Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471927
• Subject: XM_006527992.3
• Aligned Length: 1569
• Identities: 1444
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ATGACGT---------------------TGCTGATCACTGGAGATTCCATCGTTAGTGCTGAGGCAGTATGGGA  53
            |||..||                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAGTGGATTAGAGGCGGAACGGGAATGCTGATCACTGGAGATTCCATCGTTAGTGCTGAGGCAGTATGGGA  74

Query   54  TCACGTCACCATGGCCAACCGGGAGTTGGCATTTAAAGCTGGCGACGTCATCAAAGTCTTGGATGCTTCCAACA  127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCACGTCACCATGGCCAACCGGGAGTTGGCATTTAAGGCTGGCGACGTCATCAAAGTCTTGGATGCTTCCAACA  148

Query  128  AGGATTGGTGGTGGGGCCAGATCGACGATGAGGAGGGATGGTTTCCTGCCAGCTTTGTGAGGCTCTGGGTGAAC  201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGATTGGTGGTGGGGCCAGATCGACGATGAGGAGGGATGGTTTCCTGCCAGCTTTGTGAGGCTCTGGGTGAAC  222

Query  202  CAGGAGGATGAGGTGGAGGAGGGGCCCAGCGATGTGCAGAACGGACACCTGGACCCCAATTCAGACTGCCTCTG  275
            ||||||||||.|||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  223  CAGGAGGATGGGGTGGAGGAAGGGCCCAGTGATGTGCAGAATGGGCACCTGGACCCCAACTCAGACTGCCTTTG  296

Query  276  TCTGGGGCGGCCACTACAGAACCGGGACCAGATGCGGGCCAATGTCATCAATGAGATAATGAGCACTGAGCGTC  349
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct  297  TCTGGGCCGGCCACTACAGAACCGGGACCAGATGCGGGCCAATGTCATCAATGAGATCATGAGCACGGAGCGCC  370

Query  350  ACTACATCAAGCACCTCAAGGATATTTGTGAGGGCTATCTGAAGCAGTGCCGGAAGAGAAGGGACATGTTCAGT  423
            |.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTACATCAAGCACCTCAAGGACATTTGCGAGGGCTACCTGAAGCAGTGCCGAAAGAGAAGGGACATGTTCAGT  444

Query  424  GACGAGCAACTGAAGGTAATCTTTGGGAACATTGAAGATATCTACAGATTTCAGATGGGCTTTGTGAGAGACCT  497
            ||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  445  GACGAGCAGCTGAAGGTCATCTTTGGAAACATTGAAGACATATACAGATTTCAGATGGGCTTCGTGAGAGACCT  518

Query  498  GGAGAAACAGTATAACAATGATGACCCCCACCTCAGCGAGATAGGACCCTGCTTCCTAGAGCACCAAGATGGAT  571
            ||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||
Sbjct  519  GGAGAAGCAGTACAACAATGATGATCCCCACCTCAGTGAGATAGGACCCTGCTTCTTAGAGCATCAAGATGGAT  592

Query  572  TCTGGATATACTCTGAGTATTGTAACAACCACCTGGATGCTTGCATGGAGCTCTCCAAACTGATGAAGGACAGC  645
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  593  TCTGGATATACTCTGAATATTGTAACAACCACCTGGATGCCTGCATGGAACTCTCCAAGCTGATGAAGGACAGC  666

Query  646  CGCTACCAGCACTTCTTTGAGGCCTGTCGCCTCTTGCAGCAGATGATTGACATTGCTATCGATGGTTTCCTTTT  719
            |||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  667  CGCTATCAACACTTCTTTGAGGCCTGCCGCCTCTTGCAGCAGATGATCGACATTGCTATTGATGGTTTTCTTTT  740

Query  720  GACTCCAGTGCAGAAGATCTGCAAGTATCCCTTACAGTTGGCTGAGCTCCTAAAGTATACTGCCCAAGACCACA  793
            |||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  GACTCCAGTACAGAAGATCTGCAAATATCCCTTACAATTGGCCGAGCTCCTAAAGTATACTGCCCAAGATCACA  814

