Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471905
• Subject: NM_001321906.1
• Aligned Length: 2402
• Identities: 2344
• Gaps: 49

Alignment

Query    1  ATGAACCTAACTGCCAGCGTGTCCCATCACAT---CAA-GTGTCAACCCTC----AA------AAACAATCAAG  60
                                          ||   ||| |||...|.||.|    ||      |.|     .||
Sbjct    1  ------------------------------ATGCGCAAGGTGGAGAGCCGCGGGGAAGGGGGCAGA-----GAG  39

Query   61  GAACTGGGAAGTAACAGCCCTCCACAGAGAAACTGGAAGGGAATTGCTATTGCTCTGCTGGTGATTTTAGTTGT  134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   40  GAACTGGGAAGTAACAGCCCTCCACAGAGAAACTGGAAGGGAATTGCTATTGCTCTGCTGGTGATTTTAGTTGT  113

Query  135  ATGCTCACTCATCACTATGTCAGTCATCCTCTTAACCCCAGATGAACTCACAAATTCGTCAGAAACCAGATTGT  208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  114  ATGCTCACTCATCACTATGTCAGTCATCCTCTTAACCCCAGATGAACTCACAAATTCGTCAGAAACCAGATTGT  187

Query  209  CTTTGGAAGACCTCTTTAGGAAAGACTTTGTGCTTCACGATCCAGAGGCTCGGTGGATCAATGATACAGATGTG  282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  188  CTTTGGAAGACCTCTTTAGGAAAGACTTTGTGCTTCACGATCCAGAGGCTCGGTGGATCAATGATACAGATGTG  261

Query  283  GTGTATAAAAGCGAGAATGGACATGTCATTAAACTGAATATAGAAACAAATGCTACCACATTATTATTGGAAAA  356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  262  GTGTATAAAAGCGAGAATGGACATGTCATTAAACTGAATATAGAAACAAATGCTACCACATTATTATTGGAAAA  335

Query  357  CACAACTTTTGTAACCTTCAAAGCATCAAGACATTCAGTTTCACCAGATTTAAAATATGTCCTTCTGGCATATG  430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  336  CACAACTTTTGTAACCTTCAAAGCATCAAGACATTCAGTTTCACCAGATTTAAAATATGTCCTTCTGGCATATG  409

Query  431  ATGTCAAACAGATTTTTCATTATTCATATACTGCTTCATATGTGATTTACAACATACACACTAGGGAAGTTTGG  504
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  410  ATGTCAAACAGATTTTTCATTATTCGTATACTGCTTCATATGTGATTTACAACATACACACTAGGGAAGTTTGG  483

Query  505  GAGTTAAATCCTCCAGAAGTAGAGGACTCCGTCTTGCAGTACGCGGCCTGGGGTGTCCAAGGGCAGCAGCTGAT  578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  484  GAGTTAAATCCTCCAGAAGTAGAGGACTCCGTCTTGCAGTACGCGGCCTGGGGTGTCCAAGGGCAGCAGCTGAT  557

Query  579  TTATATTTTTGAAAATAATATCTACTATCAACCTGATATAAAGAGCAGTTCATTGCGACTGACATCTTCTGGAA  652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  558  TTATATTTTTGAAAATAATATCTACTATCAACCTGATATAAAGAGCAGTTCATTGCGACTGACATCTTCTGGAA  631

Query  653  AAGAAGAAATAATTTTTAATGGGATTGCTGACTGGTTATATGAAGAGGAACTCCTGCATTCTCACATCGCCCAC  726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  632  AAGAAGAAATAATTTTTAATGGGATTGCTGACTGGTTATATGAAGAGGAACTCCTGCATTCTCACATCGCCCAC  705

Query  727  TGGTGGTCACCAGATGGAGAAAGACTTGCCTTCCTGATGATAAATGACTCTTTGGTACCCACCATGGTTATCCC  800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  706  TGGTGGTCACCAGATGGAGAAAGACTTGCCTTCCTGATGATAAATGACTCTTTGGTACCCACCATGGTTATCCC  779

