Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471672
- Subject:
- XM_011533431.2
- Aligned Length:
- 3045
- Identities:
- 2087
- Gaps:
- 954
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCGGACTAACTTAACATTTGATGATTCCACACTGCATGGCCCGATTTTTATTCAAGAACCAAGTCCTGTAAT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GTTCCCTTTGGATTCTGAGGAGAAAAAAGTGAAGCTCAATTGTGAAGTTAAAGGAAATCCAAAACCTCATATCA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GGTGGAAGTTAAATGGAACAGATGTTGACACTGGTATGGATTTCCGCTACAGTGTTGTTGAAGGGAGCTTGTTG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 ATCAATAACCCCAATAAAACCCAAGATGCTGGAACGTACCAGTGCACAGCGACAAACTCGTTTGGAACAATTGT 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 TAGCAGAGAAGCAAAGCTTCAGTTTGCTTATCTTGACAACTTTAAAACAAGAACAAGAAGCACTGTGTCTGTCC 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 GTCGAGGTCAAGGAATGGTGCTACTGTGTGGCCCGCCACCCCATTCTGGAGAGCTGAGTTATGCCTGGATCTTC 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 AATGAATACCCTTCCTATCAGGATAATCGCCGCTTTGTTTCTCAAGAGACTGGGAATCTGTATATTGCCAAAGT 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 AGAAAAATCAGATGTTGGGAATTATACCTGTGTGGTTACCAATACCGTGACAAACCACAAGGTCCTGGGGCCAC 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 CTACACCACTAATATTGAGAAATGATGGAGTGATGGGTGAATATGAGCCCAAAATAGAAGTGCAGTTCCCAGAA 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 ACAGTTCCGACTGCAAAAGGAGCAACGGTGAAGCTGGAATGCTTTGCTTTAGGAAATCCAGTACCAACTATTAT 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 CTGGCGAAGAGCTGATGGAAAGCCAATAGCAAGGAAAGCCAGAAGACACAAGTCAAATGGAATTCTTGAGATCC 814
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 815 CTAATTTTCAGCAGGAGGATGCTGGTTTATATGAATGTGTAGCTGAAAATTCCAGAGGGAAAAATGTAGCAAGG 888
Query 1 ---------------------------------------------------------------ATGGAAGAAAA 11
|||||||||||
Sbjct 889 GGACAGCTAACTTTCTATGCTCAACCTAATTGGATTCAAAAAATAAATGATATTCACGTGGCCATGGAAGAAAA 962
Query 12 TGTCTTTTGGGAATGTAAAGCAAATGGAAGGCCTAAGCCTACATACAAGTGGCTAAAAAATGGCGAACCTCTGC 85
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGTCTTTTGGGAATGTAAAGCAAATGGAAGGCCTAAGCCTACATACAAGTGGCTAAAAAATGGCGAACCTCTGC 1036
Query 86 TAACTCGGGATAGAATTCAAATTGAGCAAGGAACACTCAACATAACAATAGTGAACCTCTCAGATGCTGGCATG 159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TAACTCGGGATAGAATTCAAATTGAGCAAGGAACACTCAACATAACAATAGTGAACCTCTCAGATGCTGGCATG 1110
Query 160 TATCAGTGTTTGGCAGAGAATAAACATGGAGTTATCTTTTCCAACGCAGAGCTTAGTGTTATAGCTGTAGGTCC 233
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TATCAGTGTTTGGCAGAGAATAAACATGGAGTTATCTTTTCCAACGCAGAGCTTAGTGTTATAGCTGTAGGTCC 1184
Query 234 AGATTTTTCAAGAACACTCTTGAAAAGAGTAACTCTTGTCAAAGTGGGAGGTGAAGTTGTCATTGAGTGTAAGC 307
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGATTTTTCAAGAACACTCTTGAAAAGAGTAACTCTTGTCAAAGTGGGAGGTGAAGTTGTCATTGAGTGTAAGC 1258
