Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471905
- Subject:
- NM_001321907.2
- Aligned Length:
- 2388
- Identities:
- 2345
- Gaps:
- 39
Alignment
Query 1 ATGAACCTAACTGCCAGCGTGTCCCATCACATCAAGTGTCAACCCTCAAAAACAATCAAGGAACTGGGAAGTAA 74
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAACCAAACTGCCAGCGTGTCCCATCACATCAAGTGTCAACCCTCAAAAACAATCAAGGAACTGGGAAGTAA 74
Query 75 CAGCCCTCCACAGAGAAACTGGAAGGGAATTGCTATTGCTCTGCTGGTGATTTTAGTTGTATGCTCACTCATCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAGCCCTCCACAGAGAAACTGGAAGGGAATTGCTATTGCTCTGCTGGTGATTTTAGTTGTATGCTCACTCATCA 148
Query 149 CTATGTCAGTCATCCTCTTAACCCCAGATGAACTCACAAATTCGTCAGAAACCAGATTGTCTTTGGAAGACCTC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTATGTCAGTCATCCTCTTAACCCCAGATGAACTCACAAATTCGTCAGAAACCAGATTGTCTTTGGAAGACCTC 222
Query 223 TTTAGGAAAGACTTTGTGCTTCACGATCCAGAGGCTCGGTGGATCAATGATACAGATGTGGTGTATAAAAGCGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTTAGGAAAGACTTTGTGCTTCACGATCCAGAGGCTCGGTGGATCAATGATACAGATGTGGTGTATAAAAGCGA 296
Query 297 GAATGGACATGTCATTAAACTGAATATAGAAACAAATGCTACCACATTATTATTGGAAAACACAACTTTTGTAA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAATGGACATGTCATTAAACTGAATATAGAAACAAATGCTACCACATTATTATTGGAAAACACAACTTTTGTAA 370
Query 371 CCTTCAAAGCATCAAGACATTCAGTTTCACCAGATTTAAAATATGTCCTTCTGGCATATGATGTCAAACAGATT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCTTCAAAGCATCAAGACATTCAGTTTCACCAGATTTAAAATATGTCCTTCTGGCATATGATGTCAAACAGATT 444
Query 445 TTTCATTATTCATATACTGCTTCATATGTGATTTACAACATACACACTAGGGAAGTTTGGGAGTTAAATCCTCC 518
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTCATTATTCGTATACTGCTTCATATGTGATTTACAACATACACACTAGGGAAGTTTGGGAGTTAAATCCTCC 518
Query 519 AGAAGTAGAGGACTCCGTCTTGCAGTACGCGGCCTGGGGTGTCCAAGGGCAGCAGCTGATTTATATTTTTGAAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGAAGTAGAGGACTCCGTCTTGCAGTACGCGGCCTGGGGTGTCCAAGGGCAGCAGCTGATTTATATTTTTGAAA 592
Query 593 ATAATATCTACTATCAACCTGATATAAAGAGCAGTTCATTGCGACTGACATCTTCTGGAAAAGAAGAAATAATT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATAATATCTACTATCAACCTGATATAAAGAGCAGTTCATTGCGACTGACATCTTCTGGAAAAGAAGAAATAATT 666
Query 667 TTTAATGGGATTGCTGACTGGTTATATGAAGAGGAACTCCTGCATTCTCACATCGCCCACTGGTGGTCACCAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TTTAATGGGATTGCTGACTGGTTATATGAAGAGGAACTCCTGCATTCTCACATCGCCCACTGGTGGTCACCAGA 740
Query 741 TGGAGAAAGACTTGCCTTCCTGATGATAAATGACTCTTTGGTACCCACCATGGTTATCCCTCGGTTTACTGGAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGGAGAAAGACTTGCCTTCCTGATGATAAATGACTCTTTGGTACCCACCATGGTTATCCCTCGGTTTACTGGAG 814
Query 815 CGTTGTATCCCAAAGGAAAGCAGTATCCGTATCCTAAGGCAGGTCAAATGAACCCAACAATAAAATTATATGTT 888
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CGTTGTATCCCAAAGGAAAGCAGTATCCGTATCCTAAGGCAGGTCAAGTGAACCCAACAATAAAATTATATGTT 888
Query 889 GTAAACCTGTATGGACCAACTCACACTTTGGAGCTCATGCCACCTGACAGCTTTAAATCAAGAGAATACTATAT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GTAAACCTGTATGGACCAACTCACACTTTGGAGCTCATGCCACCTGACAGCTTTAAATCAAGAGAATACTATAT 962
Query 963 CACTATGGTTAAATGGGTAAGCAATACCAAGACTGTGGTAAGATGGTTAAACCGAGCTCAGAACATCTCCATCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CACTATGGTTAAATGGGTAAGCAATACCAAGACTGTGGTAAGATGGTTAAACCGAGCTCAGAACATCTCCATCC 1036
Query 1037 TCACAGTCTGTGAGACCACTACAGGTGCTTGTAGTAAAAAATATGAGATGACATCAGATACGTGGCTCTCTCAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCACAGTCTGTGAGACCACTACAGGTGCTTGTAGTAAA------------------------------------ 1074
Query 1111 CAGAATGAGGAGCCCGTGTTTTCTAGAGACGGCAGCAAATTCTTTATGACAGTGCCTGTTAAGCAAGGGGGACG 1184
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075 ---AATGAGGAGCCCGTGTTTTCTAGAGACGGCAGCAAATTCTTTATGACAGTGCCTGTTAAGCAAGGGGGACG 1145
