Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471905
• Subject: NM_001321913.2
• Aligned Length: 2388
• Identities: 1624
• Gaps: 762

Alignment

Query    1  ATGAACCTAACTGCCAGCGTGTCCCATCACATCAAGTGTCAACCCTCAAAAACAATCAAGGAACTGGGAAGTAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CAGCCCTCCACAGAGAAACTGGAAGGGAATTGCTATTGCTCTGCTGGTGATTTTAGTTGTATGCTCACTCATCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CTATGTCAGTCATCCTCTTAACCCCAGATGAACTCACAAATTCGTCAGAAACCAGATTGTCTTTGGAAGACCTC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TTTAGGAAAGACTTTGTGCTTCACGATCCAGAGGCTCGGTGGATCAATGATACAGATGTGGTGTATAAAAGCGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GAATGGACATGTCATTAAACTGAATATAGAAACAAATGCTACCACATTATTATTGGAAAACACAACTTTTGTAA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CCTTCAAAGCATCAAGACATTCAGTTTCACCAGATTTAAAATATGTCCTTCTGGCATATGATGTCAAACAGATT  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  TTTCATTATTCATATACTGCTTCATATGTGATTTACAACATACACACTAGGGAAGTTTGGGAGTTAAATCCTCC  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  AGAAGTAGAGGACTCCGTCTTGCAGTACGCGGCCTGGGGTGTCCAAGGGCAGCAGCTGATTTATATTTTTGAAA  592
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  593  ATAATATCTACTATCAACCTGATATAAAGAGCAGTTCATTGCGACTGACATCTTCTGGAAAAGAAGAAATAATT  666
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  667  TTTAATGGGATTGCTGACTGGTTATATGAAGAGGAACTCCTGCATTCTCACATCGCCCACTGGTGGTCACCAGA  740
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  741  TGGAGAAAGACTTGCCTTCCTGATGATAAATGACTCTTTGGTACCCACCATGGTTATCCCTCGGTTTACTGGAG  814
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------ATGATAAATGACTCTTTGGTACCCACCATGGTTATCCCTCGGTTTACTGGAG  52

Query  815  CGTTGTATCCCAAAGGAAAGCAGTATCCGTATCCTAAGGCAGGTCAAATGAACCCAACAATAAAATTATATGTT  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   53  CGTTGTATCCCAAAGGAAAGCAGTATCCGTATCCTAAGGCAGGTCAAGTGAACCCAACAATAAAATTATATGTT  126

Query  889  GTAAACCTGTATGGACCAACTCACACTTTGGAGCTCATGCCACCTGACAGCTTTAAATCAAGAGAATACTATAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  127  GTAAACCTGTATGGACCAACTCACACTTTGGAGCTCATGCCACCTGACAGCTTTAAATCAAGAGAATACTATAT  200

Query  963  CACTATGGTTAAATGGGTAAGCAATACCAAGACTGTGGTAAGATGGTTAAACCGAGCTCAGAACATCTCCATCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  201  CACTATGGTTAAATGGGTAAGCAATACCAAGACTGTGGTAAGATGGTTAAACCGAGCTCAGAACATCTCCATCC  274

Query 1037  TCACAGTCTGTGAGACCACTACAGGTGCTTGTAGTAAAAAATATGAGATGACATCAGATACGTGGCTCTCTCAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  275  TCACAGTCTGTGAGACCACTACAGGTGCTTGTAGTAAAAAATATGAGATGACATCAGATACGTGGCTCTCTCAG  348

Query 1111  CAGAATGAGGAGCCCGTGTTTTCTAGAGACGGCAGCAAATTCTTTATGACAGTGCCTGTTAAGCAAGGGGGACG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  349  CAGAATGAGGAGCCCGTGTTTTCTAGAGACGGCAGCAAATTCTTTATGACAGTGCCTGTTAAGCAAGGGGGACG  422

Query 1185  TGGAGAATTTCACCACATAGCTATGTTCCTCATCCAGAGTAAAAGTGAGCAAATTACCGTGCGGCATCTGACAT  1258
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  423  TGGAGAATTTCACCACGTAGCTATGTTCCTCATCCAGAGTAAAAGTGAGCAAATTACCGTGCGGCATCTGACAT  496

Query 1259  CAGGAAACTGGGAAGTGATAAAGATCTTGGCATACGATGAAACTACTCAAAAAATTTACTTTCTGAGCACTGAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  497  CAGGAAACTGGGAAGTGATAAAGATCTTGGCATACGATGAAACTACTCAAAAAATTTACTTTCTGAGCACTGAA  570

Query 1333  TCTTCTCCCAGAGGAAGGCAGCTGTACAGTGCTTCTACTGAAGGATTATTGAATCGCCAATGCATTTCATGTAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  571  TCTTCTCCCAGAGGAAGGCAGCTGTACAGTGCTTCTACTGAAGGATTATTGAATCGCCAATGCATTTCATGTAA  644

