Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471930
• Subject: NM_019677.2
• Aligned Length: 3653
• Identities: 3130
• Gaps: 139

Alignment

Query    1  ATGGCCGGGGCTCAACCCGGAGTGCACGCCTTGCAACTCAAGCCCGTGTGCGTGTCCGACAGCCTCAAGAAGGG  74
            |||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGGGGCTCAGCCCGGAGTGCACGCCTTGCAACTCAAGCCCGTGTGCGTGTCCGACAGCCTCAAGAAGGG  74

Query   75  CACCAAATTCGTCAAGTGGGATGATGACTCAACTATTGTTACTCCAATTATTTTGAGGACTGACCCTCAGGGAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  CACCAAATTCGTCAAGTGGGATGATGACTCCACTATTGTTACTCCAATTATTTTGAGGACTGATCCTCAGGGAT  148

Query  149  TTTTCTTTTACTGGACAGATCAAAACAAGGAGACAGAGCTACTGGATCTCAGCCTTGTCAAAGATGCCAGATGT  222
            |||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||..|.|||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  149  TTTTCTTTTACTGGACAGACCAGAATAAGGAGACGGAGCTGTTAGATCTCAGCCTTGTCAAGGATGCCAGGTGT  222

Query  223  GGGAGACACGCCAAAGCTCCCAAGGACCCCAAATTACGTGAACTTTTGGATGTGGGGAACATCGGGCGCCTGGA  296
            ||||..||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.|||||||.|||||||||||.|.|.||||
Sbjct  223  GGGAAGCACGCCAAAGCTCCCAAGGACCCCAAGTTGCGTGAACTTCTGGATGTTGGGAACATCGGACACTTGGA  296

Query  297  GCAGCGCATGATCACAGTGGTGTATGGGCCTGACCTCGTGAACATCTCCCATTTGAATCTCGTGGCTTTCCAAG  370
            .|||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct  297  ACAGCGCATGATAACTGTGGTGTATGGACCAGACCTGGTGAACATTTCCCACTTGAATCTTGTGGCTTTTCAAG  370

Query  371  AAGAAGTGGCCAAGGAATGGACAAATGAGGTTTTCAGTTTGGCAACAAACCTGCTGGCCCAAAACATGTCCAGG  444
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  371  AGGAAGTAGCCAAGGAATGGACAAATGAGGTTTTCAGCTTGGCAACAAACCTGCTGGCTCAGAACATGTCCAGG  444

Query  445  GATGCATTTCTGGAAAAAGCCTATACTAAACTTAAGCTGCAAGTCACTCCAGAAGGGCGTATTCCTCTCAAAAA  518
            ||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct  445  GACGCATTTCTGGAGAAAGCATATACTAAGCTCAAGCTCCAGGTCACCCCAGAAGGCCGCATTCCTCTTAAAAA  518

Query  519  CATATATCGCTTGTTTTCAGCAGATCGGAAGCGAGTTGAAACTGCTTTAGAGGCTTGTAGTCTTCCATCTTCAA  592
            |||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  CATCTATCGATTGTTCTCAGCAGACCGGAAGCGCGTTGAAACTGCACTAGAGGCTTGTAGTCTTCCATCTTCGA  592

Query  593  GGAATGATTCAATACCTCAAGAAGATTTCACTCCAGAAGTGTACAGAGTTTTCCTCAACAACCTTTGCCCTCGA  666
            |||||||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct  593  GGAATGACTCCATTCCCCAAGAGGACTTCACTCCAGATGTATACAGAGTTTTCCTGAACAATCTCTGTCCCCGA  666

Query  667  CCTGAAATTGATAACATCTTTTCAGAATTTGGTGCAAAAAGCAAACCATATCTTACCGTTGATCAGATGATGGA  740
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  CCTGAAATTGATAACATCTTTTCTGAATTTGGTGCCAAAAGCAAACCGTACCTGACGGTTGATCAGATGATGGA  740

