Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471905
- Subject:
- NM_001178036.2
- Aligned Length:
- 2388
- Identities:
- 2235
- Gaps:
- 150
Alignment
Query 1 ATGAACCTAACTGCCAGCGTGTCCCATCACATCAAGTGTCAACCCTCAAAAACAATCAAGGAACTGGGAAGTAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CAGCCCTCCACAGAGAAACTGGAAGGGAATTGCTATTGCTCTGCTGGTGATTTTAGTTGTATGCTCACTCATCA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CTATGTCAGTCATCCTCTTAACCCCAGATGAACTCACAAATTCGTCAGAAACCAGATTGTCTTTGGAAGACCTC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --ATGTCAGTCATCCTCTTAACCCCAGATGAACTCACAAATTCGTCAGAAACCAGATTGTCTTTGGAAGACCTC 72
Query 223 TTTAGGAAAGACTTTGTGCTTCACGATCCAGAGGCTCGGTGGATCAATGATACAGATGTGGTGTATAAAAGCGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 73 TTTAGGAAAGACTTTGTGCTTCACGATCCAGAGGCTCGGTGGATCAATGATACAGATGTGGTGTATAAAAGCGA 146
Query 297 GAATGGACATGTCATTAAACTGAATATAGAAACAAATGCTACCACATTATTATTGGAAAACACAACTTTTGTAA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 147 GAATGGACATGTCATTAAACTGAATATAGAAACAAATGCTACCACATTATTATTGGAAAACACAACTTTTGTAA 220
Query 371 CCTTCAAAGCATCAAGACATTCAGTTTCACCAGATTTAAAATATGTCCTTCTGGCATATGATGTCAAACAGATT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 221 CCTTCAAAGCATCAAGACATTCAGTTTCACCAGATTTAAAATATGTCCTTCTGGCATATGATGTCAAACAGATT 294
Query 445 TTTCATTATTCATATACTGCTTCATATGTGATTTACAACATACACACTAGGGAAGTTTGGGAGTTAAATCCTCC 518
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295 TTTCATTATTCGTATACTGCTTCATATGTGATTTACAACATACACACTAGGGAAGTTTGGGAGTTAAATCCTCC 368
Query 519 AGAAGTAGAGGACTCCGTCTTGCAGTACGCGGCCTGGGGTGTCCAAGGGCAGCAGCTGATTTATATTTTTGAAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369 AGAAGTAGAGGACTCCGTCTTGCAGTACGCGGCCTGGGGTGTCCAAGGGCAGCAGCTGATTTATATTTTTGAAA 442
Query 593 ATAATATCTACTATCAACCTGATATAAAGAGCAGTTCATTGCGACTGACATCTTCTGGAAAAGAAGAAATAATT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443 ATAATATCTACTATCAACCTGATATAAAGAGCAGTTCATTGCGACTGACATCTTCTGGAAAAGAAGAAATAATT 516
Query 667 TTTAATGGGATTGCTGACTGGTTATATGAAGAGGAACTCCTGCATTCTCACATCGCCCACTGGTGGTCACCAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 TTTAATGGGATTGCTGACTGGTTATATGAAGAGGAACTCCTGCATTCTCACATCGCCCACTGGTGGTCACCAGA 590
Query 741 TGGAGAAAGACTTGCCTTCCTGATGATAAATGACTCTTTGGTACCCACCATGGTTATCCCTCGGTTTACTGGAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591 TGGAGAAAGACTTGCCTTCCTGATGATAAATGACTCTTTGGTACCCACCATGGTTATCCCTCGGTTTACTGGAG 664
Query 815 CGTTGTATCCCAAAGGAAAGCAGTATCCGTATCCTAAGGCAGGTCAAATGAACCCAACAATAAAATTATATGTT 888
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665 CGTTGTATCCCAAAGGAAAGCAGTATCCGTATCCTAAGGCAGGTCAAGTGAACCCAACAATAAAATTATATGTT 738
Query 889 GTAAACCTGTATGGACCAACTCACACTTTGGAGCTCATGCCACCTGACAGCTTTAAATCAAGAGAATACTATAT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739 GTAAACCTGTATGGACCAACTCACACTTTGGAGCTCATGCCACCTGACAGCTTTAAATCAAGAGAATACTATAT 812
Query 963 CACTATGGTTAAATGGGTAAGCAATACCAAGACTGTGGTAAGATGGTTAAACCGAGCTCAGAACATCTCCATCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813 CACTATGGTTAAATGGGTAAGCAATACCAAGACTGTGGTAAGATGGTTAAACCGAGCTCAGAACATCTCCATCC 886
Query 1037 TCACAGTCTGTGAGACCACTACAGGTGCTTGTAGTAAAAAATATGAGATGACATCAGATACGTGGCTCTCTCAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 887 TCACAGTCTGTGAGACCACTACAGGTGCTTGTAGTAAAAAATATGAGATGACATCAGATACGTGGCTCTCTCAG 960
Query 1111 CAGAATGAGGAGCCCGTGTTTTCTAGAGACGGCAGCAAATTCTTTATGACAGTGCCTGTTAAGCAAGGGGGACG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CAGAATGAGGAGCCCGTGTTTTCTAGAGACGGCAGCAAATTCTTTATGACAGTGCCTGTTAAGCAAGGGGGACG 1034
Query 1185 TGGAGAATTTCACCACATAGCTATGTTCCTCATCCAGAGTAAAAGTGAGCAAATTACCGTGCGGCATCTGACAT 1258
