Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471930
• Subject: XM_006498930.2
• Aligned Length: 3655
• Identities: 3093
• Gaps: 173

Alignment

Query    1  ATGGCCGGGGCTCAACCCGGAGTGCACGCCTTGCAACTCAAGCCCGTGTGCGTGTCCGACAGCCTCAAGAAGGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CACCAAATTCGTCAAGTGGGATGATGACTCAACTATTGTTACTCCAATTATTTTGAGGACTGACCCTCAGGGAT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TTTTCTTTTACTGGACAGATCAAA-ACA------AGGAGACAGAGCTACTGGATCTCAGCCTTGTCAAAGATGC  215
                              ||.||| |||      |||||||.|||||..|.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ------------------ATGAAACACATTAATGAGGAGACGGAGCTGTTAGATCTCAGCCTTGTCAAGGATGC  56

Query  216  CAGATGTGGGAGACACGCCAAAGCTCCCAAGGACCCCAAATTACGTGAACTTTTGGATGTGGGGAACATCGGGC  289
            |||.|||||||..||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.|||||||.|||||||||||.|
Sbjct   57  CAGGTGTGGGAAGCACGCCAAAGCTCCCAAGGACCCCAAGTTGCGTGAACTTCTGGATGTTGGGAACATCGGAC  130

Query  290  GCCTGGAGCAGCGCATGATCACAGTGGTGTATGGGCCTGACCTCGTGAACATCTCCCATTTGAATCTCGTGGCT  363
            .|.||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct  131  ACTTGGAACAGCGCATGATAACTGTGGTGTATGGACCAGACCTGGTGAACATTTCCCACTTGAATCTTGTGGCT  204

Query  364  TTCCAAGAAGAAGTGGCCAAGGAATGGACAAATGAGGTTTTCAGTTTGGCAACAAACCTGCTGGCCCAAAACAT  437
            ||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  205  TTTCAAGAGGAAGTAGCCAAGGAATGGACAAATGAGGTTTTCAGCTTGGCAACAAACCTGCTGGCTCAGAACAT  278

Query  438  GTCCAGGGATGCATTTCTGGAAAAAGCCTATACTAAACTTAAGCTGCAAGTCACTCCAGAAGGGCGTATTCCTC  511
            |||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct  279  GTCCAGGGACGCATTTCTGGAGAAAGCATATACTAAGCTCAAGCTCCAGGTCACCCCAGAAGGCCGCATTCCTC  352

Query  512  TCAAAAACATATATCGCTTGTTTTCAGCAGATCGGAAGCGAGTTGAAACTGCTTTAGAGGCTTGTAGTCTTCCA  585
            |.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||
Sbjct  353  TTAAAAACATCTATCGATTGTTCTCAGCAGACCGGAAGCGCGTTGAAACTGCACTAGAGGCTTGTAGTCTTCCA  426

Query  586  TCTTCAAGGAATGATTCAATACCTCAAGAAGATTTCACTCCAGAAGTGTACAGAGTTTTCCTCAACAACCTTTG  659
            |||||.||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct  427  TCTTCGAGGAATGACTCCATTCCCCAAGAGGACTTCACTCCAGATGTATACAGAGTTTTCCTGAACAATCTCTG  500

Query  660  CCCTCGACCTGAAATTGATAACATCTTTTCAGAATTTGGTGCAAAAAGCAAACCATATCTTACCGTTGATCAGA  733
            .||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||
Sbjct  501  TCCCCGACCTGAAATTGATAACATCTTTTCTGAATTTGGTGCCAAAAGCAAACCGTACCTGACGGTTGATCAGA  574

Query  734  TGATGGATTTTATCAACCTTAAGCAGCGAGATCCTCGGCTTAATGAAATACTTTATCCACCTCTAAAACAAGAG  807
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||
Sbjct  575  TGATGGATTTTATCAACCTTAAGCAGAGAGATCCCCGGCTCAATGAAATCCTTTACCCACCTCTGAAGCAGGAG  648

