Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471680
- Subject:
- XM_017018544.2
- Aligned Length:
- 2391
- Identities:
- 1513
- Gaps:
- 876
Alignment
Query 1 ATGGATTGCAGTGCTCCCAAGGAAATGAATAAACTGCCAGCCAACAGCCCGGAGGCGGCGGCGGCGCAGGGCCA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCCGGATGGCCCATGCGCTCCCAGGACGAGCCCGGAGCAGGAGCTTCCCGCGGCTGCCGCCCCGCCGCCGCCAC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GTGTGCCCAGGTCCGCTTCCACCGGCGCCCAAACTTTCCAGTCAGCGGACGCGCGAGCCTGCGAGGCTGAGCGG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CCAGGAGTGGGGTCTTGCAAACTCAGTAGCCCGCGGGCGCAGGCGGCCTCTGCAGCTCTGCGGGACTTGAGAGA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GGCGCAAGGCGCGCAGGCCTCGCCCCCTCCCGGGAGCTCCGGGCCCGGCAACGCGTTGCACTGTAAGATCCCTT 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 CTCTGCGAGGCCCGGAGGGGGATGCGAACGTGAGTGTGGGCAAGGGCACCCTGGAGCGGAACAATACCCCTGTT 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GTGGGCTGGGTGAACATGAGCCAGAGCACCGTGGTGCTGGGCACGGATGGAATCACGTCCGTGCTCCCGGGCAG 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 CGTGGCCACCGTTGCCACCCAGGAGGACGAGCAAGGGGATGAGAATAAGGCCCGAGGGAACTGGTCCAGCAAAC 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 TGGACTTCATCCTGTCCATGGTGGGGTACGCAGTGGGGCTGGGCAATGTCTGGAGGTTTCCCTACCTGGCCTTC 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 CAGAACGGGGGAGGTGCTTTCCTCATCCCTTACCTGATGATGCTGGCTCTGGCTGGATTACCCATCTTCTTCTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ------------------------------------ATGATGCTGGCTCTGGCTGGATTACCCATCTTCTTCTT 38
Query 741 GGAGGTGTCGCTGGGCCAGTTTGCCAGCCAGGGACCAGTGTCTGTGTGGAAGGCCATCCCAGCTCTACAAGGCT 814
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 39 GGAGGTGTCGCTGGGCCAGTTTGCCAGCCAGGGACCAGTGTCTGTGTGGAAGGCCATCCCAGCTCTACA----- 107
Query 815 GTGGCATCGCGATGCTGATCATCTCTGTCCTAATAGCCATATACTACAATGTGATTATTTGCTATACACTTTTC 888
Sbjct 108 -------------------------------------------------------------------------- 107
Query 889 TACCTGTTTGCCTCCTTTGTGTCTGTACTACCCTGGGGCTCCTGCAACAACCCTTGGAATACACCAGAATGCAA 962
Sbjct 108 -------------------------------------------------------------------------- 107
Query 963 AGATAAAACCAAACTTTTATTAGATTCCTGTGTTATCAGTGACCATCCCAAAATACAGATCAAGAACTCGACTT 1036
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 108 ---------------------AGATTCCTGTGTTATCAGTGACCATCCCAAAATACAGATCAAGAACTCGACTT 160
Query 1037 TCTGCATGACCGCTTATCCCAACGTGACAATGGTTAATTTCACCAGCCAGGCCAATAAGACATTTGTCAGTGGA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 161 TCTGCATGACCGCTTATCCCAACGTGACAATGGTTAATTTCACCAGCCAGGCCAATAAGACATTTGTCAGTGGA 234
Query 1111 AGTGAAGAGTACTTCAAGTACTTTGTGCTGAAGATTTCTGCAGGGATTGAATATCCTGGCGAGATCAGGTGGCC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 235 AGTGAAGAGTACTTCAAGTACTTTGTGCTGAAGATTTCTGCAGGGATTGAATATCCTGGCGAGATCAGGTGGCC 308
Query 1185 ACTAGCTCTCTGCCTCTTCCTGGCTTGGGTCATTGTGTATGCATCGTTGGCTAAAGGAATCAAGACTTCAGGAA 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 309 ACTAGCTCTCTGCCTCTTCCTGGCTTGGGTCATTGTGTATGCATCATTGGCTAAAGGAATCAAGACTTCAGGAA 382
Query 1259 AAGTGGTGTACTTCACGGCCACGTTCCCGTATGTCGTACTCGTGATCCTCCTCATCCGAGGAGTCACCCTGCCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 383 AAGTGGTGTACTTCACGGCCACGTTCCCGTATGTCGTACTCGTGATCCTCCTCATCCGAGGAGTCACCCTGCCT 456
