Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471782
- Subject:
- NM_008091.3
- Aligned Length:
- 1332
- Identities:
- 1194
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 ATGGAGGCGACGGCGGACCAGCCGCGCTGGGTGAGCCACCACCACCCCGCCGTGCTCAACGGGCAGCACCCGGA 74
|||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 1 ATGGAGGTGACTGCGGACCAGCCGCGCTGGGTGAGCCACCATCACCCCGCGGTCCTCAACGGTCAGCACCCAGA 74
Query 75 CACGCACCACCCGGGCCTCAGCCACTCCTACATGGACGCGGCGCAGTACCCGCTGCCGGAGGAGGTGGATGTGC 148
|||||||||||||||||||.||||.||.|||||||| .||.|||||.||||||.||||.||||||||.||.|
Sbjct 75 CACGCACCACCCGGGCCTCGGCCATTCGTACATGGA---AGCTCAGTATCCGCTGACGGAAGAGGTGGACGTAC 145
Query 149 TTTTTAACATCGACGGTCAAGGCAACCACGTCCCGCCCTACTACGGAAACTCGGTCAGGGCCACGGTGCAGAGG 222
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 146 TTTTTAACATCGATGGTCAAGGCAACCACGTCCCGTCCTACTACGGAAACTCCGTCAGGGCTACGGTGCAGAGG 219
Query 223 TACCCTCCGACCCACCACGGGAGCCAGGTGTGCCGCCCGCCTCTGCTTCATGGATCCCTACCCTGGCTGGACGG 296
||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||
Sbjct 220 TATCCTCCGACCCACCACGGGAGCCAGGTATGCCGCCCGCCTCTGCTGCACGGATCTCTGCCCTGGCTGGATGG 293
Query 297 CGGCAAAGCCCTGGGCAGCCACCACACCGCCTCCCCCTGGAATCTCAGCCCCTTCTCCAAGACGTCCATCCACC 370
|||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294 CGGCAAAGCCCTGAGCAGCCACCACACCGCCTCGCCCTGGAACCTCAGCCCCTTCTCCAAGACGTCCATCCACC 367
Query 371 ACGGCTCCCCGGGGCCCCTCTCCGTCTACCCCCCGGCCTCGTCCTCCTCCTTGTCGGGGGGCCACGCCAGCCCG 444
|||||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||..||.|||..||||||.||||.||.
Sbjct 368 ACGGCTCTCCGGGGCCTCTGTCCGTTTACCCTCCGGCTTCATCCTCTTCTCTGGCGGCCGGCCACTCCAGTCCT 441
Query 445 CACCTCTTCACCTTCCCGCCCACCCCGCCGAAGGACGTCTCCCCGGACCCATCGCTGTCCACCCCAGGCTCGGC 518
||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 442 CATCTCTTCACCTTCCCGCCCACCCCGCCGAAAGACGTCTCCCCAGACCCGTCGCTGTCCACCCCGGGATCCGC 515
Query 519 CGGCTCGGCCCGGCAGGACGAGAAAGAGTGCCTCAAGTACCAGGTGCCCCTGCCCGACAGCATGAAGCTGGAGT 592
|||.||||||.||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||..|||||.||.|||||||||||||||.
Sbjct 516 CGGGTCGGCCAGGCAAGATGAGAAAGAGTGCCTCAAGTATCAGGTGCAGCTGCCAGATAGCATGAAGCTGGAGA 589
Query 593 CGTCCCACTCCCGTGGCAGCATGACCGCCCTGGGTGGAGCCTCCTCGTCGACCCACCACCCCATCACCACCTAC 666
||||.|||||.||.||||||||||||.||||||||||.|||||.||.||..|||||||||||||.||||||||.
Sbjct 590 CGTCTCACTCTCGAGGCAGCATGACCACCCTGGGTGGGGCCTCATCCTCAGCCCACCACCCCATTACCACCTAT 663
Query 667 CCGCCCTACGTGCCCGAGTACAGCTCCGGACTCTTCCCCCCCAGCAGCCTGCTGGGCGGCTCCCCCACCGGCTT 740
||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||
Sbjct 664 CCGCCCTATGTGCCCGAGTACAGCTCTGGACTCTTCCCACCCAGCAGCCTGCTGGGAGGATCCCCTACCGGGTT 737
Query 741 CGGATGCAAGTCCAGGCCCAAGGCCCGGTCCAGCACAGAAGGCAGGGAGTGTGTGAACTGTGGGGCAACCTCGA 814
||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 738 CGGATGTAAGTCGAGGCCCAAGGCACGATCCAGCACAGAAGGCAGGGAGTGTGTGAACTGCGGGGCAACCTCTA 811
Query 815 CCCCACTGTGGCGGCGAGATGGCACGGGACACTACCTGTGCAACGCCTGCGGGCTCTATCACAAAATGAACGGA 888
||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||.
Sbjct 812 CCCCACTGTGGCGGCGAGATGGTACCGGGCACTACCTTTGCAATGCCTGCGGACTCTACCATAAAATGAATGGG 885
Query 889 CAGAACCGGCCCCTCATTAAGCCCAAGCGAAGGCTGTCTGCAGCCAGGAGAGCAGGGACGTCCTGTGCGAACTG 962
||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 886 CAGAACCGGCCCCTTATCAAGCCCAAGCGAAGGCTGTCGGCAGCAAGGAGAGCAGGGACATCCTGCGCGAACTG 959
Query 963 TCAGACCACCACAACCACACTCTGGAGGAGGAATGCCAATGGGGACCCTGTCTGCAATGCCTGTGGGCTCTACT 1036
||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 960 TCAGACCACCACCACCACCCTCTGGAGGAGGAACGCTAATGGGGACCCGGTCTGCAATGCCTGTGGGCTGTACT 1033
Query 1037 ACAAGCTTCACAATATTAACAGACCCCTGACTATGAAGAAGGAAGGCATCCAGACCAGAAACCGAAAAATGTCT 1110
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.||.||||||
Sbjct 1034 ACAAGCTTCATAATATTAACAGACCCCTGACTATGAAGAAAGAAGGCATCCAGACCCGAAACCGGAAGATGTCT 1107
Query 1111 AGCAAATCCAAAAAGTGCAAAAAAGTGCATGACTCACTGGAGGACTTCCCCAAGAACAGCTCGTTTAACCCGGC 1184
||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||||||||||.||||||.||.||||||||
Sbjct 1108 AGCAAATCGAAAAAGTGCAAAAAGGTGCATGACGCGCTGGAGGACTTCCCCAAGAGCAGCTCCTTCAACCCGGC 1181
Query 1185 CGCCCTCTCCAGACACATGTCCTCCCTGAGCCACATCTCGCCCTTCAGCCACTCCAGCCACATGCTGACCACGC 1258
|||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1182 CGCTCTCTCCAGACACATGTCATCCCTGAGCCACATCTCTCCCTTCAGCCACTCCAGCCACATGCTGACCACAC 1255
Query 1259 CCACGCCGATGCACCCGCCATCCAGCCTGTCCTTTGGACCACACCACCCCTCCAGCATGGTCACCGCCATGGGT 1332
|.|||||.|||||.|||||.|||.||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256 CGACGCCCATGCATCCGCCCTCCGGCCTCTCCTTCGGACCTCACCACCCTTCCAGCATGGTCACCGCCATGGGT 1329