Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471905
• Subject: NM_001178034.1
• Aligned Length: 2413
• Identities: 2358
• Gaps: 38

Alignment

Query    1  ATGAACCTAACTGCC----AGC--GTGTCCCATCACA-------------------TCAAGTGTCAACCCTCAA  49
            |||      ||.|||    |||  |.|.|.||.|.||                   .||.|.| ||.||..|..
Sbjct    1  ATG------ACGGCCGCGAAGCAGGAGCCGCAGCCCACCCCGGGGGCCAGGGCGAGCCAGGCG-CAGCCGGCGG  67

Query   50  AAACAATCAAGGAACTGGGAAGTAACAGCCCTCCACAGAGAAACTGGAAGGGAATTGCTATTGCTCTGCTGGTG  123
            |      |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   68  A------CCAGGAACTGGGAAGTAACAGCCCTCCACAGAGAAACTGGAAGGGAATTGCTATTGCTCTGCTGGTG  135

Query  124  ATTTTAGTTGTATGCTCACTCATCACTATGTCAGTCATCCTCTTAACCCCAGATGAACTCACAAATTCGTCAGA  197
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  136  ATTTTAGTTGTATGCTCACTCATCACTATGTCAGTCATCCTCTTAACCCCAGATGAACTCACAAATTCGTCAGA  209

Query  198  AACCAGATTGTCTTTGGAAGACCTCTTTAGGAAAGACTTTGTGCTTCACGATCCAGAGGCTCGGTGGATCAATG  271
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  210  AACCAGATTGTCTTTGGAAGACCTCTTTAGGAAAGACTTTGTGCTTCACGATCCAGAGGCTCGGTGGATCAATG  283

Query  272  ATACAGATGTGGTGTATAAAAGCGAGAATGGACATGTCATTAAACTGAATATAGAAACAAATGCTACCACATTA  345
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  284  ATACAGATGTGGTGTATAAAAGCGAGAATGGACATGTCATTAAACTGAATATAGAAACAAATGCTACCACATTA  357

Query  346  TTATTGGAAAACACAACTTTTGTAACCTTCAAAGCATCAAGACATTCAGTTTCACCAGATTTAAAATATGTCCT  419
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  358  TTATTGGAAAACACAACTTTTGTAACCTTCAAAGCATCAAGACATTCAGTTTCACCAGATTTAAAATATGTCCT  431

Query  420  TCTGGCATATGATGTCAAACAGATTTTTCATTATTCATATACTGCTTCATATGTGATTTACAACATACACACTA  493
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  432  TCTGGCATATGATGTCAAACAGATTTTTCATTATTCGTATACTGCTTCATATGTGATTTACAACATACACACTA  505

Query  494  GGGAAGTTTGGGAGTTAAATCCTCCAGAAGTAGAGGACTCCGTCTTGCAGTACGCGGCCTGGGGTGTCCAAGGG  567
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  506  GGGAAGTTTGGGAGTTAAATCCTCCAGAAGTAGAGGACTCCGTCTTGCAGTACGCGGCCTGGGGTGTCCAAGGG  579

Query  568  CAGCAGCTGATTTATATTTTTGAAAATAATATCTACTATCAACCTGATATAAAGAGCAGTTCATTGCGACTGAC  641
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  580  CAGCAGCTGATTTATATTTTTGAAAATAATATCTACTATCAACCTGATATAAAGAGCAGTTCATTGCGACTGAC  653

Query  642  ATCTTCTGGAAAAGAAGAAATAATTTTTAATGGGATTGCTGACTGGTTATATGAAGAGGAACTCCTGCATTCTC  715
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  654  ATCTTCTGGAAAAGAAGAAATAATTTTTAATGGGATTGCTGACTGGTTATATGAAGAGGAACTCCTGCATTCTC  727

Query  716  ACATCGCCCACTGGTGGTCACCAGATGGAGAAAGACTTGCCTTCCTGATGATAAATGACTCTTTGGTACCCACC  789
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  728  ACATCGCCCACTGGTGGTCACCAGATGGAGAAAGACTTGCCTTCCTGATGATAAATGACTCTTTGGTACCCACC  801