Query  808  CAAGTCCAAGTATTGATTGAGAAGTATGAACCCAACAACAGCCTCGCCAGAAAAGGACAAATATCAGTGGATGG  881
            ||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||.|||||||||||..|||||.||.||.|||||||||||
Sbjct  649  CAGGTCCAAGTGTTGATTGAGAAATATGAGCCCAACAGCAGCCTCGCCAAGAAAGGGCAGATGTCAGTGGATGG  722

Query  882  GTTCATGCGCTATCTGAGTGGAGAAGAAAACGGAGTCGTTTCACCTGAGAAACTGGATTTGAATGAAGACATGT  955
            .|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  723  ATTCATGCGCTACCTGAGCGGAGAAGAAAATGGAGTCGTTTCACCTGAGAAACTGGATTTGAACGAAGACATGT  796

Query  956  CTCAGCCCCTTTCTCACTATTTCATTAATTCCTCGCACAACACCTACCTCACAGCTGGCCAACTGGCTGGAAAC  1029
            ||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.|||
Sbjct  797  CTCAGCCCCTGTCTCACTATTTCATCAATTCCTCGCACAACACCTACCTCACAGCTGGCCAGTTGGCTGGGAAC  870

Query 1030  TCCTCTGTTGAGATGTATCGCCAAGTGCTCCTGTCTGGTTGTCGCTGTGTGGAGCTGGACTGCTGGAAGGGACG  1103
            ||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  871  TCGTCTGTAGAGATGTATCGCCAGGTGCTTCTGTCTGGATGTCGCTGTGTGGAGCTGGACTGCTGGAAGGGAAG  944

Query 1104  GACTGCAGAAGAGGAACCTGTCATCACCCATGGCTTCACCATGACAACTGAAATATCTTTCAAGGAAGTGATAG  1177
            |||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  945  GACCGCTGAGGAAGAGCCTGTCATTACCCATGGATTCACCATGACAACAGAAATATCCTTCAAGGAAGTCATAG  1018

Query 1178  AAGCAATTGCGGAGTGTGCATTTAAGACTTCACCTTTTCCAATTCTCCTTTCGTTTGAGAACCATGTGGATTCC  1251
            ||||.||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 1019  AAGCCATCGCAGAGTGTGCGTTCAAGACGTCTCCTTTCCCCATCCTCCTTTCCTTTGAGAACCACGTGGATTCC  1092

Query 1252  CCAAAGCAGCAAGCCAAGATGGCGGAGTACTGCCGACTGATCTTTGGGGATGCCCTTCTCATGGAGCCCCTGGA  1325
            ||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||.|.||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||
Sbjct 1093  CCGAAGCAACAAGCCAAGATGGCCGAGTATTGCCGATTAATCTTTGGTGATGCCCTCCTGATGGAACCACTGGA  1166

Query 1326  AAAATATCCACTGGAATCTGGAGTTCCTCTTCCAAGCCCTATGGATTTAATGTATAAAATTTTGGTGAAAAATA  1399
            ||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1167  AAAATACCCACTGGAATCTGGGGTACCTCTTCCAAGCCCTATGGATTTAATGTATAAAATCTTGGTGAAAAACA  1240

Query 1400  AGAAGAAATCACACAAGTCATCAGAAGGAAGCGGCAAAAAGAAGCTCTCAGAACAAGCCTCCAACACCTACAGT  1473
            |||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 1241  AGAAGAAGTCGCACAAGTCGTCAGAGGGAAGTGGTAAGAAGAAGCTTTCAGAGCAAGCTTCCAACACCTACAGC  1314

Query 1474  GACTCCTCCAGCATGTTCGAGCCCTCATCCCCAGGAGCCGGAGAAGCTGATACGGAAAGTGACGACGACGATGA  1547
            |||||||||||..||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.||
Sbjct 1315  GACTCCTCCAGTGTGTTCGAGCCTTCGTCTCCAGGAGCTGGGGAAGCAGATACGGAGAGTGATGACGATGACGA  1388

