Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471963
• Subject: XM_011521353.2
• Aligned Length: 2166
• Identities: 1964
• Gaps: 201

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGACAGGGTGAGCCAAGCCAGCGCTCGACAGGGCTTGCTGGACTGTATGCAGCCCCCGCAGCATCACCTGT  74

Query    1  -------------------ATGGGACAGGCCCTGGGTATCAAGAGCTGTGACTTTCAGGCAGCAAGAAACAATG  55
                               ||||   |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTTCATTAAAGGAAGTGGGATGG---ATGCCCTGGGTATCAAGAGCTGTGACTTTCAGGCAGCAAGAAACAATG  145

Query   56  AGGAGCACCACACCAAGGCCCTCAGCTCCCGGCGCCTCTTTGTGAGGAGGGGGCAGCCCTTCACCATCATCCTG  129
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  146  AGGAGCACCACACCAAGGCCCTCAGCTCCCGGCGCCTCTTTGTGAGGAGGGGGCAGCCCTTCACCATCATCCTG  219

Query  130  TACTTCCGCGCTCCAGTCCGTGCATTTCTGCCTGCCCTGAAGAAGGTGGCCCTCACTGCACAAACTGGAGAGCA  203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  220  TACTTCCGCGCTCCAGTCCGTGCATTTCTGCCTGCCCTGAAGAAGGTGGCCCTCACTGCACAAACTGGAGAGCA  293

Query  204  GCCTTCCAAGATCAACAGGACCCAAGCCACATTCCCAATTTCCAGTCTGGGGGACCGAAAGTGGTGGAGTGCAG  277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  GCCTTCCAAGATCAACAGGACCCAAGCCACATTCCCAATTTCCAGTCTGGGGGACCGAAAGTGGTGGAGTGCAG  367

Query  278  TGGTGGAGGAGAGAGATGCCCAGTCCTGGACCATCTCTGTGACCACACCTGCGGACGCTGTCATTGGCCACTAC  351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  TGGTGGAGGAGAGAGATGCCCAGTCCTGGACCATCTCTGTGACCACACCTGCGGACGCTGTCATTGGCCACTAC  441

Query  352  TCGCTTCTGCTGCAGGTCTCAGGCAGGAAGCAACTCCTCTTGGGTCAGTTCACACTGCTTTTTAACCCCTGGAA  425
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  TCGCTTCTGCTGCAGGTCTCAGGCAGGAAGCAACTCCTCTTGGGTCAGTTCACACTGCTTTTTAACCCCTGGAA  515

Query  426  TAGAGAGGATGCTGTGTTCCTGAAGAATGAGGCTCAGCGCATGGAGTACTTGTTGAACCAGAATGGTCTCATCT  499
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  TAGAGAGGATGCTGTGTTCCTGAAGAATGAGGCTCAGCGCATGGAGTACTTGTTGAACCAGAATGGTCTCATCT  589

Query  500  ACCTGGGTACAGCTGACTGCATCCAGGCAGAGTCCTGGGACTTTGGCCAGTTCGAGGGGGATGTCATTGACCTC  573
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                         
Sbjct  590  ACCTGGGTACAGCTGACTGCATCCAGGCAGAGTCCTGGGACTTTGGCCA-------------------------  638

Query  574  AGCCTGCGCTTGCTGAGCAAGGACAAGCAGGTAGAGAAGTGGAGCCAGCCGGTGCACGTGGCCCGTGTGTTGGG  647
                                                                                      
Sbjct  639  --------------------------------------------------------------------------  638

Query  648  TGCCTTGCTGCATTTTCTCAAGGAGCAGAGGGTCCTGCCCACCCCGCAGACCCAGGCCACCCAGGAAGGGGCCT  721
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  639  ------GCTGCATTTTCTCAAGGAGCAGAGGGTCCTGCCCACCCCGCAGACCCAGGCCACCCAGGAAGGGGCCT  706

Query  722  TGCTGAACAAGCGCCGGGGCAGCGTGCCCATCCTGCGGCAGTGGCTCACCGGCCGAGGCCGACCTGTGTATGAT  795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  707  TGCTGAACAAGCGCCGGGGCAGCGTGCCCATCCTGCGGCAGTGGCTCACCGGCCGAGGCCGACCTGTGTATGAT  780

Query  796  GGCCAGGCCTGGGTGTTGGCTGCTGTTGCTTGCACAGTGCTGCGATGCCTGGGAATCCCTGCCCGCGTGGTGAC  869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  GGCCAGGCCTGGGTGTTGGCTGCTGTTGCTTGCACAGTGCTGCGATGCCTGGGAATCCCTGCCCGCGTGGTGAC  854

Query  870  CACGTTTGCCTCAGCACAGGGCACCGGTGGGCGTCTTCTCATAGATGAATACTATAATGAGGAGGGACTTCAGA  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  855  CACGTTTGCCTCAGCACAGGGCACCGGTGGGCGTCTTCTCATAGATGAATACTATAATGAGGAGGGACTTCAGA  928

Query  944  ACGGAGAAGGCCAGAGAGGCAGAATCTGGATCTTCCAGACTTCCACAGAGTGCTGGATGACGCGGCCTGCCTTG  1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  929  ACGGAGAAGGCCAGAGAGGCAGAATCTGGATCTTCCAGACTTCCACAGAGTGCTGGATGACGCGGCCTGCCTTG  1002

