Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471790
• Subject: XM_006533509.3
• Aligned Length: 3165
• Identities: 2673
• Gaps: 203

Alignment

Query    1  ATGGAGGTGGTGGGTGACTTCGAGTACAGCAAGAGGGATCTCGTGGGACACGGGGCCTTCGCCGTGGTCTTCCG  74
            ||||||||||||||.||||||||||||.|||||.||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGTGGTGGGCGACTTCGAGTACTGCAAGCGGGACCTCGTGGGACACGGGGCCTTCGCTGTGGTCTTCCG  74

Query   75  GGGGCGGCACCGCCAGAAAACTGATTGGGAGGTAGCTATTAAAAGTATTAATAAAAAGAACTTGTCAAAATCAC  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGGCGGCACCGCCAGAAAACTGATTGGGAGGTGGCTATTAAAAGTATTAATAAAAAGAACTTGTCAAAATCAC  148

Query  149  AAATACTGCTTGGAAAGGAAATTAAAATCTTAAAGGAACTTCAGCATGAAAATATTGTAGCACTCTATGATGTT  222
            ||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct  149  AAATTCTGCTTGGAAAGGAAATAAAAATCTTAAAGGAGCTTCAGCATGAAAACATCGTAGCGCTCTATGATGTT  222

Query  223  CAGGAATTACCCAACTCTGTCTTTTTGGTGATGGAGTATTGCAATGGTGGAGACCTCGCAGATTATTTGCAAGC  296
            ||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGGAATTGCCCAACTCTGTCTTTCTGGTGATGGAGTATTGCAATGGTGGAGACCTGGCAGATTATTTGCAAGC  296

Query  297  GAAAGGGACTCTCAGTGAAGACACGATCAGAGTGTTTCTGCATCAGATTGCTGCTGCCATGCGAATCCTGCACA  370
            .|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAAAGGAACTCTGAGTGAAGATACTATCAGAGTGTTTCTCCATCAGATTGCGGCAGCCATGCGAATCCTGCACA  370

Query  371  GCAAAGGAATCATCCACAGAGATCTCAAACCACAGAACATCTTGCTGTCCTATGCCAATCGCAGAAAATCAAGT  444
            |||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.||.||||.|||||||||||.||.||.||.|.|
Sbjct  371  GCAAAGGGATAATCCACAGGGATCTCAAACCACAGAATATCCTGTTGTCTTATGCCAATCGAAGGAAGTCGAAT  444

Query  445  GTCAGTGGTATTCGCATCAAAATAGCGGATTTTGGTTTTGCTCGTTACCTACATAGTAACATGATGGCTGCAAC  518
            ||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||..|||||.||.||
Sbjct  445  GTCAGTGGTATTCGTATTAAAATAGCTGATTTTGGTTTCGCACGGTACCTACATAGTAACACAATGGCAGCGAC  518

Query  519  ACTGTGTGGATCCCCGATGTACATGGCTCCTGAGGTTATTATGTCTCAACATTATGATGCTAAGGCTGACTTGT  592
            |||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct  519  ACTGTGTGGATCCCCAATGTACATGGCTCCCGAGGTTATTATGTCTCAACATTATGATGCTAAGGCAGATTTAT  592

Query  593  GGAGCATAGGAACAGTGATATACCAATGCCTAGTTGGAAAACCACCTTTTCAGGCCAATAGTCCTCAAGACTTA  666
            |||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.||
Sbjct  593  GGAGCATAGGAACAGTGATCTATCAATGCCTAGTTGGAAAACCACCTTTTCAGGCTAATAGTCCTCAGGACCTA  666

Query  667  AAGATGTTTTATGAAAAAAACAGGAGCTTAATGCCTAGTATTCCCAGAGAAACATCACCTTATTTGGCTAATCT  740
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  AGGATGTTTTATGAAAAAAACAGGAGCTTAATGCCTAGTATTCCCAGAGAAACATCACCTTACTTGGCTAATCT  740

Query  741  -CTTTTGGGTTTGCTTCAGAGAAACCAAAAAGATAAGAATGGACTTTGAAGCGTTTTT-AGCCATCCTTTTTCT  812
             |||||||||||||||||||||||.|||||.||| |||||||||||||||||.||||| |||||||| |||.||
Sbjct  741  CCTTTTGGGTTTGCTTCAGAGAAATCAAAAGGAT-AGAATGGACTTTGAAGCATTTTTCAGCCATCC-TTTCCT  812