Query  741  TTTTATCAACCTTAAGCAGCGAGATCCTCGGCTTAATGAAATACTTTATCCACCTCTAAAACAAGAGCAAGTCC  814
            |||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||.||||
Sbjct  741  TTTTATCAACCTTAAGCAGAGAGATCCCCGGCTCAATGAAATCCTTTACCCACCTCTGAAGCAGGAGCAGGTCC  814

Query  815  AAGTATTGATTGAGAAGTATGAACCCAACAACAGCCTCGCCAGAAAAGGACAAATATCAGTGGATGGGTTCATG  888
            ||||.|||||||||||.|||||.|||||||.|||||||||||..|||||.||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct  815  AAGTGTTGATTGAGAAATATGAGCCCAACAGCAGCCTCGCCAAGAAAGGGCAGATGTCAGTGGATGGATTCATG  888

Query  889  CGCTATCTGAGTGGAGAAGAAAACGGAGTCGTTTCACCTGAGAAACTGGATTTGAATGAAGACATGTCTCAGCC  962
            |||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  889  CGCTACCTGAGCGGAGAAGAAAATGGAGTCGTTTCACCTGAGAAACTGGATTTGAACGAAGACATGTCTCAGCC  962

Query  963  CCTTTCTCACTATTTCATTAATTCCTCGCACAACACCTACCTCACAGCTGGCCAACTGGCTGGAAACTCCTCTG  1036
            |||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.|||||.||||
Sbjct  963  CCTGTCTCACTATTTCATCAATTCCTCGCACAACACCTACCTCACAGCTGGCCAGTTGGCTGGGAACTCGTCTG  1036

Query 1037  TTGAGATGTATCGCCAAGTGCTCCTGTCTGGTTGTCGCTGTGTGGAGCTGGACTGCTGGAAGGGACGGACTGCA  1110
            |.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.
Sbjct 1037  TAGAGATGTATCGCCAGGTGCTTCTGTCTGGATGTCGCTGTGTGGAGCTGGACTGCTGGAAGGGAAGGACCGCT  1110

Query 1111  GAAGAGGAACCTGTCATCACCCATGGCTTCACCATGACAACTGAAATATCTTTCAAGGAAGTGATAGAAGCAAT  1184
            ||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1111  GAGGAAGAGCCTGTCATTACCCATGGATTCACCATGACAACAGAAATATCCTTCAAGGAAGTCATAGAAGCCAT  1184

Query 1185  TGCGGAGTGTGCATTTAAGACTTCACCTTTTCCAATTCTCCTTTCGTTTGAGAACCATGTGGATTCCCCAAAGC  1258
            .||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1185  CGCAGAGTGTGCGTTCAAGACGTCTCCTTTCCCCATCCTCCTTTCCTTTGAGAACCACGTGGATTCCCCGAAGC  1258

Query 1259  AGCAAGCCAAGATGGCGGAGTACTGCCGACTGATCTTTGGGGATGCCCTTCTCATGGAGCCCCTGGAAAAATAT  1332
            |.||||||||||||||.|||||.||||||.|.||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.
Sbjct 1259  AACAAGCCAAGATGGCCGAGTATTGCCGATTAATCTTTGGTGATGCCCTCCTGATGGAACCACTGGAAAAATAC  1332

Query 1333  CCACTGGAATCTGGAGTTCCTCTTCCAAGCCCTATGGATTTAATGTATAAAATTTTGGTGAAAAATAAGAAGAA  1406
            ||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1333  CCACTGGAATCTGGGGTACCTCTTCCAAGCCCTATGGATTTAATGTATAAAATCTTGGTGAAAAACAAGAAGAA  1406

Query 1407  ATCACACAAGTCATCAGAAGGAAGCGGCAAAAAGAAGCTCTCAGAACAAGCCTCCAACACCTACAGTGACTCCT  1480
            .||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1407  GTCGCACAAGTCGTCAGAGGGAAGTGGTAAGAAGAAGCTTTCAGAGCAAGCTTCCAACACCTACAGCGACTCCT  1480

