Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471921
• Subject: NM_001305875.1
• Aligned Length: 1982
• Identities: 1631
• Gaps: 109

Alignment

Query    1  ATGAGGTTGACGCTACTTTGTTGCACCTGGAGGGAAGAACGTATGGGAGAGGAAG--GAAGCGAGTTG---CCC  69
                                                      ||||    |||||  .|.||.||  |   |||
Sbjct    1  ------------------------------------------ATGG----GGAAGCTTAGGCCAG--GCCACCC  26

Query   70  GTGTG----TGCA-------AG---CTGCGGCCAGAGGATCT----ATGATG--GCCAGTACCTCCAGGCCCTG  123
            .||.|    |.||       ||   ||.|||.|||||   ||    |.||||  |||||  |||  .|||||||
Sbjct   27  ATGGGCTCCTCCAGACCTCCAGAGTCTCCGGACAGAG---CTGCAGAGGATGCAGCCAG--CCT--TGGCCCTG  93

Query  124  AACGCGGACTGGCACGCAGACT-------------GCTTCAGGTGTTGTGACTGCAGTGCCTCCCTGTCGCACC  184
            |     ||..|.|.|||.|.||             |||  |.|||.||.||.||.||.|.||||||.||.||||
Sbjct   94  A-----GAAGGACCCGCTGCCTCCACCTCCGTGGGGCT--AAGTGCTGCGAGTGTAGCGTCTCCCTTTCACACC  160

Query  185  AGTACTATGAGAAGGATGGGCAGCTCTTCTGCAAGAAGGACTACTGGGCCCGCTATGGCGAGTCCTGCCATGGG  258
            |||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  161  AGTACTACGAGAAGGATGGACAGCTCTTCTGCAAGAAGGACTACTGGGCCCGCTATGGCGAGTCTTGCCACGGG  234

Query  259  TGCTCTGAGCAAATCACCAAGGGACTGGTTATGGTGGCTGGGGAGCTGAAGTACCACCCCGAGTGTTTCATCTG  332
            |||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  235  TGCTCCGAGCACATCACCAAAGGGCTGGTCATGGTGGCTGGGGAGCTGAAGTACCACCCTGAGTGTTTCATCTG  308

Query  333  CCTCACGTGTGGGACCTTTATCGGTGACGGGGACACCTACACGCTGGTGGAGCACTCCAAGCTGTACTGCGGGC  406
            ||||.|.|||||.|.|||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  309  CCTCGCCTGTGGAAACTTCATTGGCGATGGGGACACCTACACACTGGTGGAGCACTCCAAGCTGTACTGTGGCC  382

Query  407  ACTGCTACTACCAGACTGTGGTGACCCCCGTCATCGAGCAGATCCTGCCTGACTCCCCTGGCTCCCACCTGCCC  480
            |.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  383  AGTGCTACTACCAGACCGTGGTAACTCCAGTCATCGAACAGATCCTACCTGACTCACCCGGCTCCCACCTGCCC  456

Query  481  CACACCGTCACCCTGGTGTCCATCCCAGCCTCATCTCATGGCAAGCGTGGACTTTCAGTCTCCATTGACCCCCC  554
            |||||.||||||||.|||||.|||||||||||..|.||||||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct  457  CACACAGTCACCCTCGTGTCTATCCCAGCCTCTGCCCATGGCAAACGAGGCCTGTCTGTCTCCATCGACCCCCC  530

Query  555  GCACGGCCCACCGGGCTGTGGCACCGAGCACTCACACACCGTCCGCGTCCAGGGAGTGGATCCCGGGCTGCATG  628
            .|||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||| |||.|||||||||
Sbjct  531  TCACGGCCCACCAGGATGTGGCACGGAGCATTCGCACACTGTCCGAGTCCAAGGAGTGGA-CCCAGGCTGCATG  603

Query  629  AGCCCAGATGTGAAGAATTCCATCCACGTCGGAGACCGGATCTTGGAAATCAATGGCACGCCCATCCGAAATGT  702
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  604  AGCCCAGATGTGAAGAATTCCATCCACGTTGGAGACCGGATCTTGGAAATCAATGGCACGCCCATCCGGAATGT  677

Query  703  GCCCCTGGACGAGATTGACCTGCTGATTCAGGAAACCAGCCGCCTGCTCCAGCTGACCCTCGAGCATGACCCTC  776
            |||.|||||||||||.|||.|||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  678  GCCGCTGGACGAGATCGACTTGCTGATCCAGGAGACCAGCCGCCTGCTCCAGCTGACCCTCGAGCACGACCCCC  751

Query  777  ACGATACACTGGGCCACGGGCTGGGGCCTGAGACCAGCCCCCTGAGCTCTCCGGCTTATACTCCCAGCGGGGAG  850
            |.||..||||||||||.||||..|.|.|.||..||||||||||||||||.||||...|.|||||||||||..||
Sbjct  752  ATGACTCACTGGGCCATGGGCCCGTGTCGGATCCCAGCCCCCTGAGCTCCCCGGTGCACACTCCCAGCGGACAG  825

Query  851  GCGGGCAGCTCTGCCCGGCAGAAACCTGTCTTGAGGAGCTGCAGCATCGACAGGTCTCCGGGCGCTGGCTCACT  924
            ||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.|||.|||||..|..|||||||
Sbjct  826  GCAGCCAGCTCTGCCCGGCAGAAACCTGTCTTGAGGAGCTGCAGTATTGACACGTCCCCGGGTACCAGCTCACT  899