Query 308 CAAAAGCGTCTCCAAAACCTGTTTACACCTGGAAGAAAGGAAGGGATATATTAAAAGAAAATGAAAGAATTACC 381
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CAAAAGCGTCTCCAAAACCTGTTTACACCTGGAAGAAAGGAAGGGATATATTAAAAGAAAATGAAAGAATTACC 1332
Query 382 ATTTCTGAAGATGGAAACCTCAGAATCATCAACGTTACTAAATCAGACGCTGGGAGTTATACCTGTATAGCCAC 455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATTTCTGAAGATGGAAACCTCAGAATCATCAACGTTACTAAATCAGACGCTGGGAGTTATACCTGTATAGCCAC 1406
Query 456 TAACCATTTTGGAACTGCTAGCAGTACTGGAAACTTGGTAGTGAAAGATCCAACAAGGGTAATGGTACCCCCTT 529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TAACCATTTTGGAACTGCTAGCAGTACTGGAAACTTGGTAGTGAAAGATCCAACAAGGGTAATGGTACCCCCTT 1480
Query 530 CCAGTATGGATGTCACTGTTGGAGAGAGTATTGTTTTACCGTGCCAGGTAACGCATGATCACTCGCTAGACATC 603
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCAGTATGGATGTCACTGTTGGAGAGAGTATTGTTTTACCGTGCCAGGTAACGCATGATCACTCGCTAGACATC 1554
Query 604 GTGTTTACTTGGTCATTTAATGGACACCTGATAGACTTTGACAGAGATGGGGACCACTTTGAAAGAGTTGGAGG 677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GTGTTTACTTGGTCATTTAATGGACACCTGATAGACTTTGACAGAGATGGGGACCACTTTGAAAGAGTTGGAGG 1628
Query 678 ---GGATTCAGCTGGTGATTTGATGATCCGAAACATCCAACTGAAGCATGCTGGGAAATATGTCTGCATGGTCC 748
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GCAGGATTCAGCTGGTGATTTGATGATCCGAAACATCCAACTGAAGCATGCTGGGAAATATGTCTGCATGGTCC 1702
Query 749 AAACAAGTGTGGACAGGCTATCTGCTGCTGCAGACCTGATTGTAAGAGGTCCTCCAGGTCCCCCAGAGGCTGTG 822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AAACAAGTGTGGACAGGCTATCTGCTGCTGCAGACCTGATTGTAAGAGGTCCTCCAGGTCCCCCAGAGGCTGTG 1776
Query 823 ACAATAGACGAAATCACAGATACCACTGCTCAGCTCTCCTGGAGACCCGGGCCTGACAATCACAGCCCCATCAC 896
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1777 ACAATAGACGAAATCACAGATACCACTGCTCAGCTCTCCTGGAGACCCGGGCCTGACAACCACAGCCCCATCAC 1850
Query 897 CATGTATGTCATTCAAGCCAGGACTCCGTTCTCCGTGGGCTGGCAAGCAGTCAGTACAGTCCCAGAACTCATTG 970
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CATGTATGTCATTCAAGCCAGGACTCCATTCTCCGTGGGCTGGCAAGCAGTCAGTACAGTCCCAGAACTCATTG 1924
Query 971 ATGGGAAGACATTCACAGCGACCGTGGTGGGTTTGAACCCTTGGGTTGAATATGAATTCCGCACAGTTGCAGCC 1044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ATGGGAAGACATTCACAGCGACCGTGGTGGGTTTGAACCCTTGGGTTGAATATGAATTCCGCACAGTTGCAGCC 1998
Query 1045 AACGTGATTGGGATTGGGGAGCCCAGCCGCCCCTCAGAGAAACGGAGAACAGAAGAAGCTCTCCCCGAAGTCAC 1118
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AACGTGATTGGGATTGGGGAGCCCAGCCGCCCCTCAGAGAAACGGAGAACAGAAGAAGCTCTCCCCGAAGTCAC 2072
Query 1119 ACCAGCGAATGTCAGTGGTGGCGGAGGCAGCAAATCTGAACTGGTTATAACCTGGGAGACGGTCCCTGAGGAAT 1192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 ACCAGCGAATGTCAGTGGTGGCGGAGGCAGCAAATCTGAACTGGTTATAACCTGGGAGACGGTCCCTGAGGAAT 2146
