Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471905
• Subject: XM_024453023.1
• Aligned Length: 2402
• Identities: 2304
• Gaps: 88

Alignment

Query    1  ATGAACCTAACTGCCAGCGTGTCCCATCACAT---CAA-GTGTCAACCCTC----AA------AAACAATCAAG  60
                                          ||   ||| |||...|.||.|    ||      |.|     .||
Sbjct    1  ------------------------------ATGCGCAAGGTGGAGAGCCGCGGGGAAGGGGGCAGA-----GAG  39

Query   61  GAACTGGGAAGTAACAGCCCTCCACAGAGAAACTGGAAGGGAATTGCTATTGCTCTGCTGGTGATTTTAGTTGT  134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   40  GAACTGGGAAGTAACAGCCCTCCACAGAGAAACTGGAAGGGAATTGCTATTGCTCTGCTGGTGATTTTAGTTGT  113

Query  135  ATGCTCACTCATCACTATGTCAGTCATCCTCTTAACCCCAGATGAACTCACAAATTCGTCAGAAACCAGATTGT  208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  114  ATGCTCACTCATCACTATGTCAGTCATCCTCTTAACCCCAGATGAACTCACAAATTCGTCAGAAACCAGATTGT  187

Query  209  CTTTGGAAGACCTCTTTAGGAAAGACTTTGTGCTTCACGATCCAGAGGCTCGGTGGATCAATGATACAGATGTG  282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  188  CTTTGGAAGACCTCTTTAGGAAAGACTTTGTGCTTCACGATCCAGAGGCTCGGTGGATCAATGATACAGATGTG  261

Query  283  GTGTATAAAAGCGAGAATGGACATGTCATTAAACTGAATATAGAAACAAATGCTACCACATTATTATTGGAAAA  356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  262  GTGTATAAAAGCGAGAATGGACATGTCATTAAACTGAATATAGAAACAAATGCTACCACATTATTATTGGAAAA  335

Query  357  CACAACTTTTGTAACCTTCAAAGCATCAAGACATTCAGTTTCACCAGATTTAAAATATGTCCTTCTGGCATATG  430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  336  CACAACTTTTGTAACCTTCAAAGCATCAAGACATTCAGTTTCACCAGATTTAAAATATGTCCTTCTGGCATATG  409

Query  431  ATGTCAAACAGATTTTTCATTATTCATATACTGCTTCATATGTGATTTACAACATACACACTAGGGAAGTTTGG  504
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  410  ATGTCAAACAGATTTTTCATTATTCGTATACTGCTTCATATGTGATTTACAACATACACACTAGGGAAGTTTGG  483

Query  505  GAGTTAAATCCTCCAGAAGTAGAGGACTCCGTCTTGCAGTACGCGGCCTGGGGTGTCCAAGGGCAGCAGCTGAT  578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  484  GAGTTAAATCCTCCAGAAGTAGAGGACTCCGTCTTGCAGTACGCGGCCTGGGGTGTCCAAGGGCAGCAGCTGAT  557

Query  579  TTATATTTTTGAAAATAATATCTACTATCAACCTGATATAAAGAGCAGTTCATTGCGACTGACATCTTCTGGAA  652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  558  TTATATTTTTGAAAATAATATCTACTATCAACCTGATATAAAGAGCAGTTCATTGCGACTGACATCTTCTGGAA  631

Query  653  AAGAAGAAATAATTTTTAATGGGATTGCTGACTGGTTATATGAAGAGGAACTCCTGCATTCTCACATCGCCCAC  726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  632  AAGAAGAAATAATTTTTAATGGGATTGCTGACTGGTTATATGAAGAGGAACTCCTGCATTCTCACATCGCCCAC  705

Query  727  TGGTGGTCACCAGATGGAGAAAGACTTGCCTTCCTGATGATAAATGACTCTTTGGTACCCACCATGGTTATCCC  800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  706  TGGTGGTCACCAGATGGAGAAAGACTTGCCTTCCTGATGATAAATGACTCTTTGGTACCCACCATGGTTATCCC  779

