAAGCCA 814
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 815 GAAGACACAAGTCAAATGGAATTCTTGAGATCCCTAATTTTCAGCAGGAGGATGCTGGTTTATATGAATGTGTA 888
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 889 GCTGAAAATTCCAGAGGGAAAAATGTAGCAAGGGGACAGCTAACTTTCTATGCTCAACCTAATTGGATTCAAAA 962
Query 1 ----------------------ATGGAAGAAAATGTCTTTTGGGAATGTAAAGCAAATGGAAGGCCTAAGCCTA 52
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AATAAATGATATTCACGTGGCCATGGAAGAAAATGTCTTTTGGGAATGTAAAGCAAATGGAAGGCCTAAGCCTA 1036
Query 53 CATACAAGTGGCTAAAAAATGGCGAACCTCTGCTAACTCGGGATAGAATTCAAATTGAGCAAGGAACACTCAAC 126
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CATACAAGTGGCTAAAAAATGGCGAACCTCTGCTAACTCGGGATAGAATTCAAATTGAGCAAGGAACACTCAAC 1110
Query 127 ATAACAATAGTGAACCTCTCAGATGCTGGCATGTATCAGTGTTTGGCAGAGAATAAACATGGAGTTATCTTTTC 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATAACAATAGTGAACCTCTCAGATGCTGGCATGTATCAGTGTTTGGCAGAGAATAAACATGGAGTTATCTTTTC 1184
Query 201 CAACGCAGAGCTTAGTGTTATAGCTGTAGGTCCAGATTTTTCAAGAACACTCTTGAAAAGAGTAACTCTTGTCA 274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAACGCAGAGCTTAGTGTTATAGCTGTAGGTCCAGATTTTTCAAGAACACTCTTGAAAAGAGTAACTCTTGTCA 1258
Query 275 AAGTGGGAGGTGAAGTTGTCATTGAGTGTAAGCCAAAAGCGTCTCCAAAACCTGTTTACACCTGGAAGAAAGGA 348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAGTGGGAGGTGAAGTTGTCATTGAGTGTAAGCCAAAAGCGTCTCCAAAACCTGTTTACACCTGGAAGAAAGGA 1332
Query 349 AGGGATATATTAAAAGAAAATGAAAGAATTACCATTTCTGAAGATGGAAACCTCAGAATCATCAACGTTACTAA 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGGGATATATTAAAAGAAAATGAAAGAATTACCATTTCTGAAGATGGAAACCTCAGAATCATCAACGTTACTAA 1406
Query 423 ATCAGACGCTGGGAGTTATACCTGTATAGCCACTAACCATTTTGGAACTGCTAGCAGTACTGGAAACTTGGTAG 496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 ATCAGACGCTGGGAGTTATACCTGTATAGCCACTAACCATTTTGGAACTGCTAGCAGTACTGGAAACTTGGTAG 1480
Query 497 TGAAAGATCCAACAAGGGTAATGGTACCCCCTTCCAGTATGGATGTCACTGTTGGAGAGAGTATTGTTTTACCG 570
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGAAAGATCCAACAAGGGTAATGGTACCCCCTTCCAGTATGGATGTCACTGTTGGAGAGAGTATTGTTTTACCG 1554
Query 571 TGCCAGGTAACGCATGATCACTCGCTAGACATCGTGTTTACTTGGTCATTTAATGGACACCTGATAGACTTTGA 644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TGCCAGGTAACGCATGATCACTCGCTAGACATCGTGTTTACTTGGTCATTTAATGGACACCTGATAGACTTTGA 1628
Query 645 CAGAGATGGGGACCACTTTGAAAGAGTTGGAGG---GGATTCAGCTGGTGATTTGATGATCCGAAACATCCAAC 715
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CAGAGATGGGGACCACTTTGAAAGAGTTGGAGGGCAGGATTCAGCTGGTGATTTGATGATCCGAAACATCCAAC 1702
Query 716 TGAAGCATGCTGGGAAATATGTCTGCATGGTCCAAACAAGTGTGGACAGGCTATCTGCTGCTGCAGACCTGATT 789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TGAAGCATGCTGGGAAATATGTCTGCATGGTCCAAACAAGTGTGGACAGGCTATCTGCTGCTGCAGACCTGATT 1776
Query 790 GTAAGAGGTCCTCCAGGTCCCCCAGAGGCTGTGACAATAGACGAAATCACAGATACCACTGCTCAGCTCTCCTG 863
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GTAAGAGGTCCTCCAGGTCCCCCAGAGGCTGTGACAATAGACGAAATCACAGATACCACTGCTCAGCTCTCCTG 1850
Query 864 GAGACCCGGGCCTGACAATCACAGCCCCATCACCATGTATGTCATTCAAGCCAGGACTCCGTTCTCCGTGGGCT 937
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1851 GAGACCCGGGCCTGACAACCACAGCCCCATCACCATGTATGTCATTCAAGCCAGGACTCCATTCTCCGTGGGCT 1924
Query 938 GGCAAGCAGTCAGTACAGTCCCAGAACTCATTGATGGGAAGACATTCACAGCGACCGTGGTGGGTTTGAACCCT 1011
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GGCAAGCAGTCAGTACAGTCCCAGAACTCATTGATGGGAAGACATTCACAGCGACCGTGGTGGGTTTGAACCCT 1998
