Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471927
• Subject: NM_001290384.1
• Aligned Length: 1548
• Identities: 1383
• Gaps: 63

Alignment

Query    1  ATGACGTTGCTGATCACTGGAGATTCCATCGTTAGTGCTGAGGCAGTATGGGATCACGTCACCATGGCCAACCG  74
                                                                           |||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------------ATGGCCAACCG  11

Query   75  GGAGTTGGCATTTAAAGCTGGCGACGTCATCAAAGTCTTGGATGCTTCCAACAAGGATTGGTGGTGGGGCCAGA  148
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   12  GGAGTTGGCATTTAAGGCTGGCGACGTCATCAAAGTCTTGGATGCTTCCAACAAGGATTGGTGGTGGGGCCAGA  85

Query  149  TCGACGATGAGGAGGGATGGTTTCCTGCCAGCTTTGTGAGGCTCTGGGTGAACCAGGAGGATGAGGTGGAGGAG  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct   86  TCGACGATGAGGAGGGATGGTTTCCTGCCAGCTTTGTGAGGCTCTGGGTGAACCAGGAGGATGGGGTGGAGGAA  159

Query  223  GGGCCCAGCGATGTGCAGAACGGACACCTGGACCCCAATTCAGACTGCCTCTGTCTGGGGCGGCCACTACAGAA  296
            ||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  160  GGGCCCAGTGATGTGCAGAATGGGCACCTGGACCCCAACTCAGACTGCCTTTGTCTGGGCCGGCCACTACAGAA  233

Query  297  CCGGGACCAGATGCGGGCCAATGTCATCAATGAGATAATGAGCACTGAGCGTCACTACATCAAGCACCTCAAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  234  CCGGGACCAGATGCGGGCCAATGTCATCAATGAGATCATGAGCACGGAGCGCCATTACATCAAGCACCTCAAGG  307

Query  371  ATATTTGTGAGGGCTATCTGAAGCAGTGCCGGAAGAGAAGGGACATGTTCAGTGACGAGCAACTGAAGGTAATC  444
            |.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  308  ACATTTGCGAGGGCTACCTGAAGCAGTGCCGAAAGAGAAGGGACATGTTCAGTGACGAGCAGCTGAAGGTCATC  381

Query  445  TTTGGGAACATTGAAGATATCTACAGATTTCAGATGGGCTTTGTGAGAGACCTGGAGAAACAGTATAACAATGA  518
            |||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  382  TTTGGAAACATTGAAGACATATACAGATTTCAGATGGGCTTCGTGAGAGACCTGGAGAAGCAGTACAACAATGA  455

Query  519  TGACCCCCACCTCAGCGAGATAGGACCCTGCTTCCTAGAGCACCAAGATGGATTCTGGATATACTCTGAGTATT  592
            |||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  456  TGATCCCCACCTCAGTGAGATAGGACCCTGCTTCTTAGAGCATCAAGATGGATTCTGGATATACTCTGAATATT  529

Query  593  GTAACAACCACCTGGATGCTTGCATGGAGCTCTCCAAACTGATGAAGGACAGCCGCTACCAGCACTTCTTTGAG  666
            |||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  530  GTAACAACCACCTGGATGCCTGCATGGAACTCTCCAAGCTGATGAAGGACAGCCGCTATCAACACTTCTTTGAG  603

Query  667  GCCTGTCGCCTCTTGCAGCAGATGATTGACATTGCTATCGATGGTTTCCTTTTGACTCCAGTGCAGAAGATCTG  740
            |||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  604  GCCTGCCGCCTCTTGCAGCAGATGATCGACATTGCTATTGATGGTTTTCTTTTGACTCCAGTACAGAAGATCTG  677

Query  741  CAAGTATCCCTTACAGTTGGCTGAGCTCCTAAAGTATACTGCCCAAGACCACAGTGACTACAGGTATGTGGCAG  814
            |||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||
Sbjct  678  CAAATATCCCTTACAATTGGCCGAGCTCCTAAAGTATACTGCCCAAGATCACAGTGATTACAGATACGTTGCAG  751