Query  925  GGGCTCCCCGGCCTCCCAGCGCAAGGACCTGGGTCGCTCTGAGTCCCTCCGCGTAGTCTGCCGGCCACACCGCA  998
            .|.|||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|
Sbjct  900  AGCCTCTCCAGCCTCCCAGCGCAAGGACCTGGGTCGCTCCGAATCCCTCCGAGTGGTCTGCCGACCACACCGAA  973

Query  999  TCTTCCGGCCGTCGGACCTCATCCACGGGGAGGTGCTGGGCAAGGGCTGCTTCGGCCAGGCTATCAAGGTGACA  1072
            ||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  974  TCTTCCGGCCATCTGATCTCATCCATGGGGAAGTGCTGGGCAAGGGCTGTTTTGGCCAGGCCATCAAGGTGACA  1047

Query 1073  CACCGTGAGACAGGTGAGGTGATGGTGATGAAGGAGCTGATCCGGTTCGACGAGGAGACCCAGAGGACGTTCCT  1146
            |||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1048  CACCGAGAAACAGGCGAGGTGATGGTGATGAAGGAACTTATCCGGTTTGATGAGGAGACCCAGAGGACATTCCT  1121

Query 1147  CAAGGAGGTGAAGGTCATGCGATGCCTGGAACACCCCAACGTGCTCAAGTTCATCGGGGTGCTCTAC-AGGACA  1219
            |||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||| ||||||
Sbjct 1122  CAAGGAGGTAAAGGTCATGCGCTGCCTGGAGCACCCTAACGTGCTCAAGTTCATCGGAGTGCTCTACAAGGACA  1195

Query 1220  GA---GCTCA--CTCATCACTGAGTACATCAAAGGGCGGCACGCTCCGGGGCATCATCAAGAGCATGGACAGCC  1288
             |   |||.|  .|||||||.||||||||| |||||||||||.||.||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1196  -AGCGGCTAAACTTCATCACAGAGTACATC-AAGGGCGGCACCCTGCGGGGCATCATCAAGAACATGGACAGCC  1267

Query 1289  AGTACCCATGGAGCCAGAGAGTGAGCTTTGCCAAGGACATCGCATCAGGGATGGCCTACCTCCACTCCATGAAC  1362
            |||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1268  AGTACCCGTGGAGTCAGAGGGTCAGCTTTGCCAAGGACATTGCATCAGGGATGGCCTACCTCCATTCGATGAAC  1341

Query 1363  ATCATCCACCGAGACCTCAACTCCCACAACTGCCTGGTCCGCGAGAACAAGAATGTGGTGGTGGCTGACTTCGG  1436
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|.|||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 1342  ATCATCCACCGAGACCTCAACTCCCACAACTGTCTGGTCCGTGAGAATAGGAACGTGGTGGTGGCCGACTTTGG  1415

Query 1437  GCTGGCGCGTCTCATGGTGGACGAGAAGACTCAGCCTGAGGGCCTGCGGAGCCTCAAGAAGCCAGACCGCAAGA  1510
            ||||||.||.||||||.|.||.||.||||.||||.||||.|.|.|.||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1416  GCTGGCTCGACTCATGATCGATGAAAAGAATCAGTCTGAAGACTTACGCAGCCTTAAGAAGCCGGACCGCAAGA  1489

Query 1511  AGCGCTACACCGTGGTGGGCAACCCCTACTGGATGGCACCTGAGATGATCAACGGCCGCAGCTATGATGAGAAG  1584
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.|||
Sbjct 1490  AGCGGTACACAGTGGTGGGCAACCCCTACTGGATGGCGCCAGAGATGATCAATGGTCGTAGTTATGATGAAAAG  1563

Query 1585  GTGGATGTGTTCTCCTTTGGGATCGTCCTGTGCGAGATCATCGGGCGGGTGAACGCAGACCCTGACTACCTGCC  1658
            |||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1564  GTGGACGTGTTTTCCTTTGGAATTGTCCTCTGTGAGATTATCGGGCGTGTGAATGCAGACCCTGACTATCTGCC  1637

Query 1659  CCGCACCATGGACTTTGGCCTCAACGTGCGAGGATTCCTGGACCGCTACTGCCCCCCAAACTGCCCCCCGAGCT  1732
            ||||||.|||||||||||||||||.||..|.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|
Sbjct 1638  CCGCACTATGGACTTTGGCCTCAATGTAAGGGGTTTCCTGGACCGCTACTGTCCACCAAACTGTCCCCCAAGTT  1711

Query 1733  TCTTCCCCATCACCGTGCGCTGTTGCGATCTGGACCCCGAGAAGAGGCCATCCTTTGTGAAGCTGGAACACTGG  1806
            |||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1712  TCTTCCCCATCACTGTGCGCTGCTGTGACCTGGATCCTGAAAAGAGACCCTCTTTTGTAAAGCTGGAACAATGG  1785

Query 1807  CTGGAGACCCTCCGCATGCACCTGGCCGGCCACCTGCCACTGGGCCCACAGCTGGAGCAGCTGGACAGAGGTTT  1880
            ||.||.||.||.|||||||||.||.|.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||..|.||.||
Sbjct 1786  CTAGAAACACTTCGCATGCACTTGTCTGGTCACCTGCCACTGGGCCCACAACTGGAACAACTGGAGCGGGGCTT  1859

Query 1881  CTGGGAGACCTACCGGCGCGGCGAGAGCGGACTGCCTGCCCACCCTGAGGTCCCCGAC  1938
            ||||||||||||||||||.|||||||||..|||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1860  CTGGGAGACCTACCGGCGGGGCGAGAGCTCACTGCCTGCCCACCCCGAGGTCCCTGAC  1917