Query 1018  CCCCAGGGTTATGATGGATGGCAGATTCTGCACCCAAGTGCTCCTAATGGAGGTGGAGTCCTGGGGTCCTGTGA  1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003  CCCCAGGGTTATGATGGATGGCAGATTCTGCACCCAAGTGCTCCTAATGGAGGTGGAGTCCTGGGGTCCTGTGA  1076

Query 1092  TCTGGTGCCGGTCAGAGCAGTCAAGGAGGGGACGCTGGGGCTGACCCCAGCAGTGTCAGACCTTTTTGCTGCCA  1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077  TCTGGTGCCGGTCAGAGCAGTCAAGGAGGGGACGCTGGGGCTGACCCCAGCAGTGTCAGACCTTTTTGCTGCCA  1150

Query 1166  TAAATGCCTCATGTGTGGTCTGGAAGTGCTGTGAGGATGGGACACTGGAGTTGACTGACTCCAACACAAAGTAT  1239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1151  TAAATGCCTCATGTGTGGTCTGGAAGTGCTGTGAGGATGGGACACTGGAGTTGACTGACTCCAACACAAAGTAT  1224

Query 1240  GTTGGCAACAACATCAGCACCAAGGGTGTGGGCAGTGACCGCTGCGAGGACATCACTCAGAACTACAAGTATCC  1313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1225  GTTGGCAACAACATCAGCACCAAGGGTGTGGGCAGTGACCGCTGCGAGGACATCACTCAGAACTACAAGTATCC  1298

Query 1314  TGAAGGGTCTCTTCAGGAAAAAGAGGTGCTGGAGAGAGTCGAGAAAGAGAAAATGGAACGTGAGAAAGACAACG  1387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1299  TGAAGGGTCTCTTCAGGAAAAAGAGGTGCTGGAGAGAGTCGAGAAAGAGAAAATGGAACGTGAGAAAGACAACG  1372

Query 1388  GCATCCGTCCTCCCAGTCTCGAGACTGCCAGTCCTCTGTACCTGCTCTTGAAAGCACCCAGCTCCCTACCCCTG  1461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1373  GCATCCGTCCTCCCAGTCTCGAGACTGCCAGTCCTCTGTACCTGCTCTTGAAAGCACCCAGCTCCCTACCCCTG  1446

Query 1462  AGAGGGGATGCCCAGATCTCAGTGACGCTGGTTAATCACAGTGAGCAGGAGAAGGCAGTGCAGCTGGCAATTGG  1535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1447  AGAGGGGATGCCCAGATCTCAGTGACGCTGGTTAATCACAGTGAGCAGGAGAAGGCAGTGCAGCTGGCAATTGG  1520

Query 1536  GGTCCAGGCTGTACACTACAACGGTGTCCTTGCTGCCAAGCTCTGGAGGAAGAAGCTGCACCTCACGCTCAGTG  1609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1521  GGTCCAGGCTGTACACTACAACGGTGTCCTTGCTGCCAAGCTCTGGAGGAAGAAGCTGCACCTCACGCTCAGTG  1594

Query 1610  CCAACCTGGAAAAGATAATAACCATCGGCCTGTTCTTCTCCAATTTTGAGCGAAACCCACCCGAGAACACCTTC  1683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1595  CCAACCTGGAAAAGATAATAACCATCGGCCTGTTCTTCTCCAATTTTGAGCGAAACCCACCCGAGAACACCTTC  1668

Query 1684  CTTAGACTCACCGCCATGGCAACACACTCTGAATCCAACCTTAGCTGCTTTGCTCAGGAAGACATTGCCATTTG  1757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1669  CTTAGACTCACCGCCATGGCAACACACTCTGAATCCAACCTTAGCTGCTTTGCTCAGGAAGACATTGCCATTTG  1742

Query 1758  TAGACCACACCTTGCCATCAAGATGCCAGAGAAAGCAGAGCAGTATCAACCCCTCACAGCCTCAGTCAGCCTCC  1831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1743  TAGACCACACCTTGCCATCAAGATGCCAGAGAAAGCAGAGCAGTATCAACCCCTCACAGCCTCAGTCAGCCTCC  1816

Query 1832  AGAACTCCCTAGATGCCCCCATGGAGGACTGTGTGATCTCCATCCTGGGAAGGGGGCTCATTCACAGAGAGAGG  1905
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1817  AGAACTCCCTAGATGCCCCCATGGAGGACTGTGTGATCTCCATCCTGGGAAGGGGGCTCATTCACAGAGAGAGG  1890

Query 1906  AGCTACAGATTCCGTTCAGTGTGGCCTGAAAACACCATGTGTGCCAAGTTCCAGTTCACGCCAACACATGTGGG  1979
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1891  AGCTACAGATTCCGTTCAGTGTGGCCTGAAAACACCATGTGTGCCAAGTTCCAGTTCACGCCAACACATGTGGG  1964

Query 1980  GCTCCAGAGACTCACTGTGGAAGTGGACTGCAACATGTTCCAGAACCTAACCAACTATAAAAGCGTCACCGTGG  2053
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1965  GCTCCAGAGACTCACTGTGGAAGTGGACTGCAACATGTTCCAGAACCTAACCAACTATAAAAGCGTCACCGTGG  2038

Query 2054  TAGCCCCTGAACTATCAGCT  2073
            ||||||||||||||||||||
Sbjct 2039  TAGCCCCTGAACTATCAGCT  2058