Query  794  GTGACTACAGGTATGTGGCAGCTGCTTTGGCTGTCATGAGAAATGTGACTCAGCAGATCAACGAACGCAAGCGA  867
            ||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  815  GTGATTACAGATACGTTGCAGCTGCTTTGGCTGTCATGAGAAATGTGACTCAGCAGATCAATGAACGCAAGCGA  888

Query  868  CGTTTAGAGAATATTGACAAGATTGCTCAGTGGCAGGCTTCTGTCCTAGACTGGGAGGGCGAGGACATCCTAGA  941
            |||.|.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct  889  CGTCTGGAGAATATTGACAAGATTGCGCAATGGCAGGCCTCTGTCCTAGACTGGGAGGGAGAGGACATCTTAGA  962

Query  942  CAGGAGCTCGGAGCTGATCTACACTGGGGAGATGGCCTGGATCTACCAGCCCTACGGCCGCAACCAGCAGCGGG  1015
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|
Sbjct  963  CAGGAGCTCGGAGCTGATCTACACTGGAGAGATGGCCTGGATCTACCAGCCCTATGGCCGCAACCAGCAGAGAG  1036

Query 1016  TCTTCTTCCTGTTTGACCACCAGATGGTCCTCTGCAAGAAGGACCTAATCCGGAGAGACATCCTGTACTACAAA  1089
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1037  TCTTCTTCCTGTTTGACCACCAGATGGTCCTCTGCAAGAAGGACCTAATCCGGAGAGACATCCTATACTACAAG  1110

Query 1090  GGCCGCATTGACATGGATAAATATGAGGTAGTTGACATTGAGGATGGCAGAGATGATGACTTCAATGTCAGCAT  1163
            ||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1111  GGGCGCATTGACATGGATAAATATGAGGTAATTGACATCGAAGATGGCAGAGATGATGACTTTAATGTCAGCAT  1184

Query 1164  GAAGAATGCCTTTAAGCTTCACAACAAGGAGACTGAGGAGATACATCTGTTCTTTGCCAAGAAGCTGGAGGAAA  1237
            |||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.||.||..|.||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1185  GAAAAATGCTTTCAAGCTTCATAACAAGGAAACGGAAGAAGTGCATCTGTTCTTTGCCAAGAAACTGGAGGAGA  1258

Query 1238  AAATACGCTGGCTCAGGGCTTTCAGAGAAGAGAGGAAAATGGTACAGGAAGATGAAAAAATTGGCTTTGAAATT  1311
            |||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1259  AAATACGTTGGCTTAGAGCTTTCAGAGAAGAGAGAAAAATGGTACAAGAAGATGAAAAAATTGGCTTTGAGATT  1332

Query 1312  TCTGAAAACCAGAAGAGGCAGGCTGCAATGACTGTGAGAAAAGTCCCTAAGCAAAAAGGTGTCAACTCTGCCCG  1385
            ||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||...||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCTGAAAATCAGAAGAGACAGGCTGCAATGACTGTGAGAAAAGCTTCTAAACAGAAAGGTGTCAACTCTGCCCG  1406

Query 1386  CTCAGTTCCTCCTTCCTACCCACCACCGCAGGACCCGTTAAACCACGGCCAGTACCTGGTCCCCGACGGCATCG  1459
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1407  CTCAGTTCCTCCTTCCTACCCACCACCACAGGACCCGTTAAACCAGGGCCAGTACCTGGTCCCCGATGGCATCG  1480

Query 1460  CTCAGTCGCAGGTCTTTGAGTTCACCGAACCCAAGCGCAGCCAGTCACCATTCTGGCAAAACTTCAGCAGGTTA  1533
            |||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1481  CTCAGTCTCAAGTGTTTGAGTTCACTGAACCGAAACGCAGCCAGTCACCATTCTGGCAAAACTTCAGTAGGTTA  1554

Query 1534  ACCCCCTTCAAAAAA  1548
            |||||||||||||||
Sbjct 1555  ACCCCCTTCAAAAAA  1569