Query 1481  CCAGCATGTTCGAGCCCTCATCCCCAGGAGCCGGAGAAGCTGATACGGAAAGTGACGACGACGATGATGATGAT  1554
            ||||..||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct 1481  CCAGTGTGTTCGAGCCTTCGTCTCCAGGAGCTGGGGAAGCAGATACGGAGAGTGATGACGATGACGACGACGAT  1554

Query 1555  GACTGTAAAAAATCTTCAATGGATGAGGGGACTGCTGGAAGTGAGGCTATGGCCACAGAAGAAATGTCTAATCT  1628
            |||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1555  GACTGTAAAAAGTCTTCCATGGATGAGGGGACAGCTGGCAGCGAAGCCATGGCCACAGAAGAGATGTCTAACCT  1628

Query 1629  GGTGAACTATATTCAGCCAGTCAAGTTTGAGTCATTTGAAATTTCAAAAAAAAGAAATAAAAGTTTTGAAATGT  1702
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1629  GGTGAACTATATTCAGCCTGTCAAGTTTGAGTCCTTTGAAATTTCAAAAAAAAGAAATAAAAGCTTTGAAATGT  1702

Query 1703  CTTCCTTCGTGGAAACCAAAGGACTTGAACAACTCACCAAGTCTCCAGTGGAATTTGTAGAATATAACAAAATG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1703  CTTCCTTCGTGGAAACCAAAGGACTTGAACAACTTACAAAGTCTCCGGTGGAATTTGTAGAATACAACAAGATG  1776

Query 1777  CAGCTTAGCAGGATATATCCAAAAGGAACACGTGTGGATTCATCCAACTATATGCCTCAGCTCTTCTGGAATGC  1850
            ||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1777  CAACTTAGCAGGATATATCCCAAGGGAACACGTGTGGATTCATCCAACTACATGCCTCAACTCTTCTGGAATGC  1850

Query 1851  AGGTTGTCAGATGGTGGCACTTAATTTCCAGACAATGGACCTGGCTATGCAAATAAATATGGGGATGTATGAAT  1924
            .||.||||||||||||||.||.||.|||||||||.||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1851  TGGCTGTCAGATGGTGGCGCTCAACTTCCAGACAGTGGATCTAGCTATGCAGATAAACATGGGCATGTATGAGT  1924

Query 1925  ACAACGGGAAGAGTGGCTACAGATTGAAGCCAGAGTTCATGAGGAGGCCTGACAAGCATTTTGATCCATTTACT  1998
            ||||.||||||||.|||||.||..|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACAATGGGAAGAGCGGCTATAGGCTGAAGCCAGAGTTCATGAGGAGGCCGGACAAGCATTTTGATCCATTTACT  1998

Query 1999  GAAGGCATCGTAGATGGGATAGTGGCAAACACTTTGTCTGTTAAGATTATTTCAGGTCAGTTTCTTTCTGATAA  2072
            |||||.||||||||||||||||||||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1999  GAAGGAATCGTAGATGGGATAGTGGCCAACACTCTATCTGTTAAGATTATTTCAGGTCAGTTCCTCTCTGATAA  2072

Query 2073  GAAAGTTGGGACTTACGTGGAAGTAGATATGTTTGGTTTGCCTGTGGATACAAGGAGGAAGGCATTTAAGACCA  2146
            |||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2073  GAAAGTTGGGACTTATGTGGAAGTGGATATGTTTGGCTTGCCTGTGGACACAAGGAGGAAGGCATTTAAAACCA  2146

Query 2147  AAACATCCCAAGGAAATGCTGTGAATCCTGTCTGGGAAGAAGAACCTATTGTGTTCAAAAAGGTGGTTCTTCCT  2220
            |.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 2147  AGACATCCCAAGGAAATGCTGTAAACCCTGTCTGGGAAGAAGAACCTATTGTATTCAAAAAGGTAGTTCTACCT  2220