Query  813  TGAGCAAGGTCCAGTAAAAAAATCTTGCCCAGTTCCAGTGCCCATGTATTCTGGTTCTGTCTCTGGAAGCTCCT  886
            ||||||||.||||||.|||||||||||||||||.||||||||..||||||||||..|||||.||||||||||||
Sbjct  813  TGAGCAAGTTCCAGTTAAAAAATCTTGCCCAGTCCCAGTGCCTGTGTATTCTGGCCCTGTCCCTGGAAGCTCCT  886

Query  887  GTGGCAGCTCTCCATCTTGTCGTTTTGCTTCTCCACCATCCCTTCCAGATATGCAGCATATTCAGGAAGAAAAC  960
            |..|||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  GCAGCAGCTCACCATCTTGTCGCTTTGCTTCTCCACCATCCCTTCCAGATATGCAGCATATTCAGGAAGAAAAC  960

Query  961  TTATCTTCCCCACCATTGGGTCCTCCCAACTATCTACAAGTTTCCAAAGATTCTGCCAGTACTAGTAGCAAGAA  1034
            |||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||.||||||||||||
Sbjct  961  TTATCCTCCCCACCGTTGGGTCCTCCCAACTATCTACAGGTGTCCAAAGACTCTGCGAGTAATAGTAGCAAGAA  1034

Query 1035  CTCTTCTTGTGACACGGATGACTTTGTTTTGGTGCCACACAACATCTCGTCAGACCACTCATGTGATATGCCAA  1108
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||
Sbjct 1035  CTCTTCTTGTGACACGGATGACTTTGTTTTGGTTCCACACAACATCTCGTCAGACCACTCATATGACATGCCAA  1108

Query 1109  TGGGGACTGCTGGCAGACGTGCTTCAAATGAATTCTTGGTGTGTGGAGGGCAGTGTCAGCCTACTGTGTCACCT  1182
            ||||||||.|.|.||||||||||||||||||||||||..|||||||||                          
Sbjct 1109  TGGGGACTACGGCCAGACGTGCTTCAAATGAATTCTTTATGTGTGGAG--------------------------  1156

Query 1183  CACAGCGAAACAGCACCAATTCCAGTTCCTACTCAAATAAGGAATTATCAGCGCATAGAGCAGAATCTTACATC  1256
                                                                                      
Sbjct 1157  --------------------------------------------------------------------------  1156

Query 1257  TACTGCCAGCTCAGGCACAAATGTACATGGTTCTCCAAGATCTGCAGTGGTACGAAGGTCCAACACCAGCCCCA  1330
                                                  ||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1157  --------------------------------------GATCTGCAGTAGTACGAAGGTCTAATACCAGCCCCA  1192

Query 1331  TGGGCTTCCTCCGGCCGGGATCATGCTCCCCAGTACCAGCAGACACAGCACAGACAGTTGGACGAAGGCTCTCC  1404
            ||||||||||||||...||.||.||||||||.|||||||.||||||||..|||||||..||||||||.|||||.
Sbjct 1193  TGGGCTTCCTCCGGGTTGGGTCCTGCTCCCCTGTACCAGGAGACACAGTGCAGACAGGAGGACGAAGACTCTCT  1266

Query 1405  ACTGGGTCTTCTAGGCCTTACTCACCTTCCCCTTTGGTTGGTACCATTCCTGAGCAATTCAGTCAGTGCTGCTG  1478
            |||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1267  ACTGGCTCTTCCAGGCCTTACTCACCATCCCCTTTGGTTGGTACCATTCCTGAACAGTTTAGTCAGTGCTGCTG  1340

Query 1479  TGGGCATCCTCAGGGCCATGACTCCAGGAGTAGAAACTCCTCAGGTTCTCCAGTGCCACAAGCTCAGTCCCCAC  1552
            |||.|||||||||||||||||..||||||||||..|||||||||||||||||||||||||..|.|||.|.||||
Sbjct 1341  TGGACATCCTCAGGGCCATGAAGCCAGGAGTAGGCACTCCTCAGGTTCTCCAGTGCCACAGACCCAGGCACCAC  1414

Query 1553  AGTCTCTCTTATCGGGTGCTAGACTGCAGAGCGCCCCCACCCTCACTGACATCTATCAGAACAAGCAGAAGCTC  1626
            ||||.||||||..||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1415  AGTCACTCTTACTGGGTGCTAGACTGCAGAGTGCACCCACCCTCACCGATATCTATCAGAACAAGCAGAAGCTC  1488