Query  801  TCGGTTTACTGGAGCGTTGTATCCCAAAGGAAAGCAGTATCCGTATCCTAAGGCAGGTCAAATGAACCCAACAA  874
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  780  TCGGTTTACTGGAGCGTTGTATCCCAAAGGAAAGCAGTATCCGTATCCTAAGGCAGGTCAAGTGAACCCAACAA  853

Query  875  TAAAATTATATGTTGTAAACCTGTATGGACCAACTCACACTTTGGAGCTCATGCCACCTGACAGCTTTAAATCA  948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  854  TAAAATTATATGTTGTAAACCTGTATGGACCAACTCACACTTTGGAGCTCATGCCACCTGACAGCTTTAAATCA  927

Query  949  AGAGAATACTATATCACTATGGTTAAATGGGTAAGCAATACCAAGACTGTGGTAAGATGGTTAAACCGAGCTCA  1022
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  928  AGAGAATACTATATCACTATGGTTAAATGGGTAAGCAATACCAAGACTGTGGTAAGATGGTTAAACCGAGCTCA  1001

Query 1023  GAACATCTCCATCCTCACAGTCTGTGAGACCACTACAGGTGCTTGTAGTAAAAAATATGAGATGACATCAGATA  1096
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      
Sbjct 1002  GAACATCTCCATCCTCACAGTCTGTGAGACCACTACAGGTGCTTGTAGTAAA----------------------  1053

Query 1097  CGTGGCTCTCTCAGCAGAATGAGGAGCCCGTGTTTTCTAGAGACGGCAGCAAATTCTTTATGACAGTGCCTGTT  1170
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1054  -----------------AATGAGGAGCCCGTGTTTTCTAGAGACGGCAGCAAATTCTTTATGACAGTGCCTGTT  1110

Query 1171  AAGCAAGGGGGACGTGGAGAATTTCACCACATAGCTATGTTCCTCATCCAGAGTAAAAGTGAGCAAATTACCGT  1244
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGCAAGGGGGACGTGGAGAATTTCACCACGTAGCTATGTTCCTCATCCAGAGTAAAAGTGAGCAAATTACCGT  1184

Query 1245  GCGGCATCTGACATCAGGAAACTGGGAAGTGATAAAGATCTTGGCATACGATGAAACTACTCAAAAAATTTACT  1318
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCGGCATCTGACATCAGGAAACTGGGAAGTGATAAAGATCTTGGCATACGATGAAACTACTCAAAAAATTTACT  1258

Query 1319  TTCTGAGCACTGAATCTTCTCCCAGAGGAAGGCAGCTGTACAGTGCTTCTACTGAAGGATTATTGAATCGCCAA  1392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTCTGAGCACTGAATCTTCTCCCAGAGGAAGGCAGCTGTACAGTGCTTCTACTGAAGGATTATTGAATCGCCAA  1332

Query 1393  TGCATTTCATGTAATTTCATGAAAGAACAATGTACATATTTTGATGCCAGTTTTAGTCCCATGAATCAACATTT  1466
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TGCATTTCATGTAATTTCATGAAAGAACAATGTACATATTTTGATGCCAGTTTTAGTCCCATGAATCAACATTT  1406

Query 1467  CTTATTATTCTGTGAAGGTCCAAGGGTCCCAGTGGTCAGCCTACATAGTACGGACAACCCAGCAAAATATTTTA  1540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTTATTATTCTGTGAAGGTCCAAGGGTCCCAGTGGTCAGCCTACATAGTACGGACAACCCAGCAAAATATTTTA  1480

Query 1541  TATTGGAAAGCAATTCTATGCTGAAGGAAGCTATCCTGAAGAAGAAGATAGGAAAGCCAGAAATTAAAATCCTT  1614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TATTGGAAAGCAATTCTATGCTGAAGGAAGCTATCCTGAAGAAGAAGATAGGAAAGCCAGAAATTAAAATCCTT  1554