Query 1185 TGGAGAATTTCACCACATAGCTATGTTCCTCATCCAGAGTAAAAGTGAGCAAATTACCGTGCGGCATCTGACAT 1258
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1146 TGGAGAATTTCACCACGTAGCTATGTTCCTCATCCAGAGTAAAAGTGAGCAAATTACCGTGCGGCATCTGACAT 1219
Query 1259 CAGGAAACTGGGAAGTGATAAAGATCTTGGCATACGATGAAACTACTCAAAAAATTTACTTTCTGAGCACTGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1220 CAGGAAACTGGGAAGTGATAAAGATCTTGGCATACGATGAAACTACTCAAAAAATTTACTTTCTGAGCACTGAA 1293
Query 1333 TCTTCTCCCAGAGGAAGGCAGCTGTACAGTGCTTCTACTGAAGGATTATTGAATCGCCAATGCATTTCATGTAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1294 TCTTCTCCCAGAGGAAGGCAGCTGTACAGTGCTTCTACTGAAGGATTATTGAATCGCCAATGCATTTCATGTAA 1367
Query 1407 TTTCATGAAAGAACAATGTACATATTTTGATGCCAGTTTTAGTCCCATGAATCAACATTTCTTATTATTCTGTG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1368 TTTCATGAAAGAACAATGTACATATTTTGATGCCAGTTTTAGTCCCATGAATCAACATTTCTTATTATTCTGTG 1441
Query 1481 AAGGTCCAAGGGTCCCAGTGGTCAGCCTACATAGTACGGACAACCCAGCAAAATATTTTATATTGGAAAGCAAT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1442 AAGGTCCAAGGGTCCCAGTGGTCAGCCTACATAGTACGGACAACCCAGCAAAATATTTTATATTGGAAAGCAAT 1515
Query 1555 TCTATGCTGAAGGAAGCTATCCTGAAGAAGAAGATAGGAAAGCCAGAAATTAAAATCCTTCATATTGACGACTA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1516 TCTATGCTGAAGGAAGCTATCCTGAAGAAGAAGATAGGAAAGCCAGAAATTAAAATCCTTCATATTGACGACTA 1589
Query 1629 TGAACTTCCTTTACAGTTGTCCCTTCCCAAAGATTTTATGGACCGAAACCAGTATGCTCTTCTGTTAATAATGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1590 TGAACTTCCTTTACAGTTGTCCCTTCCCAAAGATTTTATGGACCGAAACCAGTATGCTCTTCTGTTAATAATGG 1663
Query 1703 ATGAAGAACCAGGAGGCCAGCTGGTTACAGATAAGTTCCATATTGACTGGGATTCCGTACTCATTGACATGGAT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1664 ATGAAGAACCAGGAGGCCAGCTGGTTACAGATAAGTTCCATATTGACTGGGATTCCGTACTCATTGACATGGAT 1737
Query 1777 AATGTCATTGTAGCAAGATTTGATGGCAGAGGAAGTGGATTCCAGGGTCTGAAAATTTTGCAGGAGATTCATCG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1738 AATGTCATTGTAGCAAGATTTGATGGCAGAGGAAGTGGATTCCAGGGTCTGAAAATTTTGCAGGAGATTCATCG 1811
Query 1851 AAGATTAGGTTCAGTAGAAGTAAAGGACCAAATAACAGCTGTGAAATTTTTGCTGAAACTGCCTTACATTGACT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1812 AAGATTAGGTTCAGTAGAAGTAAAGGACCAAATAACAGCTGTGAAATTTTTGCTGAAACTGCCTTACATTGACT 1885
Query 1925 CCAAAAGATTAAGCATTTTTGGAAAGGGTTATGGTGGCTATATTGCATCAATGATCTTAAAATCAGATGAAAAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1886 CCAAAAGATTAAGCATTTTTGGAAAGGGTTATGGTGGCTATATTGCATCAATGATCTTAAAATCAGATGAAAAG 1959
Query 1999 CTTTTTAAATGTGGATCCGTGGTTGCACCTATCACAGACTTGAAATTGTATGCCTCAGCTTTCTCTGAAAGATA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1960 CTTTTTAAATGTGGATCCGTGGTTGCACCTATCACAGACTTGAAATTGTATGCCTCAGCTTTCTCTGAAAGATA 2033
Query 2073 CCTTGGGATGCCATCTAAGGAAGAAAGCACTTACCAGGCAGCCAGTGTGCTACATAATGTTCATGGCTTGAAAG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2034 CCTTGGGATGCCATCTAAGGAAGAAAGCACTTACCAGGCAGCCAGTGTGCTACATAATGTTCATGGCTTGAAAG 2107
Query 2147 AAGAAAATATATTAATAATTCATGGAACTGCTGACACAAAAGTTCATTTCCAACACTCAGCAGAATTAATCAAG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2108 AAGAAAATATATTAATAATTCATGGAACTGCTGACACAAAAGTTCATTTCCAACACTCAGCAGAATTAATCAAG 2181
Query 2221 CACCTAATAAAAGCTGGAGTGAATTATACTATGCAGGTCTACCCAGATGAAGGTCATAACGTATCTGAGAAGAG 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2182 CACCTAATAAAAGCTGGAGTGAATTATACTATGCAGGTCTACCCAGATGAAGGTCATAACGTATCTGAGAAGAG 2255
Query 2295 CAAGTATCATCTCTACAGCACAATCCTCAAATTCTTCAGTGATTGTTTGAAGGAAGAAATATCTGTGCTACCAC 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2256 CAAGTATCATCTCTACAGCACAATCCTCAAATTCTTCAGTGATTGTTTGAAGGAAGAAATATCTGTGCTACCAC 2329
Query 2369 AGGAACCAGAAGAAGATGAA 2388
||||||||||||||||||||
Sbjct 2330 AGGAACCAGAAGAAGATGAA 2349