Query 1627  AGAAAACAGCACTCTGACCCCGTGTGCCCATCCCATACTGGGGCTGGGTACAGCTACTCGCCTCAGCCCAGTCG  1700
            |||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||.||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 1489  AGAAAGCAGCACTCTGACCCTGTGTGTCCGTCCCATGCTGGAGCTGGGTATAGTTACTCACCTCAGCCTAGTCG  1562

Query 1701  GCCTGGCAGCCTTGGAACTTCTCCCACCAAGCACTTGGGGTCCTCTCCACGGAGTTCTGACTGGTTCTTTAAAA  1774
            |||||||||||||||.||.|||||||||||||||..|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1563  GCCTGGCAGCCTTGGGACCTCTCCCACCAAGCACACGGGGTCCTCTCCACGGAATTCTGACTGGTTCTTTAAAA  1636

Query 1775  CTCCTTTGCCAACAATCATTGGCTCTCCTACTAAGACCACAGCTCCTTTCAAAATCCCTAAAACTCAAGCATCT  1848
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1637  CTCCTTTACCAACAATCATTGGCTCTCCTACTAAGACTACAGCTCCTTTCAAAATCCCTAAAACACAAGCATCT  1710

Query 1849  TCCAACCTGTTAGCCTTGGTTACTCGTCATGGGCCTGCTGAAGAACAGTCGAAAGATGGGAATGAGCCACGGGA  1922
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...|||||.||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1711  TCTAACCTGTTAGCCTTGGTTACTCGTCATGGGCCTGCTGAAAGCCAGTCCAAAGATGGGAATGACCCTCGTGA  1784

Query 1923  ATGTGCCCATTGCCTCTTAGTGCAAGGAAGTGAGAGGCAGCGGGCCG---AGCAGCAGAGCAAGGCAGTGTTTG  1993
            .|||.||||.|||||||.|||.||||||||.||||||||.||..|.|   ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1785  GTGTTCCCACTGCCTCTCAGTACAAGGAAGCGAGAGGCATCGATCTGAGCAGCAGCAGAGCAAGGCAGTGTTTG  1858

Query 1994  GCAGATCTGTCAGTACCGGGAAGTTATCAGATCAACAAGGAAAGACTCCTATATGTCGACATCAGGGCAGCACA  2067
            ||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||.||||.|.|||.||.||.||||.|||||||||||.
Sbjct 1859  GCAGATCTGTCAGTACTGGGAAGTTATCAGAACAACAAGTAAAGGCACCTTTAGGTGGACACCAGGGCAGCACG  1932

Query 2068  GACAGTTTAAATACAGAACGACCAATGGATATAGCTCCGGCAGGAGCCTGTGGTGGTGTTCTGGCACCTCCTGC  2141
            ||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||.|.|.||||||...||.||
Sbjct 1933  GATAGTTTAAACACAGAACGACCAATGGATGTAGCTCCTGCAGGAGCCTGTGGTGTTATGCTGGCATTGCCAGC  2006

Query 2142  AGGTACAGCAGCAAGTTCCAAGGCTGTCCTCTTCACTGTAGGGTCTCCTCCACACAGTGCGGCAGCCCCCACTT  2215
            |||.|||||||||||..|||..||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||..||||||||||||
Sbjct 2007  AGGAACAGCAGCAAGCGCCAGAGCTGTCCTCTTCACCGTGGGGTCTCCTCCACACAGTGCCACAGCCCCCACTT  2080

Query 2216  GTACCCACATGTTCCTTCGAACAAGAACAACCTCAGTGGGGCCCAGCAACTCCGGGGGCTCTCTT-TGTGCCAT  2288
            ||||.||.|||.||||||||||||||||.||||||||||||.||||||.|||.||.||.|| ||| |||.|  |
Sbjct 2081  GTACTCATATGGTCCTTCGAACAAGAACCACCTCAGTGGGGTCCAGCAGCTCAGGAGGTTC-CTTGTGTTC--T  2151

Query 2289  G--AGTGGCCGCGTTTGCGTGGGGTCCCCCGCTTGCCCCAAGCCTTCGGGTCTTTCCCTTTCCAGGAGCAGAGG  2360
            |  ||||||||.||.||.|||||.|||||..||.|.||  ||..||.||.||||.|||  .|||||||||||||
Sbjct 2152  GCAAGTGGCCGAGTATGTGTGGGCTCCCCTCCTGGACC--AGGGTTGGGCTCTTCCCC--ACCAGGAGCAGAGG  2221