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 TGGAGAATTTCACCACGTAGCTATGTTCCTCATCCAGAGTAAAAGTGAGCAAATTACCGTGCGGCATCTGACAT 1108
Query 1259 CAGGAAACTGGGAAGTGATAAAGATCTTGGCATACGATGAAACTACTCAAAAAATTTACTTTCTGAGCACTGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109 CAGGAAACTGGGAAGTGATAAAGATCTTGGCATACGATGAAACTACTCAAAAAATTTACTTTCTGAGCACTGAA 1182
Query 1333 TCTTCTCCCAGAGGAAGGCAGCTGTACAGTGCTTCTACTGAAGGATTATTGAATCGCCAATGCATTTCATGTAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183 TCTTCTCCCAGAGGAAGGCAGCTGTACAGTGCTTCTACTGAAGGATTATTGAATCGCCAATGCATTTCATGTAA 1256
Query 1407 TTTCATGAAAGAACAATGTACATATTTTGATGCCAGTTTTAGTCCCATGAATCAACATTTCTTATTATTCTGTG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257 TTTCATGAAAGAACAATGTACATATTTTGATGCCAGTTTTAGTCCCATGAATCAACATTTCTTATTATTCTGTG 1330
Query 1481 AAGGTCCAAGGGTCCCAGTGGTCAGCCTACATAGTACGGACAACCCAGCAAAATATTTTATATTGGAAAGCAAT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331 AAGGTCCAAGGGTCCCAGTGGTCAGCCTACATAGTACGGACAACCCAGCAAAATATTTTATATTGGAAAGCAAT 1404
Query 1555 TCTATGCTGAAGGAAGCTATCCTGAAGAAGAAGATAGGAAAGCCAGAAATTAAAATCCTTCATATTGACGACTA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405 TCTATGCTGAAGGAAGCTATCCTGAAGAAGAAGATAGGAAAGCCAGAAATTAAAATCCTTCATATTGACGACTA 1478
Query 1629 TGAACTTCCTTTACAGTTGTCCCTTCCCAAAGATTTTATGGACCGAAACCAGTATGCTCTTCTGTTAATAATGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1479 TGAACTTCCTTTACAGTTGTCCCTTCCCAAAGATTTTATGGACCGAAACCAGTATGCTCTTCTGTTAATAATGG 1552
Query 1703 ATGAAGAACCAGGAGGCCAGCTGGTTACAGATAAGTTCCATATTGACTGGGATTCCGTACTCATTGACATGGAT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553 ATGAAGAACCAGGAGGCCAGCTGGTTACAGATAAGTTCCATATTGACTGGGATTCCGTACTCATTGACATGGAT 1626
Query 1777 AATGTCATTGTAGCAAGATTTGATGGCAGAGGAAGTGGATTCCAGGGTCTGAAAATTTTGCAGGAGATTCATCG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1627 AATGTCATTGTAGCAAGATTTGATGGCAGAGGAAGTGGATTCCAGGGTCTGAAAATTTTGCAGGAGATTCATCG 1700
Query 1851 AAGATTAGGTTCAGTAGAAGTAAAGGACCAAATAACAGCTGTGAAATTTTTGCTGAAACTGCCTTACATTGACT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1701 AAGATTAGGTTCAGTAGAAGTAAAGGACCAAATAACAGCTGTGAAATTTTTGCTGAAACTGCCTTACATTGACT 1774
Query 1925 CCAAAAGATTAAGCATTTTTGGAAAGGGTTATGGTGGCTATATTGCATCAATGATCTTAAAATCAGATGAAAAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1775 CCAAAAGATTAAGCATTTTTGGAAAGGGTTATGGTGGCTATATTGCATCAATGATCTTAAAATCAGATGAAAAG 1848
Query 1999 CTTTTTAAATGTGGATCCGTGGTTGCACCTATCACAGACTTGAAATTGTATGCCTCAGCTTTCTCTGAAAGATA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1849 CTTTTTAAATGTGGATCCGTGGTTGCACCTATCACAGACTTGAAATTGTATGCCTCAGCTTTCTCTGAAAGATA 1922
Query 2073 CCTTGGGATGCCATCTAAGGAAGAAAGCACTTACCAGGCAGCCAGTGTGCTACATAATGTTCATGGCTTGAAAG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1923 CCTTGGGATGCCATCTAAGGAAGAAAGCACTTACCAGGCAGCCAGTGTGCTACATAATGTTCATGGCTTGAAAG 1996
Query 2147 AAGAAAATATATTAATAATTCATGGAACTGCTGACACAAAAGTTCATTTCCAACACTCAGCAGAATTAATCAAG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1997 AAGAAAATATATTAATAATTCATGGAACTGCTGACACAAAAGTTCATTTCCAACACTCAGCAGAATTAATCAAG 2070
Query 2221 CACCTAATAAAAGCTGGAGTGAATTATACTATGCAGGTCTACCCAGATGAAGGTCATAACGTATCTGAGAAGAG 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2071 CACCTAATAAAAGCTGGAGTGAATTATACTATGCAGGTCTACCCAGATGAAGGTCATAACGTATCTGAGAAGAG 2144
Query 2295 CAAGTATCATCTCTACAGCACAATCCTCAAATTCTTCAGTGATTGTTTGAAGGAAGAAATATCTGTGCTACCAC 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2145 CAAGTATCATCTCTACAGCACAATCCTCAAATTCTTCAGTGATTGTTTGAAGGAAGAAATATCTGTGCTACCAC 2218
Query 2369 AGGAACCAGAAGAAGATGAA 2388
||||||||||||||||||||
Sbjct 2219 AGGAACCAGAAGAAGATGAA 2238