Query 2221  ACTCTGGCCTGTTTGAGAATAGCAGTTTATGAAGAAGGAGGTAAATTCATTGGCCACCGTATCTTGCCAGTGCA  2294
            .||||||||||||||||.|||||||..||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 2221  TCTCTGGCCTGTTTGAGGATAGCAGCATATGAAGAGGGAGGCAAATTTATTGGCCACCGGATATTGCCTGTGCA  2294

Query 2295  AGCCATTCGGCCAGGCTATCACTATATCTGTCTAAGGAATGAAAGGAACCAGCCTCTGACGCTGCCTGCTGTCT  2368
            .||.||||||||||||||||||||.|||||.||..|||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 2295  GGCTATTCGGCCAGGCTATCACTACATCTGCCTGCGGAATGAGAGGAACCAGCCCCTGACGCTGCCAGCTGTCT  2368

Query 2369  TTGTCTACATAGAAGTGAAAGACTATGTGCCAGACACATATGCAGATGTCATCGAAGCTTTATCAAACCCAATC  2442
            ||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2369  TTGTCTACATAGAAGTCAAAGATTATGTGCCAGACACGTATGCAGATGTAATCGAAGCTCTATCAAACCCAATC  2442

Query 2443  CGATATGTGAACCTGATGGAACAGAGAGCTAAGCAATTGGCTGCTTTGACACTGGAAGATGAAGAAGAAGTAAA  2516
            ||||||||.||.|||||||||||||||||||||||..|||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 2443  CGATATGTCAATCTGATGGAACAGAGAGCTAAGCAGCTGGCTGCGTTGACCCTGGAGGATGAAGAGGAAGTAAA  2516

Query 2517  GAAAGAGGCTGATCCTGGAGAAACACCATCAGAGGCTCCAAGTGAAGCGAGAACGACTCCAGCAGAAAATGGGG  2590
            |||.||||||||.||||||||||||.|.||.|||||||||||.|||.|.||.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 2517  GAAGGAGGCTGACCCTGGAGAAACATCTTCCGAGGCTCCAAGCGAAACCAGGACAACGCCAGCAGAGAATGGGG  2590

Query 2591  TGAATCACACTACAACCCTGACACCCAAGCCACCCTCCCAGGCTCTCCACAGCCAGCCAGCTCCAGGTTCTGTA  2664
            ||||||||||..||.||||..||||||||||.||.||||||||||..|||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 2591  TGAATCACACCGCATCCCTTGCACCCAAGCCGCCTTCCCAGGCTCCACACAGCCAGCCTGCTCCAGGGTCTGTG  2664

Query 2665  AAGGCACCTGCCAAAACAGAAGATCTTATTCAGAGTGTCTTAACAGAAGTGGAAGCACAGACCATCGAAGAACT  2738
            ||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||
Sbjct 2665  AAGGCACCTGCCAAAACAGAAGATCTGATCCAGAGCGTGTTAACAGAAGTAGAGGCGCAAACCATCGAAGAGCT  2738

Query 2739  AAAGCAACAGAAATCGTTTGTGAAACTTCAAAAGAAACACTACAAAGAAATGAAAGACCTGGTTAAGAGACACC  2812
            .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2739  CAAGCAACAGAAATCGTTCGTGAAACTTCAAAAGAAACACTACAAAGAAATGAAAGACCTGGTGAAGAGACACC  2812

Query 2813  ACAAGAAAACCACTGACCTTATCAAAGAACACACTACCAAGTATAATGAAATTCAGAATGACTACTTGAGAAGG  2886
            |||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2813  ACAAGAAAACCACGGAGCTCATTAAGGAGCACACGACCAAGTACAACGAGATTCAGAATGACTACCTGAGAAGG  2886

Query 2887  AGAGCCGCTTTGGAAAAGTCCGCCAAAAAGGACAGTAAGAAAAAATCGGAACCCAGCAGCCCTGATCATGGTTC  2960
            ||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 2887  AGGGCAGCCTTGGAGAAGTCCGCCAAAAAGGACAGCAAGAAGAAATCTGAACCCAGCAGCCCTGACCACGGCTC  2960