Query 1407  TTTCATGAAAGAACAATGTACATATTTTGATGCCAGTTTTAGTCCCATGAATCAACATTTCTTATTATTCTGTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  645  TTTCATGAAAGAACAATGTACATATTTTGATGCCAGTTTTAGTCCCATGAATCAACATTTCTTATTATTCTGTG  718

Query 1481  AAGGTCCAAGGGTCCCAGTGGTCAGCCTACATAGTACGGACAACCCAGCAAAATATTTTATATTGGAAAGCAAT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719  AAGGTCCAAGGGTCCCAGTGGTCAGCCTACATAGTACGGACAACCCAGCAAAATATTTTATATTGGAAAGCAAT  792

Query 1555  TCTATGCTGAAGGAAGCTATCCTGAAGAAGAAGATAGGAAAGCCAGAAATTAAAATCCTTCATATTGACGACTA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  793  TCTATGCTGAAGGAAGCTATCCTGAAGAAGAAGATAGGAAAGCCAGAAATTAAAATCCTTCATATTGACGACTA  866

Query 1629  TGAACTTCCTTTACAGTTGTCCCTTCCCAAAGATTTTATGGACCGAAACCAGTATGCTCTTCTGTTAATAATGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  TGAACTTCCTTTACAGTTGTCCCTTCCCAAAGATTTTATGGACCGAAACCAGTATGCTCTTCTGTTAATAATGG  940

Query 1703  ATGAAGAACCAGGAGGCCAGCTGGTTACAGATAAGTTCCATATTGACTGGGATTCCGTACTCATTGACATGGAT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  941  ATGAAGAACCAGGAGGCCAGCTGGTTACAGATAAGTTCCATATTGACTGGGATTCCGTACTCATTGACATGGAT  1014

Query 1777  AATGTCATTGTAGCAAGATTTGATGGCAGAGGAAGTGGATTCCAGGGTCTGAAAATTTTGCAGGAGATTCATCG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015  AATGTCATTGTAGCAAGATTTGATGGCAGAGGAAGTGGATTCCAGGGTCTGAAAATTTTGCAGGAGATTCATCG  1088

Query 1851  AAGATTAGGTTCAGTAGAAGTAAAGGACCAAATAACAGCTGTGAAATTTTTGCTGAAACTGCCTTACATTGACT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089  AAGATTAGGTTCAGTAGAAGTAAAGGACCAAATAACAGCTGTGAAATTTTTGCTGAAACTGCCTTACATTGACT  1162

Query 1925  CCAAAAGATTAAGCATTTTTGGAAAGGGTTATGGTGGCTATATTGCATCAATGATCTTAAAATCAGATGAAAAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163  CCAAAAGATTAAGCATTTTTGGAAAGGGTTATGGTGGCTATATTGCATCAATGATCTTAAAATCAGATGAAAAG  1236

Query 1999  CTTTTTAAATGTGGATCCGTGGTTGCACCTATCACAGACTTGAAATTGTATGCCTCAGCTTTCTCTGAAAGATA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237  CTTTTTAAATGTGGATCCGTGGTTGCACCTATCACAGACTTGAAATTGTATGCCTCAGCTTTCTCTGAAAGATA  1310

Query 2073  CCTTGGGATGCCATCTAAGGAAGAAAGCACTTACCAGGCAGCCAGTGTGCTACATAATGTTCATGGCTTGAAAG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311  CCTTGGGATGCCATCTAAGGAAGAAAGCACTTACCAGGCAGCCAGTGTGCTACATAATGTTCATGGCTTGAAAG  1384

Query 2147  AAGAAAATATATTAATAATTCATGGAACTGCTGACACAAAAGTTCATTTCCAACACTCAGCAGAATTAATCAAG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385  AAGAAAATATATTAATAATTCATGGAACTGCTGACACAAAAGTTCATTTCCAACACTCAGCAGAATTAATCAAG  1458

Query 2221  CACCTAATAAAAGCTGGAGTGAATTATACTATGCAGGTCTACCCAGATGAAGGTCATAACGTATCTGAGAAGAG  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1459  CACCTAATAAAAGCTGGAGTGAATTATACTATGCAGGTCTACCCAGATGAAGGTCATAACGTATCTGAGAAGAG  1532

Query 2295  CAAGTATCATCTCTACAGCACAATCCTCAAATTCTTCAGTGATTGTTTGAAGGAAGAAATATCTGTGCTACCAC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1533  CAAGTATCATCTCTACAGCACAATCCTCAAATTCTTCAGTGATTGTTTGAAGGAAGAAATATCTGTGCTACCAC  1606

Query 2369  AGGAACCAGAAGAAGATGAA  2388
            ||||||||||||||||||||
Sbjct 1607  AGGAACCAGAAGAAGATGAA  1626