Query 2361  CAGCTCCCAGCCTGAGATACGTGCCTTACGGTGCTTCACCCCCCCAGCCTAGAGGG-CTCATCACCTTTGAAGC  2433
            .||||||||||||.||||||||||||||.||||||||| ||.|||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2222  GAGCTCCCAGCCTAAGATACGTGCCTTATGGTGCTTCA-CCACCCAGCCTAGAGGGTCTCATCACCTTTGAAGC  2294

Query 2434  CCCTGAACTGCCGGAGGAGACGCTGATGGAGCGGGAACACACAGACACCTTACGCCATCTGAATGTGATGCTGA  2507
            |||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||..|||||.|.|
Sbjct 2295  CCCTGAACTACCAGAGGAGACACTGATGGAGCGAGAGCACACAGACACCTTACGCCATCTGAACATGATGTTAA  2368

Query 2508  TGTTCACTGAGTGTGTGCTGGACCTGACAGCCATGAGGGGAGGAAACCNTGAGCTGTGCACATCTGCTGTGTCC  2581
            ||||.|||||||||||||||||||||||.||..|||||||.||.||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TGTTTACTGAGTGTGTGCTGGACCTGACGGCAGTGAGGGGTGGGAACCCTGAGCTGTGCACATCTGCTGTGTCC  2442

Query 2582  TTGTACCAGATCCAGGAGAGTGTGGTGGTGGACCAGATCAGTCAGCTGAGCAAAGACTGGGGGCGGGTGGAGCA  2655
            |||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2443  TTGTACCAGATTCAGGAGAGTGTAGTTGTGGACCAGATCAGCCAGCTAAGCAAAGATTGGGGGCGGGTGGAGCA  2516

Query 2656  GCTGGTGTTGTACATGAAAGCAGCACAGCTGCTTGCGGCTTCTCTGCATCTTGCCAAAGCCCAGATCAAGTCCG  2729
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||.|||||||.|
Sbjct 2517  GCTGGTGTTGTACATGAAGGCAGCACAGCTGCTGGCGGCTTCCCTGCATCTCGCCAAAGCTCAGGTCAAGTCTG  2590

Query 2730  GGAAACTGAGCCCATCCACAGCTGTGAAACAAGTTGTCAAGAATCTGAACGAACGATATAAATTCTGCATCACC  2803
            ||||.|||||||||||||..|||||||||||||||||.||.||||||||.|||.||||.|||||||||||||||
Sbjct 2591  GGAAGCTGAGCCCATCCATGGCTGTGAAACAAGTTGTTAAAAATCTGAATGAAAGATACAAATTCTGCATCACC  2664

Query 2804  ATGTGCAAGAAACTTACAGAAAAGCTGAATCGATTCTTCTCTGACAAACAGAGGTTTATTGATGAAATCAACAG  2877
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  ATGTGCAAGAAACTTACAGAAAAGCTGAATCGCTTCTTCTCCGATAAACAGAGATTTATTGATGAAATCAACAG  2738

Query 2878  TGTGACTGCAGAGAAACTCATCTATAATTGTGCTGTAGAAATGGTTCAGTCTGCAGCCCTGGATGAGATGTTTC  2951
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  TGTGACTGCAGAGAAACTCATCTATAATTGTGCTGTGGAAATGGTTCAATCTGCAGCCCTGGATGAGATGTTTC  2812

Query 2952  AGCAGACCGAAGATATTGTTTATCGCTATCATAAGGCAGCCCTTCTTTTGGAAGGCCTAAGTAGGATTCTACAG  3025
            |||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.||||||.|||.||.|||
Sbjct 2813  AGCAGACTGAAGACATCGTTTATCGCTACCACAAGGCAGCCCTTCTTTTGGAAGGCTTAAGTAAGATCCTGCAG  2886

Query 3026  GACCCTGCAGATATTGAAAATGTGCATAAAT----------------ATAAATGTAGTATTG------AGAG--  3075
            ||||||.|||||.||||||||||||||||.|                |||..||.|.|.|||      ||||  
Sbjct 2887  GACCCTACAGATGTTGAAAATGTGCATAAGTCATTAAGCTCCTGGTCATATCTGAACTGTTGCTGGAAAGAGGA  2960

Query 3076  AAG-----------ACTGTCGGCGC-TCT----GCC---ATAGCACCGCAACCGTG-  3112
            |||           |.|||  |..| |||    |||   ||||..|.|.||||.|| 
Sbjct 2961  AAGAAAGTGTATTCATTGT--GTTCATCTTGGGGCCAAGATAGAGCAGGAACCATGG  3015