Query  790  ATGGTTATCCCTCGGTTTACTGGAGCGTTGTATCCCAAAGGAAAGCAGTATCCGTATCCTAAGGCAGGTCAAAT  863
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  802  ATGGTTATCCCTCGGTTTACTGGAGCGTTGTATCCCAAAGGAAAGCAGTATCCGTATCCTAAGGCAGGTCAAGT  875

Query  864  GAACCCAACAATAAAATTATATGTTGTAAACCTGTATGGACCAACTCACACTTTGGAGCTCATGCCACCTGACA  937
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  876  GAACCCAACAATAAAATTATATGTTGTAAACCTGTATGGACCAACTCACACTTTGGAGCTCATGCCACCTGACA  949

Query  938  GCTTTAAATCAAGAGAATACTATATCACTATGGTTAAATGGGTAAGCAATACCAAGACTGTGGTAAGATGGTTA  1011
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  950  GCTTTAAATCAAGAGAATACTATATCACTATGGTTAAATGGGTAAGCAATACCAAGACTGTGGTAAGATGGTTA  1023

Query 1012  AACCGAGCTCAGAACATCTCCATCCTCACAGTCTGTGAGACCACTACAGGTGCTTGTAGTAAAAAATATGAGAT  1085
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1024  AACCGAGCTCAGAACATCTCCATCCTCACAGTCTGTGAGACCACTACAGGTGCTTGTAGTAAAAAATATGAGAT  1097

Query 1086  GACATCAGATACGTGGCTCTCTCAGCAGAATGAGGAGCCCGTGTTTTCTAGAGACGGCAGCAAATTCTTTATGA  1159
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1098  GACATCAGATACGTGGCTCTCTCAGCAGAATGAGGAGCCCGTGTTTTCTAGAGACGGCAGCAAATTCTTTATGA  1171

Query 1160  CAGTGCCTGTTAAGCAAGGGGGACGTGGAGAATTTCACCACATAGCTATGTTCCTCATCCAGAGTAAAAGTGAG  1233
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1172  CAGTGCCTGTTAAGCAAGGGGGACGTGGAGAATTTCACCACATAGCTATGTTCCTCATCCAGAGTAAAAGTGAG  1245

Query 1234  CAAATTACCGTGCGGCATCTGACATCAGGAAACTGGGAAGTGATAAAGATCTTGGCATACGATGAAACTACTCA  1307
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1246  CAAATTACCGTGCGGCATCTGACATCAGGAAACTGGGAAGTGATAAAGATCTTGGCATACGATGAAACTACTCA  1319

Query 1308  AAAAATTTACTTTCTGAGCACTGAATCTTCTCCCAGAGGAAGGCAGCTGTACAGTGCTTCTACTGAAGGATTAT  1381
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320  AAAAATTTACTTTCTGAGCACTGAATCTTCTCCCAGAGGAAGGCAGCTGTACAGTGCTTCTACTGAAGGATTAT  1393

Query 1382  TGAATCGCCAATGCATTTCATGTAATTTCATGAAAGAACAATGTACATATTTTGATGCCAGTTTTAGTCCCATG  1455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1394  TGAATCGCCAATGCATTTCATGTAATTTCATGAAAGAACAATGTACATATTTTGATGCCAGTTTTAGTCCCATG  1467

Query 1456  AATCAACATTTCTTATTATTCTGTGAAGGTCCAAGGGTCCCAGTGGTCAGCCTACATAGTACGGACAACCCAGC  1529
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1468  AATCAACATTTCTTATTATTCTGTGAAGGTCCAAGGGTCCCAGTGGTCAGCCTACATAGTACGGACAACCCAGC  1541

Query 1530  AAAATATTTTATATTGGAAAGCAATTCTATGCTGAAGGAAGCTATCCTGAAGAAGAAGATAGGAAAGCCAGAAA  1603
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1542  AAAATATTTTATATTGGAAAGCAATTCTATGCTGAAGGAAGCTATCCTGAAGAAGAAGATAGGAAAGCCAGAAA  1615