Query  801  TCGGTTTACTGGAGCGTTGTATCCCAAAGGAAAGCAGTATCCGTATCCTAAGGCAGGTCAAATGAACCCAACAA  874
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  780  TCGGTTTACTGGAGCGTTGTATCCCAAAGGAAAGCAGTATCCGTATCCTAAGGCAGGTCAAGTGAACCCAACAA  853

Query  875  TAAAATTATATGTTGTAAACCTGTATGGACCAACTCACACTTTGGAGCTCATGCCACCTGACAGCTTTAAATCA  948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  854  TAAAATTATATGTTGTAAACCTGTATGGACCAACTCACACTTTGGAGCTCATGCCACCTGACAGCTTTAAATCA  927

Query  949  AGAGAATACTATATCACTATGGTTAAATGGGTAAGCAATACCAAGACTGTGGTAAGATGGTTAAACCGAGCTCA  1022
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  928  AGAGAATACTATATCACTATGGTTAAATGGGTAAGCAATACCAAGACTGTGGTAAGATGGTTAAACCGAGCTCA  1001

Query 1023  GAACATCTCCATCCTCACAGTCTGTGAGACCACTACAGGTGCTTGTAGTAAAAAATATGAGATGACATCAGATA  1096
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1002  GAACATCTCCATCCTCACAGTCTGTGAGACCACTACAGGTGCTTGTAGTAAAAAATATGAGATGACATCAGATA  1075

Query 1097  CGTGGCTCTCTCAGCAGAATGAGGAGCCCGTGTTTTCTAGAGACGGCAGCAAATTCTTTATGACAGTGCCTGTT  1170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1076  CGTGGCTCTCTCAGCAGAATGAGGAGCCCGTGTTTTCTAGAGACGGCAGCAAATTCTTTATGACAGTGCCTGTT  1149

Query 1171  AAGCAAGGGGGACGTGGAGAATTTCACCACATAGCTATGTTCCTCATCCAGAGTAAAAGTGAGCAAATTACCGT  1244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1150  AAGCAAGGGGGACGTGGAGAATTTCACCACATAGCTATGTTCCTCATCCAGAGTAAAAGTGAGCAAATTACCGT  1223

Query 1245  GCGGCATCTGACATCAGGAAACTGGGAAGTGATAAAGATCTTGGCATACGATGAAACTACTCAAAAAATTTACT  1318
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1224  GCGGCATCTGACATCAGGAAACTGGGAAGTGATAAAGATCTTGGCATACGATGAAACTACTCAAAAAATTTACT  1297

Query 1319  TTCTGAGCACTGAATCTTCTCCCAGAGGAAGGCAGCTGTACAGTGCTTCTACTGAAGGATTATTGAATCGCCAA  1392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1298  TTCTGAGCACTGAATCTTCTCCCAGAGGAAGGCAGCTGTACAGTGCTTCTACTGAAGGATTATTGAATCGCCAA  1371

Query 1393  TGCATTTCATGTAATTTCATGAAAGAACAATGTACATATTTTGATGCCAGTTTTAGTCCCATGAATCAACATTT  1466
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1372  TGCATTTCATGTAATTTCATGAAAGAACAATGTACATATTTTGATGCCAGTTTTAGTCCCATGAATCAACATTT  1445

Query 1467  CTTATTATTCTGTGAAGGTCCAAGGGTCCCAGTGGTCAGCCTACATAGTACGGACAACCCAGCAAAATATTTTA  1540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1446  CTTATTATTCTGTGAAGGTCCAAGGGTCCCAGTGGTCAGCCTACATAGTACGGACAACCCAGCAAAATATTTTA  1519

Query 1541  TATTGGAAAGCAATTCTATGCTGAAGGAAGCTATCCTGAAGAAGAAGATAGGAAAGCCAGAAATTAAAATCCTT  1614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1520  TATTGGAAAGCAATTCTATGCTGAAGGAAGCTATCCTGAAGAAGAAGATAGGAAAGCCAGAAATTAAAATCCTT  1593