Query 1548  TGATGATGACTGTAAAAAATCTTCAATGGATGAGGGGACTGCTGGAAGTGAGGCTATGGCCACAGAAGAAATGT  1621
            .||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1389  CGACGATGACTGTAAAAAGTCTTCCATGGATGAGGGGACAGCTGGCAGCGAAGCCATGGCCACAGAAGAGATGT  1462

Query 1622  CTAATCTGGTGAACTATATTCAGCCAGTCAAGTTTGAGTCATTTGAAATTTCAAAAAAAAGAAATAAAAGTTTT  1695
            ||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1463  CTAACCTGGTGAACTATATTCAGCCTGTCAAGTTTGAGTCCTTTGAAATTTCAAAAAAAAGAAATAAAAGCTTT  1536

Query 1696  GAAATGTCTTCCTTCGTGGAAACCAAAGGACTTGAACAACTCACCAAGTCTCCAGTGGAATTTGTAGAATATAA  1769
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1537  GAAATGTCTTCCTTCGTGGAAACCAAAGGACTTGAACAACTTACAAAGTCTCCGGTGGAATTTGTAGAATACAA  1610

Query 1770  CAAAATGCAGCTTAGCAGGATATATCCAAAAGGAACACGTGTGGATTCATCCAACTATATGCCTCAGCTCTTCT  1843
            |||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1611  CAAGATGCAACTTAGCAGGATATATCCCAAGGGAACACGTGTGGATTCATCCAACTACATGCCTCAACTCTTCT  1684

Query 1844  GGAATGCAGGTTGTCAGATGGTGGCACTTAATTTCCAGACAATGGACCTGGCTATGCAAATAAATATGGGGATG  1917
            |||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||.||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 1685  GGAATGCTGGCTGTCAGATGGTGGCGCTCAACTTCCAGACAGTGGATCTAGCTATGCAGATAAACATGGGCATG  1758

Query 1918  TATGAATACAACGGGAAGAGTGGCTACAGATTGAAGCCAGAGTTCATGAGGAGGCCTGACAAGCATTTTGATCC  1991
            |||||.|||||.||||||||.|||||.||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1759  TATGAGTACAATGGGAAGAGCGGCTATAGGCTGAAGCCAGAGTTCATGAGGAGGCCGGACAAGCATTTTGATCC  1832

Query 1992  ATTTACTGAAGGCATCGTAGATGGGATAGTGGCAAACACTTTGTCTGTTAAGATTATTTCAGGTCAGTTTCTTT  2065
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1833  ATTTACTGAAGGAATCGTAGATGGGATAGTGGCCAACACTCTATCTGTTAAGATTATTTCAGGTCAGTTCCTCT  1906

Query 2066  CTGATAAGAAAGTTGGGACTTACGTGGAAGTAGATATGTTTGGTTTGCCTGTGGATACAAGGAGGAAGGCATTT  2139
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1907  CTGATAAGAAAGTTGGGACTTATGTGGAAGTGGATATGTTTGGCTTGCCTGTGGACACAAGGAGGAAGGCATTT  1980

Query 2140  AAGACCAAAACATCCCAAGGAAATGCTGTGAATCCTGTCTGGGAAGAAGAACCTATTGTGTTCAAAAAGGTGGT  2213
            ||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1981  AAAACCAAGACATCCCAAGGAAATGCTGTAAACCCTGTCTGGGAAGAAGAACCTATTGTATTCAAAAAGGTAGT  2054

Query 2214  TCTTCCTACTCTGGCCTGTTTGAGAATAGCAGTTTATGAAGAAGGAGGTAAATTCATTGGCCACCGTATCTTGC  2287
            |||.|||.||||||||||||||||.|||||||..||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 2055  TCTACCTTCTCTGGCCTGTTTGAGGATAGCAGCATATGAAGAGGGAGGCAAATTTATTGGCCACCGGATATTGC  2128

