Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471736
• Subject: XM_006527758.3
• Aligned Length: 1152
• Identities: 979
• Gaps: 48

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------ATGTGGCCCCTGTGGCGCCTCGTGTCTCT  29
                                                         |||||.||||||||||..|||...|..||
Sbjct    1  ATGCCTGGTCCATGGGCACAAAGAGGGAGTAGAGGAACATTGACCATGTGTCCCCTGTGGCTACTCACCTTGCT  74

Query   30  GCTGGCCCTGAGCCAGGCCCTGCCCTTTGAGCAGAGAGGCTTCTGGGACTTCACCCTGGACGATGGGCCATTCA  103
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||..||.|||||||||||||||.||||.|||||||...|||
Sbjct   75  GCTGGCCCTGAGCCAGGCCTTGCCCTTTGAGCAGAAGGGTTTCTGGGACTTCACCTTGGATGATGGGCTGCTCA  148

Query  104  TGATGAACGATGAGGAAGCTTCGGGCGCTGACACC---TCAGGCGTCCTGGACCCGGACTCTGTCACACCCACC  174
            |||||||.||||||||.|||||.||..|.||||||   |||||.||||..||||.|||||||||||||||.|||
Sbjct  149  TGATGAATGATGAGGAGGCTTCAGGTTCAGACACCACTTCAGGTGTCCCCGACCTGGACTCTGTCACACCTACC  222

Query  175  TACAGCGCCATGTGTCCTTTCGGCTGCCACTGCCACCTGCGGGTGGTTCAGTGCTCCGACCTGGGTCTGAAGTC  248
            |.|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|||||||||||.|
Sbjct  223  TTCAGTGCCATGTGTCCTTTCGGTTGCCACTGCCACCTGCGGGTTGTTCAGTGCTCTGACTTGGGTCTGAAGAC  296

Query  249  TGTGCCCAAAGAGATCTCCCCTGACACCACGCTGCTGGACCTGCAGAACAACGACATCTCCGAGCTCCGCAAGG  322
            |||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||
Sbjct  297  TGTGCCCAAGGAGATCTCACCTGACACCACACTGCTAGACCTGCAGAACAATGACATTTCTGAGCTTCGCAAGG  370

Query  323  ATGACTTCAAGGGTCTCCAGCACCTCTACGCCCTCGTCCTGGTGAACAACAAGATCTCCAAGATCCATGAGAAG  396
            ||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGACTTCAAAGGCCTCCAGCACCTCTACGCCCTGGTCTTGGTAAACAATAAGATCTCCAAGATCCATGAGAAG  444

Query  397  GCCTTCAGCCCACTGCGGAAGCTGCAGAAGCTCTACATCTCCAAGAACCACCTGGTGGAGATCCCGCCCAACCT  470
            |||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  445  GCCTTTAGCCCTCTGCGGAAGCTGCAAAAACTCTACATCTCCAAGAACCACCTGGTGGAGATTCCTCCCAACCT  518

Query  471  ACCCAGCTCCCTGGTGGAGCTCCGCATCCACGACAACCGCATCCGCAAGGTGCCCAAGGGAGTGTTCAGCGGGC  544
            .||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  GCCCAGCTCCCTGGTAGAACTACGAATCCATGACAACCGTATCCGCAAAGTGCCCAAGGGCGTGTTCAGCGGGC  592

Query  545  TCCGGAACATGAACTGCATCGAGATGGGCGGGAACCCACTGGAGAACAGTGGCTTTGAACCTGGAGCCTTCGAT  618
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  593  TCCGGAACATGAACTGCATTGAGATGGGCGGGAATCCCCTGGAGAACAGTGGCTTTGAACCAGGAGCCTTTGAT  666

Query  619  GGCCTGAAGCTCAACTACCTGCGCATCTCAGAGGCCAAGCTGACTGGCATCCCCAAAGACCTCCCTGAGACCCT  692
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  667  GGCCTGAAGCTCAATTACCTGCGCATCTCAGAGGCCAAGCTCACTGGCATCCCCAAAGATCTCCCTGAGACCCT  740

Query  693  GAATGAACTCCACCTAGACCACAACAAAATCCAGGCCATCGAACTGGAGGACCTGCTTCGCTACTCCAAGCTGT  766
            |||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||..||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  741  GAACGAACTTCACCTGGACCACAACAAAATCCAGGCTATTGAGTTGGAGGACCTACTTCGATACTCCAAGCTGT  814

Query  767  ACAGGCTGGGCCTAGGCCACAACCAGATCAGGATGATCGAGAACGGGAGCCTGAGCTTCCTGCCCACCCTCCGG  840
            |||||.|||||.||||.|||||.|||||..|||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||..||
Sbjct  815  ACAGGTTGGGCTTAGGTCACAATCAGATTCGGATGATTGAGAATGGGAGCCTGAGTTTTCTGCCTACCCTGAGG  888

Query  841  GAGCTCCACTTGGACAACAACAAGTTGGCCAGGGTGCCCTCAGGGCTCCCAGACCTCAAGCTCCTCCAGGTGGT  914
            ||.||.||||||||||||||||||.||.||.|||||||..|.||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  889  GAACTTCACTTGGACAACAACAAGCTGTCCCGGGTGCCTGCTGGCCTCCCAGATCTCAAGCTCCTCCAGGTTGT  962

Query  915  CTATCTGCACTCCAACAACATCACCAAAGTGGGTGTCAACGACTTCTGTCCCATGGGCTTCGGGGTGAAGCGGG  988
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||.|||
Sbjct  963  CTATCTGCACTCCAACAACATCACCAAGGTGGGCATCAATGACTTCTGTCCTATGGGCTTCGGAGTCAAGAGGG  1036

Query  989  CCTACTACAACGGCATCAGCCTCTTCAACAACCCCGTGCCCTACTGGGAGGTGCAGCCGGCCACTTTCCGCTGC  1062
            |||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1037  CCTACTATAATGGCATCAGCCTCTTCAACAACCCTGTGCCCTACTGGGAAGTGCAGCCTGCCACCTTCCGCTGC  1110

Query 1063  GTCACTGACCGCCTGGCCATCCAGTTTGGCAACTACAAAAAG  1104
            ||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct 1111  GTTACTGACCGCCTGGCCATCCAATTTGGAAATTATAAGAAG  1152