Query  815  CTGCTTTGGCTGTCATGAGAAATGTGACTCAGCAGATCAACGAACGCAAGCGACGTTTAGAGAATATTGACAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||
Sbjct  752  CTGCTTTGGCTGTCATGAGAAATGTGACTCAGCAGATCAATGAACGCAAGCGACGTCTGGAGAATATTGACAAG  825

Query  889  ATTGCTCAGTGGCAGGCTTCTGTCCTAGACTGGGAGGGCGAGGACATCCTAGACAGGAGCTCGGAGCTGATCTA  962
            |||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  826  ATTGCGCAATGGCAGGCCTCTGTCCTAGACTGGGAGGGAGAGGACATCTTAGACAGGAGCTCGGAGCTGATCTA  899

Query  963  CACTGGGGAGATGGCCTGGATCTACCAGCCCTACGGCCGCAACCAGCAGCGGGTCTTCTTCCTGTTTGACCACC  1036
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||
Sbjct  900  CACTGGAGAGATGGCCTGGATCTACCAGCCCTATGGCCGCAACCAGCAGAGAGTCTTCTTCCTGTTTGACCACC  973

Query 1037  AGATGGTCCTCTGCAAGAAGGACCTAATCCGGAGAGACATCCTGTACTACAAAGGCCGCATTGACATGGATAAA  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  974  AGATGGTCCTCTGCAAGAAGGACCTAATCCGGAGAGACATCCTATACTACAAGGGGCGCATTGACATGGATAAA  1047

Query 1111  TATGAGGTAGTTGACATTGAGGATGGCAGAGATGATGACTTCAATGTCAGCATGAAGAATGCCTTTAAGCTTCA  1184
            |||||||||.|||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1048  TATGAGGTAATTGACATCGAAGATGGCAGAGATGATGACTTTAATGTCAGCATGAAAAATGCTTTCAAGCTTCA  1121

Query 1185  CAACAAGGAGACTGAGGAGATACATCTGTTCTTTGCCAAGAAGCTGGAGGAAAAAATACGCTGGCTCAGGGCTT  1258
            .||||||||.||.||.||..|.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 1122  TAACAAGGAAACGGAAGAAGTGCATCTGTTCTTTGCCAAGAAACTGGAGGAGAAAATACGTTGGCTTAGAGCTT  1195

Query 1259  TCAGAGAAGAGAGGAAAATGGTACAGGAAGATGAAAAAATTGGCTTTGAAATTTCTGAAAACCAGAAGAGGCAG  1332
            |||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1196  TCAGAGAAGAGAGAAAAATGGTACAAGAAGATGAAAAAATTGGCTTTGAGATTTCTGAAAATCAGAAGAGACAG  1269

Query 1333  GCTGCAATGACTGTGAGAAAAGTCCCTAAGCAAAAAGGTGTCAACTCTGCCCGCTCAGTTCCTCCTTCCTACCC  1406
            ||||||||||||||||||||||...||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1270  GCTGCAATGACTGTGAGAAAAGCTTCTAAACAGAAAGGTGTCAACTCTGCCCGCTCAGTTCCTCCTTCCTACCC  1343

Query 1407  ACCACCGCAGGACCCGTTAAACCACGGCCAGTACCTGGTCCCCGACGGCATCGCTCAGTCGCAGGTCTTTGAGT  1480
            ||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 1344  ACCACCACAGGACCCGTTAAACCAGGGCCAGTACCTGGTCCCCGATGGCATCGCTCAGTCTCAAGTGTTTGAGT  1417

Query 1481  TCACCGAACCCAAGCGCAGCCAGTCACCATTCTGGCAAAACTTCAGCAGGTTAACCCCCTTCAAAAAA  1548
            ||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1418  TCACTGAACCGAAACGCAGCCAGTCACCATTCTGGCAAAACTTCAGTAGGTTAACCCCCTTCAAAAAA  1485