Query 2288  CAGTGCAAGCCATTCGGCCAGGCTATCACTATATCTGTCTAAGGAATGAAAGGAACCAGCCTCTGACGCTGCCT  2361
            |.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||..|||||||.|||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 2129  CTGTGCAGGCTATTCGGCCAGGCTATCACTACATCTGCCTGCGGAATGAGAGGAACCAGCCCCTGACGCTGCCA  2202

Query 2362  GCTGTCTTTGTCTACATAGAAGTGAAAGACTATGTGCCAGACACATATGCAGATGTCATCGAAGCTTTATCAAA  2435
            |||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct 2203  GCTGTCTTTGTCTACATAGAAGTCAAAGATTATGTGCCAGACACGTATGCAGATGTAATCGAAGCTCTATCAAA  2276

Query 2436  CCCAATCCGATATGTGAACCTGATGGAACAGAGAGCTAAGCAATTGGCTGCTTTGACACTGGAAGATGAAGAAG  2509
            |||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||..|||||||.|||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 2277  CCCAATCCGATATGTCAATCTGATGGAACAGAGAGCTAAGCAGCTGGCTGCGTTGACCCTGGAGGATGAAGAGG  2350

Query 2510  AAGTAAAGAAAGAGGCTGATCCTGGAGAAACACCATCAGAGGCTCCAAGTGAAGCGAGAACGACTCCAGCAGAA  2583
            ||||||||||.||||||||.||||||||||||.|.||.|||||||||||.|||.|.||.||.||.||||||||.
Sbjct 2351  AAGTAAAGAAGGAGGCTGACCCTGGAGAAACATCTTCCGAGGCTCCAAGCGAAACCAGGACAACGCCAGCAGAG  2424

Query 2584  AATGGGGTGAATCACACTACAACCCTGACACCCAAGCCACCCTCCCAGGCTCTCCACAGCCAGCCAGCTCCAGG  2657
            |||||||||||||||||..||.||||..||||||||||.||.||||||||||..|||||||||||.||||||||
Sbjct 2425  AATGGGGTGAATCACACCGCATCCCTTGCACCCAAGCCGCCTTCCCAGGCTCCACACAGCCAGCCTGCTCCAGG  2498

Query 2658  TTCTGTAAAGGCACCTGCCAAAACAGAAGATCTTATTCAGAGTGTCTTAACAGAAGTGGAAGCACAGACCATCG  2731
            .|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||
Sbjct 2499  GTCTGTGAAGGCACCTGCCAAAACAGAAGATCTGATCCAGAGCGTGTTAACAGAAGTAGAGGCGCAAACCATCG  2572

Query 2732  AAGAACTAAAGCAACAGAAATCGTTTGTGAAACTTCAAAAGAAACACTACAAAGAAATGAAAGACCTGGTTAAG  2805
            ||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2573  AAGAGCTCAAGCAACAGAAATCGTTCGTGAAACTTCAAAAGAAACACTACAAAGAAATGAAAGACCTGGTGAAG  2646

Query 2806  AGACACCACAAGAAAACCACTGACCTTATCAAAGAACACACTACCAAGTATAATGAAATTCAGAATGACTACTT  2879
            ||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||.|
Sbjct 2647  AGACACCACAAGAAAACCACGGAGCTCATTAAGGAGCACACGACCAAGTACAACGAGATTCAGAATGACTACCT  2720

Query 2880  GAGAAGGAGAGCCGCTTTGGAAAAGTCCGCCAAAAAGGACAGTAAGAAAAAATCGGAACCCAGCAGCCCTGATC  2953
            |||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 2721  GAGAAGGAGGGCAGCCTTGGAGAAGTCCGCCAAAAAGGACAGCAAGAAGAAATCTGAACCCAGCAGCCCTGACC  2794