Query 1012 TGGGTTGAATATGAATTCCGCACAGTTGCAGCCAACGTGATTGGGATTGGGGAGCCCAGCCGCCCCTCAGAGAA 1085
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TGGGTTGAATATGAATTCCGCACAGTTGCAGCCAACGTGATTGGGATTGGGGAGCCCAGCCGCCCCTCAGAGAA 2072
Query 1086 ACGGAGAACAGAAGAAGCTCTCCCCGAAGTCACACCAGCGAATGTCAGTGGTGGCGGAGGCAGCAAATCTGAAC 1159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 ACGGAGAACAGAAGAAGCTCTCCCCGAAGTCACACCAGCGAATGTCAGTGGTGGCGGAGGCAGCAAATCTGAAC 2146
Query 1160 TGGTTATAACCTGGGAGACGGTCCCTGAGGAATTACAGAATGGTCGTGGCTTTGGTTATGTGGTGGCCTTCCGG 1233
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TGGTTATAACCTGGGAGACGGTCCCTGAGGAATTACAGAATGGTCGAGGCTTTGGTTATGTGGTGGCCTTCCGG 2220
Query 1234 CCCTACGGTAAAATGATCTGGATGCTGACAGTGCTGGCCTCAGCTGACGCCTCTAGATACGTGTTCAGGAATGA 1307
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CCCTACGGTAAAATGATCTGGATGCTGACAGTGCTGGCCTCAGCTGATGCCTCTAGATACGTGTTCAGGAATGA 2294
Query 1308 GAGCGTGCACCCCTTCTCTCCCTTTGAGGTTAAAGTAGGTGTCTTCAACAACAAAGGAGAAGGCCCTTTCAGTC 1381
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GAGCGTGCACCCCTTCTCTCCCTTTGAGGTTAAAGTAGGTGTCTTCAACAACAAAGGAGAAGGCCCTTTCAGTC 2368
Query 1382 CCACCACGGTGGTGTATTCTGCAGAAGAAGAACCCACCAAACCACCAGCCAGTATCTTTGCCAGAAGTCTTTCT 1455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CCACCACGGTGGTGTATTCTGCAGAAGAAGAACCCACCAAACCACCAGCCAGTATCTTTGCCAGAAGTCTTTCT 2442
Query 1456 GCCACAGATATTGAAGTTTTCTGGGCCTCCCCACTGGAGAAGAATAGAGGACGAATACAAGGTTATGAGGTTAA 1529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GCCACAGATATTGAAGTTTTCTGGGCCTCCCCACTGGAGAAGAATAGAGGACGAATACAAGGTTATGAGGTTAA 2516
Query 1530 ATATTGGAGACATGAAGACAAAGAAGAAAATGCTAGAAAAATACGAACAGTTGGAAATCAGACATCAACAAAAA 1603
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 ATATTGGAGACATGAAGACAAAGAAGAAAATGCTAGAAAAATACGAACAGTTGGAAATCAGACATCAACAAAAA 2590
Query 1604 TCACGAACTTAAAAGGCAGTGTGCTGTATCACTTAGCTGTCAAGGCATATAATTCTGCTGGGACAGGCCCCTCT 1677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TCACGAACTTAAAAGGCAGTGTGCTGTATCACTTAGCTGTCAAGGCATATAATTCTGCTGGGACAGGCCCCTCT 2664
Query 1678 AGTGCAACAGTCAATGTGACAACCCGAAAGCCACCACCAAGTCAACCCCCCGGAAACATCATATGGAATTCATC 1751
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 AGTGCAACAGTCAATGTGACAACCCGAAAGCCACCACCAAGTCAACCCCCCGGAAACATCATATGGAATTCATC 2738
Query 1752 AGACTCCAAAATTATCCTGAATTGGGATCAAGTGAAGGCCCTGGATAATGAGTCGGAAGTAAAAGGATACAAAG 1825
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 AGACTCCAAAATTATCCTGAATTGGGATCAAGTGAAGGCCCTGGATAATGAGTCGGAAGTAAAAGGATACAAAG 2812
Query 1826 TCTTGTACAGATGGAACAGACAAAGCAGCACATCTGTCATTGAAACAAATAAAACATCGGTGGAGCTTTCTTTG 1899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 TCTTGTACAGATGGAACAGACAAAGCAGCACATCTGTCATTGAAACAAATAAAACATCGGTGGAGCTTTCTTTG 2886
Query 1900 CCTTTCGATGAAGATTATATAATAGAAATTAAGCCATTCAGCGACGGAGGAGATGGCAGCAGCAGTGAACAAAT 1973
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 CCTTTCGATGAAGATTATATAATAGAAATTAAGCCATTCAGCGACGGAGGAGATGGCAGCAGCAGTGAACAAAT 2960
Query 1974 TCGAATTCCAAAGATATCAAATGCCTACGCGAGAGGATCTGGGGCTTCCACTTCGAATGCATGTACGCTGTCAG 2047
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 TCGAATTCCAAAGATATCAAATGCCTACGCGAGAGGATCTGGGGCTTCCACTTCGAATGCATGTACGCTGTCAG 3034
Query 2048 CCATCAGTACAATAATGATTTCCCTCACAGCTAGGTCCAGTTTA 2091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 CCATCAGTACAATAATGATTTCCCTCACAGCTAGGTCCAGTTTA 3078
