Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471681
• Subject: NM_005073.4
• Aligned Length: 2124
• Identities: 2122
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGGAATGTCCAAATCACACAGTTTCTTTGGTTATCCCCTGAGCATCTTCTTCATCGTGGTCAATGAGTTTTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGAATGTCCAAATCACACAGTTTCTTTGGTTATCCCCTGAGCATCTTCTTCATCGTGGTCAATGAGTTTTG  74

Query   75  CGAAAGATTTTCCTACTATGGAATGCGAGCAATCCTGATTCTGTACTTCACAAATTTCATCAGCTGGGATGATA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGAAAGATTTTCCTACTATGGAATGCGAGCAATCCTGATTCTGTACTTCACAAATTTCATCAGCTGGGATGATA  148

Query  149  ACCTGTCCACCGCCATCTACCATACGTTTGTGGCTCTGTGCTACCTGACGCCAATTCTCGGAGCTCTTATCGCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCTGTCCACCGCCATCTACCATACGTTTGTGGCTCTGTGCTACCTGACGCCAATTCTCGGAGCTCTTATCGCC  222

Query  223  GACTCGTGGCTGGGAAAGTTCAAGACCATTGTGTCGCTCTCCATTGTCTACACAATTGGACAAGCAGTCACCTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACTCGTGGCTGGGAAAGTTCAAGACCATTGTGTCGCTCTCCATTGTCTACACAATTGGACAAGCAGTCACCTC  296

Query  297  AGTAAGCTCCATTAATGACCTCACAGACCACAACCATGATGGCACCCCCGACAGCCTTCCTGTGCACGTGGTGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGTAAGCTCCATTAATGACCTCACAGACCACAACCATGATGGCACCCCCGACAGCCTTCCTGTGCACGTGGTGC  370

Query  371  TGTCCTTGATCGGCCTGGCCCTGATAGCTCTCGGGACTGGAGGAATCAAACCCTGTGTGTCTGCGTTTGGTGGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGTCCTTGATCGGCCTGGCCCTGATAGCTCTCGGGACTGGAGGAATCAAACCCTGTGTGTCTGCGTTTGGTGGA  444

Query  445  GATCAGTTTGAAGAGGGCCAGGAGAAACAAAGAAACAGATTTTTTTCCATCTTTTACTTGGCTATTAATGCTGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATCAGTTTGAAGAGGGCCAGGAGAAACAAAGAAACAGATTTTTTTCCATCTTTTACTTGGCTATTAATGCTGG  518

Query  519  AAGTTTGCTTTCCACAATCATCACACCCATGCTCAGAGTTCAACAATGTGGAATTCACAGTAAACAAGCTTGTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGTTTGCTTTCCACAATCATCACACCCATGCTCAGAGTTCAACAATGTGGAATTCACAGTAAACAAGCTTGTT  592

Query  593  ACCCACTGGCCTTTGGGGTTCCTGCTGCTCTCATGGCTGTAGCCCTGATTGTGTTTGTCCTTGGCAGTGGGATG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCCACTGGCCTTTGGGGTTCCTGCTGCTCTCATGGCTGTAGCCCTGATTGTGTTTGTCCTTGGCAGTGGGATG  666

Query  667  TACAAGAAGTTCAAGCCACAGGGCAACATCATGGGTAAAGTGGCCAAGTGCATCGGTTTTGCCATCAAAAATAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TACAAGAAGTTCAAGCCACAGGGCAACATCATGGGTAAAGTGGCCAAGTGCATCGGTTTTGCCATCAAAAATAG  740

Query  741  ATTTAGGCATCGGAGTAAGGCATTTCCCAAGAGGGAGCACTGGCTGGACTGGGCTAAAGAGAAATACGATGAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATTTAGGCATCGGAGTAAGGCATTTCCCAAGAGGGAGCACTGGCTGGACTGGGCTAAAGAGAAATACGATGAGC  814

Query  815  GGCTCATCTCCCAAATTAAGATGGTTACGAGGGTGATGTTCCTGTATATTCCACTCCCAATGTTCTGGGCCTTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGCTCATCTCCCAAATTAAGATGGTTACGAGGGTGATGTTCCTGTATATTCCACTCCCAATGTTCTGGGCCTTG  888

Query  889  TTTGACCAGCAGGGCTCCAGGTGGACACTGCAGGCAACAACTATGTCCGGGAAAATCGGAGCTGTTGAAATTCA  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  889  TTTGACCAGCAGGGCTCCAGGTGGACACTGCAGGCAACAACTATGTCCGGGAAAATCGGAGCTCTTGAAATTCA  962

Query  963  GCCCGATCAGATGCAGACCGTGAACGCCATCCTGATCGTGATCATGGTCCCGATCTTCGATGCTGTGCTGTACC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCCCGATCAGATGCAGACCGTGAACGCCATCCTGATCGTGATCATGGTCCCGATCTTCGATGCTGTGCTGTACC  1036