Query 1604  TTAAAATCCTTCATATTGACGACTATGAACTTCCTTTACAGTTGTCCCTTCCCAAAGATTTTATGGACCGAAAC  1677
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1616  TTAAAATCCTTCATATTGACGACTATGAACTTCCTTTACAGTTGTCCCTTCCCAAAGATTTTATGGACCGAAAC  1689

Query 1678  CAGTATGCTCTTCTGTTAATAATGGATGAAGAACCAGGAGGCCAGCTGGTTACAGATAAGTTCCATATTGACTG  1751
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1690  CAGTATGCTCTTCTGTTAATAATGGATGAAGAACCAGGAGGCCAGCTGGTTACAGATAAGTTCCATATTGACTG  1763

Query 1752  GGATTCCGTACTCATTGACATGGATAATGTCATTGTAGCAAGATTTGATGGCAGAGGAAGTGGATTCCAGGGTC  1825
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1764  GGATTCCGTACTCATTGACATGGATAATGTCATTGTAGCAAGATTTGATGGCAGAGGAAGTGGATTCCAGGGTC  1837

Query 1826  TGAAAATTTTGCAGGAGATTCATCGAAGATTAGGTTCAGTAGAAGTAAAGGACCAAATAACAGCTGTGAAATTT  1899
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1838  TGAAAATTTTGCAGGAGATTCATCGAAGATTAGGTTCAGTAGAAGTAAAGGACCAAATAACAGCTGTGAAATTT  1911

Query 1900  TTGCTGAAACTGCCTTACATTGACTCCAAAAGATTAAGCATTTTTGGAAAGGGTTATGGTGGCTATATTGCATC  1973
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1912  TTGCTGAAACTGCCTTACATTGACTCCAAAAGATTAAGCATTTTTGGAAAGGGTTATGGTGGCTATATTGCATC  1985

Query 1974  AATGATCTTAAAATCAGATGAAAAGCTTTTTAAATGTGGATCCGTGGTTGCACCTATCACAGACTTGAAATTGT  2047
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1986  AATGATCTTAAAATCAGATGAAAAGCTTTTTAAATGTGGATCCGTGGTTGCACCTATCACAGACTTGAAATTGT  2059

Query 2048  ATGCCTCAGCTTTCTCTGAAAGATACCTTGGGATGCCATCTAAGGAAGAAAGCACTTACCAGGCAGCCAGTGTG  2121
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2060  ATGCCTCAGCTTTCTCTGAAAGATACCTTGGGATGCCATCTAAGGAAGAAAGCACTTACCAGGCAGCCAGTGTG  2133

Query 2122  CTACATAATGTTCATGGCTTGAAAGAAGAAAATATATTAATAATTCATGGAACTGCTGACACAAAAGTTCATTT  2195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2134  CTACATAATGTTCATGGCTTGAAAGAAGAAAATATATTAATAATTCATGGAACTGCTGACACAAAAGTTCATTT  2207

Query 2196  CCAACACTCAGCAGAATTAATCAAGCACCTAATAAAAGCTGGAGTGAATTATACTATGCAGGTCTACCCAGATG  2269
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2208  CCAACACTCAGCAGAATTAATCAAGCACCTAATAAAAGCTGGAGTGAATTATACTATGCAGGTCTACCCAGATG  2281

Query 2270  AAGGTCATAACGTATCTGAGAAGAGCAAGTATCATCTCTACAGCACAATCCTCAAATTCTTCAGTGATTGTTTG  2343
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2282  AAGGTCATAACGTATCTGAGAAGAGCAAGTATCATCTCTACAGCACAATCCTCAAATTCTTCAGTGATTGTTTG  2355

Query 2344  AAGGAAGAAATATCTGTGCTACCACAGGAACCAGAAGAAGATGAA  2388
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2356  AAGGAAGAAATATCTGTGCTACCACAGGAACCAGAAGAAGATGAA  2400