Query 1615  CATATTGACGACTATGAACTTCCTTTACAGTTGTCCCTTCCCAAAGATTTTATGGACCGAAACCAGTATGCTCT  1688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1594  CATATTGACGACTATGAACTTCCTTTACAGTTGTCCCTTCCCAAAGATTTTATGGACCGAAACCAGTATGCTCT  1667

Query 1689  TCTGTTAATAATGGATGAAGAACCAGGAGGCCAGCTGGTTACAGATAAGTTCCATATTGACTGGGATTCCGTAC  1762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1668  TCTGTTAATAATGGATGAAGAACCAGGAGGCCAGCTGGTTACAGATAAGTTCCATATTGACTGGGATTCCGTAC  1741

Query 1763  TCATTGACATGGATAATGTCATTGTAGCAAGATTTGATGGCAGAGGAAGTGGATTCCAGGGTCTGAAAATTTTG  1836
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1742  TCATTGACATGGATAATGTCATTGTAGCAAGATTTGATGGCAGAGGAAGTGGATTCCAGGGTCTGAAAATTTTG  1815

Query 1837  CAGGAGATTCATCGAAGATTAGGTTCAGTAGAAGTAAAGGACCAAATAACAGCTGTGAAATTTTTGCTGAAACT  1910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1816  CAGGAGATTCATCGAAGATTAGGTTCAGTAGAAGTAAAGGACCAAATAACAGCTGTGAAATTTTTGCTGAAACT  1889

Query 1911  GCCTTACATTGACTCCAAAAGATTAAGCATTTTTGGAAAGGGTTATGGTGGCTATATTGCATCAATGATCTTAA  1984
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1890  GCCTTACATTGACTCCAAAAGATTAAGCATTTTTGGAAAGGGTTATGGTGGCTATATTGCATCAATGATCTTAA  1963

Query 1985  AATCAGATGAAAAGCTTTTTAAATGTGGATCCGTGGTTGCACCTATCACAGACTTGAAATTGTATGCCTCAGCT  2058
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1964  AATCAGATGAAAAGCTTTTTAAATGTGGATCCGTGGTTGCACCTATCACAGACTTGAAATTGTATGCCTCAGCT  2037

Query 2059  TTCTCTGAAAGATACCTTGGGATGCCATCTAAGGAAGAAAGCACTTACCAGGCAGCCAGTGTGCTACATAATGT  2132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2038  TTCTCTGAAAGATACCTTGGGATGCCATCTAAGGAAGAAAGCACTTACCAGGCAGCCAGTGTGCTACATAATGT  2111

Query 2133  TCATGGCTTGAAAGAAGAAAATATATTAATAATTCATGGAACTGCTGACACAAAAGTTCATTTCCAACACTCAG  2206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2112  TCATGGCTTGAAAGAAGAAAATATATTAATAATTCATGGAACTGCTGACACAAAAGTTCATTTCCAACACTCAG  2185

Query 2207  CAGAATTAATCAAGCACCTAATAAAAGCTGGAGTGAATTATACTATGCAGGTCTACCCAGATGAAGGTCATAAC  2280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2186  CAGAATTAATCAAGCACCTAATAAAAGCTGGAGTGAATTATACTATGCAGGTCTACCCAGATGAAGGTCATAAC  2259

Query 2281  GTATCTGAGAAGAGCAAGTATCATCTCTACAGCACAATCCTCAAATTCTTCAGTGATTGTTTGAAGGAAGAAAT  2354
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2260  GTATCTGAGAAGAGCAAGTATCATCTCTACAGCACAATCCTCAAATTCTTCAGTGATTGTTTGAAGGAAGAAAT  2333

Query 2355  ATCTGTGCTACCACAGGAACCAGAAGAAGATGAA  2388
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2334  ATCTGTGCTACCACAGGAACCAGAAGAAGATGAA  2367