Query 1193 TACAGAATGGTCGTGGCTTTGGTTATGTGGTGGCCTTCCGGCCCTACGGTAAAATGATCTGGATGCTGACAGTG 1266
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TACAGAATGGTCGAGGCTTTGGTTATGTGGTGGCCTTCCGGCCCTACGGTAAAATGATCTGGATGCTGACAGTG 2220
Query 1267 CTGGCCTCAGCTGACGCCTCTAGATACGTGTTCAGGAATGAGAGCGTGCACCCCTTCTCTCCCTTTGAGGTTAA 1340
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CTGGCCTCAGCTGATGCCTCTAGATACGTGTTCAGGAATGAGAGCGTGCACCCCTTCTCTCCCTTTGAGGTTAA 2294
Query 1341 AGTAGGTGTCTTCAACAACAAAGGAGAAGGCCCTTTCAGTCCCACCACGGTGGTGTATTCTGCAGAAGAAGAAC 1414
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 AGTAGGTGTCTTCAACAACAAAGGAGAAGGCCCTTTCAGTCCCACCACGGTGGTGTATTCTGCAGAAGAAGAAC 2368
Query 1415 CCACCAAACCACCAGCCAGTATCTTTGCCAGAAGTCTTTCTGCCACAGATATTGAAGTTTTCTGGGCCTCCCCA 1488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CCACCAAACCACCAGCCAGTATCTTTGCCAGAAGTCTTTCTGCCACAGATATTGAAGTTTTCTGGGCCTCCCCA 2442
Query 1489 CTGGAGAAGAATAGAGGACGAATACAAGGTTATGAGGTTAAATATTGGAGACATGAAGACAAAGAAGAAAATGC 1562
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CTGGAGAAGAATAGAGGACGAATACAAGGTTATGAGGTTAAATATTGGAGACATGAAGACAAAGAAGAAAATGC 2516
Query 1563 TAGAAAAATACGAACAGTTGGAAATCAGACATCAACAAAAATCACGAACTTAAAAGGCAGTGTGCTGTATCACT 1636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TAGAAAAATACGAACAGTTGGAAATCAGACATCAACAAAAATCACGAACTTAAAAGGCAGTGTGCTGTATCACT 2590
Query 1637 TAGCTGTCAAGGCATATAATTCTGCTGGGACAGGCCCCTCTAGTGCAACAGTCAATGTGACAACCCGAAAGCCA 1710
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TAGCTGTCAAGGCATATAATTCTGCTGGGACAGGCCCCTCTAGTGCAACAGTCAATGTGACAACCCGAAAGCCA 2664
Query 1711 CCACCAAGTCAACCCCCCGGAAACATCATATGGAATTCATCAGACTCCAAAATTATCCTGAATTGGGATCAAGT 1784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CCACCAAGTCAACCCCCCGGAAACATCATATGGAATTCATCAGACTCCAAAATTATCCTGAATTGGGATCAAGT 2738
Query 1785 GAAGGCCCTGGATAATGAGTCGGAAGTAAAAGGATACAAAGTCTTGTACAGATGGAACAGACAAAGCAGCACAT 1858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 GAAGGCCCTGGATAATGAGTCGGAAGTAAAAGGATACAAAGTCTTGTACAGATGGAACAGACAAAGCAGCACAT 2812
Query 1859 CTGTCATTGAAACAAATAAAACATCGGTGGAGCTTTCTTTGCCTTTCGATGAAGATTATATAATAGAAATTAAG 1932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 CTGTCATTGAAACAAATAAAACATCGGTGGAGCTTTCTTTGCCTTTCGATGAAGATTATATAATAGAAATTAAG 2886
Query 1933 CCATTCAGCGACGGAGGAGATGGCAGCAGCAGTGAACAAATTCGAATTCCAAAGATATCAAATGCCTACGCGAG 2006
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 CCATTCAGCGACGGAGGAGATGGCAGCAGCAGTGAACAAATTCGAATTCCAAAGATATCAAATGCCTACGCGAG 2960
Query 2007 AGGATCTGGGGCTTCCACTTCGAATGCATGTACGCTGTCAGCCATCAGTACAATAATGATTTCCCTCACAGCTA 2080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 AGGATCTGGGGCTTCCACTTCGAATGCATGTACGCTGTCAGCCATCAGTACAATAATGATTTCCCTCACAGCTA 3034
Query 2081 GGTCCAGTTTA 2091
|||||||||||
Sbjct 3035 GGTCCAGTTTA 3045