Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471890
• Subject: XM_011512534.2
• Aligned Length: 1303
• Identities: 1201
• Gaps: 83

Alignment

Query    1  ATGTTCAGTCTGATGGCCAGTTGCTGCGGCTGGTTCAAGCGGTGGCGGGAGCCTGTCAGAAAGGTGACTCTTTT  74
                                                     .||.|  .|||||     .|||.| |.||||.|
Sbjct    1  -----------------------------------------ATGCC--TAGCCT-----CAAGCT-ATTCTTCT  25

Query   75  GATGGTGGGACTTG-------ATAATGCTGGTAAAAC-CGCAACAGCAAAGGGAATCCAAG-----------GA  129
                    |.||||       |.|.||||||.|..|| .|||..|||.|       |||.|           .|
Sbjct   26  --------GCCTTGGCCTCCAAGAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCA-------CCACGCCCAGCCCGGCCA  84

Query  130  GAATACCCTGAAGATGTAGCTCCTACTGTTGGATTTTCAAAAATTAACCTTAGACAAGGAAAGTTTGAAGTCAC  203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   85  GAATACCCTGAAGATGTAGCTCCTACTGTTGGATTTTCAAAAATTAACCTTAGACAAGGAAAGTTTGAAGTCAC  158

Query  204  CATCTTTGACTTGGGAGGTGGAATAAGAATTCGGGGAATCTGGAAGAATTACTATGCTGAATCCTATGGGGTAA  277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  159  CATCTTTGACTTGGGAGGTGGAATAAGAATTCGGGGAATCTGGAAGAATTACTATGCTGAATCCTATGGGGTAA  232

Query  278  TATTTGTTGTGGATTCCAGTGATGAAGAGAGAATGGAAGAGACAAAAGAGGCTATGTCAGAAATGCTAAGACAT  351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  233  TATTTGTTGTGGATTCCAGTGATGAAGAGAGAATGGAAGAGACAAAAGAGGCTATGTCAGAAATGCTAAGACAT  306

Query  352  CCTAGGATATCGGGAAAGCCTATATTGGTGTTGGCAAATAAACAAGATAAAGAAGGAGCTTTAGGAGAAGCTGA  425
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  307  CCTAGGATATCGGGAAAGCCTATATTGGTGTTGGCAAATAAACAAGATAAAGAAGGAGCTTTAGGAGAAGCTGA  380

Query  426  TGTCATTGAATGTCTATCTCTGGAAAAATTGGTCAATGAGCACAAGTGCCTGTGTCAGATAGAACCATGTTCAG  499
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  381  TGTCATTGAATGTCTATCTCTGGAAAAATTGGTCAATGAGCACAAGTGCCTGTGTCAGATAGAACCATGTTCAG  454

Query  500  CAATCTCGGGGTATGGAAAGAAAATTGACAAGTCCATTAAAAAAGGCCTTTATTGGCTGCTACATGTTATTGCA  573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  455  CAATCTCGGGGTATGGAAAGAAAATTGACAAGTCCATTAAAAAAGGCCTTTATTGGCTGCTACATGTTATTGCA  528

Query  574  AGAGACTTTGATGCCTTAAATGAACGCATCCAAAAAGAGACAACAGAGCAGCGTGCTCTTGAGGAACAAGAGAA  647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  529  AGAGACTTTGATGCCTTAAATGAACGCATCCAAAAAGAGACAACAGAGCAGCGTGCTCTTGAGGAACAAGAGAA  602

Query  648  ACAAGAAAGAGCTGAACGAGTGCGAAAATTACGAGAAGAAAGAAAACAAAATGAACAGGAGCAGGCTGAACTCG  721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  603  ACAAGAAAGAGCTGAACGAGTGCGAAAATTACGAGAAGAAAGAAAACAAAATGAACAGGAGCAGGCTGAACTCG  676

Query  722  ATGGAACCAGTGGTCTGGCTGAGTTGGACCCAGAACCAACGAATCCTTTCCAGCCAATAGCATCTGTAATCATT  795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  677  ATGGAACCAGTGGTCTGGCTGAGTTGGACCCAGAACCAACGAATCCTTTCCAGCCAATAGCATCTGTAATCATT  750

Query  796  GAGAATGAAGGAAAACTTGAAAGAGAGAAAAAAAACCAAAAAATGGAGAAAGACAGTGATGGCTGCCACCTGAA  869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  751  GAGAATGAAGGAAAACTTGAAAGAGAGAAAAAAAACCAAAAAATGGAGAAAGACAGTGATGGCTGCCACCTGAA  824

Query  870  ACATAAAATGGAGCATGAGCAAATAGAGACACAAGGCCAGGTTAATCACAATGGCCAAAAAAATAATGAATTTG  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  825  ACATAAAATGGAGCATGAGCAAATAGAGACACAAGGCCAGGTTAATCACAATGGCCAAAAAAATAATGAATTTG  898

Query  944  GACTAGTAGAAAATTATAAGGAGGCATTAACACAGCAGTTAAAGAATGAAGATGAGACAGACCGGCCATCATTG  1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  899  GACTAGTAGAAAATTATAAGGAGGCATTAACACAGCAGTTAAAGAATGAAGATGAGACAGACCGGCCATCATTG  972

Query 1018  GAATCAGCTAATGGTAAAAAGAAAACTAAGAAACTAAGAATGAAAAGGAACCACCGGGTAGAACCACTTAATAT  1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  973  GAATCAGCTAATGGTAAAAAGAAAACTAAGAAACTAAGAATGAAAAGGAACCACCGGGTAGAACCACTTAATAT  1046

Query 1092  AGATGACTGTGCTCCTGAGAGTCCAACGCCACCCCCACCCCCTCCTCCTGTTGGCTGGGGAACCCCTAAAGTCA  1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1047  AGATGACTGTGCTCCTGAGAGTCCAACGCCACCCCCACCCCCTCCTCCTGTTGGCTGGGGAACCCCTAAAGTCA  1120

Query 1166  CTAGACTTCCAAAACTTGAGCCTCTTGGTGAAACACATCATAATGATTTCTATAGGAAGCCACTGCCTCCCCTG  1239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1121  CTAGACTTCCAAAACTTGAGCCTCTTGGTGAAACACATCATAATGATTTCTATAGGAAGCCACTGCCTCCCCTG  1194

Query 1240  GCTGTGCCACAGCGACCTAACAGTGATGCTCATGATGTGATCTCA  1284
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195  GCTGTGCCACAGCGACCTAACAGTGATGCTCATGATGTGATCTCA  1239