Query 2961  ATCAACGATTGAGCAAGACCTCGCTGCCCTGGATGCTGAAATGACCCAAAAGTTAATAGACTTGAAGGACAAAC  3034
            ||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 2961  ATCAGCCATTGAGCAAGACCTCGCTGCCCTGGATGCAGAAATGACTCAGAAGTTGATAGACTTGAAAGACAAGC  3034

Query 3035  AACAGCAGCAGCTGCTTAATCTTCGGCAAGAACAGTATTATAGTGAAAAATACCAGAAGCGAGAACATATTAAA  3108
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 3035  AACAACAGCAGCTGCTTAATCTTCGGCAAGAGCAGTATTACAGCGAGAAGTACCAAAAGCGAGAACACATTAAA  3108

Query 3109  CTGCTTATTCAAAAGTTGACGGATGTCGCAGAAGAGTGTCAGAACAATCAGTTAAAGAAGCTCAAAGAAATCTG  3182
            |||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 3109  CTGCTTATTCAGAAGTTGACAGATGTTGCAGAAGAGTGTCAGAACAATCAGTTAAAGAAGCTGAAGGAAATCTG  3182

Query 3183  TGAGAAAGAAAAGAAAGAATTAAAGAAGAAAATGGATAAAAAGAGGCAGGAGAAGATAACAGAAGCTAAATCCA  3256
            .||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 3183  CGAGAAAGAGAAGAAGGAATTAAAGAAGAAAATGGATAAGAAGAGGCAAGAGAAGATAACAGAAGCCAAGTCCA  3256

Query 3257  AAGACAAAAGTCAGATGGAAGAGGAGAAGACAGAGATGATCCGGTCATATATCCAGGAAGTGGTGCAGTATATC  3330
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 3257  AAGACAAAAGCCAGATGGAAGAGGAGAAGACAGAGATGATCCGATCGTACATCCAGGAGGTGGTTCAGTACATC  3330

Query 3331  AAGAGGCTAGAAGAAGCGCAAAGTAAACGGCAAGAAAAACTCGTAGAGAAACACAAGGAAATACGTCAGCAGAT  3404
            ||||||.||||.|||||.|||||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 3331  AAGAGGTTAGAGGAAGCACAAAGTAAAAGACAAGAAAAACTCGTGGAGAAACACAATGAGATCCGCCAGCAGAT  3404

Query 3405  CCTGGATGAAAAGCCCAAGCTGCAGGTGGAGCTGGAGCAAGAATACCAAGACAAATTCAAAAGACTGCCCCTC-  3477
            |||.|||||.|||||||||     ||.|.||                                   ||||||| 
Sbjct 3405  CCTCGATGAGAAGCCCAAG-----GGGGAAG-----------------------------------GCCCCTCC  3438

Query 3478  -GAGATTTTGGAATTCGTGCAGGAAGCCATGAAAGGAAAGATCAGTGAAGACAGCAATCACGGTTCTGCCCCTC  3550
             .|| |.|||    ||| |.|||..||||||      |.||||              .|.|.||||..|||..|
Sbjct 3439  TCAG-TCTTG----TCG-GAAGGTTGCCATG------AGGATC--------------CCTCTGTTCCCCCCAAC  3486

Query 3551  T---CTCCCTGTCCTCAGACCCTGGAAAAGTGAACCACAAGACTCCCTCCAGTGAGGAGCTGGGAGGAGACATC  3621
            |   ||||    ||.|| |||||              ||||   |.|||.||||.                   
Sbjct 3487  TTTACTCC----CCCCA-ACCCT--------------CAAG---CTCTCAAGTGG-------------------  3519

Query 3622  CCAGGAAAAGAATTTGATACTCCTCTG  3648
                                       
Sbjct 3520  ---------------------------  3519