Query 1333 GGAGCTGGAGCTGGGATCTGGTACTTCATCACACCCAAGTGGGAGAAACTCACGGATGCCACGGTGTGGAAAGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 457 GGAGCTGGAGCTGGGATCTGGTACTTCATCACACCCAAGTGGGAGAAACTCACGGATGCCACGGTGTGGAAAGA 530
Query 1407 TGCTGCCACTCAGATTTTCTTCTCTTTATCTGCTGCATGGGGAGGCCTGATCACTCTCTCTTCTTACAACAAAT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 531 TGCTGCCACTCAGATTTTCTTCTCTTTATCTGCTGCATGGGGAGGCCTGATCACTCTCTCTTCTTACAACAAAT 604
Query 1481 TCCACAACAACTGCTACAGGGACACTCTAATTGTCACCTGCACCAACAGTGCCACAAGCATCTTTGCCGGCTTC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 605 TCCACAACAACTGCTACAGGGACACTCTAATTGTCACCTGCACCAACAGTGCCACAAGCATCTTTGCCGGCTTC 678
Query 1555 GTCATCTTCTCCGTTATCGGCTTCATGGCCAATGAACGCAAAGTCAACATTGAGAATGTGGCAGACCAAGGGCC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 679 GTCATCTTCTCCGTTATCGGCTTCATGGCCAATGAACGCAAAGTCAACATTGAGAATGTGGCAGACCAAGGGCC 752
Query 1629 AGGCATTGCATTTGTGGTTTACCCGGAAGCCTTAACCAGGCTGCCTCTCTCTCCGTTCTGGGCCATCATCTTTT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 753 AGGCATTGCATTTGTGGTTTACCCGGAAGCCTTAACCAGGCTGCCTCTCTCTCCGTTCTGGGCCATCATCTTTT 826
Query 1703 TCCTGATGCTCCTCACTCTTGGACTTGACACTATGTTTGCCACCATCGAGACCATAGTGACCTCCATCTCAGAC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 827 TCCTGATGCTCCTCACTCTTGGACTTGACACTATGTTTGCCACCATCGAGACCATAGTGACCTCCATCTCAGAC 900
Query 1777 GAGTTTCCCAAGTACCTACGCACACACAAGCCAGTGTTTACTCTGGGCTGCTGCATTTGTTTCTTCATCATGGG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 GAGTTTCCCAAGTACCTACGCACACACAAGCCAGTGTTTACTCTGGGCTGCTGCATTTGTTTCTTCATCATGGG 974
Query 1851 TTTTCCAATGATCACTCAGGGTGGAATTTACATGTTTCAGCTTGTGGACACCTATGCTGCCTCCTATGCCCTTG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 975 TTTTCCAATGATCACTCAGGGTGGAATTTACATGTTTCAGCTTGTGGACACCTATGCTGCCTCCTATGCCCTTG 1048
Query 1925 TCATCATTGCCATTTTTGAGCTCGTGGGGATCTCTTATGTGTATGGCTTGCAAAGATTCTGTGAAGATATAGAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1049 TCATCATTGCCATTTTTGAGCTCGTGGGGATCTCTTATGTGTATGGCTTGCAAAGATTCTGTGAAGATATAGAG 1122
Query 1999 ATGATGATTGGATTCCAGCCTAACATCTTCTGGAAAGTCTGCTGGGCATTTGTAACCCCAACCATTTTAACCTT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1123 ATGATGATTGGATTCCAGCCTAACATCTTCTGGAAAGTCTGCTGGGCATTTGTAACCCCAACCATTTTAACCTT 1196
Query 2073 TATCCTTTGCTTCAGCTTTTACCAGTGGGAACCCATGACCTATGGCTCTTACCGCTATCCTAACTGGTCCATGG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1197 TATCCTTTGCTTCAGCTTTTACCAGTGGGAGCCCATGACCTATGGCTCTTACCGCTATCCTAACTGGTCCATGG 1270
Query 2147 TGCTCGGATGGCTAATGCTCGCCTGTTCCGTCATCTGGATCCCAATTATGTTTGTGATAAAAATGCATCTGGCC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1271 TGCTCGGATGGCTAATGCTCGCCTGTTCCGTCATCTGGATCCCAATTATGTTTGTGATAAAAATGCATCTGGCC 1344
Query 2221 CCTGGAAGATTTATTGAGAGGCTGAAGTTGGTGTGCTCGCCACAGCCGGACTGGGGCCCATTCTTAGCTCAACA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1345 CCTGGAAGATTTATTGAGAGGCTGAAGTTGGTGTGCTCGCCACAGCCGGACTGGGGCCCATTCTTAGCTCAACA 1418
Query 2295 CCGCGGGGAGCGTTACAAGAACATGATCGACCCCTTGGGAACCTCTTCCTTGGGACTCAAACTGCCAGTGAAGG 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1419 CCGCGGGGAGCGTTACAAGAACATGATCGACCCCTTGGGAACCTCTTCCTTGGGACTCAAACTGCCAGTGAAGG 1492
Query 2369 ATTTGGAACTGGGCACTCAGTGC 2391
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1493 ATTTGGAACTGGGCACTCAGTGC 1515