Query 1615  CATATTGACGACTATGAACTTCCTTTACAGTTGTCCCTTCCCAAAGATTTTATGGACCGAAACCAGTATGCTCT  1688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CATATTGACGACTATGAACTTCCTTTACAGTTGTCCCTTCCCAAAGATTTTATGGACCGAAACCAGTATGCTCT  1628

Query 1689  TCTGTTAATAATGGATGAAGAACCAGGAGGCCAGCTGGTTACAGATAAGTTCCATATTGACTGGGATTCCGTAC  1762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TCTGTTAATAATGGATGAAGAACCAGGAGGCCAGCTGGTTACAGATAAGTTCCATATTGACTGGGATTCCGTAC  1702

Query 1763  TCATTGACATGGATAATGTCATTGTAGCAAGATTTGATGGCAGAGGAAGTGGATTCCAGGGTCTGAAAATTTTG  1836
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TCATTGACATGGATAATGTCATTGTAGCAAGATTTGATGGCAGAGGAAGTGGATTCCAGGGTCTGAAAATTTTG  1776

Query 1837  CAGGAGATTCATCGAAGATTAGGTTCAGTAGAAGTAAAGGACCAAATAACAGCTGTGAAATTTTTGCTGAAACT  1910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CAGGAGATTCATCGAAGATTAGGTTCAGTAGAAGTAAAGGACCAAATAACAGCTGTGAAATTTTTGCTGAAACT  1850

Query 1911  GCCTTACATTGACTCCAAAAGATTAAGCATTTTTGGAAAGGGTTATGGTGGCTATATTGCATCAATGATCTTAA  1984
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCCTTACATTGACTCCAAAAGATTAAGCATTTTTGGAAAGGGTTATGGTGGCTATATTGCATCAATGATCTTAA  1924

Query 1985  AATCAGATGAAAAGCTTTTTAAATGTGGATCCGTGGTTGCACCTATCACAGACTTGAAATTGTATGCCTCAGCT  2058
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AATCAGATGAAAAGCTTTTTAAATGTGGATCCGTGGTTGCACCTATCACAGACTTGAAATTGTATGCCTCAGCT  1998

Query 2059  TTCTCTGAAAGATACCTTGGGATGCCATCTAAGGAAGAAAGCACTTACCAGGCAGCCAGTGTGCTACATAATGT  2132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TTCTCTGAAAGATACCTTGGGATGCCATCTAAGGAAGAAAGCACTTACCAGGCAGCCAGTGTGCTACATAATGT  2072

Query 2133  TCATGGCTTGAAAGAAGAAAATATATTAATAATTCATGGAACTGCTGACACAAAAGTTCATTTCCAACACTCAG  2206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TCATGGCTTGAAAGAAGAAAATATATTAATAATTCATGGAACTGCTGACACAAAAGTTCATTTCCAACACTCAG  2146

Query 2207  CAGAATTAATCAAGCACCTAATAAAAGCTGGAGTGAATTATACTATGCAGGTCTACCCAGATGAAGGTCATAAC  2280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CAGAATTAATCAAGCACCTAATAAAAGCTGGAGTGAATTATACTATGCAGGTCTACCCAGATGAAGGTCATAAC  2220

Query 2281  GTATCTGAGAAGAGCAAGTATCATCTCTACAGCACAATCCTCAAATTCTTCAGTGATTGTTTGAAGGAAGAAAT  2354
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GTATCTGAGAAGAGCAAGTATCATCTCTACAGCACAATCCTCAAATTCTTCAGTGATTGTTTGAAGGAAGAAAT  2294

Query 2355  ATCTGTGCTACCACAGGAACCAGAAGAAGATGAA  2388
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  ATCTGTGCTACCACAGGAACCAGAAGAAGATGAA  2328