Query 1037  CTCTCATTGCAAAATGTGGCTTCAATTTCACCTCCTTGAAGAAGATGGCAGTTGGCATGGTCCTGGCCTCCATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCTCATTGCAAAATGTGGCTTCAATTTCACCTCCTTGAAGAAGATGGCAGTTGGCATGGTCCTGGCCTCCATG  1110

Query 1111  GCCTTTGTGGTGGCTGCCATCGTGCAGGTGGAAATCGATAAAACTCTTCCAGTCTTCCCCAAAGGAAACGAAGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCTTTGTGGTGGCTGCCATCGTGCAGGTGGAAATCGATAAAACTCTTCCAGTCTTCCCCAAAGGAAACGAAGT  1184

Query 1185  CCAAATTAAAGTTTTGAATATAGGAAACAATACCATGAATATATCTCTTCCTGGAGAGATGGTGACACTTGGCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCAAATTAAAGTTTTGAATATAGGAAACAATACCATGAATATATCTCTTCCTGGAGAGATGGTGACACTTGGCC  1258

Query 1259  CAATGTCTCAAACAAATGCATTTATGACTTTTGATGTAAACAAACTGACAAGGATAAACATTTCTTCTCCTGGA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAATGTCTCAAACAAATGCATTTATGACTTTTGATGTAAACAAACTGACAAGGATAAACATTTCTTCTCCTGGA  1332

Query 1333  TCACCAGTCACTGCCGTAACTGACGACTTCAAGCAGGGCCAACGCCACACGCTTCTAGTGTGGGCCCCCAATCA  1406
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCACCAGTCACTGCTGTAACTGACGACTTCAAGCAGGGCCAACGCCACACGCTTCTAGTGTGGGCCCCCAATCA  1406

Query 1407  CTACCAGGTGGTAAAGGATGGTCTTAACCAGAAGCCAGAAAAAGGGGAAAATGGAATCAGATTTGTAAATACTT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTACCAGGTGGTAAAGGATGGTCTTAACCAGAAGCCAGAAAAAGGGGAAAATGGAATCAGATTTGTAAATACTT  1480

Query 1481  TTAACGAGCTCATCACCATCACAATGAGTGGGAAAGTTTATGCAAACATCAGCAGCTACAATGCCAGCACATAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTAACGAGCTCATCACCATCACAATGAGTGGGAAAGTTTATGCAAACATCAGCAGCTACAATGCCAGCACATAC  1554

Query 1555  CAGTTTTTTCCTTCTGGCATAAAAGGCTTCACAATAAGCTCAACAGAGATTCCGCCACAATGTCAACCTAATTT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGTTTTTTCCTTCTGGCATAAAAGGCTTCACAATAAGCTCAACAGAGATTCCGCCACAATGTCAACCTAATTT  1628

Query 1629  CAATACTTTCTACCTTGAATTTGGTAGTGCTTATACCTATATAGTCCAAAGGAAGAATGACAGCTGCCCTGAAG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CAATACTTTCTACCTTGAATTTGGTAGTGCTTATACCTATATAGTCCAAAGGAAGAATGACAGCTGCCCTGAAG  1702

Query 1703  TGAAGGTGTTTGAAGATATTTCAGCCAACACAGTTAACATGGCTCTGCAAATCCCGCAGTATTTTCTTCTCACC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGAAGGTGTTTGAAGATATTTCAGCCAACACAGTTAACATGGCTCTGCAAATCCCGCAGTATTTTCTTCTCACC  1776

Query 1777  TGTGGCGAAGTGGTCTTCTCTGTCACGGGATTGGAATTCTCATATTCTCAGGCTCCTTCCAACATGAAGTCGGT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TGTGGCGAAGTGGTCTTCTCTGTCACGGGATTGGAATTCTCATATTCTCAGGCTCCTTCCAACATGAAGTCGGT  1850

Query 1851  GCTTCAGGCAGGATGGCTGCTGACCGTGGCTGTTGGCAACATCATTGTGCTCATCGTGGCAGGGGCAGGCCAGT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCTTCAGGCAGGATGGCTGCTGACCGTGGCTGTTGGCAACATCATTGTGCTCATCGTGGCAGGGGCAGGCCAGT  1924

Query 1925  TCAGCAAACAGTGGGCCGAGTACATTCTATTTGCCGCGTTGCTTCTGGTCGTCTGTGTAATTTTTGCCATCATG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TCAGCAAACAGTGGGCCGAGTACATTCTATTTGCCGCGTTGCTTCTGGTCGTCTGTGTAATTTTTGCCATCATG  1998

Query 1999  GCTCGGTTCTATACTTACATCAACCCAGCGGAGATCGAAGCTCAATTTGATGAGGATGAAAAGAAAAACAGACT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GCTCGGTTCTATACTTACATCAACCCAGCGGAGATCGAAGCTCAATTTGATGAGGATGAAAAGAAAAACAGACT  2072

Query 2073  GGAAAAGAGTAACCCATATTTCATGTCAGGGGCCAATTCACAGAAACAGATG  2124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GGAAAAGAGTAACCCATATTTCATGTCAGGGGCCAATTCACAGAAACAGATG  2124