Query 2954  ATGGTTCATCAACGATTGAGCAAGACCTCGCTGCCCTGGATGCTGAAATGACCCAAAAGTTAATAGACTTGAAG  3027
            |.||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 2795  ACGGCTCATCAGCCATTGAGCAAGACCTCGCTGCCCTGGATGCAGAAATGACTCAGAAGTTGATAGACTTGAAA  2868

Query 3028  GACAAACAACAGCAGCAGCTGCTTAATCTTCGGCAAGAACAGTATTATAGTGAAAAATACCAGAAGCGAGAACA  3101
            |||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct 2869  GACAAGCAACAACAGCAGCTGCTTAATCTTCGGCAAGAGCAGTATTACAGCGAGAAGTACCAAAAGCGAGAACA  2942

Query 3102  TATTAAACTGCTTATTCAAAAGTTGACGGATGTCGCAGAAGAGTGTCAGAACAATCAGTTAAAGAAGCTCAAAG  3175
            .|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 2943  CATTAAACTGCTTATTCAGAAGTTGACAGATGTTGCAGAAGAGTGTCAGAACAATCAGTTAAAGAAGCTGAAGG  3016

Query 3176  AAATCTGTGAGAAAGAAAAGAAAGAATTAAAGAAGAAAATGGATAAAAAGAGGCAGGAGAAGATAACAGAAGCT  3249
            |||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 3017  AAATCTGCGAGAAAGAGAAGAAGGAATTAAAGAAGAAAATGGATAAGAAGAGGCAAGAGAAGATAACAGAAGCC  3090

Query 3250  AAATCCAAAGACAAAAGTCAGATGGAAGAGGAGAAGACAGAGATGATCCGGTCATATATCCAGGAAGTGGTGCA  3323
            ||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||
Sbjct 3091  AAGTCCAAAGACAAAAGCCAGATGGAAGAGGAGAAGACAGAGATGATCCGATCGTACATCCAGGAGGTGGTTCA  3164

Query 3324  GTATATCAAGAGGCTAGAAGAAGCGCAAAGTAAACGGCAAGAAAAACTCGTAGAGAAACACAAGGAAATACGTC  3397
            |||.|||||||||.||||.|||||.|||||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|
Sbjct 3165  GTACATCAAGAGGTTAGAGGAAGCACAAAGTAAAAGACAAGAAAAACTCGTGGAGAAACACAATGAGATCCGCC  3238

Query 3398  AGCAGATCCTGGATGAAAAGCCCAAGCTGCAGGTGGAGCTGGAGCAAGAATACCAAGACAAATTCAAAAGACTG  3471
            ||||||||||.|||||.|||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 3239  AGCAGATCCTCGATGAGAAGCCCAAGCTGCAGACGGAGCTGGAGCAAGAATACCAAGACAAGTTCAAAAGGCTG  3312

Query 3472  CCCCTCGAGATTTTGGAATTCGTGCAGGAAGCCATGAAAGGAAAGATCAGTGAAGACAGCAATCACGGTTCTGC  3545
            |||||.||||||.||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 3313  CCCCTGGAGATTCTGGAGTTTGTACAGGAAGCCATGAAAGGGAAGATCAGCGAGGACAGCAATCACGGCTCTGC  3386

Query 3546  CCCTCTCTCCCTGTCCTCAGACCCTGGAAAAGTGAACCACAAGACTCCCTCCAGTGAGGAGCTGGGAGGAGACA  3619
            |||||.|||.|||.|||||||..|||.|||.|||||||.||||.|||||||||||||||||.|.|.|.||||.|
Sbjct 3387  CCCTCCCTCTCTGGCCTCAGATGCTGCAAAGGTGAACCTCAAGTCTCCCTCCAGTGAGGAGATAGAAAGAGAGA  3460

Query 3620  TCCCAGGAAAAGAATTTGATACTCCTCTG  3648
            .||||||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct 3461  ACCCAGGAAGAGAGTTTGATACTCCTCTG  3489